KEGG   Apis laboriosa (Himalayan honeybee): 122720364
Entry
122720364         CDS       T07817                                 
Name
(RefSeq) spatacsin
  KO
K19026  spatacsin
Organism
alab  Apis laboriosa (Himalayan honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:alab00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:alab03400]
    122720364
DNA repair and recombination proteins [BR:alab03400]
 Eukaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    Other HR factors
     122720364
SSDB
Motif
Pfam: Spatacsin_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 122720364
NCBI-ProteinID: XP_043802952
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1791 aa
MADKTTVGGIPVECLTGEPAAIWSGWRILGDRELVREASAKGTHINLAYKCLAYRKRCSI
ENAQCYFNKEVEIWITELLKRHQIYKASHILNNMNKDPVRYIFEVCINCKDSMLRNYLSE
HLISIAYFENEYINSWNIIKSIMQFEQKHMIKDSLSTSLCIEDIIKLPEIVRQSLCTELY
FSLNEKSLSKNITNNILWDYLLSNNKIVPIKFWIDTYYGNNTIEESNMIKEEYKLLFNNL
NIVPNMIESIDSSSASTFIKNLTKNHLCRYGIFVKKEQQDVKLLLARIFGNAISISEFNT
ILSYKSCNINRNEFMSRIDKELCLARCLNQINIQEDEIKIAELYDALTKMCENQDQNMLI
EGIFKTIYYLSDDTIEYLKENYLIVLVLIFSYLSKENTMYNQNKSTTMKQNILRDIFTNK
NGLQLCDYNISNEILQNTLEQISILKSIIEKKQKKEVTIYELLDGYKNLNIKRLYKWRFN
NESMPYFSNETLVKKYGYTEALTYEYYLKEARPNMAIFSLKHSQGKLIGNISCRRKHKAA
LYAHIFALRNLNKPEILHTCISFIEMLNIDSENLRLHITVANYIDKEINISIGNLLENII
YGNEDDLKSVMGYLENSFQKNFVESLIDDSQQFINILKIWDVIVRFARMHNFSLPISLLK
FLANQNFWFEFVLVCHIFNYSLNQVLENTKHFEDTILREHLLTCLCNVQLTKSQLAVYSE
QKIKSRDVRQSLYYKIGVKQNESIYGSPVLTDSASTSESHDMYEYAISDNICSPDDDLWL
IILKCHQSPDPPGALINSSRLTLRPFLAVLATCYEPSSITAYCYSWMVISTTDKEILSDY
NECLEQQIWTANQVSNLLEQMVKNGYIDILNKAYKIFMPENLFNLFFEFLEQCAIYGNFK
DYQQNLLDFKTQCIDLKCNDAMDWNCSDITYLNNLYWIATVTIKCVIATLAYRLKSSHLQ
IKFLEILIKCNFHKNFPVFVPNFQSFLQIIKILQKTNIILNFAAFTVSDNIYSFDTEIHR
CINDLIRIENYASALELSNVMGFSSSEIILAQYRSKFKYYIHKNEKIEDNFWYECAQNFK
KYNIPYKEVVEFFVEHAEKVTSHKERYEILKLAFETLKNIETEQQDIYTLEMAMWKSCIL
AGPENVQLDNGPYIFNKLKTELLSGLNKLKFSYTLNNIQERNAAKILIDILIDLGRLDTA
LRITTIFNYKHKDLQILILCLSLAEGEILPNDLTIEQQNLLKEVNKNKQQKYSALKNRSL
QRFSSSSSLVTSININEMSKDKTNIQMECLLILQKLLDILEHGLDICLRIVLCYKLAMQL
EKSYQVLLILNNPIQFLQEVTESNIKDKSEIINDIIIAYKIDNDTVATFLAENIMLSITS
AVKGGYENNICLWEYSLNTNFRIIMELCNDISLLGWKLLKTANKLLGHSHGEKTNALTLK
TIVELLIRAHDCFTTSCNMEGIASVLCKCQIFANILQNLKYWTLLVRLITGVGRFTEMNY
IFQILKENDQFEFLLGKGLNKVTGLETALLDFLKHHCPENKELFTLVALHFRLYHELALM
WENEAKDLIKTIISNATKEYNKLQSNVDEIKFIKTEYIQKQLQLIITNYTHATEYYLQAN
KLNLASQCSDQVQLVTLQLSLFNTTSYNQQVICILNLKPEDIDKVLCHNLSFSQSFIIVH
AYNHHVDWANLIYNHCILNGETKYLKDFITVNKLTPSLVQDCVRRYRLEKSITHTMTNNM
KILISELSDVECKYVLASQLGFKNIVEAMLNNPMIGAYLKDTVWKKGYNAT
NT seq 5376 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcagataaaactacagtgggtggtattccagttgaatgtttaactggagaacctgca
gctatttggtctggttggcgtatattgggagatagagaacttgtcagggaagcatctgca
