Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber): 139978259
Help
Entry
139978259 CDS
T10891
Name
(RefSeq) fibrillin-3-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ajj Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber)
Pathway
ajj04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ajj00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
139978259
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ajj00536
]
139978259
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ajj00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
139978259
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139978259
NCBI-ProteinID:
XP_071844386
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(25068027..25148387)
Genome browser
AA seq
3120 aa
AA seq
DB search
MAPFRGRLFTFISLCVLSAVNAQQHNTQYRQLRGPNVCGPKFYSYCCPGWTRHERFNTCS
VPICSSNCQGGYCVRPNSCYCQGGEISARGCGQDTLSSGPTGQLPPIQQCYQQCLNGGTC
QGASCSCSQGYQGNNCNEVVCTPACQNGGRCIGGNRCSCPYGFVGPACETDYRTGPCFTV
MDNQQCEGIISGLICTKAMCCATVGHGWGSPCESCDTFDNPCERGYFVDARTLQCRDADE
CQQVPGLCKGGECVNTIGSYTCTCPVGYRLNVLNQRCQDIDECSENVALCDHGVCINREG
GFRCECDSGYSFDSSLSICSNDEMPPITTPFTCPGGYSLNSDGTGCIKTGPGPGGDCPDG
QSIQINDDGSRICIRSTSPCPSGYSLSADGQGCVPPIFTDCRVGYIPQNDGCVKLRLGEC
PPGFMILNDGVSCRDVNNRVVCPVGYRLSRNGRMCTQSRIGDCDPGQAKNEFGQCSSVNR
GHCPEGYVLASDSITCFHSVTGVIFCPSGYEIGRNRDSCVPDNSQGCPSGYYPTQAGNCI
PYQPGFCPDEFNLQPDRFTCLTISGRVFCPQGFVRNEDGTACVQLTPPTSISEEEGHCYM
RYRNSRQPACSRRLGDQLTFVQCCCDWRMQAWGSTLDSCDPCPTGELLDRICEDDPITDA
PPMSICTANPGICPNGQCVPEGDVGFQCLCDEGYQRVGRQNCVDRDECQDPTFCTNGMCR
NTEGSFICTCRRGYQLSQDRRNCNDIDECEEDVETCMHGLCFNTDGSFMCDCFEGYKLSL
DERHCYDIDECQGNRMCRNGRCTNTEGSYECICHDGYELSDENLCEDKNECLDLACGPGT
CENLIGSYRCTCPTGFVEIDGTCVEKARAFCHINSREGRCTTQSSMPVTISQCCCSAVAV
EKSLSWGPACEPCPSQGSQMFERLCSQGPGRDSFGLNINECLTFATLCENGMCEDLTGNY
RCSCNSGFRLSDQGKSCRDDNECAINRLLCNGGNCRNTPGSYACECSDGYRFEAASSSCR
DIDECLETPCVGGRCINTQGGFRCECLMPGMTLDESLTICEDNRIGVCWTAIRGGRCEAN
IMGVMRRDACCATFGRAWGSPCEPCPSSNPCLPGYIPQVGGCVDINECEINPMLCTNGAC
VNADGSYQCICDNGLTLDTSGTMCVDVQSYKCYLDYAEGECYEPIAGIYRKSVCCCAMGW
AYGHGTDCSPCPERDTPEWDELCPRGDGFADTREMVEIMDGSIIVEDINECIIFEDACTN
GDCINQIGYFECECEMGYALEYEYSCVDIDECSILTGVCGNGTCENRPGTFHCNCFEGFQ
SFSIMMPTCEDVNECETMPNICRGGFCQNTHGSFICICPRGQELTPDGMACRDVDECSSI
RGICSNGECNNMLGTYRCMCDEGFRPTANFLACEDMNECDMHKGGCDQICVNTIGSFHCE
