Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber): 139975640
Help
Entry
139975640 CDS
T10891
Name
(RefSeq) uncharacterized protein isoform X1
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
ajj Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber)
Brite
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
ajj04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
139975640
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
hEGF
EGF_2
EGF_PEAR1L
EGF_TEN
EGF_Teneurin
EGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139975640
NCBI-ProteinID:
XP_071839820
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(6823139..6914872)
Genome browser
AA seq
1604 aa
AA seq
DB search
MSTHIFLLVICSVLIQFEASLGQYSSRDTHGSSYNRYSGTEQYQYGGNRVSLQNQNDELG
DGMPNTCPYQEEQMVATRQPCVRSYIKTVKIWRPDCGYTRRWCVGYERRTAYYTTYRLVY
ERQYVTKYKCCHGWSRMNGEQGCMYPTCSVGVCFNGGSCNGGYSQMCRCPPGFQGPRCQY
DTNECLFSNGGCQGRCCNTIGSFYCKCEEGFELSADGVTCLDIDECRHNNGGCQRICDNT
HGGYSCACPTGEKLHIDDRTCIPEDGCEVDNGGCHHQCVSYSQGRYACQCHTGFRLNDDG
KTCRRYNPCALRNGGCQHICTNSMDTAICTCRHGYELSNDFQSCVDIDECATPGSCQQNC
LNTEGSFRCSCNSSYTLTEDGRSCRDRYTIGIDIFDICRSETCGGLGDCVVVNGTGICQC
LEGYQVADYNPLLCVDINECEGANCCEDGHKCLNMIGSYRCTCNSGFIQTPDGCGCKDID
ECAADDYGQCAQYCLNTVGGHTCYCEKGFINLNNGRVCQQAPTIQFEASPAPPFNFPNNN
DQRAALSEGNSSLICGEGTFGPRCQYDCDSCMRGGICNDENNGCICPSGWTGLLCNETCP
ARFYGIDCEQECPCQNGGTCDPETGDCTCPPGVSGDFCEDGCPPGHFGRSCKKSCQCPTG
IPCTKRFGICLCQPGYFGGQCEQPCPRFFYGAGCRQNCDCHATNSNGCDPVDGTCLCNPG
FEGDRCQDECPLGHYGEECRHICQCQDANACNKVTGECSLECPAGYTGEACERPCGMRKY
GVNCKFTCHCGGQDCNSISGECFCEAGTMGQDCAEECPVDTWGVNCVNNCTCADHEICEK
SNGQCLCPRGFFGDECSQACAHGRWGSNCRHTCICQNGGICDPENGDCACAPGWRGLRCT
TECAVGTYGQDCGLQCDCENSAGCDSETGECICADGWSGPRCESKCPRGLYGRNCENVCM
CRNNATCDHISGACTCAPGWTGTICNKACPDGFFGYECQHRCDCGNGQQCSPTNGACACR
PGFTGFSCQQECPVGTWGEDCRMSCECANGATCDSVSGQCICASGWTGRRCNQACLPGFF
GAGCTQTCSCLLHAECDHITGECDCPAGYWGRTCEKECNAGFYGPGCQQICDCMNGGVCE
RFNGTCQCRPGYSGDRCEDTCPRDFFGEGCMQRCLCQNGADCDSISGICICPPGWKGAQC
NKPCLAGYYGEDCQEICYCGVGNPCNHVTGDCVCPVGYTGTECSEACPEGTWGQDCTESC
SCGANQVCSPITGECSCRPGYRGRHCSRDCHEGSYGPNCLQECQCENGGTCNHNDGSCSC
TDGYIGSLCELSCPEGTYGRNCAERCECQNGGSCHNITGECTCPAGYTGPKCERGCQEGR
FGEYCQSVKDCLNGGILDPVTGRCQCPMGWMGNMCDQECSSDQYGPNCELSCQCLNGGRC
DRYTGCCECSDGYYGHNCQFTCPQGSYGPYCAEKCDCHRDAQCDPVTGQCRCPAGRTGPE
CKQTCPTGFFGSNCFQLCDCANMTQCNPATGVCECPPGLTGETCQTECPEGKFGPDCSLN
CDCLNGASCDSVTGSCLCVNGHFGARCQLNSLSERLRGDLAGNF
NT seq
4815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgacgcatatctttttgttggtcatctgttcggtgcttattcagttcgaagccagt
