Apis laboriosa (Himalayan honeybee): 122720364
Help
Entry
122720364 CDS
T07817
Name
(RefSeq) spatacsin
KO
K19026
spatacsin
Organism
alab
Apis laboriosa (Himalayan honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
alab03400
]
122720364
DNA repair and recombination proteins [BR:
alab03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
122720364
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Spatacsin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122720364
NCBI-ProteinID:
XP_043802952
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1791 aa
AA seq
DB search
MADKTTVGGIPVECLTGEPAAIWSGWRILGDRELVREASAKGTHINLAYKCLAYRKRCSI
ENAQCYFNKEVEIWITELLKRHQIYKASHILNNMNKDPVRYIFEVCINCKDSMLRNYLSE
HLISIAYFENEYINSWNIIKSIMQFEQKHMIKDSLSTSLCIEDIIKLPEIVRQSLCTELY
FSLNEKSLSKNITNNILWDYLLSNNKIVPIKFWIDTYYGNNTIEESNMIKEEYKLLFNNL
NIVPNMIESIDSSSASTFIKNLTKNHLCRYGIFVKKEQQDVKLLLARIFGNAISISEFNT
ILSYKSCNINRNEFMSRIDKELCLARCLNQINIQEDEIKIAELYDALTKMCENQDQNMLI
EGIFKTIYYLSDDTIEYLKENYLIVLVLIFSYLSKENTMYNQNKSTTMKQNILRDIFTNK
NGLQLCDYNISNEILQNTLEQISILKSIIEKKQKKEVTIYELLDGYKNLNIKRLYKWRFN
NESMPYFSNETLVKKYGYTEALTYEYYLKEARPNMAIFSLKHSQGKLIGNISCRRKHKAA
LYAHIFALRNLNKPEILHTCISFIEMLNIDSENLRLHITVANYIDKEINISIGNLLENII
YGNEDDLKSVMGYLENSFQKNFVESLIDDSQQFINILKIWDVIVRFARMHNFSLPISLLK
FLANQNFWFEFVLVCHIFNYSLNQVLENTKHFEDTILREHLLTCLCNVQLTKSQLAVYSE
QKIKSRDVRQSLYYKIGVKQNESIYGSPVLTDSASTSESHDMYEYAISDNICSPDDDLWL
IILKCHQSPDPPGALINSSRLTLRPFLAVLATCYEPSSITAYCYSWMVISTTDKEILSDY
NECLEQQIWTANQVSNLLEQMVKNGYIDILNKAYKIFMPENLFNLFFEFLEQCAIYGNFK
DYQQNLLDFKTQCIDLKCNDAMDWNCSDITYLNNLYWIATVTIKCVIATLAYRLKSSHLQ
IKFLEILIKCNFHKNFPVFVPNFQSFLQIIKILQKTNIILNFAAFTVSDNIYSFDTEIHR
CINDLIRIENYASALELSNVMGFSSSEIILAQYRSKFKYYIHKNEKIEDNFWYECAQNFK
KYNIPYKEVVEFFVEHAEKVTSHKERYEILKLAFETLKNIETEQQDIYTLEMAMWKSCIL
AGPENVQLDNGPYIFNKLKTELLSGLNKLKFSYTLNNIQERNAAKILIDILIDLGRLDTA
LRITTIFNYKHKDLQILILCLSLAEGEILPNDLTIEQQNLLKEVNKNKQQKYSALKNRSL
QRFSSSSSLVTSININEMSKDKTNIQMECLLILQKLLDILEHGLDICLRIVLCYKLAMQL
EKSYQVLLILNNPIQFLQEVTESNIKDKSEIINDIIIAYKIDNDTVATFLAENIMLSITS
AVKGGYENNICLWEYSLNTNFRIIMELCNDISLLGWKLLKTANKLLGHSHGEKTNALTLK
TIVELLIRAHDCFTTSCNMEGIASVLCKCQIFANILQNLKYWTLLVRLITGVGRFTEMNY
IFQILKENDQFEFLLGKGLNKVTGLETALLDFLKHHCPENKELFTLVALHFRLYHELALM
WENEAKDLIKTIISNATKEYNKLQSNVDEIKFIKTEYIQKQLQLIITNYTHATEYYLQAN
KLNLASQCSDQVQLVTLQLSLFNTTSYNQQVICILNLKPEDIDKVLCHNLSFSQSFIIVH
AYNHHVDWANLIYNHCILNGETKYLKDFITVNKLTPSLVQDCVRRYRLEKSITHTMTNNM
KILISELSDVECKYVLASQLGFKNIVEAMLNNPMIGAYLKDTVWKKGYNAT
NT seq
5376 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagataaaactacagtgggtggtattccagttgaatgtttaactggagaacctgca
gctatttggtctggttggcgtatattgggagatagagaacttgtcagggaagcatctgca
aaaggcactcatattaatcttgcttataaatgtttagcttataggaaaagatgttctatt