CDDGYSLMGDSTTCRDKDECTENPLICGGGTCNNEIGGYRCSCDEGYTPSSDFKMCIDVN
ECIQNQFICIYGACENVPGGFICSCDFGFSEKNGEPGCTDDDECTMNIHECAINTVCKNT
EGSFECECAPGFIKDGEGCVDVDECESLTDDCDINAQCVNTDGSYQCQCLEGFIGDGRDC
QDFDECMHNQNLCQNGQCLNSPGTYHCDCDVGFIGNEDRDRCDDIDECDQFSNICIFGEC
MNLPGGFRCICDSGYALDDQGANCTDVDECENTDVYCRNGNCTNEMGSYTCECPEHYTLS
AGGTRCYDLRPGKCYTKVMDSDRGDTGSMCVGILSMDTSRFKCCCLVGQGWGDPCMPCPE
NNTTEYFQLCPDGPKIVPDGPDKPGGPDGGRPDGGGPDGGRPDGGRPDGGGPDGGGPDGG
GPDGGGPDGGRPDGGPDNGNGDQNECEIFPQLCNGGDCINTIGSYKCICPDGFELNNDFL
GCVDINECERSQYICGAGECMNLVGNYSCLCPTGFMFMETVFGRNCMDIRQMHCYVSINE
TEDGSECQNAIPSLMTRKQCCCSGIQGAGWGDPCNPCATPDTNEYYTICHSQGRGNQGLT
GMPVDINECEIDGICVNGVCMNEDGSFHCACSLGYSYNPQIIGCEDVDECARGLDRCMGR
AFCVNVPGNHYCDCPDGYKLTRSGISCTDIDECVEEFDVCGNGQCSNKMGGYDCACERGF
ERSDDGSTCVDINECDFAFGVCGNGTCINTVGSHECSCHYGFERSDSGVCQDIDECNTLM
GRCPNGACVNTIGSFFCDCMVGYSPQGPSMACVDMDECVDIPGICENGFCKNFIGGYRCV
CDDGFEVGAVDGNYGEYCIDIDECLEINNLCLSGDCINLEGSFRCNCRPGYILSDDGLSC
IDMRRAPCFELFLANQCSSSRSNNLTLLECCCTRGAGWGFPCQICPEEGTAAFDAMCPHG
IGYIPSRSPNVYSDIDECKMFPSECIDGDCINTDGSFRCECGQGRRLDQTGKICQNINEC
IEQPNLCGRNSSCVDTIGSFQCICGEGFQTGRGGRCEDINECRRSRNLCAFRCQNLPGSF
RCTCPRGFALTEDGRLCRDFDECESGENNCRYGCRNLIGKFMCVCHEGYQAVGGDGNICR
DVDECSIRHNLCDNGICMNTPGSFQCVCNSGFVASPEGNACVDQRRGTCYGVLHHGLCQD
PVERVPSITVGQCCCNGFKAWGNDCETCPIFGTSEYLNLCRTPVSPTIDICASVVGLCSN
GLCLSDNGGFICQCNPGYLISRDGTTCEDKNECDSNMCSHDCRNTPGSFKCLCPHGYVLS
HNMVTCEDLDECLLDLHSCQHRCENTVGGFQCVCRDGHLQVGMACPDGDECREDPSLCGP
YGTCQNTPGGYRCECQRYFRPDESGTMCVDIDECQEQPHRCQYECKNTLAGFTCGCPDGY
VQNYWGQCGDQNECASQGVCGDALCFNTQGSYQCSCQSGFSLDQQSMSCNDIDECSGYGG
YGGFSNPCQNECQNHAGSFTCGCPTGYYSLSQGSCFSTLGQDSEVPCYHCHQTRRRRDVS
ETEGALPGVIANNTAILIRVPLQKATSHSKLLKLTTGFAKSIGFFKYQIIYSNQDGVFNV
DERKEGRAVLRFSEPVTEPGIFSVEIEGQIVEREEVLAEDETNTILTEPLALLVEVEVYE
NT seq
9363 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgcctttcaggggaaggctttttacttttatatcgctatgtgtccttagtgctgta
aatgcccagcagcataacacgcagtacagacaattgagaggaccaaatgtgtgtggacca
aaattctattcatactgctgcccaggttggacgaggcacgaaagattcaacacgtgttca
gttcccatttgcagtagtaactgccaaggtggttactgtgtaagaccaaactcatgttat
tgtcaagggggtgaaatatctgcacgagggtgcggccaagatactctcagttcaggacct
acaggccagttgccgccaatccagcaatgctaccaacagtgccttaatggaggaacctgt
caaggagcatcttgttcgtgttctcaaggttatcaaggaaataactgtaatgaagtggta
tgtacacccgcatgccaaaatggaggcagatgtattggtggaaacaggtgctcctgccca
