Aulosira laxa: NIES50_25460
Help
Entry
NIES50_25460 CDS
T09879
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
alax
Aulosira laxa
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7619
CLIPPER_2
CLIPPER
DUF7927
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ73976
LinkDB
All DBs
Position
3112729..3116811
Genome browser
AA seq
1360 aa
AA seq
DB search
MSTSFLRASTRLFLTTAIICGSFLPLLKTVLADSTPPGTTIDNSATGSFEGETSGTTNTV
TSNTVSVTVLEVAGITINSSSVPTEASSNVTNAGTYQGIAGINTGDVAYFDFTITNTGND
PTQFFIPGTATITGGTLEGIQIIAVDPDGTGAASETTVAVNVPSTGDNTINLLGTTNGYI
PVNGTVKVRVAVKVTETVVNNSITVTLGSTPVPPNPSSQNQPYTANGNLDVYTVDLPNGT
TIPSSYASIPTVSQVAEASGNPANGDSTNHRQEASANQSIALAATPNTSGYKSVQLTTDN
DSTNSVTSGDKLTWRVTYANTGSVDISNFQITDVLPAGVTLSTALATANITVNATQATAP
SPNTSYNGTGNNNLFAAGVTFKAGGVITIDIPVNVNAALPNGTILSNQPTANASNLPTVG
IKTDNIDNTTTGLPTGVTPLTNSILQTQNSSIDPTTVSVGSATVIGYKSVKLTTDQGATG
LDPGDTVTWTVIYKNTGTVDVPNFQITDTLPSGVTKSGTPTLVTASGGGQASPTINSSYD
GISNTNLFASGITLKAGGTIVVNIPVTINSGVSGTKSNQATAQGNNLPTAGINTDNVDSD
TGVTEVPAASIKQTQTGTIDPTVINIPATTPTPSLSGYKSVKLTNDLDSSSSITAGDTVT
WSVTYINTGTVDVSNFQITDILPSGLTKSGSINITTNNTQGTAPTANSSYDGTGNNSLLQ
TPITLKAGGIITVRIPITINAGASGTKSNQATANGGNISATNTDNVDSSTTGLPTGVTIP
SGSITQTQNPSIDPTTFTIIAPQLSGYKSVKLTTDADTSNSVTPGDTVTWTIIYKNSGTA
SVPNFQIADALPTGVTKTGTPTVSVSGVGQTTPTVDTNYNGNGNNNLFSTTVPLVVGGVI
AVKIPVTINANQVGDKVNQAVGTGTGIAAVNTDNVDSTSTLASDVSAQIETGSIAQTQLV
SVDATKISIPEVQGFKSVKLTNDIDANNVVTAGDELTWTIVYKNTSTVPISNFQITDVLD
TNVTRTGANPISVTVKIAGVSQTAPTINSAYTGSNPNANLIDASTPYTLPANAVITINVP
VKILSSTPANTVLSNQSIGTASNLPSIGVKTDNVDSNPTTTLPADVTIPSNSIDQTENAG
TIDPTTVTTTVPVSSGVPNLLLVKRITAINGVKITGFVDDTTSAQASDDDHANWPTPKNT
YLPGAINLSNIKPGDQLEYTIYFLSTGTKDATNVTICDLIPSNTTFLGTPFNGLTADTGG
LPQADMGIAFANSNTSLPTVPTVYMTNVADGDRGFFYAPGTTPPSICKKPVSFTTMTAAD
NTNGLVMVNVVTSPTTLPKATGSGTPTNSYGYIRFKVKVN
NT seq
4083 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacctcctttcttcgagcatcgactcgcttatttttaaccactgccataatttgt
ggcagtttcttacctttactaaaaacggttttggctgattcgactcctccggggactacg
atcgacaatagcgccacgggcagttttgaaggagagacatcaggcactactaataccgtg
acttctaacactgtcagcgtcaccgttttagaagtggcaggaattacgattaattcgagt
agtgtgccaactgaagcctctagtaatgtgactaatgcgggcacatatcaaggaattgct
gggattaatacaggtgatgtggcctattttgacttcaccattactaatactggcaacgat
ccgacgcaattttttatccctggtacagccacaattacaggtggaacattagaaggcatt
cagattattgctgttgatcctgatggtacaggtgcggcttcagagacaacagttgccgtc
aatgttcccagtaccggggataatacgatcaatttgttaggtacgactaatggttatatc
cctgtaaatggcacagtaaaagtgcgagtagcggtcaaagttacagaaacagtggtgaat
aattctattactgtaactttaggaagtacacctgttcctcccaatcccagcagccaaaac
caaccttatacagccaacggcaatcttgatgtttatacagtagatttgcccaatgggaca
actattcctagtagctatgccagcattcctacagtcagtcaagttgcagaagctagcggt
aatcctgcgaatggcgattctaccaatcatcgccaagaagcaagcgcaaatcaatctatt
gcattagcagctacaccaaatacttctggttataaatcagtacaattaaccaccgacaat
gatagtaccaatagcgttacttctggtgacaaacttacctggagagtgacctatgctaat
actggttctgtagatattagcaacttccaaattactgatgttttaccagcaggagtcacg
ctatctacagcattagctactgcgaatattactgttaatgctacacaagcaacagcacca
tctcctaatactagttataacggtacaggtaataataatctctttgctgctggcgtaaca
ttcaaagcaggtggagtgattacaattgatattcctgtgaatgtgaatgcagcattaccc
