Apis laboriosa (Himalayan honeybee): 122719024
Help
Entry
122719024 CDS
T07817
Name
(RefSeq) probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 isoform X1
KO
K10615
E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
alab
Apis laboriosa (Himalayan honeybee)
Pathway
alab04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
122719024
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
alab04121
]
122719024
Enzymes [BR:
alab01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
122719024
Ubiquitin system [BR:
alab04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
122719024
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122719024
NCBI-ProteinID:
XP_043800459
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1080 aa
AA seq
DB search
MANWNKKRRLASEPVIAVDPLHKKKDMFCWGSTIHGELGLGGIEDENILIPRELDFKKAA
EIQQIACGENYTVVITQIGEIYSCGNNDYGQLGHEKGRKRLQLIPGLDAFVFKKAACGAY
HTLAINEWGQLFSWGSNTEGQLGLNSKNFMESSPRMVKTLGTSVVVQIACGMKHAFALTN
NGELYSWGSNSEGQLGLGTDTKYEIKPKFISAFIGIPIAFIACGGYHSIAISKSGAVFGW
GKNTFGQLGLNDTQDRNLPCQLQTLQNAKICYAACGEEFSVFLTVDGGVFTCGAGMYGQL
GHGSNSNEILPRQVMELMGSTVTQISCGKRHTLALVPSRGRVYAWGLGGAGQLGNHSTRS
VTTPQVVHGPWIAPNGSTIIDVNKQFNSRTIGYVVKHIFTGGDHCFATVISQNDIVKPDD
CRILESTSQILTIIEDQLMACQRVPPNSSIDHELMTYLETVFKSLSCITGSFLLKNDAHY
GCSSKHHGVDLDQASRLFGIIRELDNKTIQELIFTCITDSLIPSFVNLSSKIICTESLRI
YLILPLYHGFVNPLNCNSLHKPFCKAILALKPEILKTVTSWWLKTPPHYFERLVRVHKSV
VLHYVKQFKSNKAVSWDVTLQVILDSLHLLNKLNNEGDEGNKVPYSTFHLPELIELIDIR
TDYIKWISEKESFSCQKVFCNYPFLLDANAKIILLETDQAIQMQSAMNEAATLAVMNQMF
FDPFSIPHHNQFVILNVSRENIVADTLRELSQYNSSDLKKPLRVKFHGEEAEDAGGVKKE
FFMLLLREILDPKYGMFKQYEETRIIWFSEDSLEDENMYFLIGILCGLVIYNFIIIDLPF
PLALYKKLLHEPVGLIDMKDMSPVLAKSMQNILDYEEADFEEVFGLHFEIVREVFGEKKI
YELIPDGSKVPVTWKNKKQFVDLYVDYTLNKSVDLHFQAFYKGFHKVCGGRVLELFHSYE
LMAVVVGNEDYDWEELEKNAAYKEGYTKDNPTIVLFWQVFRELPLEEKKKFLLFLTGSDR
IPIQGMKAIKITIQPMNDERLLPVAHTCFNLLDLPRYQTRERLRYKLLQAIQQTHGFSLV
NT seq
3243 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaactggaataaaaagcgacgtttggccagcgagcctgttatagcagtggatcct
ttacataaaaaaaaagatatgttttgttggggtagtactatacatggggaattaggtttg
ggtggtatagaagatgaaaatattttgattccccgtgaacttgattttaaaaaagctgca
gaaatacagcaaattgcatgtggtgaaaattatacagtagttattactcaaattggtgaa
atatattcatgtgggaataatgattatggacaacttggtcatgaaaaaggaagaaaaaga
ttacaattgatacctggattggatgcatttgtattcaaaaaagcagcttgtggagcatat
catactttagcaataaatgaatggggacaattatttagttggggatctaatacagaaggt
caactaggtttaaattctaaaaattttatggaatcttcaccacgtatggtaaaaacctta
ggaacaagtgtagtggtacagatagcttgtggaatgaaacatgcatttgcattgacaaat
aatggagaattatatagttggggttctaacagtgaagggcagcttggtttaggtactgat
actaaatatgaaataaagcccaaatttatcagtgcctttattggaattcctattgccttt
attgcctgtggaggatatcatagcatagctatatcaaaatcaggagctgtatttggatgg