tatgggtttgttggaccagcttgtgagacagattacaggactggtccttgcttcactgtc
atggataatcaacagtgtgaagggatcatctctgggttaatctgtaccaaagctatgtgc
tgtgccactgtcggtcacggctggggaagtccatgcgaatcctgtgataccttcgacaac
ccatgtgagcgtggttactttgtagacgctaggactcttcagtgcagagatgctgatgaa
tgtcaacaagtcccaggactctgcaaaggaggtgaatgtgtcaacaccattggatcctac
acttgcacatgtccagtaggatacagactaaatgtcttaaaccagagatgccaagatatt
gatgaatgctcggagaatgtcgccctctgtgatcatggtgtctgcataaaccgcgaagga
ggcttcaggtgtgaatgcgactctggttacagctttgattccagcctcagcatctgttcg
aatgatgagatgcctccgatcaccacgccgtttacgtgtccaggcgggtacagcttgaat
agtgacggtacaggttgcatcaagactgggcctggcccaggaggagactgcccagatggt
caatccattcaaatcaatgatgatggcagtcgtatctgtatcagatcaacgtccccgtgt
ccaagtggctacagcctcagtgcagacggtcaaggttgtgtgcctccaatcttcaccgat
tgtcgagtcggttacatcccacaaaacgatggctgtgttaagcttcgactaggcgaatgt
ccgccgggattcatgatactcaatgacggtgtttcgtgtcgggatgtcaacaacagggtg
gtatgccccgtggggtacaggctcagccgcaacggcagaatgtgtacgcagtccaggatc
ggagattgcgatccaggccaagccaaaaatgaatttggccaatgttcatcggttaacaga
ggacattgccccgaaggttacgttctagctagcgatagcatcacttgctttcacagcgtc
actggggtcatattctgtccgtcgggatatgaaatagggagaaacagagattcgtgcgtt
cccgataattctcaaggctgtccgtccggttactaccccacccaagcaggaaattgcatt
ccttaccagccaggattctgcccagatgaatttaatcttcagccagataggttcacctgt
cttacaatttctggtcgtgtcttttgcccacaaggctttgtacgcaatgaggatggtact
gcgtgtgtgcagctaactcctccaacctctatcagtgaggaggagggtcactgttacatg
agataccgtaacagtcgacagccggcttgcagcagaagacttggtgaccagctgaccttt
gtgcagtgttgctgtgattggagaatgcaggcttggggttcaactctggattcatgtgac
ccctgtccaacaggagagctgcttgataggatctgtgaggatgatcccatcacagatgct
cctcccatgtcaatctgtacagccaatccaggaatctgtcccaatggccagtgtgtcccc
gagggagacgtaggcttccaatgcttatgtgatgaagggtatcaaagagtaggcagacaa
aactgcgtagacagggacgaatgtcaggatcctactttctgtaccaacgggatgtgtagg
aacaccgaaggtagctttatctgcacctgcaggcgaggatatcaacttagtcaagacagg
aggaattgcaatgatattgatgaatgtgaggaggacgttgagacctgcatgcacggtctc
tgttttaacacagacggttctttcatgtgtgactgctttgagggttacaaactttcacta
gatgagcgacactgctatgatattgatgagtgtcagggtaacaggatgtgtaggaacggg
agatgtaccaacaccgaaggcagctatgaatgcatatgtcacgatggatatgaactatca
gacgaaaacctctgtgaagataagaacgaatgcctggatctagcatgcggcccaggaaca
tgtgaaaatctgataggatcttatcgctgcacttgtcctaccggctttgttgaaattgat
ggaacttgcgttgagaaggccagagcattttgccacatcaacagtcgagagggtcgttgt
accacccagtccagcatgcctgtcaccatatcgcagtgttgttgtagtgcagttgccgta
