Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber): 139977180
Help
Entry
139977180 CDS
T10891
Name
(RefSeq) scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein DMBT1-like isoform X1
KO
K13912
deleted in malignant brain tumors 1 protein
Organism
ajj Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SRCR
SRCR_2
Hepsin-SRCR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139977180
NCBI-ProteinID:
XP_071842522
LinkDB
All DBs
Position
2:9424057..9478571
Genome browser
AA seq
1120 aa
AA seq
DB search
MTTRWFNSSSAGLVILGFLLICISACLAQENGDIRLVDGEEHTEGRVEVYQSGVWGTVCD
DGWTIQEAEVVCYQLGFGPAAASLTNAHFGKGTGPVLMDDVQCSGQEERLADCVFRDVGH
NCGHEEDASVICTYVTLFSSTAPTSALRLAGGKSSAGRVEIFVNGQWGTVCDDGWDISQA
TVVCRHLGFQRATAALAYAAFGEGTGPIQSDYTNCIGNETDFLQCQFQSDGFCGHFEDAS
VVCYNPEKGSEERSIRLAGGNETAGRVEIYLNGEWGTVCDDAWDINDANVVCNQLGFAGA
LDYLGSAAFGEGTGEIHLDDVGCNGEETELLSCNYNSIDNCNHYEDASVICQLTLKEPTP
EEGSIRLAGGNETAGRVEIYLNGEWGTVCDDEWDIHDAHVVCHELGFPGALGYRTGASFG
EGTGEIYLDDVGCGGEETELLSCYYNSIDNCNHGEDAGVICELTLNETTPEEGSIRLAGG
NETAGRVEIFLNRKWGTVCDDGWDIHDADVVCNQLGFFWALDFFMSAAFGEGTGEIHLDD
VRCGGEETELLSCYHNNIDDCNHGEDAGVSCQFTSKDPMPEEGSVRLAGGNETAGRVEIF
LNREWGTVCDDDWDINDANVVCYQLGYVRALDYRGSAAFGEGTGEIHLDDVRCDGEEAKL
LRCYYKNYDNCNHGEDAGVICQLTSDEHTPEEGSIRLAGGIETAGRVEIFLKREWGTVCD
DAWDINDAKVVCNQLGFARALESRGSAAFGEGTGKIHLDDVGCGGEETELLSCYYNSFDN
CNHGEDASVICQLTSDEPTPEEGSIRLAGGNETAGRVEIYLNGEWGTVCDDAWDINDANV
VCNQLGFVRSLESRGSAAFGEGTGEIHLDDVGCGGEETELLSCYFNSIDNCNHGEDASVI
CQFTSDEPAPEEGSIRLAGGNETAGRVEIYLNGEWGTVCDDEWDINDANVVCNQLGLIRA
LESRGSAAFGEGTGKIHLDDVGCGGEETELLSCYYRRIDNCNHAEDASVICQLTSGELRL
ADEGAYNEGMLLVNLNGQWGTVCDDGFTEGNGNIACKQLGFDGVVSFSDSGGGEISLPIN
MDDVACIGREERLIDCPHTTTSNCIHNEDVRLVCSALSLT
NT seq
3363 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgacacggtggttcaattcgtcttcggctgggttagtaatcttaggattccttctc
atctgcatctcagcctgtctcgcccaagaaaacggagatattcgtttagtggatggtgaa
gaacacacggaaggccgtgtagaggtctaccagagtggagtgtggggtacagtatgtgat
gatggttggacaatccaggaagcagaagtggtctgctaccaactggggtttggaccagca
gctgcttctcttacaaacgcccattttggtaaaggcaccggcccagttctaatggacgat
gtacaatgtagtggccaagaagaaagattggcagattgtgtcttccgtgatgttggacat
aactgtggtcatgaagaagatgctagcgtgatctgtacttatgtcactttgttcagttca
acggccccaacgtctgcacttcggttagctggcggcaagagctctgcaggtcgagtggaa
atttttgttaatggtcagtggggtacagtgtgcgatgatggttgggatataagtcaggca
acagtcgtctgtcgccatcttggattccaaagagccactgcagccctggcatatgcagcc
tttggcgaaggcacaggccccatacagtcagattacacaaattgcattggcaatgaaact
gacttcttgcaatgccagttccagtctgatggtttctgcggtcatttcgaagatgccagt
gtagtctgttataatcctgaaaaaggctcagaggaacgttccattcgtcttgctggaggt
aatgagacagctggacgtgttgagatctacctaaatggagaatggggcactgtctgtgat