aaaggcactcatattaatcttgcttataaatgtttagcttataggaaaagatgttctatt
gaaaatgctcaatgttatttcaacaaagaagtagaaatttggattacagaacttctaaaa
agacatcaaatttataaagcttctcatattttaaataatatgaataaagatccagtaaga
tatatatttgaagtttgtataaattgtaaagattctatgttaagaaattatttatcagaa
cacttaataagtattgcatattttgaaaatgaatatataaattcatggaatataataaaa
agcattatgcaatttgaacaaaaacatatgattaaagacagtttaagcacttctttatgt
atagaagatattataaaactaccagaaattgtgaggcaatcattatgtacagaattatat
ttttccttaaatgaaaaatctctttcaaaaaatataactaacaatatattatgggattat
ttattatcaaataataaaattgttcccataaagttttggattgatacttattatggtaat
aatacaatagaagaatcaaatatgattaaagaagaatataaattactgtttaataattta
aatatagttccaaatatgattgaatctattgattcttcaagtgctagtaccttcataaaa
aatttaactaaaaatcatttatgtaggtatggtatatttgttaaaaaagaacaacaagat
gtaaaattattattggcacgtatttttggaaatgcaatatcaatatcagaattcaacaca
atattatcatacaaatcttgtaatattaatagaaatgaatttatgagcagaattgataaa
gaattatgtctggcacgttgcttgaatcaaataaatattcaagaagatgaaattaaaatt
gctgaattatatgatgcattaacaaaaatgtgtgaaaatcaagaccagaatatgttaata
gaaggaatttttaaaacaatttattatctttctgatgataccattgaatatttgaaagaa
aattatttaatagttttagtattaatattttcatatttgtctaaagaaaatacaatgtat
aatcaaaataaaagtacaactatgaaacaaaatatactaagagatatatttacaaataaa
aatggtttacaactatgtgattataatatttcaaatgaaattcttcaaaatacattagaa
caaatatcaattcttaaatctattatagaaaaaaaacaaaaaaaagaagtgacaatatat
gaattattggatggttacaaaaatttaaatataaaacgtttatataaatggcgttttaat
aatgaatctatgccttatttttctaatgaaactcttgttaaaaaatatggatatacagaa
gcattaacatatgaatactacttgaaagaagcccgtcctaatatggctatatttagttta
aaacattctcaaggaaaactaattgggaatatttcttgtagaaggaaacataaagcagct
ctatatgcacatatttttgccttacgaaatttaaataaaccagaaatattacatacttgt
atttctttcattgaaatgttaaatattgattcagaaaatttaagacttcatataactgtg
gcaaattacattgataaggaaattaatatttctattggaaatttactagaaaatataatt
tatggaaatgaagatgatttaaaatctgtaatgggttatcttgaaaatagttttcaaaaa
aattttgttgaaagtttaattgatgatagtcagcaatttataaatatattgaagatatgg
gatgttattgtacgatttgcaagaatgcacaatttttctttgccaattagcttattaaaa
tttttagcaaatcagaacttctggtttgaatttgtgttagtttgtcatatatttaattat
tctttgaatcaggtattggaaaatacaaaacattttgaagatacaattctcagagaacat
ttgttaacttgtttgtgcaatgttcaacttacaaaatctcaattagctgtttatagcgaa
cagaagataaaatcacgagatgttaggcaatcattatattataaaattggtgttaaacaa
aatgaatcaatttatggttctccagtattaacagattcagcaagtacttctgaatctcat
gatatgtatgaatatgctataagtgataacatttgttctccagatgatgatttatggttg
attattctaaaatgtcatcaaagcccagatccacctggtgctttaataaattcatctcgg
ttaaccttaagaccttttcttgcagttttagcaacctgttatgagccatcttcaataaca
gcatattgttattcttggatggtaatatctactacagataaagagattctttctgattat
aatgaatgtttagaacaacaaatatggacagccaatcaagtttctaatttattagagcaa
atggtaaaaaatggatatatcgatattcttaataaagcttacaaaatttttatgcctgaa
aatctttttaatttattttttgaatttctcgaacaatgtgcaatttatggtaatttcaaa
gattatcaacaaaatttattggattttaaaacacagtgtatagatctcaaatgtaatgat
