Acinetobacter lactucae: OTEC02_05070
Help
Entry
OTEC02_05070 CDS
T05220
Name
(GenBank) RNA polymerase-binding ATPase
KO
K03580
ATP-dependent helicase HepA [EC:5.6.2.-]
Organism
alc
Acinetobacter lactucae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
alc03021
]
OTEC02_05070
Transcription machinery [BR:
alc03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
Other transcription-related factors
RNA polymerase-associated proteins
OTEC02_05070
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RapA_C
Tudor_1_RapA
Tudor_RapA
Helicase_C
SNF2-rel_dom
ResIII
DEAD
AAA_22
AAA_34
Cep192_D5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD28194
LinkDB
All DBs
Position
1066582..1069419
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MEKLQQYAIGQRWLSDTETELGLGVLIDVDERSVSILFPKSDETRVYARNNAPLSRIIFN
TNDEVQDQEGQKWIVESIEDRHGVLRYNVVRTLESGEQERKALNETRIGAQIQLSKPLDR
LLASQVDYKEWYDLRIEAMLMQAQMQNSPLRGMVGARVGLIPHQLYIAHEVGKRFAPRVL
LADEVGLGKTIEAGLIIHQQLKTGRSERILILVPDSLQYQWMIEMRRRFNLQFSLFDLTR
TASIKEHDPELNPFLTEQCIIASVDLMVDHDDLREQAIEAGFDLLVVDEAHHLMWSEEEG
GNDRYDLIEELAENTAGVLLLTATPEQLGVESHFARLRLLDPQRFSSLERFLDEETQYQQ
TAKIAEVLMSDQALTPEHLSALEGLLGHSIEDQPEQRFRAIHELLDRHGTGRILFRNTRE
AIQGFPGRDCQPAPLPAPEDWSKDGKLREQMWPEEAQIDGSWMQNDPRVPWLMEVLRKDL
KHKKVLLIARSGPVVESLENVLRLHAGIRTAMFHEGMSLLERDQAAAYFAEESYGAQILL
CSEIGSEGRNFQFASDLILFDLPANPDVLEQRIGRLDRIGQENRIQIHVPYLVGTAQERM
FRWYNEALNIFSNISPTAQTLQENFIVELKDCLLADQGQTFEDLLEEVNVQRQALEAELQ
AGRDRLLEYNSCRPIVAQEIVQALEDYDDNTTLPMFVKRFMSSTNIDFDEQSNGTVIIKP
TDQMQVQGLALDEEGMTATFYRDQAQLREDAQYLTLEHPFIESVMEMIRTQSFGSTNVAV
LKSNALKQGSVLIEVWFKVDVVAPKSLNLPSSLPKQLIRVLLSENGQDLSEKIDPTILKP
YLHHLDGNSCRQVVKARRDIIEQRYKQALEIAKVDLPQLQQQAKEHYGNKWQYEIDRLTY
LKQFNPSIRQDEIDRLQKLQKEGLGLLDGLTVTPEAIQVLVVVKP
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggaaaaattgcagcagtatgctattggtcaacgttggctatcagacacagaaactgag
ctcggtttaggtgttcttattgatgtagatgaaagatctgtcagcattttattccccaaa
agtgatgagacacgtgtctatgcacgtaataatgctccactatctcgtatcatcttcaat
acgaatgatgaagttcaagatcaagaaggtcagaagtggatcgttgagtcgattgaagat
cgtcatggtgttttacgttacaacgtcgttcgtactttagaaagtggtgagcaagagcgt
aaagcgttaaatgaaacgcgtattggtgcgcaaattcagttgtcaaaacctttagatcgt
ttacttgcaagtcaagttgattataaagagtggtatgacctgcgtattgaagcgatgttg
atgcaagcgcaaatgcagaatagccctctacgtggtatggtcggtgcacgcgttggcttg
atccctcatcagctttatatcgcacatgaagttggtaaacgttttgcacctcgtgtttta
cttgccgatgaagtaggtttaggtaaaacaattgaagctggtttaattatccaccaacag