gagaagtccctctcgtggggtcctgcttgtgagccttgcccatcccagggatcgcagatg
tttgagagactttgctcccaaggtcctggaagggatagttttggattaaatattaatgaa
tgtctgacctttgcaactctctgtgagaacggtatgtgcgaggatcttactggcaattac
agatgtagttgtaatagtggcttcaggttatcagaccaaggcaaatcatgtagagatgac
aacgagtgtgccataaacagattgctgtgtaacggtggtaactgccggaacactcccggt
agctacgcctgtgaatgttccgatggttacaggtttgaagctgcgtcgtcatcctgcaga
gatattgatgaatgcctggagactccatgtgttggtggcagatgcatcaatacccagggt
ggtttcagatgtgaatgtcttatgcctggtatgactcttgatgagtctctgacaatctgt
gaagataaccgtatcggtgtttgctggacggctatcagaggaggtcgttgtgaagctaac
atcatgggagtgatgcgtcgtgatgcctgctgtgccacctttgggcgcgcctggggatct
ccctgtgagccctgcccgagctccaatccttgcctccccggatacataccgcaagttggc
ggctgtgtggacattaacgagtgcgagatcaaccctatgctgtgtactaacggtgcgtgt
gtcaatgctgatgggtcctaccagtgtatctgtgacaatggactaactttggacacttct
gggaccatgtgtgtggacgttcaatcctacaagtgttatctggactatgccgagggagag
tgctacgagcctatcgcaggaatttaccgtaaatccgtctgttgctgtgctatgggttgg
gcctatggtcatggaaccgactgcagcccgtgcccagaaagagacactcctgaatgggat
gaactctgccctagaggagacggttttgctgataccagggaaatggtagagatcatggat
ggctcgattattgtcgaagatatcaatgaatgtatcatcttcgaggacgcctgtaccaac
ggcgattgcatcaaccaaatcggatacttcgagtgcgagtgtgaaatgggctacgcattg
gagtatgagtacagctgtgttgatatcgacgagtgctccatcctgaccggagtctgcggt
aacggaacatgtgaaaaccgacccgggactttccactgtaactgctttgaaggttttcaa
tctttcagcataatgatgcccacatgtgaagatgtcaacgaatgtgaaaccatgcctaac
atctgtagaggaggcttctgtcagaacacgcacggtagtttcatctgtatctgtcctcga
ggacaagagcttacgccggacggaatggcctgcagagatgtggatgaatgttccagtatc
cggggtatctgctccaacggggaatgtaacaacatgctcggtacttaccgatgcatgtgc
gacgaaggcttcagaccaacagcaaacttccttgcttgtgaagatatgaatgagtgcgac
atgcacaagggtggctgcgaccagatctgtgttaacaccattggcagcttccactgtgaa
tgtgacgacggctactcattgatgggtgacagtaccacttgcagagataaggatgagtgt
acagagaatccattaatctgtggaggaggtacctgcaacaatgaaatcggtggctataga
tgttcctgcgatgagggatacactccttcctctgacttcaagatgtgcattgatgtcaac
gaatgcatccagaaccagttcatctgcatctatggtgcttgtgagaatgttccaggcggt
ttcatctgctcttgcgattttggattttcagagaagaatggagaacccggttgcacagat
gatgatgagtgtactatgaatattcatgaatgtgcaatcaacactgtttgtaagaacact
gagggcagcttcgaatgtgagtgtgcccctggatttatcaaagatggagagggatgtgtt
gatgttgatgaatgtgagagtctgacggacgactgtgatatcaatgctcagtgtgtgaac
acagatggatcttatcaatgtcagtgtctggaaggattcattggagatggcagagactgc
caagattttgatgagtgcatgcataaccagaatctctgtcagaacggccagtgtctcaac
agcccgggaacatatcactgtgactgtgacgttggattcatcggaaacgaggaccgtgac
