Aulosira laxa: NIES50_11640
Help
Entry
NIES50_11640 CDS
T09879
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
alax
Aulosira laxa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alax00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
alax02000
]
NIES50_11640
Transporters [BR:
alax02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NIES50_11640
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ72610
LinkDB
All DBs
Position
complement(1381975..1387215)
Genome browser
AA seq
1746 aa
AA seq
DB search
MTRSPNSNRRLWLLLLSRGSIALGVVLLAGIIGGIWWANNFIHQKLVPLIESNLLELLGR
PVNLGAVQSFSPNSLRFGNTSIPATTTDPDRLVAQAVDVGFDPWLLVFNRTLKLNVTLIQ
PAVYIEQDQQGRWVSTRINTATQEKKGFITTELETIRLQNGGLVLSPYTPANKPRVNVGF
NQLNGVARLLEQNQRINFDATTQPVNGGSLQISGDTLTKTTETTLQINTSNLAAATLTQL
VQSPVTLPSGTVDGNLTVKFQPKQPKTTVFGIVNVNQVTAQVNNFPNKLTNINGKLQFQG
TQVALENISTSLGNIPAQINGSVNTQTGYNVTANIKAVSAQNLLQTFNIKLPVTTAGDFT
ANFKLQGAIPKPVVTGAVSTIKPAVIDRVNFEKISTQFRGTPQEIVISQIQATPTVGGEI
TGSGRVGLGKQGDVAINLQAQRLPGDALAQTYNASTANIRIGTISANTRVSGTLANLRTL
VQVQAPMATYPGKVELAINKKLIQFQNTVFQVAGGTVAARGQLVGDRWQAFVDANQVPLQ
SLAQATSNPNNANAALPKQFQGNLNGEFNLSGTTKSFQLANIQASGQANLNVAGGRVNLN
NIRLNNGLWQAVANASGIQINQFAPNVQGQIANSNIQVSGNTNSFALANIQAAGQARLSL
ARGSVNVRNINLSNGNWQAIATISQIQLNNLSQNLRGRLNGDVQVAGTTASFQPQDIVAA
GNVRFSQGLAALTQPLTAQFQWNGQRLQIAQATAPGLRASGDIAVALQPTPQITGLNLNI
QADNYNLQSLPIQLPGNIAVAGRVDFNGQVAGTPTTPIANGNIRLENFAINGLAFDPVLT
GNVSYQGGQGTQFQVTGRQDQIAFSLGANNRPTAFNIRRDGTVATGNTVGDNLAVNVQDF
PISLAKGFLPANANLGSINGQLSGNLTVNLTDYSLVGNVAVAQPRIGRIQADEFRGNISY
GNGNFNLTNGELIQGQNRYLLSGILPTSLNNPLQFTVSFDQTRIENLLSTLNIYNYQDLQ
TGLQPPKLAGAEALQTEPVSLPNTNLLAQIDYLSKIQSQVTQARTQEQRTERVPSLEELQ
GLISGNIGVTGSLRSGLNIGFNITGNNWVWGKYNINQLVASGNFENGNLTLQPLQVNFNN
SLLAFTGQLSQQALSGQAQVQNLALADIKPFFPQLPVDVEGNINANATLSGSLNNPQAVG
ELALVDGSLNNQSVQSAQVSFNYNDARLNFGSNVLVTGTQPIQINGSIPAKLPFTSVEPD
PSISIQANVQNEGLALLNLVNNQVKWVDGQGQVNVQVQGTLDRPETTGIATINNATINVQ
SLTEPLTNVTGTAQFAGDRLIVDNLQAQYSRGQLTAAGILPIFASQNAQQQAASNPLTVS
LQNLQLNFQDLYQGAVNGNAVITGTAFAPQLGGRIQLNDGEVLLGNAASVSKTTSQPANS
QEFTVTTPETTANSTPTAPTTTNTARIPIEFANLQLVLADDVRVTRQPLFSFVAQGDITL
NGTLTKPRPQGEVRLRGGQINLFTTQFTLERGYEQTALFTPSRGFDPTLDVRLLAIVPEA
TRSLGRTSPISSEIQDISAINFGTLNTVRISAIAKGPASELSDNLVLTSEPRRSRSEIVA
LLGGSILNNLQQGDATLGLINIAGSAVFSNLQGTLSQIGQTIGLSELRLFPTLVTNTNTN
VSVLGLAAEGVFDVSNDFSVSLSRVFASNEPLRYNVIYRLNDELRVRASTNLGDEGRAVV
EYETRF
NT seq
5241 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacacgctctcctaattctaatcggcgtttgtggttgctgttactcagtcgtggcagc
atagctttgggagtagttttactcgcagggattattgggggtatttggtgggctaataac
tttattcatcaaaaattagtaccattaattgaaagcaatcttttagagttgctgggaaga
cctgtaaatttaggtgcggttcaaagcttttcaccaaatagcctgcgttttggtaacaca
