Algoriphagus sp. NBT04N3: GYM62_16140
Help
Entry
GYM62_16140 CDS
T09623
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
algo
Algoriphagus sp. NBT04N3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Gly_rich_2
Ig_7
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYH40246
LinkDB
All DBs
Position
3689970..3695099
Genome browser
AA seq
1709 aa
AA seq
DB search
MRRNILTSLFLAFLIIVGLEAYGQTRTLTLNTPGSGNFTIPYNISTIEVQVWGGGGGGGY
NSASNRPAAGGGGGGFSSHPLLPVTPSTNINYTVGNGGLGGTPSIVSTDGSLSIFGSITA
NGGRRGNELIGGTGGAGSGGSLNFSGGNSNNAPNSNNRGGSGGGGAGGPGGAGNPGLAAL
STLGGIGGTSIGGGAGGNGGDSGNSGSEGNQPGGGGGGEGTGNGNGGNGGNGRIILNWAC
NSSLVSGNPNPAPICLGTGIGTITYNLTGATGYNINWSPSVPSGINVTTDPIAGTVSIQG
NPSSTGTFSYTLTPTYPSGSTGGCTGPSSFSGSFIVNANNTAGTISSNIFCQGSPLPAGV
TQPTTGATGIGAISWTPSNPGGITASWASNQITFSGTPATSGTFNYSIPLTGGCGNINAT
GTITINATPAITAQNTPGGVTCINGTPFGQLSVGTGFGYTYQWYSNDTQDYTTPNLISGA
TSNTYTPPNNISGTSYYYVVVNSPTCSSVTSSVSGAYIVNPNNTVSPASSSPTVCVSTAI
PTITHSVTGGTGLGTITWSPSNPGGITASLNSGIISINGTPTNFGVFSYSIPVTGGCGIV
NATGTIIVNAQAAIISPSLTGQTRCENAAFSPISVANRQGFTYQWFENTANNNSSGTAIA
GATSNSYTPPSTPGPTKYYYVRVTSSACSTTATSAASGPFVVNSLPIVSFVGQPTPGNYC
VDTNISYSTQPGETNYVWTIPGTVNVDYTIVSGGNGNPNLVLRWLTPGNKSVTVNYQDAQ
GCGATTPAISNTITIQKNFASPPSNPNPSSCNPVVGGGIFPTITHNTTGATGISNAGISG
ANGLPLGLSATWSGTATNGTITISGTVDPSVTPGPKSYSIPLTGGCGTVAATGVIDIQPQ
YTITEISSVSPSNLGGAATVTLKVNPASFANGPFVINYQRGLANPLAANNITVNFTNGVA
TFFSPGINNADLTSLTINSIRKDTDPTSCPITLTSNNNTFFGIQPKIFDSNGTFYVPAGI
FQVTVKVYGAGGGGGGGNLSSNSAGGGGGGYSERTINVIPGEPLGIFVGAGGAGQINPGT
PAGNGGNSWVTRDSSHPNPQASSVAYAFGGGGANGTTRGAAALPGLNGTINQPGNIGALP
NTTAPDTGGRGGKGGGPDGGNGGLGGAGAGNRPGDPGIPFGGGGGGAKGNANGGNGAGGY
VIITYPLPQVSSCFKVIDDGAISGTTVIEFTCNTSWTAPEGLAGFSAVVGGAGGGGGYGS
GSGGGGAGQLVQNLSYTTTNPYGLPAGTTFSITVGQGGQGAANINEKGGIGLPSSITGTI
DGSPISGAFALGGGGGGSRGNGLGTSGASGGGGAASSPPVTIFQGGAPSNTSIGKAGGTG
DASTNGAHAGGGGGGIFSLGQTGQGAGTGQGKGGDGGNGIQFVIAGVTRNFGAGGGGIGN
NFNGVNKFNGLGGKVVNSAGQVVDVKIGGDGNQDNASSIGLQGLDRTGSGGGAGFAGGGR
GGNGVVYIYYFNFRILEVEYLYFETTYLKSDKKGLLKWATSKEWENSHFEIERSINGVDN
WKKIGSVKGQGYSNDPFEYQFSDENLPPSGGIIYYRLKQFDFDGKFTYSKVKSIQVEPVS
GSSYWVTYPNPSSRNEQIKLTLLNTSVYNDEPIIIRISDAKGVTETYAVRSPEDVSEKVN
FHLRAIDQGVFVVQLIWGNHQQQIKLIRI
NT seq
5130 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagaaatatacttacatctttatttttagcttttctgattatagtcgggttggag
gcgtatgggcagacaagaactttgactttaaatactccgggatctggtaattttacaatt
ccatataatatttcaacaattgaggttcaagtatggggcggtggtggcggtggtggatat
aactctgcaagtaatcgacctgctgctggtggaggtggtggaggattttcaagtcacccg
ctgttgcctgtaactcctagcacaaatattaattatactgttggtaatggcggacttggg