cttaaaacaggacgttcagaacgaattcttattttagtccctgattctcttcagtatcag
tggatgattgaaatgcgtcgccgttttaacttgcaattctctctatttgatttaacgcgt
acagcatctattaaagaacatgatccagagcttaacccgttcttgactgagcaatgcatt
attgccagtgttgacttaatggttgaccatgatgatttgcgtgagcaagccatagaagct
ggttttgatttgcttgtggttgatgaagcacatcatttgatgtggagcgaagaagaaggc
ggtaatgatcgctacgatttaattgaagagttagctgaaaatacggcaggagtattatta
ctcactgcaacacctgaacaattaggcgtagaaagccatttcgctcgcttacgtttactt
gatccacaacgttttagtagtttagagcgtttcttagatgaagaaactcagtaccagcag
actgcaaaaattgctgaagtgctcatgtcggatcaagctttaacgccagagcatttatca
gctttagaaggtttattaggtcacagtattgaagaccagcctgaacaacgctttagagca
attcacgaattattagaccgtcacggaactggacgtattttattccgtaatacacgtgaa
gcgattcagggcttcccaggtcgtgattgtcaaccagcaccgttaccagcaccagaagat
tggtcaaaagatggcaaactgcgtgagcagatgtggcctgaagaagcgcaaattgatggt
tcatggatgcaaaatgatccacgtgtgccatggttaatggaagttttacgtaaagatctt
aagcataaaaaagtgcttttaatcgcgcgtagcggaccagtggttgagtctttagaaaat
gtgttgcgcttacatgcaggtattcgtacggcaatgttccatgaaggcatgagcttactt
gaacgtgaccaagctgctgcttattttgctgaggaaagctatggcgcacagattctactg
tgttcggaaattggttcggaaggccgtaatttccaattcgctagtgatctaattttattt
gatttaccagctaacccagatgttttagagcagcgtattgggcgtctagaccgtatcggt
caagaaaaccgtattcagattcatgtgccatatcttgtgggaacagctcaagaacgtatg
ttccgttggtataacgaagcacttaatattttcagcaatatttctccaacagcgcaaacg
ctacaagagaactttattgttgaattaaaagactgtttacttgcagaccaaggtcaaaca
tttgaagatttgcttgaagaagtaaatgttcaacgtcaagctttggaagctgaacttcaa
gctggtcgagatcgtttacttgaatataattcatgtcgtcctattgtggcacaagaaatt
gttcaggcacttgaagactatgatgacaatacaacactaccaatgtttgtgaagcgtttc
atgtcatcaaccaatatcgactttgatgagcaaagtaatggtacggtgattattaaaccg
actgaccaaatgcaagtgcaaggtttagctttagacgaagaggggatgacagcaaccttc
tatcgcgatcaagctcagcttcgtgaagatgctcaatatttaactttagagcatccattt
attgaaagtgttatggaaatgatccgtacacaatcatttggtagtaccaatgttgctgtg
ctcaaatcgaatgcgttaaagcagggttcggtattaattgaagtctggttcaaagtagat
gttgttgcaccgaagtcactgaatttaccatcgagcttacctaagcagcttattcgtgta
ttgttaagtgaaaatggtcaagatttgtctgaaaaaattgatccgacaatcttgaaaccg
tatttacatcacttagatggcaatagctgtcgtcaggtggttaaggctcgtcgtgatatc
attgagcagcgctataaacaagcgttagagattgcgaaagttgatttacctcagcttcaa
cagcaagcaaaagaacactatggtaataaatggcaatatgaaattgaccgtttaacttac
ttaaaacagttcaacccaagtattcgccaagatgaaattgaccgtttacaaaaactgcaa
aaagaagggctcggcttgcttgatggtttaactgttacaccagaagcaattcaagtatta
gttgtggttaagccataa
DBGET
integrated database retrieval system