tcaattcctgcaactacaacagatcccgatagactggtagcacaagcagtagatgtgggt
tttgacccttggctattagtttttaatcggactttgaagctcaatgtgactttaattcag
cctgctgtttatattgaacaggatcagcaagggcgttgggtttctacgagaattaatact
gcgactcaggaaaagaagggttttattaccactgaactggagacaattcgcttgcaaaat
ggcggtttagtattgtctccctataccccagccaataaaccgagggtgaacgttgggttt
aatcaactgaatggtgtagcgcggttattagagcaaaatcaacggattaattttgatgct
actactcaacctgtgaatggtggtagtttgcaaatttcgggagacactctgaccaaaact
accgaaacgacgctgcaaatcaatactagcaatttggcagcagcgacgctgacgcaatta
gtacagtcacctgtgactttaccatcggggactgtggatggtaatttaacagttaaattt
caaccgaagcaaccaaaaacaacggtttttggcatagttaacgttaatcaagttacggcg
caagttaataattttcctaataaattaactaacatcaacgggaaattacaattccagggt
acgcaggtggcgctggaaaatatatctaccagcttgggtaatatcccggcgcaaattaat
ggctcagtcaatacgcaaactggttataatgtcaccgcgaatatcaaagctgttagcgcg
caaaatctcttacaaacctttaacattaaactccccgtcaccactgctggagatttcacc
gccaattttaagttacaaggtgcaattcccaagcctgtagttacaggtgcggtgagtaca
attaaacctgcggtgattgaccgcgtaaattttgagaaaattagcacccaatttcgggga
acaccgcaggaaattgtgatttctcagattcaagctaccccaacggtagggggagaaatt
acaggtagcggtcgagttgggttaggtaagcagggtgacgttgcgatcaatttacaggcc
caaaggttacctggagatgcattagctcaaacttataatgctagtactgccaatattcgc
attggtacaatctctgcaaataccagagtttcgggaaccctagcgaatttgcgaactctg
gtgcaagtccaagcaccaatggctacttatccggggaaagttgaattagcaattaacaaa
aaactgattcagttccagaatacagtttttcaagtagcgggggggacagttgcagcgcga
ggacaactggtaggcgatcgctggcaagcttttgttgatgccaatcaagttcctctgcag
agtttggctcaagctactagcaatccaaataatgccaatgcggctttaccaaagcaattt
caaggtaatttaaacggggaatttaatttatctggaactacaaaatctttccaattagct
aacattcaagcttctggacaagcaaatttaaatgtcgctggcgggagagttaatctcaat
aatattcgcttgaataatggtctgtggcaagctgtagctaatgcttctggcattcaaatc
aatcaatttgccccaaatgttcaaggacaaattgctaatagtaatatacaggtttctggt
aatactaattcttttgctttagctaatattcaagctgcgggacaagcgcggttgagttta
gctaggggaagcgttaatgtcagaaatatcaatttgagtaatggcaactggcaagctata
gccactatttcccaaattcaattaaacaatttatcacaaaatttgcgcgggcggttaaat
ggtgatgtgcaagttgcgggaaccacagcttccttccaaccgcaagacattgtagcggca
ggtaatgtcaggttttcccaaggtttagcggcactcacacaaccattaactgcccagttt
caatggaatgggcaacgtttacaaattgcccaagcgactgcacccggtttgcgggcatct
ggtgatattgctgtggcattgcaacccactccccaaattactggcttaaatctgaatatc
caggcagataattacaatctgcaaagtctgccaattcagcttcctggtaacattgctgtg
gcggggagagtagattttaacggacaagttgctggtacaccaactaccccaattgctaac
ggtaatattcgcttagaaaattttgccattaatggtttagcatttgaccctgtcttaact
ggaaatgttagttatcaaggcggacagggaacgcaatttcaagttactggtagacaagac
caaattgccttttctttaggtgcaaataatcgcccaactgcatttaatattaggcgcgat
ggtacggttgctactggcaatactgtcggagataatttagcagttaatgtccaagatttt
cctatatctttagcgaaaggcttcctgcctgcgaatgcaaacttaggcagcatcaacggg