ggaactccatcaatagtttctacggatggatcattatcaatatttggatcaataacagca
aatggaggtagaagaggaaatgaacttattggtggaacggggggggctggctctggcgga
tcattaaacttttctggtggtaattcaaataatgctccaaattcaaataatagaggaggt
tctggtggaggtggagctggcggaccgggtggagcaggaaatccgggattagcagcatta
tcaacattaggagggataggtggaacttctattggaggtggagctggtggaaacggagga
gatagtggaaactcaggttcggaaggaaatcaaccaggtgggggtggtggaggagaagga
acaggaaatggtaatggtggcaatggtggtaatggtagaataatcttgaattgggcctgt
aattcatcattagtttctggtaatccaaacccggctccaatatgtcttggtactggtata
ggaactataacatataatttaactggagcaacaggttacaatattaattggtcaccatct
gttccatcaggaattaatgttacaactgatccaatcgcaggaactgtaagcattcaaggt
aacccatcttctactggcacgttttcttatacacttactcctacttatccttcgggctct
actggaggatgtacaggaccatcttcattttctggctcttttattgttaacgcaaataac
actgctggaacaatttcctcaaatatcttttgccaaggctcaccactacctgctggagta
actcaacctactactggagcaacaggaataggcgccatttcttggactccttctaatcca
ggaggaattacagcctcttgggcatccaaccaaattactttctccgggactcctgctaca
tcgggcacctttaattacagcattccattaacagggggttgtggaaatattaatgcaact
ggaacaataacgataaacgctacccctgcgattacagcccagaatactccaggaggtgtt
acatgtattaatggtactccatttggccagttgtcagttgggacagggtttggatacact
taccaatggtacagcaacgacacgcaggattataccactcccaacttgatttctggggct
acctcaaacacttacacccccccaaataatatctctggaacatcttattattatgtagtg
gtaaattcacctacctgtagcagtgtaacaagctcagtttctggagcatatattgtaaat
ccaaataacacagtgtctcctgcttcttcatcgccgacagtttgtgtgagcacagctatt
cctacaataacacacagtgtcacaggaggaaccggtttgggaacaatcacatggagccca
tccaatccaggaggaatcaccgcaagcttaaattcaggtataatttcaatcaatgggact
ccaacgaattttggggtattttcctattccattccagttactggcggatgtggaattgtc
aatgcaacaggaaccattatagttaatgcacaagctgcaattatttctccaagcctaaca
ggacagaccagatgtgaaaatgcggctttctctcctatctcagtagcaaatcgacaagga
tttacctaccaatggtttgaaaacactgcaaacaacaactccagcggaacagctatcgcg
ggtgccacatccaattcctatacccctccctctactcctgggccaacaaaatattattat
gtgagggttacatcgtccgcttgtagtaccacagctactagtgcggcatcaggacctttc
gtagtaaactccttaccaattgtttccttcgtcggtcaaccaacaccaggaaattactgt
gtagataccaatatctcctattcgacacagccaggagaaacaaattatgtttggacaatt
cccggcactgtaaatgtcgattatacaattgtatccggtggaaatggaaatcccaatttg
gttttaagatggctaactcctggaaacaagtcagtaacagttaattaccaagacgcacaa
ggatgtggggcaaccactccagctatctcaaatacaataacaattcagaaaaattttgct
tctccaccatcaaacccaaatcctagttcctgtaatccagtggtaggaggcggaattttt
ccaacgattacacataacactactggagcaactggaatttcaaatgctggcatttcagga
gccaatggtcttccattaggattatcagctacttggtcgggaacagcaacaaatggtaca
attacaattagtggtactgttgacccttcggtaactcctggtcctaaatcctattctatt
cctttgactggtggatgtggaactgtagctgcgacaggagttattgatatacaacctcaa
tatacaataacagaaatttcttctgtctctccttcgaatcttggaggtgcggccaccgtc