gcaatggattggaattgttcagatattacatatttgaataatttatattggattgctact
gttacaattaaatgtgttattgcaacactcgcttatagattaaaaagttcacatttgcaa
ataaaattccttgaaattttaataaaatgtaattttcataaaaattttccagttttcgtt
ccaaattttcagtcttttctacaaattataaaaattcttcaaaaaactaatatcatatta
aattttgcggcatttacagtatcagataatatttatagttttgatacagaaattcataga
tgtattaatgatttaataagaatcgaaaattatgctagtgctttagaattatcaaatgtt
atgggattcagttcatctgaaataattttagctcagtatcgaagtaaatttaaatattat
attcataaaaatgaaaaaattgaagataatttttggtatgaatgtgcacaaaattttaaa
aaatataatattccatataaggaagtagtagaattttttgttgagcatgctgaaaaagtt
acttctcataaagaaagatatgaaatattaaaactagcttttgaaactttaaaaaatatt
gaaacagaacagcaagatatttatacactggaaatggcaatgtggaaatcatgtatatta
gcaggtcctgaaaatgtacaattagataatggaccttatatttttaataaactaaaaaca
gaattattatcaggattaaataaattgaaattcagctatacattaaataatatacaggaa
agaaatgcagctaaaattttaattgatatattaattgatttaggtagattagatactgca
ttgagaataactacaatctttaattataaacataaggatttacaaattttaatattatgt
ttaagtctagcagaaggagaaattttaccaaatgatttaactattgaacaacaaaatctt
ctaaaagaagtaaataagaataaacaacaaaaatatagtgccttaaagaatcgtagctta
caaagattttcttcatcttcttcattagtcacctcaatcaatataaatgaaatgtcaaaa
gataaaacaaatatacaaatggaatgtttattaattttacaaaaattacttgatattctg
gaacatggcttagacatatgtcttagaattgtcctatgttataaattagcaatgcaatta
gagaaaagttatcaggtattattaatattaaacaatccaattcaatttttacaagaagtt
acagaaagtaatattaaagataaatctgaaattattaatgatataattattgcatataaa
atagataatgatactgttgcaacatttttggctgaaaatattatgctaagcattacttct
gctgtaaaaggtggatatgaaaataatatttgtttatgggaatattctttaaacacgaat
tttcgtattattatggaattatgtaatgatatttcactcctcggttggaagcttttaaaa
acggcaaacaaattgcttggtcattctcatggtgaaaagacaaatgcattaacccttaaa
acaatcgtagaattattaatacgagctcatgattgttttacaacttcttgcaatatggaa
ggaattgcatcagtattatgtaaatgtcaaattttcgcaaatattttacaaaatcttaaa
tattggacattattggtccgccttataacaggtgttggtcgttttacagaaatgaattat
atatttcaaattctaaaggaaaatgatcaatttgaatttttacttggaaaaggactaaat
aaggtaactggtctagaaacagcacttttggattttcttaaacatcattgtcctgaaaat
aaagagctttttactttggtagccttacattttcgattatatcatgaactagcacttatg
tgggaaaatgaagcaaaagatttaatcaaaacaataatatcaaatgctacaaaagaatat
aataaattacaaagtaatgttgatgaaataaaatttattaaaactgaatatattcaaaaa
caattacaattaattataactaattatactcatgcaacagaatattatttacaggctaat
aaattaaatcttgctagtcaatgttctgaccaagtacaattagttactcttcaactttca
ctttttaatacaacatcttacaatcaacaagtaatttgtatacttaatttaaaacctgaa
gatattgataaagtattatgtcataatttaagcttctctcaaagttttattattgttcat
gcttataatcatcatgtagattgggctaatttgatttataatcattgtatattaaatgga
gaaacaaaatatttaaaagatttcataactgtaaataaactcactccaagtcttgtacaa
gattgtgtacgcagatataggttagaaaagagtattactcatactatgacaaataatatg
aaaatattaatttctgaattatcagatgtggaatgtaaatatgtgttagcaagtcaatta
ggatttaaaaatattgtagaagcaatgcttaataatcctatgataggtgcatatcttaaa
gatactgtatggaaaaaaggatataatgctacttaa

DBGET integrated database retrieval system