Alteromonas sp. Mac1: AV939_16635
Help
Entry
AV939_16635 CDS
T05687
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21397
ABC transport system ATP-binding/permease protein
Organism
ale
Alteromonas sp. Mac1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ale00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ale02000
]
AV939_16635
Transporters [BR:
ale02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
Other subfamilies
Other ABC transporters
AV939_16635
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
FHA
ABC2_membrane
Yop-YscD_cpl
AAA_21
ABC2_membrane_3
SMC_N
AAA_22
RsgA_GTPase
Rad17
AAA_29
AAA
Methyltransf_7
AAA_25
nSTAND1
AAA_28
NB-ARC
AAA_18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ88058
LinkDB
All DBs
Position
3922758..3925307
Genome browser
AA seq
849 aa
AA seq
DB search
MSEALQAPTYVKENKMAELQAVSVTITSLSGVESEFVLSQNGEFDIGRSDTCYSSINAEL
LSRRHLTLRYTDGQIFVTDNNSSNGSAIGDVRLIGGQTYAVQLPSTILLANGSIHVQLSS
VAEQLASNSPPNTLKPTTSSPSSTSHLTGQGLNLASNLDAAPQGPITHSGSGNDELHQLL
LTHGQVLIGRSYDCNYVIDSLQASRKHALLTLSNNRITLKDLDTTNGTFVNGERIAGSVN
ITATDEITIGTTTFAIQTGTVELKYAIVADNIEKVYAKGIVGLNTMSLKIPSQQFIALMG
PSGCGKSTLLKGLNGANPITSGAITVQGLKLNNSNYNTLKKYIGYVPQDDIVHGELSVEK
TLFYAAKLRISDDVTKQEIKNKISTVLASLNLDTDAIRKSKVSDLSGGQRKRVSIAVELL
NDPKILFLDEPTSPLDPETIEDFLSCIRRLVSKGQTVIMVTHKPSDLDYVDQVIFLSKGG
YQTYYGDKNQLLNHFEKDNIIEVYSMMKNPNQGKRWYDHWVSQNPASELSVKQEVLANKS
NTALLGQYFWLCVRYFNIKLNDHANLLLLLAQPLIIGGLLVFIFSKLQVSVMFMMAVSAV
WFGVSNAAKEIVSELPIYERERMYNLNIFNYIASKLTVLSIIACIQVAIFIGITHLAYSG
GNSVNGISEETQLWSISSTALFMLLLSVSATLFGLFLSAVFTTTEKVMTFVPIALMPQIM
LAGIIAPLDNNIKILLSYLTLGRWGTEGFAHIQDEAARELGKWTNEKADIPASVMQRVLT
PPTTGNENNAAEFTTQGAMQQLNLYDDKSGMVSLFPESFTGVIIAITLINILAFCGLLLA
LRSKDKRFI
NT seq
2550 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagcgaagcactgcaagcgccaacctatgttaaagagaacaaaatggcagagttacaa
gcagtaagcgttaccataacttccttgagtggggttgagtcggaatttgtcctgtcgcaa
aacggtgagttcgatattggtcgttctgacacttgctattcaagcattaatgctgagtta
ttatcgcggcggcatttaacgttgcgctacacagatgggcagatttttgttaccgataat
aacagctctaatggcagcgctattggcgacgtgagattgattggggggcaaacctatgca
gtacaactgcccagtactattttattggccaatggcagcattcacgttcagctttcatct
gttgcagagcaactagcttcaaattcaccacccaatacactaaaaccgactacgtcatcg
ccttcatcgacttcacatttaaccggacagggcttgaatttggcgtctaatttggatgct
gcaccgcaagggcctataacccacagcggatcaggaaatgacgagcttcatcaactgttg
ttaacccacgggcaagtattaattggtcgttcttacgactgcaattacgtaattgattcg
ctacaagcttcacgcaaacatgcgttgcttacgctttctaataatcgcattacccttaaa
gatcttgatacaaccaatggcacctttgtaaacggcgaaagaatagctggctcagtaaac
atcaccgccactgacgaaattactattggtactacaacgtttgcgattcaaaccggaact
gtagaactcaaatatgccattgtggcagataatattgaaaaggtttatgccaaggggata
gttggcctgaacaccatgagtttgaaaatacccagtcagcaatttattgccctaatgggc
ccttctggatgcggtaaatcaacccttttgaaaggcttaaatggcgccaatcctattacg
tcaggtgcgattactgttcaaggcttaaagcttaataatagtaactacaatacccttaag
aaatacattggctacgtgccccaagacgatattgtgcacggtgaattaagtgtggaaaag
acccttttttacgcggccaaattacgcatttcagacgacgtaacaaagcaggaaatcaaa
aataaaattagtacggtattggcaagtttaaacttagataccgacgctatcagaaagagt
aaagtgagtgatttatccggcgggcaaagaaaacgagtatctattgctgtagaactactt
aacgatcctaaaatactgtttcttgacgaacccacctcccctttagatcccgaaactatt
gaagattttttatcgtgtattaggcgactagtgagtaaaggccaaacggttattatggta
acgcataaaccctcggatttagactatgttgatcaggttatctttttgtcgaagggggga
tatcagacctactacggcgataaaaaccagctgcttaaccacttcgaaaaagacaatatc
attgaagtgtattctatgatgaaaaatcctaatcaaggcaagcgttggtacgatcactgg
gtgagtcaaaacccggcttctgaacttagcgttaagcaggaagtacttgcgaataagtcg
aataccgcgcttttagggcaatatttctggctatgtgttcgctattttaatatcaaactt
aacgaccacgccaatttgcttctactgcttgctcagcctcttattattggggggttattg
gtcttcatatttagcaagttacaggtcagcgtaatgtttatgatggcggtttccgccgtg
tggtttggcgtaagcaacgctgccaaggaaatagtatcagaactgcccatttatgaacga
gaacgcatgtataacctaaacatctttaattatattgcatctaaattaacggtactgtcg
attattgcctgcattcaagttgccatattcatcgggattactcatttagcttacagcggc
ggtaatagcgttaatggcattagtgaagagacacaattatggagtataagtagcaccgcg
ctctttatgctgctgttatcggtttctgccaccctattcggattgtttctatcagcagtt
ttcactacaaccgaaaaagtcatgacctttgtacctatcgcccttatgcctcagattatg
cttgctggtattattgcgccattagataacaatataaaaattctacttagctatttaacg
ttaggtcgctggggaacggaagggtttgcccacattcaagatgaagccgctagagagcta
ggtaaatggacaaatgaaaaagccgatattcctgcttcggttatgcaacgcgtgttaact
ccacccacaacgggaaacgaaaataatgccgcagaattcaccacacaaggcgcaatgcag
caactcaatttatatgacgataagtcagggatggtgagcttatttcctgaaagttttaca
ggagtaattattgccatcacattgataaatatattggctttctgtggattgttacttgca
cttcgaagcaaagataaacgctttatttag
DBGET
integrated database retrieval system
