KEGG   Aliarcobacter lanthieri: ALANTH_0876
Entry
ALANTH_0876       CDS       T06854                                 
Name
(GenBank) c-di-GMP phosphodiesterase, class II (HD-GYP, GAF domains)
Organism
alan  Aliarcobacter lanthieri
SSDB
Motif
Pfam: HD_5 PDEase_II HD GAF Lactamase_B_2 GAF_2 GAF_3 Lactamase_B
Other DBs
NCBI-ProteinID: QKF58991
LinkDB
Position
873847..876174
AA seq 775 aa
MNCIKVLGSSGSKSKNSGTTSFQISKHIVIDAGNIINSLEKNSFQINHIFLTHSHLDHIS
DIPFMLDNYFEDRVTPLTIYGSAKTLEVLKNSIFNNQIWPDFSNIKLLNSNQNSLIFKEI
KEDEEIIIDKHTIKPINANHIDGAFGFIVTRAKKSYLISGDTFINDNIVEYLNNDLSIKA
LFIECSFPNRLQKLSDISRHLTPNSLNSTLINLKRDDIQIYLYHLKYEYITEIKEQIQEL
GILKNGGKVLEDGDIVDINSLKVTSTIQDIEIFDRFMDINLKLASEQDKEQLYEMILTLI
RDLTKSDAGTLYLISEDKKYLDFKVVQNNSLNVFLGTKEQKISWNSLPLYLENGKQNREM
VAVVSALDNKIINIQDVYNSTEYNFEGTKKFDNTTNYCSKSMLVIPLVNHENDVIGVIQL
INKNIKEKNSFFTSDDEKILKALSFQAAMALTNTRLIASLEEFLEAFVSAIANAIDAKSR
HTSTHITKMSKLAPLIAKSISADDTIYKNTVYSKNDLKEIELAAKLHDVGKISIPEWVID
KSTKLQKLLDGFELIKLRVEVIKRDLKIEFLEDKISKEEYQTKLKAIEDDLDFINTSNKG
GEFMSDESIKRVEKLSSYIYILNNQEEKLLNADEIYNLSIRKGTLTLEEKDIMNSHAKLS
YDMLSALPFPKKYSNITHIAINHHEKLNGKGYPRGLSSEDLVLEDRILILADIFEALTSI
DRPYKGIKKLSEVFKILDFMVKDGEIDGDLLEFFKNSNALKEYCKTELLQEQLDV
NT seq 2328 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaattgtattaaagtattaggaagtagtggaagtaaatcaaaaaatagtggaactact
tcatttcaaatctctaaacatatagttattgatgctggaaatataatcaactcattagaa
aaaaactcatttcaaataaatcatatttttttaactcattctcatttagatcatatttct
gatattccttttatgttagataattatttcgaagatagagttactcctcttacaatatat
ggttcagctaaaactttggaagttttaaaaaatagtatatttaataatcaaatttggcca
gatttttcaaatataaaactattaaatagtaatcaaaatagccttatttttaaagagata
aaagaagatgaagaaattattattgataaacatacaattaagccaattaatgcaaaccat
atagatggtgcttttggatttattgttacaagggctaaaaaaagctatttaataagtgga
gatacttttatcaatgataatatagttgagtacctaaataatgatttaagtataaaagca
ctttttattgaatgttcttttccaaatagattacaaaaattatcagatattagcagacat
ttaacaccaaatagtttaaatagcactcttataaatttgaaaagagatgatattcaaata
tatttatatcacttaaaatatgaatacattacagagataaaagagcaaatccaagagtta
ggtattttaaaaaatggtggtaaagttttagaagatggggatatagtagatataaatagt
ttaaaagttacttctactattcaggatattgaaatatttgatagatttatggatataaat
ttaaaactagcaagtgaacaagataaagagcaattatatgagatgattttaactttgatt
agagatcttacaaaaagtgatgcaggaacactatatttaataagtgaagataaaaaatat
cttgattttaaagtagttcaaaataatagtctaaatgtctttttaggaacaaaagaacaa
aaaatatcttggaactctctacctttatatttagaaaatggtaaacaaaatagagaaatg
gttgctgttgttagtgctttggataataagataataaatattcaagatgtttacaactca
acagagtataattttgaaggtacaaaaaagtttgataacactacaaactactgttcaaaa
tctatgttggttattcctttagtaaatcatgaaaatgatgtaataggtgtaattcaatta
ataaataaaaatataaaagagaaaaatagctttttcacttctgatgacgaaaaaatctta
aaagctttatcttttcaagcagcaatggctttaacaaatacaagattgattgctagtttg
gaagagtttttagaagcatttgtaagtgctattgcaaatgctattgatgcaaaatcaaga
catacttctactcatattacaaagatgtcaaagttagctccattaattgcaaaatcaata
agtgctgatgatacaatatataaaaatactgtttattcaaaaaatgatttaaaagagata
gaactagctgccaagcttcatgatgttggaaaaatctctattcctgaatgggtaattgac
aaatcaacaaaacttcaaaaattactagatggttttgaattaattaaattaagagttgaa
gtaataaaaagagatttaaaaatagagttcttagaagacaaaataagtaaagaagagtat
caaactaaactaaaggctattgaagatgatttagattttataaatacatcaaataaaggt
ggagagtttatgagtgatgaaagtataaaaagagttgaaaaattatcttcatatatctat
attttaaacaatcaagaagaaaaacttttaaatgcagatgagatatataacttatctatt
agaaaaggaactttaactttagaagagaaagatattatgaactctcatgcaaaactatct
tatgatatgttaagtgctttgccttttcctaaaaaatactcaaatattacacacatagct
ataaatcaccatgaaaaattaaatggaaaaggttatccaagaggtttaagttcagaagat
ttggtattagaagataggattctaatcttagcagatatttttgaagcattaacttctatt
gatagaccatataaaggaataaaaaaattaagtgaagtatttaaaatattagattttatg
gtaaaagatggtgaaatagatggggatttactagagttctttaaaaatagtaatgcttta
aaagagtattgtaaaacagaacttttacaagagcagttagatgtttaa

DBGET integrated database retrieval system