aatggcacaattctcagcaatcaacctactgctaatgcctcaaatttaccaacggtgggc
ataaaaacagacaatattgacaatactacgacaggcttacctacaggagttacgccccta
actaacagtattctgcaaactcaaaattctagtattgatcccacaactgtaagtgtggga
agtgccactgtaattggttataaatcagttaaattaacaaccgatcaaggtgcaacaggt
cttgaccctggagacactgtaacatggacagtaatttataaaaataccggaacagttgat
gttcctaattttcaaattaccgatacattaccatcaggggtgactaaatcaggaacacct
actctcgtaactgcaagtggtggtgggcaagcttctccgacaattaatagtagttatgat
ggcattagtaatactaacctctttgcttctggaattacattaaaagcaggaggcacaata
gttgttaatattcctgtaacgattaatagcggagtatcaggtacaaaatccaaccaagct
acagcccaaggtaataacttaccgaccgcaggcatcaatacagataacgttgacagcgac
acaggggtaacagaagttcctgcagctagtataaagcaaactcaaacaggaacaattgac
cccactgtaattaatattcctgctactacaccaacgcctagtttatcaggttataaatct
gtaaaactgacaaatgatttagatagtagtagtagcattactgcgggagatacagttaca
tggtcagttacttacatcaatacaggtacagttgatgtaagtaacttccaaattactgat
atattgccatcaggattaacaaaatcaggcagtattaatattacgactaataatactcaa
ggtacagcaccaactgccaatagcagttatgatggcactggcaataatagtcttttacaa
accccaattactttaaaagctgggggtattattacagtcagaattcctataactattaac
gctggagcatcaggtacaaaatccaatcaagcaacagctaatggtgggaatatctcagct
acaaatacagataatgttgatagtagcactaccggattacctacaggtgtaaccatacct
agtggtagcattacgcaaacacaaaaccctagcattgatccaacaacattcacaattatt
gcgcctcaattatcaggttataaatctgtgaaattaaccacagatgcagatacaagtaat
agtgttacgcctggagatacagtcacatggacaattatttataaaaactcaggaacagcg
agtgttcccaattttcaaatagcagatgctttaccaactggagttacaaaaaccggaaca
ccaactgtcagcgtcagtggagtagggcaaacaactcccaccgttgatactaactacaat
ggtaacggcaataataatcttttcagtactacagtgcctttagttgttgggggtgtaata
gctgttaaaattcctgtgacaattaatgctaatcaagtaggagataaagttaaccaagct
gtaggtacaggcacaggaatcgcagcagttaatacagataatgtagatagtacatccaca
ttagctagcgatgtatcagcgcaaattgaaacaggcagtatagcacaaactcaattagta
tctgttgatgctactaaaattagtattcctgaagtacaaggatttaaatctgtcaaatta
actaatgatatagatgctaataatgtagttacggctggtgatgaattaacctggacaatt
gtttataaaaatactagtactgtaccaattagtaatttccaaattacagatgttttagat
actaatgtgactagaaccggagcaaatccgatttctgtgaccgtgaaaattgctggagta
agtcaaacagcccccactattaattcagcttacacaggttccaatcctaatgctaattta
attgatgcttctacgccctatacattaccagctaatgctgttattactatcaatgttcct
gtgaaaattttgagtagtactccggcaaatacagttttaagtaatcaaagtataggcacc
gctagtaacttacctagtattggtgtcaaaacagataacgttgatagtaaccccaccact
actttaccagcagatgtcactatacctagtaatagtatcgatcaaacagaaaatgcggga
acaattgatccaactactgtaactacaactgttccagttagtagtggtgttcctaattta
cttttggtgaaaagaattactgcgattaatggtgtgaagattacagggtttgtagatgat
actacaagtgctcaagctagcgatgatgatcatgctaactggcctactcctaaaaatact
tatttacctggagccatcaatctcagcaatattaaaccaggcgatcaactagagtataca
atttatttcctctcgactggtactaaagatgcgacaaatgtcacgatttgcgatttaatt
cctagtaatactacctttttgggaacaccatttaatggtttaactgctgatacaggtggt
ttaccacaagcggatatgggtatagcatttgccaatagtaacactagtttacctactgta
ccaaccgtttacatgactaatgttgctgatggcgatcgcggtttcttttatgcgccagga
actacacctccaagcatttgtaaaaaacccgttagttttaccacgatgacagctgcagat
aatactaatggtttagtaatggttaatgtagtgacaagtcctactaccttacccaaagca
actggatctgggactccgactaattcttatggatatataaggttcaaagttaaggtgaat
tga
DBGET
integrated database retrieval system