Argopecten irradians (bay scallop): 138332933
Help
Entry
138332933 CDS
T10542
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
airr Argopecten irradians (bay scallop)
Pathway
airr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
airr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
138332933
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
138332933
NCBI-ProteinID:
XP_069137084
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(4051612..4087552)
Genome browser
AA seq
2308 aa
AA seq
DB search
MCTHGRCINMNGGYKCICNIGFMSTPDNRACIDINECKARESPCINGICINNQGSFRCEC
PPNFRMGPEGRTCIDSRRDQCYREYRSGRCSSALATLMSKAMCCCMDTGGVNILKGWGQR
CEPCPTPGDRGYSDLCRDIGRTPDGDINECQLNPYICVNGACENRDGSYRCLCNPGFESD
STGKLCTDIDECAKYPNYCDGGQCRNTLGSYRCTCPAGYQFIERSSSCEDKNECESNPCT
DADCINTPGSFRCDCREPGASLDSTGRICVDNRKGACWLEIRNGMCENNMKTLVTKAECC
GSIGKAWGSPCETCPPLSQLKCPPGYAPKSGICIDINECELYSNLCQGGGECVNTPGSFT
CNCPPGLSLDSTGRTCVDMREATCYLGFSRGVCTNPLSGNYLKADCCCSLGKAWGSTCAA
CPARDSAEYQSLCVTNGGRPKDINECMMYPGICSNGQCQNTFGSFVCTCNQGYALDNTGF
NCTDIDECRISFGVCGNGTCQNTPGMFRCICNEGFKGVMMDQMCVDIDECDEQPGLCRGG
SCVNTIGGYFCECPDGHVLSTDGQSCSDVDECSESQSICNNGICENFLGGYHCRCFEGYV
ATRDHTTCIDDNECANRNGGCASLCVNTPGSFVCGCDPGFVLLPDQRSCGDVNECAEGDD
ICNGGRCTNLPGSYRCTCMDGLTPSVDGKMCLDVDECLANRNLCLNGQCQNNHGSYVCIC
ETGFSVKMETRNPGCTDDNECELGSAGCDSHAVCINTIGSYKCDCKPGYTGDGFTCRDSN
ECTRDNGGCDLDATCINVPGSFKCVCDDGFSGDGFQCRDVDECTLDSTLCTNGQCLNFPG
GFRCDCDMGFAPTVDEKACVDINECDTFHNLCVNGECENLIGLFRCNCNQGFRLDESGGN
CTDINECSNPDNCLYGTCVNTQGGYICQCPTGYETNPTGTGCIDKRLGTCYMTAPDNRQY
GRCTDVITLDTYRATCCCSVGKGWGEDPGFCERCPVNGTSEYKTLCPGGPGFKPSIDLIL
EDIDECEELQNVCKGGECQNTFGSFICVCPTGYRLYNHQCIDINECVEDSTLCGEGTCMN
TEGSYRCVCPNGYIPMEGDVDCMDMRKGDCFPTYYTTTQPPFTLVCESPIAFNITRVDCC
CTTIGQAWGQPCEACPAKRSAEYADLCEPERIGEGINECEKFQGICENGRCIDTLQSFRC
ECFDGYEYNPTSYKCEDIDECRLTGESPCKGYAQCINTPGSFTCQCPPGYKLSPGGRRCL
DVNECEELAGVCINGECDNLDGSFRCTCLPGFRLNTNRDACIDRNECTARPGRCRNGTCE
NLIGGFRCHCSPGFIVSNNQECLDVNECLDQIGLCQNGRCVNTMGSFTCSCPQGFQITRD
GMDCRDIDECVERDNICLAGSCVNSEGSYRCICDEGYMLQQLGNNQFCIDVNECETIPDV
CANGQCENIDGGYRCQCPPNTLLTDDGMMCLDVREGNCFGRFQGGLCLDAFTRNMTKAMC
CCTVGQAWGNTNLCEVCPQRGEASFDALCPDTGVITSPDGGTMDVNECMMIPGLCENGQC
VNTDGSFRCECGQGYILDDTGRRCVDNNECLTGNICGNGTCTNVEGGFQCNCADGFMPGM
DNTCEDVNECLTDQNNCAFRCVNIPGSFRCICPKGYNIAPDGIHCQDVDECARGDHQCRY
ACKNLVGTFMCVCPEGYREVGTNDCRDIDECTSRPDVCRNGRCINTIGGYRCRCHPGFST
SLDGKECRDTREDYCFFELTGGRCRIVPSIRRTTQVECCCTGAAAWGRGCDRCPSVGSRQ
FRKLCPDGIGTRPGGEDINECLLFPGRCKNGQCINKPGSYGCICDRGYKTDSMGTSCIDV
NECEDQRSPCEFTCLNLVGSYKCTCPPGYVLNMDGKTCRDLDECANMQHNCQHKCINTVG
SFECGCADGFRRGMGNRCMDINECEEQPHLCGPKGTCNNTPGSFRCVCLRGYTVDETGTN
