Alteromonas sp. Mac1: AV939_17270
Help
Entry
AV939_17270 CDS
T05687
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
ale
Alteromonas sp. Mac1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS
cREC_REC
HATPase_c_2
HATPase_c_5
MLTR_LBD
PAS_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ88170
LinkDB
All DBs
Position
4079024..4082476
Genome browser
AA seq
1150 aa
AA seq
DB search
MTFGWVTLAVLYLFLLFSLASWGDKNSPRARALTSHPAIYSLALAIYCTAWTFFGMVGQA
SRDTWIYLPIMLGPILVYVLGYRFIYKLTLVSKKQHITTISDFIASRYGKRQTVALLVTV
IALLATIPYIALQLKAIGSTFQLLTQQPNSNFIVIAATTFIAIFAIYFGTKHADVTEYRR
GLMLAIAFESTIKLLALVLVAFVGYSAWRQTETGPFLETFVNTAALSQFSSFNFIAQTIM
AAAAIVCLPRQFHVAVIDNLSLSHLKTARWLFPLYLAIISAVIPIIAIAGKAIFAGASVE
PDSYVLSLAMFSGSALLQVIVFVGGLSAATAMIIVATLTLSTMLTNDVILPRYLAFRGNH
SEKRDFSAQIRLIRRIVIGFILLMAFLYHQQMTSSRSLHSIGLIAFSLVIQLMPAILGGL
YWKRAHAHGVYAGLLVGIILWVLWLVFPLVGKQTSQFANNELISQGAMISLGANAVMYII
FSWFAPHRLIDRIQAEAFVSPAVVKNSVIKGPNSNVTVSDLITLLSTFMGTGRCEQLIEQ
YQHHNSCTLNHQASPDEDFLTFCERALGGVIGASSAKVLLDSALRGKKMDFTEVINFFDD
TTQAMQFNMTALLTSLENMDQGISVVDKHLNLVAWNKRYAALYTYPEDFLAVGIPIEKLI
RFNASQGEFGKLDVEAEVEKRLEHLRSGTPHRFKRQRKDGRVIEMVGNPLPGGGFVTSFN
DITDHIEIQQALEESNIDLEARIKRRTEEVHTINAELRLEIERRSGAETELIRARKAAED
ANASKTRFLALASHDVLQPLNAAKLYISALEEQELSNGVHEIIQKLHHSVTSSEALIGTL
LDISRLDQGEMKPDIEPVDVQALLSPLIDDIRMRAQEKGLSLRVWVKPLWVMADKTYLYR
IMQNLLSNAVKYTQKGKVLLVIKSTKSSVSFRVYDTGIGISEDKKDNIFSDFYRINQSAE
HGIGLGLGVVRRLSQQLGSDITVSSSLQKGSCFTFSLPKAQPGSSISTTTKPKNTTFTGL
QVLCVDDQRENLDAMQTLLARWGVKVMLAGSWDEALALIEQTSPQILLMDYQLSHDETQN
GLALIDKIRFQLDAILPAALITATPDEDLVAKCKEQGVNYLSKPLKPAKLRALLQSMTRH
IHESHYSDSD
NT seq
3453 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgttcggttgggttacgcttgcggtactgtatctatttttacttttttccttggcg
agttggggcgataagaactcgcctcgagcacgagcgttaacttcgcacccagccatctac
tcactggcactcgccatatattgcacggcgtggacattttttggcatggtagggcaagcc
agccgtgacacatggatttacctgcccattatgttagggccaattttggtatatgtgctt
gggtatcgatttatttataagctaactctagttagcaaaaagcaacatatcaccacaatt
tctgattttattgcgtctcgttatggcaagcgccaaaccgtcgcattgttagtgaccgtt
atcgcgctgctggctaccattccgtatattgcgttgcaattaaaagcgattggctccact
tttcagttgttaactcaacagcctaatagcaatttcatcgtgattgccgccaccacattt
attgccatatttgcgatttattttggtactaagcatgccgatgtaaccgagtaccgcaga
ggattaatgctcgctatcgcctttgaatccactattaagttattggcgttggtgttggtt
gcatttgtgggctacagcgcgtggcgacaaaccgaaacaggcccttttctagagaccttt
gtaaacactgccgcactgtctcaatttagctcgttcaacttcattgctcagaccatcatg
gccgcggctgctattgtgtgcctgcctcgccaattccatgtggcagtcattgataacctg
agcctttcacacttaaaaacagcccgatggttgttcccgctttatctcgcgattatttct
gcggttattcccattattgctattgcgggtaaagccatttttgctggtgccagtgttgag
cccgactcctacgtactatccctggctatgttctctggttcagccttgctacaagttatt