ttgggtcagtactcttcgagggacacacacggttctagctacaatcgttatagcggcact
gagcagtatcagtatgggggcaaccgtgtcagccttcaaaaccaaaatgatgaactcggg
gacggaatgccaaacacttgcccttatcaggaggaacaaatggtggcaacaagacaacct
tgtgtacgatcctacatcaagactgtgaagatctggagaccagactgtggttataccaga
agatggtgtgttggatatgaaagacggactgcttactataccacctacagacttgtgtat
gagaggcagtacgttaccaaatacaagtgttgccatggctggtccaggatgaacggagaa
caaggatgcatgtatccaacttgcagtgttggagtctgtttcaatggaggatcttgtaat
gggggctactcacaaatgtgcagatgtccacctggcttccagggacctagatgtcaatat
gatactaatgaatgtttattcagcaatggtggatgccagggaagatgctgtaacaccatt
ggcagcttctactgtaaatgcgaagagggatttgaactctcagcagacggtgttacgtgt
ttagatattgacgaatgccgccataataatggtggatgtcaaagaatatgtgacaatacc
catggcggatactcctgtgcatgtccaacaggagagaaattacacatcgatgaccggaca
tgtatacctgaagatggatgtgaagtcgataatggtggttgtcatcaccagtgtgtttct
tattctcaagggaggtatgcctgtcagtgccacactggattcagattgaatgatgatggt
aaaacttgcagaaggtacaatccttgtgcgttgcgtaatggaggttgccagcacatttgc
accaatagcatggatactgctatatgcacgtgtagacatggctatgaactgtctaatgac
ttccaaagttgtgttgatattgatgaatgtgcaacgccaggaagttgccaacagaactgt
ctgaacacagaaggatcattccgttgcagttgtaattcatcatacaccctcacagaggat
gggagaagttgcagagacaggtacaccattggcattgatatatttgatatatgtcgctct
gagacatgtggcgggcttggcgattgtgtggtggtgaatggtaccgggatctgtcaatgc
ctagaaggctaccaggttgcagactataatccccttctctgtgttgatatcaacgaatgt
gagggcgctaattgctgcgaggatgggcataagtgtttgaacatgattggttcatacagg
tgcacatgtaacagtgggttcatacagacccctgacggctgtggctgtaaggatattgat
gaatgcgctgccgatgactatggtcaatgcgctcagtattgtctcaatacggttggagga
catacatgttactgtgaaaaaggcttcataaatcttaataatggaagagtttgtcaacag
gcacctacaatccagtttgaagcatcgcccgcaccaccttttaatttccctaacaacaat
gaccaacgggctgcactcagtgaaggaaattctagtttgatctgtggcgagggcactttc
gggccacggtgccagtatgactgtgacagttgcatgagaggaggcatctgtaatgatgaa
aataatggctgcatttgcccatctggttggactggacttctctgtaatgaaacctgtcca
gcaagattctatggcattgactgtgagcaggaatgtccatgtcagaatggtggtacatgt
gacccagagacaggtgattgcacctgcccccctggggtatcaggtgacttctgtgaagat
ggttgccctcctggtcactttggtcgaagctgtaaaaaatcttgccagtgtccaacaggc
attccttgtaccaagaggtttggaatctgcctatgtcagccaggatactttggaggacag
tgtgaacaaccatgtcccaggtttttctatggtgcaggctgcaggcagaactgtgactgt
cacgccactaattccaatggctgtgaccctgtcgacggtacctgcttgtgtaacccgggg
tttgaaggagataggtgtcaagatgaatgccccctcggtcattacggtgaagagtgcaga
catatttgccagtgtcaggatgccaatgcttgtaacaaagtaaccggtgaatgtagcctg
gagtgccctgcaggatacacaggagaagcatgtgaaagaccttgcggaatgcgaaagtac
ggagtgaactgtaagttcacttgtcactgcgggggtcaggattgtaacagtatctcaggc
gagtgcttctgtgaggcaggtacaatgggacaagactgtgccgaggaatgtccagttgat
