Algoriphagus sp. NBT04N3: GYM62_06290
Help
Entry
GYM62_06290 CDS
T09623
Name
(GenBank) beta-galactosidase
Organism
algo
Algoriphagus sp. NBT04N3
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_2_N
Glyco_hydro_2
Glyco_hydro_2_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYH38428
LinkDB
All DBs
Position
1468369..1470192
Genome browser
AA seq
607 aa
AA seq
DB search
MRSSLFLILLFSCTYAFGQANFLKTPWTDQVSSDAPLQDYPRPQLVRSEWQNLNGPWDYS
ILPKGSLPEIGFAGKIIVPFPVESYLSGVQQPVGPDNEIWYQKDFELALKSNKKRILLHF
GAVDWESEVWVNGKSLGIHRGGFDSFSYDITDHLEPGKKQQIRVRVWDPSDSGPQPRGKQ
VKNPRGIWYTPVTGIWQTVWLESVPKSYISETFSVSNFEQKTQVFHTSVIESKPGQKVEI
QLTNQGVLIASGSNFVGEPIQLKLENPIPWSPQQPHLYDVKIKLLDGSKVIDEVSSYAAF
REVKMAKARDGHQRIFLNGEPLFQYGPLDQGWWPDGLYTAPTDEALAFDIEKTKEMGFNM
IRKHVKVEPARWYYHADKLGMLVWQDMPSGDMGNKWEIRPGVIREGTSKERNGESESIFK
TEWTEIIQEFKFFPSIVVWVPFNEAWGQFKTAEIVDLTRKLDLTRLINSASGGNFEWENP
KEADLVGDILDLHNYPDPVMPDPTLFGEKNILVLGEFGGLGLPLDGHTWQNRDNWGYQSF
SDQAELFARYSLLMEDLKEFIPKGLAAAIYTQTTDVEVEVNGLMTYDRQVFKFDLNALKK
LHSELYR
NT seq
1824 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgctctagtctttttttgattttattgtttagttgtacatatgcctttgggcaggct
aattttttaaagactccctggacggatcaagttagctcggatgcgcctttacaggattac
ccaaggcctcagttagttcgttcagagtggcagaatctgaatggaccctgggattacagc
attcttccaaaaggcagtttgccagagattggatttgctggaaaaatcatcgtgcctttt
cctgtagaatcttacttgtctggagttcagcaacccgttggtccggataatgaaatttgg
tatcaaaaagacttcgaattggctcttaaatctaataagaaaagaatattgctgcatttt
ggagctgttgactgggagtcagaagtttgggtgaatgggaaatcgcttggtatacataga
ggagggtttgactcattttcctatgatatcaccgatcatttagagccaggaaaaaaacag
caaatcagagttagagtgtgggatccaagtgattccggtccacagccaagaggaaagcaa
gttaaaaacccaagaggaatttggtatacaccggtcactggaatttggcaaaccgtatgg
ttagagtcagttcctaaatcttatatctctgagactttctctgtttccaattttgagcaa
aaaactcaagtttttcatactagcgtaattgaatctaaacccgggcagaaggttgaaatt
caattgaccaatcaaggcgtgctaattgcctctggatctaattttgttggtgagcctatt
caactaaaattggaaaatccaattccatggtctcctcagcaaccacatttgtatgatgtt
aaaattaaattacttgatgggagcaaggtcattgatgaagtcagttcatatgccgctttt
agagaggtcaaaatggctaaagctcgagacgggcatcagcgaatttttttaaatggagaa
cctttatttcaatatggacctttagaccaaggctggtggccggatggattgtatactgcg
ccaaccgatgaagctttagcttttgatatagaaaaaaccaaggaaatgggcttcaacatg
attagaaagcatgtgaaggtagagcctgccagatggtattaccatgcagacaaattagga
atgctagtttggcaagatatgccttctggagacatggggaataaatgggagataagacct
ggagtgattcgagaaggtacttccaaagaaagaaatggagagtctgagtcaatttttaag
actgagtggactgaaatcattcaagaattcaaattcttcccttccattgttgtttgggtt
cctttcaatgaagcatggggccagtttaaaactgctgaaatcgtggatttaaccagaaaa
ttggatctaacccgcttgataaattctgccagtgggggaaattttgaatgggagaatcct
aaggaagccgacctagtgggagatattttagatttacataattatcccgaccctgttatg
ccagatccaactttatttggagagaaaaacatcttggttcttggggaatttggaggatta
ggattgccgcttgatggtcatacttggcaaaatcgggataattggggctatcagagtttt
tcggatcaagcagagctttttgccaggtacagtcttttgatggaggatcttaaagaattt
attcctaaaggattagctgcggctatttatacccaaactacagacgttgaagtagaagta
aatggattaatgacctatgatagacaggtattcaaatttgacctgaatgctctaaagaaa
ttacacagtgaactgtatcgataa
DBGET
integrated database retrieval system