Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber): 139981428
Help
Entry
139981428 CDS
T10891
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K02599
Notch 1
Organism
ajj
Apostichopus japonicus (Japanese sea cucumber)
Pathway
ajj04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ajj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
139981428
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
Reeler
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139981428
NCBI-ProteinID:
XP_071849902
LinkDB
All DBs
Position
15:28242732..28309897
Genome browser
AA seq
1873 aa
AA seq
DB search
MGLPKRASVFAHMTSSYQLLSDFPAVDLSSICSHQVRHGNLQASLDSPVTLQLSTSSYQA
GSNNVVRVTLSSAVPGSIIAVKGFVLQAQTVSGAAMDGSWVPLPGQLIYNGCGNSVSTVI
HDGNANPFTLPLMFDFSVPSTNSGNLEFRLTVVQNFATFWENIIFDQVLVPQDAACNLCN
GGTCLSLPPPGVGFICSCPPLFTGRNCEIQQDEHPCDVIQCFNGGLCVFMGYGTCQCPPG
FSGLQCENVDNANPFCDSVECFNGGTCVFIGFGFCQCVQGFSGIQCENNPCDQISCLNGG
TCVVAGGVAMCMCPGTFFGDDCGMIDSNPCDNLLCINGGSCTSMDQTAFCNCLPGFTGTL
CEVQNGGGFCDQITCLNGGLCTEAIGFAFCFCQTGFTGADCGIQMEPCASNPCQGGQTCM
ITADGLSYICLCMTSIGMLSCDVIGNPCMSNPCMNGATCMNGADGLSYICACMTPTGIQP
CAPTDVNQACASSPCQEGTCMVSSDGMSHTCICETPTGLQRCNQLGDLCIPNPCFNGGSC
EVDPLLGFTCSCAPGFRGGICSDSVRPCDSQPCMNQATCLNSANDELFICLCLPGYTGQT
CGMFDPCSSNPCQNQGTCMGIEGMDTFVCGCAVNFSGDFCEIFTATNPCDSSPCLAGGTC
TSSGTSFTCNCPTFFSGPTCGTFTNPCINPNPCQSGGTCDIDATSATGFTCQCPAGFEGN
LCQTQIAGNPCDSSPCLVGGTCTSSGTSFTCNCPNFFTGPTCETFTPGNPCDSSPCLAGG
TCTSSGTSFTCNCPNFFSGPTCEYFTNPCINPNPCQSGGTCDIDATSATGFTCQCPAGFG
GNLCQTQIAGNPCDSSPCLVGGTCTSSGTSFTCNCPNFFTGPTCETFTPGNPCDSSPCLA
GGTCTSSGTSFTCNCPNFFTGPTCETFTNPCINPNPCQSGGTCDIDATSATGFTCQCPAG
FEGNLCQTQIAGNPCDSSPCLVGGTCTSSGTSFTCNCPNFFNGPTCETFTPGNPCDSSPC
LAGGTCTSSGTSFTCNCPNFFSGPTCEYFTNPCINPNPCQSGGTCDIDATSATGFTCQCP
AGFGGNLCQTQIAGNPCDSSPCLVGGTCTSSGTSFTCNCPNFFTGPTCETFTPGNPCDSS
PCLAGGTCTSSGTSFTCNCPNFFTGPTCETFTNPCINPNPCQSGGTCDIDATSATGFTCQ
CPAGFEGNLCQTQIAGNPCDSSPCLVGGTCTSSGTSFTCNCPNFFNGPTCETFTPGNPCD
SSPCLAGGTCTSSGTSFTCNCPNFFSGPTCEYFTNPCINPNPCQSGGTCDIDATSATGFT
CQCPAGFGGNLCQTQIAGNPCDSSPCLVGGTCTSSGTSFTCNCPNFFTGPTCETFTPGNP
CDSSPCLAGGTCTSSGTSFTCNCPNFFSGPTCETFTNPCVNPNPCQSGGICEVDATSATG
FTCQCPAGFGGNFCQTQIAGNPCDSSPCLAGGTCTSSGTSFTCNCPTFVTGPTCGTFRNP
CVNPNPCQSGGTCNIDSTSATGFTCQCPAGFGGNFCQTQIGDSCQSSPCLNGATCLSSGS
SFVCICAENYQGQTCATLIDNCASRPCFFGGTCTSTSTGFECTCATGYIGPTCGIILPDP
CFGDPCQSGGTCTPVSGVPLGFSCQCPPEFTGDTCQTSVPIVGPCDTNMCQNGGTCVVAG
FSFTCTCITGYTGFLCQDMVATTDPCDPSPCLNGGECSLSEDRFVCRCVTGFTGDLCQIE
TGGPCDNSPCQNNGMCSSTDGVNYECTCLEGTSGLNCEVVVELCGGVQCMNGATCVTLPL
IFPGFPEVQQCSCTEGFVGPDCSVEVTGDLCGDIQCFNGATCETLTVPGLTVYSCMCAEG
FAGDTCAEEGKYN
NT seq
5622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtctaccaaagcgagcatccgtgttcgcccacatgactagctcctaccaattgctt
agtgatttccctgcagttgatctctcatcgatatgttcacaccaggttagacacgggaat
ttgcaagcctccctggactccccagtcaccctccagctgtcgacgagctcttatcaagca
ggaagcaataacgtggttagagtgacgttatcgagtgcagttccgggatctatcattgcg