CVDIDECANGKCTDGCENIPGAYRCQCPPGYTLHPNMDQCIDDNECNEQGMCGQAECNNE
EGSYTCFCPPGLEFDPNLMLCVDPNVCNSHSIWFVLDPNVCNSHQCLFGCSPNGLTFVCG
CPTGYLSIGQGHCLSTLNTPPEDNLNEIYPNGNIPHVPAPTDGTLPHGEGCYECDIEDQD
LPLTQRSKRSAGLQKLKVTKKGKNRMLEHQRSNNASRSNQNVLDPDKPIVLHLNRSNIRR
KTKVMKVLPALAALKNNIRYSIARGNERHIFSMHERKGISSLQFRRKIHKPKVYHLRITG
RPIHRKTEIAGKNVNLKKIAIRLDVHLV
NT seq
6927 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgtacccacggtcgctgtatcaacatgaacggtggttacaagtgtatctgtaacatt
ggctttatgtccactcctgacaaccgagcctgtatagatatcaacgagtgtaaagcaagg
gagtcgccatgtatcaatggaatctgtatcaacaaccagggtagctttaggtgtgaatgt
ccaccaaacttccgtatgggaccggagggccgcacatgtatagatagtaggcgtgaccag
tgttatagggagtacagaagtggacgatgctctagtgctctggctacccttatgtctaag
gctatgtgttgttgtatggatactggtggagtgaacatcctcaagggatggggacagaga
tgtgaaccctgccccaccccgggagacaggggatatagcgacctgtgtagggatatagga
aggacacctgatggtgatatcaatgagtgccagctgaacccttacatctgtgtcaatgga
gcctgtgagaatagagatggtagttatagatgtctctgtaaccctgggtttgagtctgac
tcaaccggaaagttgtgtactgatattgacgagtgtgcaaagtaccctaattactgtgat
ggagggcagtgtcgtaatacactgggtagctaccgttgtacatgtccggctggatatcag
ttcattgagagaagctccagctgtgaagacaagaatgagtgtgaaagtaacccatgtact
gatgcggactgtatcaacacaccgggtagtttccgctgtgactgtcgtgagccgggtgct
tcactcgactcaacaggcaggatctgtgttgacaacagaaagggagcctgctggctggag
attcgtaacggaatgtgtgagaacaatatgaagaccctagttacaaaggctgagtgttgt
gggagtataggaaaggcttggggaagtccctgtgagacatgtccaccattatcccaactg
aagtgtcctcctggctatgcgccaaagagtggaatttgtattgatatcaatgagtgcgag
ctgtactcaaacctgtgtcagggtggaggtgagtgtgtgaacactccgggatcctttacc
tgtaactgtcctccaggcctcagtcttgactccacaggccgtacctgtgtcgatatgaga
gaagctacctgctatctgggattctccagaggagtctgtaccaaccctctgtctggtaat
tatctgaaggccgactgctgttgctccctggggaaagcttggggaagtacctgtgctgca
tgtccagcccgtgactcagcggagtaccagtctttatgtgtcactaatggtggccgacct
aaagatattaacgagtgtatgatgtaccctgggatctgcagtaatggccaatgtcagaac
acatttggaagttttgtctgtacctgtaaccagggatacgctctagataacacaggcttc
aactgtacagatattgatgaatgccgtatttcgtttggtgtatgtggtaacggaacttgt
cagaacacaccaggaatgttccgatgtatctgtaacgagggcttcaagggggtcatgatg
gatcagatgtgtgttgacattgatgagtgtgatgaacagcctggtctgtgtagaggcgga
tcctgtgtcaatactatcggaggttatttctgtgagtgtccggacggtcatgtcctctca
acagatggccagtcctgttctgatgttgatgagtgctctgagagccagagtatctgtaac
aatggaatctgtgagaacttcctgggcggttaccattgtcgatgttttgagggttacgtg
gccaccagagatcataccacgtgtatagatgataatgagtgtgccaacagaaatggtggc
tgtgcctcactgtgtgtaaatacccccggatcctttgtctgcggatgtgaccctggattt
gtactgcttccggatcaaaggtcgtgtggtgatgtaaatgaatgtgcagaaggggatgat
atttgtaatggtggacgatgtaccaaccttccaggcagttatcgttgtacatgtatggat