gaaaatgctcaatgttatttcaacaaagaagtagaaatttggattacagaacttctaaaa
agacatcaaatttataaagcttctcatattttaaataatatgaataaagatccagtaaga
tatatatttgaagtttgtataaattgtaaagattctatgttaagaaattatttatcagaa
cacttaataagtattgcatattttgaaaatgaatatataaattcatggaatataataaaa
agcattatgcaatttgaacaaaaacatatgattaaagacagtttaagcacttctttatgt
atagaagatattataaaactaccagaaattgtgaggcaatcattatgtacagaattatat
ttttccttaaatgaaaaatctctttcaaaaaatataactaacaatatattatgggattat
ttattatcaaataataaaattgttcccataaagttttggattgatacttattatggtaat
aatacaatagaagaatcaaatatgattaaagaagaatataaattactgtttaataattta
aatatagttccaaatatgattgaatctattgattcttcaagtgctagtaccttcataaaa
aatttaactaaaaatcatttatgtaggtatggtatatttgttaaaaaagaacaacaagat
gtaaaattattattggcacgtatttttggaaatgcaatatcaatatcagaattcaacaca
atattatcatacaaatcttgtaatattaatagaaatgaatttatgagcagaattgataaa
gaattatgtctggcacgttgcttgaatcaaataaatattcaagaagatgaaattaaaatt
gctgaattatatgatgcattaacaaaaatgtgtgaaaatcaagaccagaatatgttaata
gaaggaatttttaaaacaatttattatctttctgatgataccattgaatatttgaaagaa
aattatttaatagttttagtattaatattttcatatttgtctaaagaaaatacaatgtat
aatcaaaataaaagtacaactatgaaacaaaatatactaagagatatatttacaaataaa
aatggtttacaactatgtgattataatatttcaaatgaaattcttcaaaatacattagaa
caaatatcaattcttaaatctattatagaaaaaaaacaaaaaaaagaagtgacaatatat
gaattattggatggttacaaaaatttaaatataaaacgtttatataaatggcgttttaat
aatgaatctatgccttatttttctaatgaaactcttgttaaaaaatatggatatacagaa
gcattaacatatgaatactacttgaaagaagcccgtcctaatatggctatatttagttta
aaacattctcaaggaaaactaattgggaatatttcttgtagaaggaaacataaagcagct
ctatatgcacatatttttgccttacgaaatttaaataaaccagaaatattacatacttgt
atttctttcattgaaatgttaaatattgattcagaaaatttaagacttcatataactgtg
gcaaattacattgataaggaaattaatatttctattggaaatttactagaaaatataatt
tatggaaatgaagatgatttaaaatctgtaatgggttatcttgaaaatagttttcaaaaa
aattttgttgaaagtttaattgatgatagtcagcaatttataaatatattgaagatatgg
gatgttattgtacgatttgcaagaatgcacaatttttctttgccaattagcttattaaaa
tttttagcaaatcagaacttctggtttgaatttgtgttagtttgtcatatatttaattat
tctttgaatcaggtattggaaaatacaaaacattttgaagatacaattctcagagaacat
ttgttaacttgtttgtgcaatgttcaacttacaaaatctcaattagctgtttatagcgaa
cagaagataaaatcacgagatgttaggcaatcattatattataaaattggtgttaaacaa
aatgaatcaatttatggttctccagtattaacagattcagcaagtacttctgaatctcat
gatatgtatgaatatgctataagtgataacatttgttctccagatgatgatttatggttg
attattctaaaatgtcatcaaagcccagatccacctggtgctttaataaattcatctcgg
ttaaccttaagaccttttcttgcagttttagcaacctgttatgagccatcttcaataaca
gcatattgttattcttggatggtaatatctactacagataaagagattctttctgattat
aatgaatgtttagaacaacaaatatggacagccaatcaagtttctaatttattagagcaa
atggtaaaaaatggatatatcgatattcttaataaagcttacaaaatttttatgcctgaa
aatctttttaatttattttttgaatttctcgaacaatgtgcaatttatggtaatttcaaa
gattatcaacaaaatttattggattttaaaacacagtgtatagatctcaaatgtaatgat
gcaatggattggaattgttcagatattacatatttgaataatttatattggattgctact