gtatttgttggggggttatcagctgcaactgcaatgattattgtggcaaccctaacccta
agcaccatgttaaccaatgacgttattttacctcgctacttagcgtttcgcggcaatcac
tctgaaaaaagagatttctctgcgcaaatacgccttataagacgcattgttattggcttc
atattactaatggcatttttgtaccatcaacagatgaccagtagccgctcgctacattca
attgggcttattgcgttttcactagtgattcaattaatgccagcgatcctcggtggatta
tattggaagcgcgcacatgcccatggggtttacgcgggcttgttggtgggaataatactt
tgggtattgtggttagtatttccgctggtaggaaagcaaacatcacaatttgccaataac
gaacttatcagccaaggcgcgatgataagccttggtgcgaatgccgtaatgtacattatt
ttctcgtggtttgccccgcaccggcttatcgacagaattcaagccgaggcttttgtgtct
cctgctgtggttaaaaacagtgtcattaaagggccaaatagcaatgttacggtatctgac
ctcattacgttactatcgactttcatgggtacaggtcgatgcgaacagcttattgagcaa
tatcaacatcacaacagctgcacgttgaaccaccaagcttctcccgatgaagactttctt
acgttttgtgagcgcgcgctgggcggtgttataggtgcatccagcgccaaagtattgtta
gacagcgcactgcgtggcaagaaaatggacttcacggaagtcattaactttttcgacgac
accacacaagccatgcaatttaatatgaccgcgcttttgacctcgttagaaaacatggat
caaggcattagcgtagtcgataaacacttaaatttagtggcttggaataagcgatacgca
gcactttatacctaccctgaagattttcttgcagtgggcatacccatagagaaacttatc
cgtttcaacgcatcacaaggggaatttggcaaactggatgtagaagcggaagtagaaaag
cgcttagaacatttgcgctctggtaccccccaccgattcaaacgtcagcgaaaagatggc
cgtgtaattgaaatggtaggcaaccccctaccaggaggcggctttgtgaccagttttaat
gacatcaccgaccacattgagattcaacaagcccttgaagaatcaaatatcgacttagaa
gctagaataaaaaggcgtaccgaagaggtgcataccatcaacgccgaactacggcttgaa
atagagcggcgctctggagcagaaactgaactgatacgggctagaaaggccgccgaagat
gcgaatgccagtaaaactcgcttcctagcactggccagccatgatgtacttcagcctttg
aacgccgccaagttgtatatttcggcgttagaagaacaagagctatcgaatggtgtacat
gaaatcattcaaaagctgcaccactcggtaacctcaagtgaggcacttatcggtacgctt
ttagatatatcacgccttgatcagggtgaaatgaagccagacattgagcccgtagatgta
caagctctgctcagcccgcttattgacgatataagaatgcgagcacaggaaaaaggtctt
tcgttgcgggtatgggtgaaaccactttgggtaatggccgacaaaacctacttgtataga
attatgcagaatttactgtcaaatgctgtgaagtacacacaaaaaggcaaagttctactt
gttataaagtccaccaaatcatcagtttcttttcgtgtttatgacacaggaattggcatt
tcggaagataaaaaagataacatttttagtgatttctatcgcattaatcaaagtgcagaa
catggtattggcttggggctaggtgtggtacgtaggttaagtcagcagttgggtagcgat
ataaccgtatcgtcctcactgcaaaaaggcagttgctttacttttagcctgccaaaagcc
cagcccggttcttcaataagtacaacaaccaagcctaaaaacacaactttcactggatta
caggtactttgtgtagacgaccaacgggagaacttagatgcaatgcaaacgttgcttgct
cgctggggcgttaaggtgatgttagccgggtcgtgggatgaagcccttgccctgattgag
caaacatcgcctcagatattattgatggactatcaattaagccatgatgaaacgcaaaac
ggcttagccttaatagataagattaggttccaacttgatgccatactacccgccgcgctt
atcacagctacgccagatgaagatttagtggctaaatgtaaggagcaaggggttaactat
ctatctaagccgttaaagccagcaaaactaagagcgctacttcaaagtatgactcgccac
attcacgagtcacattatagcgatagcgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