accttaaaggtaaatcctgcttcatttgcaaatgggccctttgtaataaattaccaaagg
ggattagcaaacccacttgccgcaaataatatcacagtaaatttcaccaatggtgtagct
acatttttcagtcctgggataaacaatgctgatttaacttcattgaccatcaactcaatc
aggaaggatactgatcctacttcttgcccaattaccctcacatccaacaacaatactttt
tttggaatccagccaaaaatctttgactctaatggaacattttatgttccagcaggaatc
ttccaagtaactgtcaaagtatatggcgctggtggtggtggtggtggtggcaacctatct
tcgaatagtgctggtggtggtggcggaggatattctgaaagaacaataaatgtgatacca
ggtgaacccttaggcattttcgtgggtgctggtggtgctggtcaaattaatccaggtact
ccagctggaaatggaggtaatagttgggttacaagagactcaagccaccctaatccacaa
gcatctagtgtagcctacgcttttggaggaggtggagcgaatggaactacaagaggtgca
gcagcacttcccggattgaatggcacaattaatcaacctggaaatattggagctcttcct
aacacaactgcgcctgacactggtggtagaggaggcaagggaggaggtcctgatggtggt
aatggagggcttggaggtgcaggagcgggaaatagacctggtgaccctggtattccattc
ggtggaggaggcggtggagccaaaggaaatgcaaatggtggaaatggcgccggcggatat
gtaattattacttacccgcttccacaggtctcatcatgctttaaagttatcgatgacgga
gctatttcgggaactaccgttatagaattcacttgtaatacctcttggacagccccggaa
ggactagctggatttagtgcagttgtaggtggagctggaggtggcggtggctacggctca
gggagtggtggaggcggtgccggtcaactcgtacaaaatttatcctataccaccactaac
ccatatggactccctgctggaactacattttctattacagttgggcaaggaggtcaagga
gccgctaatataaatgaaaaaggtggcataggtttaccctcttcaataactggaaccatt
gatggaagtcctatttcaggtgctttcgctttaggaggtggagggggtggctcacgagga
aacggcctaggtacgagtggcgcttcaggtggtggcggggcagctagctctccccctgta
acaatttttcagggaggagctccttcaaacacttcaattggaaaagcaggtggaacagga
gatgcttccacaaatggtgctcatgccggcggtggaggtggaggaatcttttctttaggc
caaacaggacaaggggctggaacaggtcagggaaaaggtggtgacggaggaaatggcatc
cagtttgtaattgcaggagtaacaagaaattttggagcaggaggcggcggaataggaaat
aattttaatggtgtcaataagtttaatggcctcggaggtaaagttgtaaattcagcaggc
caagttgtagacgtgaaaattggcggtgatgggaatcaagataatgccagttcaattgga
cttcaaggcttggatcgaactggttctggtggaggggctggattcgctggaggcggcaga
ggaggaaatggcgtggtttatatttattatttcaatttccgtattctagaagtagagtat
ctttactttgaaaccacctatcttaaatcagataaaaaaggactgcttaaatgggctact
tctaaagaatgggaaaactctcattttgaaattgagcgttcaattaatggtgtagacaat
tggaagaaaattggcagtgttaaaggacaaggctattcaaatgatccttttgaatatcag
tttagtgatgaaaatcttcccccttctggaggaattatttactatagattaaagcagttt
gattttgatggaaaattcacttacagtaaagtgaaatcaatccaagtggagcctgtttca
ggaagttcctattgggtaacatatccaaatccaagtagcagaaatgagcaaataaaactc
acccttctaaatacatcagtttataatgacgaaccgatcataatcagaatatccgatgca
aaaggagtcacagagacttatgcagtaaggtctcctgaagatgtttctgaaaaggtaaat
tttcacctccgagctattgatcaaggagtatttgtagttcaattaatttggggaaatcat
cagcaacaaatcaaactgatcagaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system