ggaaaaaatacatttggtcaattaggattaaatgacacacaagatagaaatttaccatgt
cagttacaaacattacaaaatgcaaaaatatgttatgcagcttgtggagaagaattttct
gtatttttaacagtagatggtggagtatttacatgtggtgctggaatgtatggtcaatta
ggacatggaagcaatagtaatgaaattttacctcgtcaagtgatggaacttatgggtagc
acagttacacaaatttcatgtggtaaaagacatactttggcattagtaccatcaagaggt
agagtttatgcatggggtttaggtggtgcaggacaattaggtaatcattcaactcgaagc
gtaacaactccacaagtagtacatggtccatggattgcaccaaatggttcaacaataata
gacgttaataagcaattcaattctcgtacaattggttatgttgttaaacatattttcact
ggtggagatcattgttttgccacagtaatttcacagaatgatattgtaaaaccagatgac
tgtagaatactagagagcacttctcaaattcttacaataattgaagatcaactaatggca
tgtcaacgagttccgccaaattcatctattgatcatgaacttatgacatatttagaaact
gtatttaaaagtttgtcctgtataactggatcattcttacttaaaaatgatgctcattat
ggatgttcaagtaagcatcatggggtggatcttgatcaagctagtagattatttggaatt
attagagagttggataacaagacaattcaagaattgatatttacttgtataacagacagt
ttgattccttcttttgttaatttatcatctaaaataatttgtacggaatctttaagaatc
tatttaatattacctttatatcatggttttgtaaatcctcttaattgtaattcattgcat
aagccattttgcaaagctattttagcattaaagccagagattcttaaaactgttacaagt
tggtggcttaagacaccaccccattattttgagagattagttagagttcataaatcagtc
gttttacattatgtaaaacagtttaaatcaaataaggctgtatcatgggatgtgacattg
caagttatcttagattctttacatttattaaataaattgaataacgaaggcgatgaaggc
aataaagtaccttattctacatttcatttaccagaattaatagaacttatagatataaga
actgattatataaaatggatttcagaaaaagaatctttttcttgccaaaaagtattctgt
aattatccttttcttcttgatgcaaatgctaaaattatacttcttgaaacggatcaagct
attcagatgcaatcagcaatgaatgaggcagcaactctagctgtaatgaatcaaatgttt
tttgatccattttctataccacatcataatcaatttgtaatattgaatgtttcgcgggaa
aatattgttgctgatactttgcgagaattgtcacaatataattctagtgatttaaaaaag
cctcttcgagtaaaatttcatggtgaagaagcagaagatgcaggtggagttaaaaaagaa
ttctttatgctattactaagggaaattttagatcctaaatatggcatgtttaaacaatat
gaagaaactagaattatatggtttagtgaagattcacttgaagatgaaaatatgtatttt
ttaattggaattctttgtggactagttatctataattttattattattgatttgccattt
ccattagctttatataagaaattgttacatgaaccagttggtttaattgatatgaaagat
atgtcaccagtacttgccaaaagtatgcaaaatatattagattatgaagaagcagatttt
gaagaagtttttggtttacattttgaaatagttagagaagtatttggtgaaaagaaaata
tatgaactcatacctgatggtagtaaagttcctgttacatggaaaaataaaaaacaattt
gttgatttatacgtagattatacattaaataaatctgtagatcttcattttcaagcattt
tataaaggttttcataaagtttgcggcggtcgtgtattggaattatttcatagttatgaa
cttatggctgtagtagtaggaaatgaagattatgattgggaagagttagaaaagaatgca
gcatataaagaaggatacacaaaagataatcctactattgtattattttggcaagtattt
cgtgaacttccgttggaagaaaagaaaaaattcttactatttttaacaggaagtgataga
atacctatacaaggcatgaaagcaatcaaaattacaatacaaccaatgaatgatgaacgt
ttattacctgttgctcatacatgttttaatttacttgatcttcctcgatatcaaactcga
gaaagattacgatataaattattacaagcaattcaacaaactcatggcttttcattagta
taa
DBGET
integrated database retrieval system