agatgtgatgatatcgatgaatgtgatcagtttagcaacatatgtatcttcggcgagtgc
atgaatttacccggaggcttccgctgcatctgtgattctggatacgccctcgatgatcag
ggagccaactgcaccgatgtggatgagtgtgagaatactgatgtttattgccgtaatggc
aactgcaccaacgagatgggaagctacacctgtgaatgcccggaacactacacattatct
gctggaggtacaagatgctatgacttgaggcctggcaagtgttacactaaagtgatggac
tctgaccggggtgatactggttccatgtgtgtgggtattctcagcatggacacttctcgc
ttcaagtgctgctgtctggtaggccaaggatggggtgatccttgtatgccttgtcccgag
aacaacacaactgagtactttcaactttgccctgatggtcctaaaattgtacctgatgga
cctgataaacctggtggaccggacggtggtagaccggacggtggcggaccggacggtggc
cgaccggacggcggccgaccggacggtggcggaccggacggtggcggaccggatggtggc
ggaccggacggtggtggaccggatggtggcagaccggacggtgggccagataatggaaat
ggtgaccagaatgagtgtgagatcttcccacagctctgtaacggtggtgattgtataaat
acaattggaagttacaagtgcatctgccctgatggatttgaactgaacaatgatttcctt
ggatgtgttgacattaacgagtgtgaacgttcccagtacatctgtggtgcaggggagtgt
atgaatctggttggtaattactcctgtctctgtcccactggatttatgttcatggaaacg
gtctttggacgtaactgcatggatatcagacagatgcactgttatgtctcaatcaatgaa
actgaggatggcagtgaatgccagaatgctattccttccctgatgacccggaaacagtgt
tgttgcagtggtatccagggtgccggatggggagacccatgtaacccctgtgcaacacct
gacacaaatgagtactacacaatatgtcactcccagggtagaggaaatcagggactcact
ggtatgccagttgatatcaacgagtgtgagatagatgggatttgtgttaacggtgtctgc
atgaacgaagacggaagcttccactgtgcttgcagtttgggatacagctacaacccacag
atcattggctgtgaagatgttgacgagtgtgcccgtggcctggaccggtgcatgggaaga
gctttctgtgtcaatgttcccggaaaccattactgtgattgtccagatggctacaaactg
accaggagtggcatttcatgtacagatatcgatgaatgtgtagaagaatttgatgtctgt
ggaaatggacaatgttcgaataaaatgggagggtatgactgtgcttgcgagagaggcttt
gaacgcagcgatgacggtagcacttgtgtcgatatcaacgagtgtgattttgcgtttggt
gtctgcggtaacggaacctgcattaacaccgtagggtcacacgaatgttcctgtcactac
ggatttgaacggtcagacagtggagtttgccaagatattgatgaatgcaatacgctcatg
ggccgatgtcctaatggtgcttgtgtgaacaccatcggttccttcttttgcgattgcatg
gttggatattcaccccaaggaccaagcatggcttgcgtggatatggacgagtgtgtcgat
atcccagggatctgtgagaacggtttctgcaagaatttcatcggcggttacagatgcgtc
tgtgatgatggctttgaggtgggtgccgtggatggtaactacggagaatactgtatcgac
atcgacgagtgcctggagataaacaatctctgtttgagcggtgattgcatcaacctagaa
ggaagtttccgttgtaattgccgaccaggttacatcctctccgacgatggactctcctgc
attgatatgaggcgagctccatgctttgagctctttttggccaaccagtgttcgagcagc
cggagcaacaacctcaccctgcttgaatgctgctgcactcgaggtgccgggtggggattc
ccctgtcaaatctgccctgaggaaggaacagctgcctttgatgccatgtgcccccatggt