ggtctgacgccatctgtagacggcaagatgtgtttagatgtggatgagtgtctagccaac
aggaatctgtgtctaaatgggcagtgtcagaataatcatggatcctacgtgtgtatatgt
gagacagggttctctgtcaagatggagaccagaaacccaggatgtactgatgataatgaa
tgtgagttaggctccgcgggatgtgactctcatgctgtctgtattaacaccattggctcc
tataaatgtgactgcaagcctggttacactggggatggattcacatgtagagacagtaat
gagtgtacccgtgacaatggcggctgtgatctagatgctacctgtatcaatgttcctggc
agcttcaagtgtgtttgtgacgatggtttttctggagatggcttccaatgcagagatgtg
gacgagtgtactctggactctactctgtgtactaatggacagtgccttaacttccctggc
ggcttccgatgtgactgtgatatgggtttcgccccaactgtagatgagaaggcttgtgta
gacattaacgagtgcgataccttccacaacttgtgtgttaatggagagtgtgagaacttg
atcggcctgttcagatgtaactgtaaccaaggtttcagactggacgagtcgggcggaaac
tgcacagatataaatgagtgttccaaccctgataattgtctgtacgggacatgtgtgaac
acccaagggggctacatctgtcagtgtccaacaggctacgaaaccaaccccacaggaaca
ggctgtatcgataagcgcctaggtacctgttacatgacggcccctgataatcgacagtac
ggccgctgtactgatgtgattaccctggatacatatagagccacctgttgttgtagcgtg
ggtaaaggctggggagaggacccaggattctgtgagcgatgtcctgtcaatggcacaagt
gaatacaagacattgtgcccaggtggaccaggctttaaaccttccattgatctgatcctc
gaagatattgatgaatgtgaagagctccagaatgtctgtaagggtggtgaatgtcagaat
acatttggaagtttcatctgtgtgtgtccgactggataccgactctacaaccaccagtgt
attgatataaatgagtgtgttgaggacagtaccctgtgtggagaggggacctgtatgaac
acagagggaagctacagatgtgtctgtcctaatggctatataccaatggaaggcgatgtc
gactgtatggacatgaggaaaggtgattgtttccctacctactacactacaacacagcct
ccgttcaccttggtctgtgagagtcctattgccttcaacatcaccagggtcgactgttgt
tgtacaactattggtcaggcatggggtcagccgtgtgaagcttgcccagccaaacgctca
gctgaatacgctgatctttgtgagcctgagaggattggagagggaatcaatgaatgtgag
aaattccaaggaatctgtgagaatggccgctgtatagataccttacaaagcttccgatgt
gaatgttttgatggctatgagtacaacccaacatcctacaagtgtgaagatattgatgag
tgtcgtctgacaggagagtcgccctgtaaaggctatgcccagtgtatcaatactcccggg
agctttacttgtcagtgtccaccaggctacaaactctcccctggaggtcggcgttgtctg
gacgtgaatgaatgtgaggagcttgctggtgtatgtatcaatggagagtgtgataacctg
gatggtagcttcagatgtacctgtttaccaggcttccgactcaacacaaacagagatgcc
tgtatcgatagaaatgaatgtacagctagaccaggacgttgtaggaatgggacgtgtgaa
aaccttattggaggttttagatgtcattgttctcctggcttcattgtgtccaacaaccag
gagtgtctagatgtgaatgaatgtttggaccagattggattgtgtcagaatggccgctgt
gtcaatactatgggtagcttcacctgttcttgtccacaagggttccaaatcactagagat
ggcatggactgtagggatattgatgaatgtgtggaaagagacaacatttgtctggccggg
agctgtgtaaacagtgaaggatcataccgatgtatctgtgacgaaggctacatgttacag
cagctgggaaataaccagttctgtatagatgtgaatgaatgtgagactatccctgacgta
tgtgctaatggtcagtgtgagaacattgacggaggatatcgctgtcagtgtcctccaaac
acactcctcacagacgatggcatgatgtgtctcgatgttagggaaggaaattgctttgga
cgatttcaaggtggtctgtgcctcgatgccttcacaaggaatatgactaaggcaatgtgt