gttacaattaaatgtgttattgcaacactcgcttatagattaaaaagttcacatttgcaa
ataaaattccttgaaattttaataaaatgtaattttcataaaaattttccagttttcgtt
ccaaattttcagtcttttctacaaattataaaaattcttcaaaaaactaatatcatatta
aattttgcggcatttacagtatcagataatatttatagttttgatacagaaattcataga
tgtattaatgatttaataagaatcgaaaattatgctagtgctttagaattatcaaatgtt
atgggattcagttcatctgaaataattttagctcagtatcgaagtaaatttaaatattat
attcataaaaatgaaaaaattgaagataatttttggtatgaatgtgcacaaaattttaaa
aaatataatattccatataaggaagtagtagaattttttgttgagcatgctgaaaaagtt
acttctcataaagaaagatatgaaatattaaaactagcttttgaaactttaaaaaatatt
gaaacagaacagcaagatatttatacactggaaatggcaatgtggaaatcatgtatatta
gcaggtcctgaaaatgtacaattagataatggaccttatatttttaataaactaaaaaca
gaattattatcaggattaaataaattgaaattcagctatacattaaataatatacaggaa
agaaatgcagctaaaattttaattgatatattaattgatttaggtagattagatactgca
ttgagaataactacaatctttaattataaacataaggatttacaaattttaatattatgt
ttaagtctagcagaaggagaaattttaccaaatgatttaactattgaacaacaaaatctt
ctaaaagaagtaaataagaataaacaacaaaaatatagtgccttaaagaatcgtagctta
caaagattttcttcatcttcttcattagtcacctcaatcaatataaatgaaatgtcaaaa
gataaaacaaatatacaaatggaatgtttattaattttacaaaaattacttgatattctg
gaacatggcttagacatatgtcttagaattgtcctatgttataaattagcaatgcaatta
gagaaaagttatcaggtattattaatattaaacaatccaattcaatttttacaagaagtt
acagaaagtaatattaaagataaatctgaaattattaatgatataattattgcatataaa
atagataatgatactgttgcaacatttttggctgaaaatattatgctaagcattacttct
gctgtaaaaggtggatatgaaaataatatttgtttatgggaatattctttaaacacgaat
tttcgtattattatggaattatgtaatgatatttcactcctcggttggaagcttttaaaa
acggcaaacaaattgcttggtcattctcatggtgaaaagacaaatgcattaacccttaaa
acaatcgtagaattattaatacgagctcatgattgttttacaacttcttgcaatatggaa
ggaattgcatcagtattatgtaaatgtcaaattttcgcaaatattttacaaaatcttaaa
tattggacattattggtccgccttataacaggtgttggtcgttttacagaaatgaattat
atatttcaaattctaaaggaaaatgatcaatttgaatttttacttggaaaaggactaaat
aaggtaactggtctagaaacagcacttttggattttcttaaacatcattgtcctgaaaat
aaagagctttttactttggtagccttacattttcgattatatcatgaactagcacttatg
tgggaaaatgaagcaaaagatttaatcaaaacaataatatcaaatgctacaaaagaatat
aataaattacaaagtaatgttgatgaaataaaatttattaaaactgaatatattcaaaaa
caattacaattaattataactaattatactcatgcaacagaatattatttacaggctaat
aaattaaatcttgctagtcaatgttctgaccaagtacaattagttactcttcaactttca
ctttttaatacaacatcttacaatcaacaagtaatttgtatacttaatttaaaacctgaa
gatattgataaagtattatgtcataatttaagcttctctcaaagttttattattgttcat
gcttataatcatcatgtagattgggctaatttgatttataatcattgtatattaaatgga
gaaacaaaatatttaaaagatttcataactgtaaataaactcactccaagtcttgtacaa
gattgtgtacgcagatataggttagaaaagagtattactcatactatgacaaataatatg
aaaatattaatttctgaattatcagatgtggaatgtaaatatgtgttagcaagtcaatta
ggatttaaaaatattgtagaagcaatgcttaataatcctatgataggtgcatatcttaaa
gatactgtatggaaaaaaggatataatgctacttaa
DBGET
integrated database retrieval system