gatgcatgggacattaatgatgctaatgtagtatgcaatcagttaggcttcgctggggcc
cttgattatcttggtagtgctgcgtttggtgagggaacaggagaaatccatctggatgat
gttggttgcaatggcgaagaaactgaattgttgagctgtaattataatagcatcgacaat
tgtaatcattatgaagatgcaagtgttatctgtcaactcactttaaaggaacctacacca
gaggaaggttccattcgtcttgctggaggtaatgagacagctggacgtgttgagatctac
ttaaatggagaatggggcactgtctgtgatgatgaatgggacattcatgatgctcatgtt
gtttgccatgagttaggattccctggggcattaggttatcgtactggtgcttcatttggt
gagggaacaggagaaatctatctggatgatgttggatgcggtggcgaagaaactgaattg
ttgagctgttattataatagcattgacaattgtaatcatggtgaagatgctggtgtcatc
tgtgaactcactttaaacgaaactacaccagaggaaggttccattcgtcttgctggaggt
aatgagacagctggacgtgttgagatcttcctaaatagaaaatggggcactgtctgtgat
gatggatgggacattcatgatgctgatgtagtttgcaatcagttaggcttcttttgggcc
cttgatttttttatgagcgctgcatttggtgaaggcacaggagaaatccatctggatgat
gttagatgcggtggcgaagaaactgaattgttgagctgttatcataataacatcgacgat
tgcaatcatggtgaagatgctggtgttagctgtcaattcacttcaaaggatcctatgcca
gaggaaggttccgttcgtcttgctggaggtaatgagacagctggacgtgttgagatcttc
ctaaatagagaatggggcactgtctgtgatgatgattgggacattaatgatgctaatgtt
gtttgctatcagttaggctacgttcgggcccttgattatcgtggtagtgctgcgtttggt
gagggaacaggagaaatccatttggatgatgttagatgcgatggcgaagaagctaaattg
ttgaggtgttattataaaaactacgacaattgtaatcatggtgaagatgctggtgttatc
tgtcaactcacttcagacgaacatacgccagaggaaggttccattcgtcttgctggaggc
atcgagacagctggacgtgttgagatcttcctaaagagagaatggggcactgtctgtgat
gatgcatgggacattaatgatgctaaagttgtttgcaatcagttaggcttcgctcgggcc
cttgaatctcgtggaagtgctgcgtttggtgagggaacaggaaaaattcatctggatgat
gttggatgcggtggcgaagagactgaattgttgagctgttattataatagcttcgacaat
tgtaatcatggtgaagatgcaagtgttatctgtcaactcacttcagacgaacctacgcca
gaggaaggttccattcgtcttgctggaggtaatgagacagctggacgtgttgagatctac
ctaaatggagaatggggcactgtctgtgatgatgcatgggacattaatgatgctaatgta
gtatgcaatcagttaggcttcgttcggtcccttgagtctcgtggaagtgctgcgtttggt
gagggaacaggagaaatccatcttgatgatgttggatgcggtggcgaagaaactgaattg
ttgagctgttattttaatagcatcgacaattgtaatcatggtgaagatgcaagtgttatc
tgtcaattcacttcagacgaacctgcgccagaggaaggttccattcgtcttgctggaggt
aatgagacagctggacgtgttgagatctacctaaatggagaatggggcactgtctgtgat
gatgaatgggacattaatgatgctaatgtagtttgcaatcaattaggcctcattcgggcc
cttgagtctcgtggaagtgctgcgtttggtgagggtacaggaaaaatccatcttgatgat
gttggatgcggtggtgaagaaactgaattgttgagctgttattatagaagaatcgacaat
tgtaatcatgctgaagatgcaagtgttatctgtcaactcacttcaggcgaactgcgactg
gcagatgaaggagcctacaacgagggaatgctattagtgaacctcaatggacagtgggga
accgtctgcgatgacggtttcacagagggaaatggcaacattgcctgtaagcagcttggg
tttgatggagtagtctcatttagcgacagtggagggggagaaatatctctcccaatcaac
atggacgatgtagcatgcatcggacgggaggaaagactgatagattgcccgcacactacc
acatctaattgcatacataatgaagatgtgaggctggtctgttctgcactcagtctgaca
tga
DBGET
integrated database retrieval system