gtaaaagggtttgtactacaggcacagacggtatctggtgctgcaatggatggttcttgg
gtgcctttaccgggacaactaatatacaatggatgcggcaattctgtgtccacggtgata
catgatggaaatgcaaatccctttacgcttccattaatgttcgatttctcagttccgtcc
acaaattctggcaatttggaattcaggttgacagttgtgcagaattttgcgacgttctgg
gaaaatataatatttgaccaagttttagttccgcaagatgctgcatgtaacctatgcaac
ggaggaacctgcttaagcctccctcctcctggtgttgggttcatatgttcatgtccacca
ttatttacaggacgaaactgtgaaatacagcaggatgaacatccttgtgatgttattcag
tgcttcaatggaggtctctgtgttttcatgggatacggcacctgtcagtgccctcctggt
ttctctggacttcaatgcgagaatgttgataatgcaaatcctttttgtgattcggtggaa
tgcttcaatggtggcacctgtgtgtttattggatttggcttctgccaatgcgtgcaaggc
ttctccgggattcagtgcgagaacaacccgtgtgatcagatctcctgtctaaacggtggc
acttgtgttgtggcgggtggtgtggcaatgtgcatgtgtccgggcaccttttttggagat
gattgcggcatgatagacagcaacccatgtgataatcttctttgcattaatggaggttct
tgtacttccatggatcagacagctttttgtaactgcctgccaggtttcacagggacactt
tgcgaagtacaaaatggcggtggtttttgtgatcaaataacctgtttaaacggaggtcta
tgtactgaggctattggatttgcattctgcttttgccagactggcttcaccggtgctgat
tgtgggatccagatggagccttgtgccagtaatccatgtcaaggtggccagacttgtatg
attacagcagatggactctcatatatatgtttgtgtatgacttctattgggatgctatcc
tgtgacgtaataggaaatccttgcatgagtaacccttgtatgaatggagccacatgcatg
aatggagctgatggtctctcctacatctgtgcctgcatgacacctacaggcattcagcca
tgtgctcccactgatgtaaatcaagcctgtgcaagttcaccatgtcaagaaggaacttgt
atggtttcatctgatggtatgagccacacctgtatctgtgagacaccaactggacttcaa
cgttgcaaccagctaggtgacctctgtattcctaatccttgtttcaatggtgggagctgt
gaagtagatccgttgctgggttttacttgcagctgtgcgccaggcttccgaggtggcata
tgttcagactctgtgaggccctgtgacagccaaccttgcatgaaccaagcaacttgtctg
aatagtgcaaacgacgaattattcatatgtttgtgtctgcctggatacactggacaaaca
tgtggaatgttcgatccttgtagcagtaacccctgtcagaaccagggcacatgtatggga
atcgagggaatggacacgtttgtttgtggatgcgcagtgaatttctctggcgacttctgt
gaaatttttacagctactaatccttgtgacagttccccttgtttagcaggagggacctgt
acctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaccttcttttctgggccgacatgt
ggaacttttacgaacccttgcattaatcccaatccttgccaatctggtggcacctgtgac
atagatgcaacatcagctactggttttacttgtcaatgtccagctggatttgaagggaat
ctttgtcaaactcagattgctggtaatccttgtgacagttccccctgtttagtaggaggg
acctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaacttctttactggaccg
acatgtgaaacttttacgcctggtaatccttgtgacagttccccctgtttagcaggaggg
acctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaacttcttttctggaccg
acatgtgaatattttacgaacccttgcattaatcccaatccttgccaatctggtggcacc
tgtgacatagacgcaacatcagctactggttttacttgtcaatgtccagctggatttgga
gggaatctttgtcaaactcagattgctggtaatccttgtgacagttccccctgtttagta
ggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaacttctttact
ggaccgacatgtgaaacttttacgcctggtaatccttgtgacagttccccctgtttagca
ggagggacctgtacttctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaacttctttact
ggaccgacatgtgaaacttttacgaacccttgcattaatcccaatccttgccaatctggt
ggcacctgtgacatagatgcaacatcagctactggttttacttgtcaatgtccagctgga
tttgaagggaatctttgtcaaactcagattgctggtaatccttgtgacagttccccctgt
ttagtaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaacttc
tttaatggaccgacatgtgaaacttttacgcctggtaatccttgtgacagttccccctgt
ttagcaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccctaacttc
ttttctggaccgacatgtgaatattttacgaacccttgcattaatcccaatccttgccaa
tctggtggcacctgtgacatagacgcaacatcagctactggttttacttgtcaatgtcca
gctggatttggagggaatctttgtcaaactcagattgctggtaatccttgtgacagttcc
ccctgtttagtaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaattgccct
aacttctttactggaccgacatgtgaaacttttacgcctggtaatccttgtgacagttcc
ccctgtttagcaggagggacctgtacttctagcggcaccagtttcacctgtaattgccct
aacttctttactggaccgacatgtgaaacttttacgaacccttgcattaatcccaatcct
tgccaatctggtggcacctgtgacatagatgcaacatcagctactggttttacttgtcaa
tgtccagctggatttgaagggaatctttgtcaaactcagattgctggtaatccttgtgac
agttccccctgtttagtaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaat
tgccctaacttctttaatggaccgacatgtgaaacttttacgcctggtaatccttgtgac
agttccccctgtttagcaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacctgtaat
tgccctaacttcttttctggaccgacatgtgaatattttacgaacccttgcattaatccc
aatccttgccaatctggtggcacctgtgacatagacgcaacatcagctactggttttact
tgtcaatgtccagctggatttggagggaatctttgtcaaactcagattgctggtaatcct
tgtgacagttccccctgtttagtaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacc
tgtaattgccctaacttctttactggaccgacatgtgaaacttttacgcctggtaatcct
tgtgacagttccccatgtttagcaggagggacctgtacctctagcggcaccagtttcacc
tgtaattgccctaacttcttttctggaccgacatgtgaaacttttacgaacccttgcgtt
aatcccaatccttgccagtctggtggcatctgtgaggtggacgcaacatcagctactggt
tttacttgtcaatgtccagctggatttggagggaatttttgtcagactcagattgctggt
aatccttgtgacagttccccctgtttagcaggagggacctgtacctctagcggcaccagt
ttcacctgtaattgccctaccttcgtgactggaccgacatgtggaacatttaggaaccct
tgcgttaatcccaatccttgccagtctgggggcacctgtaacatagactcaacatcagct
actggttttacttgtcaatgtccagctggatttggagggaatttttgtcagactcagatt
ggtgattcttgtcaaagttctccatgtttaaatggagctacctgtttatccagtggctcg
tcattcgtgtgtatatgtgccgaaaattaccaagggcaaacgtgcgctactctcatagat
aattgtgctagcagaccatgcttttttggaggcacttgcacttccacgagtacaggattt
gaatgtacttgtgccacaggatacattggtcccacatgtgggataatccttcctgatcct
tgttttggtgacccgtgccaatcgggaggaacttgtacccctgtttctggggtacctctt
ggattcagctgtcaatgtcctcctgagtttactggtgatacatgtcaaacatctgtccca
atcgttggcccttgtgataccaatatgtgtcaaaatggcggaacttgtgttgtagctggc
tttagctttacctgtacttgtataacaggatacacaggttttctttgtcaagatatggta
gcaaccactgacccttgtgacccatccccttgtctcaatggtggggaatgctcattgtct
gaagatcgctttgtctgtagatgtgtgactggatttacaggtgacttgtgccaaatagag
acgggaggtccttgcgataattctccctgccagaacaatggaatgtgttcatctacggat
ggtgtaaattacgaatgcacttgtctagaaggaacgtctgggctgaactgtgaagttgtt
gtggagctatgtggaggtgtgcagtgcatgaatggtgctacttgtgttacattaccactc
atattccctggttttccagaggtacaacagtgttcctgcacagaaggattcgttggacca
gattgttcagtggaggttactggggatctgtgtggtgacattcagtgtttcaacggtgct
acgtgtgagacattaacagtaccaggccttaccgtctattcttgcatgtgcgctgaagga
tttgctggggacacttgcgctgaggaaggcaagtacaactaa
DBGET
integrated database retrieval system