caattatcaggaaatttaacagttaatttaacagattatagtttagtcggtaatgtcgcc
gtagctcaaccgcgaattggcagaatccaagcagatgaatttcgcggcaatattagttat
gggaatggcaactttaatttaactaatggggaactcattcaaggacaaaatcgctattta
cttagtggaattttaccgacttcactcaataatcccttacaatttacagttagttttgac
caaaccagaattgaaaatttactctccacactgaatatctacaattatcaagacttacaa
actggtttacagcctccaaaactagctggtgcggaagctttacaaactgaacctgtgagt
ttacccaacaccaatttattagcgcaaatagattatctctccaaaattcaaagccaagtc
actcaagcaagaacccaagaacaacgaactgaacgcgtacctagtttagaagaattgcaa
ggattaattagcggtaatattggcgtaacaggttctttacgctccggcttaaatatcggc
tttaatattacaggtaataattgggtatggggtaaatataatattaatcaacttgtcgct
agcggcaattttgaaaatggcaatttaaccctacaacctctgcaagttaatttcaataat
tccctcctcgcttttaccggacaattaagccagcaagcattatctggacaagcacaagtc
cagaatttagcattagcagatattaaacctttcttcccccaattacctgtagatgtggaa
gggaatatcaatgccaatgcgacattatcaggaagtttaaataatccccaagctgtagga
gaattagctttagtagatggtagcttaaataatcaatctgtacagtctgcccaagttagc
tttaactataacgatgcacggttaaattttggcagtaatgttttagtgactggcacacaa
ccaattcaaattaatggtagtattcctgccaaattaccttttacatccgtcgagccagat
cccagtattagcattcaagctaacgtgcaaaatgaaggcttggcattattaaatctggtg
aataatcaagtcaaatgggtagatggtcaaggacaagtcaacgtccaagttcaaggaaca
ttagatagaccagaaaccaccggcattgccacaattaataatgccacaatcaatgtccaa
agcctcacagaaccattaaccaatgttacaggtacagcacagtttgcaggcgatcgctta
attgtcgataatctacaagcacaatacagtcgcggacaattaacagccgcaggtattctc
cccattttcgccagtcaaaatgcccaacagcaagccgctagcaatcccctaactgtttca
ttgcaaaacttgcagttgaatttccaagacttatatcaaggcgcagtcaacggtaatgca
gtaattaccggaacagcatttgcaccccaactcggcgggagaattcaactcaatgatggt
gaagtattattaggaaacgccgcatctgtcagcaaaacaacttcccagccagcaaattcc
caagaatttacagtcacaacacccgaaaccacggcgaatagtacccccacagcacccaca
accacaaatacagccagaatcccgatagaatttgccaacttacagctagttttagccgac
gatgtgcgcgtcacccgtcaacccctatttagctttgtggcgcagggtgatatcacgctc
aacggaacccttactaaaccccgtccccaaggagaagttcgcttgcggggaggacagata
aatttatttactacccaatttaccttagagcgtggttacgaacaaaccgcactatttaca
cccagtcgtggtttcgatcccacattagatgtgcgcttactcgccattgtcccagaagcc
actcgcagcttagggcgaacctcacccatatctagcgaaattcaagatatttctgccatc
aactttggcacattaaacacagttcgtattagtgcgatcgctaaaggcccagctagcgaa
ttatctgataatttggtattaactagcgaacctcgccgtagtcgctctgaaatcgtggct
ttactgggaggttccattctcaacaatttacagcaaggtgatgcaaccttgggactaatt
aatatcgctggttcagcagttttctctaatttgcaaggtactcttagccaaattggacaa
actatcggcttaagtgaattgcgactatttcctaccttggtaactaatactaataccaat
gtttctgtattaggtttagccgccgaaggtgtatttgatgtatcgaatgatttttctgtg
tcgttatcgcgagtttttgctagcaatgaacccttacgttacaacgtaatttatcgcctc
aatgatgaacttcgcgtgcgcgcttctactaatttaggtgatgaaggtcgtgctgtcgtt
gagtatgaaacgcgattttaa
DBGET
integrated database retrieval system