acatggggtgtcaactgtgtcaataattgcacatgcgccgaccacgagatttgtgaaaag
tccaacggtcagtgtctgtgtccccgtggcttctttggagacgaatgttcacaggcctgc
gctcacggcagatgggggagtaactgtcgccatacttgtatctgtcagaacggtggtatt
tgtgaccctgagaatggtgactgtgcttgtgcaccaggatggagagggctcagatgtaca
actgaatgtgctgtgggtacttacggtcaagattgtggtcttcaatgtgactgtgaaaac
agcgcaggctgtgattcagaaacaggggagtgtatctgtgctgatggatggagtggaccg
agatgtgaaagcaaatgtcctcgtggattgtacggtcgtaactgtgagaatgtctgtatg
tgcagaaacaatgctacatgtgatcatatcagtggtgcatgcacctgtgctcctggctgg
accggaactatctgtaacaaagcttgtccagatggtttctttggatacgaatgtcagcac
agatgtgattgtgggaacggtcagcagtgtagccctactaatggagcatgtgcctgtcgt
cctggcttcactggattcagctgtcaacaagaatgtccagtcggtacctggggtgaagac
tgtagaatgagttgtgaatgtgccaacggtgcaacatgtgactctgttagcggtcagtgt
atctgtgcgtccggctggactgggcgtcgatgcaaccaagcttgcttgccagggtttttt
ggtgccggttgcacccaaacatgtagctgtctactgcatgcagagtgtgaccacatcaca
ggagaatgtgattgccccgctggctactggggaaggacttgtgagaaagaatgcaatgct
ggtttttacggtccagggtgtcaacagatctgtgattgtatgaacggaggtgtttgcgag
agatttaacggaacatgtcagtgcagacctggctatagtggagaccggtgtgaagacacc
tgtcctagagatttctttggtgagggatgtatgcagagatgtctatgtcagaacggagct
gattgtgactctatcagtggaatctgtatctgtcctcctggatggaagggtgcacagtgt
aataaaccctgtttggcaggttactatggtgaagactgtcaagagatttgttactgtggt
gtcggtaacccttgcaatcatgtgaccggtgattgcgtatgtccagtgggctacacaggg
acagagtgcagtgaggcttgtcctgagggtacctggggtcaagattgtacagagagctgt
tcttgtggggctaatcaggtctgcagtccgattactggtgaatgttcgtgtcgccctggt
taccgggggagacactgcagcagagattgtcatgaaggctcttatggacctaactgcctt
caagaatgccaatgtgagaatggaggtacttgtaatcataatgatggttcctgttcctgc
acagatggctatatcggaagcctttgtgaattatcatgcccagagggaacctatggacga
aactgtgccgagagatgcgaatgtcaaaatggtggttcttgccataacatcacaggagag
tgtacatgtccagcagggtatactggtcctaagtgtgaaagaggatgccaagaaggaaga
tttggtgaatactgtcaaagtgtgaaagactgcttgaatggaggtatattggatccagtg
actggacgatgccagtgtcccatgggatggatgggcaacatgtgtgaccaagaatgttcc
tctgatcagtatgggccaaactgtgagctctcctgtcagtgtctaaatggaggccgttgt
gacagatatactggatgctgtgaatgcagtgatggttattacggacacaactgtcaattt
acttgccctcaagggtcatacggtccttactgtgcggagaagtgtgactgtcacagagac
gcacagtgtgaccctgtcacgggtcagtgtagatgtccagctgggaggacgggaccagag
tgcaaacagacatgtcctactggattctttggatccaactgttttcaactatgtgactgt
gctaatatgacgcagtgcaacccagctacgggtgtgtgtgaatgtcccccaggtttaact
ggagagacatgccaaacagaatgtccagaaggcaagtttggaccagactgctctctaaac
tgtgactgtttaaatggagcatcatgtgattcagtgacagggtcttgtctctgtgtaaat
ggacactttggagccaggtgtcaactaaattctctcagtgaaaggctacgaggagatctt
gcaggaaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
