Alteromonas sp. Mac1: AV939_06110
Help
Entry
AV939_06110 CDS
T05687
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
ale
Alteromonas sp. Mac1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ale00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ale02000
]
AV939_06110
Transporters [BR:
ale02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
AV939_06110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ86195
LinkDB
All DBs
Position
1460472..1461851
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MGFVTLKNKRYLLEGRDIIKLAWPLLIAQITQMLMGVSDTIMAGRYSATDMAAVALGFSI
TVPLLCFIQGIALALPPIISRLQGTKDITGIANASQQAGYLVCFVGLAVATLIPFAGNIV
SLFPMADELHTITVDYVVYVLCAMPGFALYQWLRNYCEGLGKTKPTMLITVIGLMANIIG
NYLFIYGVGPIPAFGGAGCGVATAIVIYTMLIATFIYVRFSPALKKYQLFDTYYKPSVVA
IKRTFKLGLPIAMTLLFEVTLFAVVALLLAPFGSTTVAAHQVALNFSALMFMIPMSIGMA
ASIRIGYRIGQDNRRQAKIAAQCSILIGFVTAACTATFTLSAKAFIIGLYTSDDAVYQMA
NALLIYAAIFQLSDAIQVISANALRGYKDTTAMFIITFVSYWLIGLPTGVILGRTDWVTA
EPMSAGGFWIGFIVGLSAAAIMLGARLYYIQRPNYRYAT
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atcggatttgtaactttgaagaacaaacgttatttacttgaaggtagagatataataaag
ctggcttggccattattaattgcgcaaatcacccaaatgctaatgggcgtaagcgatacg
attatggcgggacgttatagcgccactgatatggcagcggtggccctgggttttagtatt
accgtgcccttattatgctttatacaaggtattgcacttgccttaccgccgattatttca
aggcttcaaggtacaaaagacataactggcattgccaatgccagtcaacaagcaggctac
ttagtgtgtttcgttggtttagcggtagccacccttattccctttgccggcaacatcgtc
tcgttattccctatggcagatgagcttcataccattaccgtagattatgtcgtttatgtg
ctgtgtgccatgccgggttttgcgctttatcagtggttacggaattactgtgaagggtta
ggtaaaaccaagcccactatgttaattaccgttataggtttaatggctaatattattggt
aactacctgttcatttacggtgtgggccctattcctgcttttggtggcgcaggttgtggt
gtagcaacagccattgttatttataccatgctaattgctactttcatttacgtacgattt
agcccagcactaaaaaaataccaactattcgatacgtactacaagccgtctgtggtggcc
ataaagcgtacctttaagcttggccttcctatcgccatgacattgctgtttgaagtgacc
ttatttgctgtagtggcattgttactagcgccctttggctcaacaaccgttgccgcacac
caagttgcccttaatttctcagcgcttatgtttatgatacccatgagtattggtatggca
gcgtctattcgaattggttatcgcatagggcaagataatagacggcaagctaaaattgcc
gctcagtgttccattttaattgggtttgttaccgcagcctgtactgcaaccttcacgcta
agtgccaaagcattcatcattgggctttatactagcgacgatgcagtttaccaaatggcg
aatgcgctgcttatttatgcggctatttttcaactttcagacgctatacaagtaatatca
gccaatgccttacgtggatacaaagacacgactgccatgtttattattacatttgtgtct
tactggttaattggcctgcccaccggcgtaatattaggccgtactgattgggtaaccgca
gagcctatgtctgctggcggtttttggattgggtttattgtggggttaagtgcagcagcc
attatgctaggcgcaagactttattatattcagcggccaaactaccgctacgctacctag
DBGET
integrated database retrieval system