tgttgtaccgtggggcaggcctggggtaacaccaatctgtgtgaagtgtgtcctcagagg
ggtgaagccagctttgatgcactgtgtcctgataccggagttattacaagtccagatgga
ggaactatggatgtgaatgagtgtatgatgatacctggactgtgtgagaatggacagtgt
gtcaataccgatggatcattccgctgtgaatgtggacaaggctacatcttagacgacact
ggtcggcgttgtgtagataacaacgagtgcttgactggtaatatatgtggaaatggaacc
tgtaccaatgtagagggaggatttcagtgtaactgtgccgacgggtttatgccaggaatg
gacaatacatgtgaagatgtaaatgaatgtctgacggaccagaacaactgtgctttccgc
tgtgtcaacattcctggctccttcaggtgtatctgtcctaaaggttacaacatagcaccc
gacggaatccattgtcaagatgtggacgagtgtgcccgaggggaccaccagtgtcggtac
gcctgtaagaatctggtcggaaccttcatgtgtgtatgtccagagggttacagggaagta
ggaaccaacgactgtagagatattgacgagtgtactagccggccagatgtttgtaggaac
ggtcgctgtatcaacacaattggaggctacaggtgtcgctgtcacccaggcttctctaca
agtctggatggcaaggaatgtcgcgacaccagggaagactactgcttctttgagctgact
gggggacgctgtaggattgtgccgtctataaggaggaccacacaggtcgaatgctgctgt
acaggtgctgccgcctggggtcgaggctgtgacaggtgtccaagcgttggttctagacag
ttcagaaagttgtgtccagatggaataggcaccaggcctggtggtgaagatataaatgag
tgtctactgttccctgggcgatgtaagaatggtcaatgtatcaacaagcctggatcgtat
ggatgtatatgtgaccgtggctacaagacagactctatgggaaccagttgtatagatgtg
aacgaatgtgaagaccagcgctcaccatgtgagtttacctgcctcaaccttgttggcagc
tacaaatgtacctgtcctccaggctatgtccttaacatggatggcaagacatgtcgagat
ctcgatgagtgtgccaacatgcagcataactgtcagcacaaatgtatcaatacagtggga
agttttgagtgtggttgtgctgacggattccgccgtggtatggggaacagatgtatggat
atcaatgaatgtgaggagcagccccatttgtgtggccctaagggaacctgtaacaacacg
cctggaagttttagatgtgtctgtctccgtggttacacagtcgatgagacaggaaccaac
tgtgtcgacattgacgagtgtgctaacggaaagtgtacagatgggtgcgagaatatccct
ggtgcctaccgctgtcagtgtcctcccggctacaccctacaccccaatatggaccagtgt
atagatgacaatgagtgtaatgaacaaggaatgtgtggtcaagctgaatgtaataacgag
gagggcagctacacctgtttctgtcctcccggactcgagtttgaccccaacttgatgttg
tgtgtagatccgaatgtgtgtaacagccattctatttggtttgttttagatccgaatgtg
tgtaacagccaccagtgtctgtttggttgttcacctaatggattaacatttgtttgtggc
tgtccaacaggctacctgagtattggacaagggcattgtttgtcgacccttaatacaccc
ccggaagataatctaaatgagatctatcccaatggtaacatcccccacgtgccagctccc
acagacgggacgttgccccacggggagggctgctatgaatgtgatatagaggaccaggac
ctgcccctaacccaacgcagcaagaggtctgccggcctgcaaaagcttaaggtgaccaaa
aagggtaaaaacagaatgcttgaacatcagaggtcaaacaatgcatcaaggtcaaaccag
aatgtccttgatcctgacaagccaatcgtgctgcacctgaataggtcaaatatcagacga
aagacaaaggtgatgaaggttttacctgctctggcagcacttaagaacaatatcagatac
tcaatcgcacgtggcaacgaacgacacatcttcagcatgcatgaacgaaagggcattagt
tctttacaattcagaaggaaaatccataaacctaaggtttatcacctccgaatcacaggc
cgacctattcacaggaaaacagaaattgctggtaaaaatgtaaaccttaagaaaatagca
attcgactggatgttcaccttgtatga
DBGET
integrated database retrieval system