attggctacatacccagtagatcccccaacgtctactctgacatcgatgagtgtaaaatg
ttcccatcagagtgcatagacggcgattgcatcaatacagacggttctttcaggtgcgag
tgtggacaaggtcgccgtctggaccaaaccggcaagatttgtcagaatatcaatgagtgt
atagaacagccgaacctctgtggcagaaattcaagttgtgtcgataccatcggctccttc
cagtgtatctgtggagagggcttccagacgggtcgaggtggccgttgtgaagatatcaac
gaatgccgcagaagtagaaacctttgtgccttccgttgccagaacctgcccggctctttc
cgttgcacctgtcctagaggatttgcccttacagaggatggcagactatgcagagatttt
gacgaatgcgaaagcggcgagaacaactgcagatacggttgcaggaacctgattggaaag
ttcatgtgtgtctgtcacgagggctaccaagccgtcgggggcgacggaaacatctgcaga
gatgtggatgaatgttctatcagacacaacctttgtgataacggtatctgtatgaatacg
cctggaagcttccagtgtgtctgtaactctggctttgtagcttcaccggaaggcaacgca
tgcgtcgaccagagacgtggcacctgttacggtgtcttacaccatggactatgtcaggat
ccagtagaaagagtgccctctattacagttggccagtgttgctgtaacggtttcaaggct
tggggcaatgactgtgagacctgtccaatatttggaacatccgagtacctgaacctttgc
agaaccccggtgtctcccactattgacatctgtgcctcagttgtgggactctgtagtaat
ggcctctgtctcagtgataatggaggcttcatctgtcagtgtaaccctggttacctcatc
agcagagatggaactacatgtgaagacaaaaatgaatgtgatagcaacatgtgttcacat
gactgcaggaatactccaggaagctttaaatgtctctgtccacatggatatgtactcagc
cataacatggtaacatgtgaagatttagacgaatgtctcctagacctgcatagctgtcag
caccgatgtgaaaacacggttggcggattccagtgtgtttgccgagatggtcacttgcaa
gtcggcatggcttgtcctgacggagatgaatgtcgtgaggatcccagtttgtgtggaccc
tacggtacctgtcagaacaccccaggaggttaccgctgcgaatgccagaggtacttccga
ccagacgagtcgggcactatgtgtgttgacatcgacgaatgccaggagcaacctcacagg
tgtcagtacgagtgtaaaaatactctggcaggattcacctgtgggtgtcctgacggctat
gtccagaattactggggtcaatgtggggaccaaaacgagtgtgccagccaaggtgtttgt
ggtgatgctctatgcttcaatactcagggaagctaccaatgttcttgtcaaagtggattt
tctctggaccaacagtctatgtcctgtaatgatattgatgagtgttcagggtacggtggc
tatggtgggttctcgaatccatgccagaatgaatgtcaaaaccatgctggaagctttaca
tgtggatgtcctacaggctactacagtctgtctcaaggttcttgcttttctacgctgggt
caagactctgaggtaccgtgctaccattgtcaccagactagacgaaggagagatgtgtcg
gagacagagggagcccttcccggcgttatcgctaacaacactgcaatacttatccgagta
cccctccagaaagccacctcacattccaagcttctaaaactaaccaccggctttgcgaag
tccatcggtttctttaaatatcaaatcatatacagtaaccaagatggcgtcttcaacgta
gatgaacggaaggaaggccgagcggtactccggtttagcgaacccgtcaccgaaccgggt
atcttctcggtcgaaatcgaaggccagattgtcgagagggaggaagtgttggccgaggat
gaaaccaacactattttgacggaaccattagctctgcttgtggaggttgaagtttatgaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
