Actinobacillus lignieresii: NCTC10568_00521
Help
Entry
NCTC10568_00521 CDS
T06678
Name
(GenBank) Family of uncharacterised function (DUF490)
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
alig
Actinobacillus lignieresii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alig00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
alig02000
]
NCTC10568_00521
Transporters [BR:
alig02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC10568_00521
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
T2SSN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEB25809
LinkDB
All DBs
Position
1:537201..540434
Genome browser
AA seq
1077 aa
AA seq
DB search
MTKQAPIKLPLDASIPQLEAKNIHIERKVKDKEGKLTTAQSIVKVASLLLQAKADQQAVE
LSQLSLKSDRGDIHGNGLLTLAENYPLNWALNADSPLLTELKIPASQAKIALNGELFGKT
SLDIQTSGAVKANLKGNVQLAEPKTPLNLHLTADAVSYPFMPEKGSDPLKLEKIDLLLTG
DLLNYQLDTQVSATGMRIPASRAHLKGQGEITQFNIDQLALNALEGKANLSGNINWENGV
AWDAQTDLNAINTKSLAPQWAAVLSGGLQSKGYAGRGENGSDWNVEVSHLDLNGSLLQKN
LQLKGEIKSNNDTLLDVPSATLIYGENNIALKGVLSDESDFSAQINAPNLTGLLPKLAAN
IQGNIKLNGKVAEPNLDVDLTAKSLSYDQLSLKNLVAKGKVNTEKTIQGNLDVSLAQLAY
GDVTVENADLAVSGSEANHNLKLSAKGNPIGANLQLSGKFDRLQQVWRGQLSQVAIESKD
FGSFKTNQAVNVSYDNKQVNANVSAHCWNNPKINLCFPQAFNAGQEGKVPFEIKQFNLAT
IQEFLDQNTQLAGIINAKGDAAWFKNKQPQVNVELDSKKLKLVQKLDGGNSFPLTLSPVK
VNANLADNNLKLKTDIKVENNGRLTTDLVMNDVANTRKLSGSIHIDQLTLKLIKPLLTGG
ESVDGNINARLSVGGTVTAPLLNGTLNLSELRAKASAMPFDVTGGHLVLNFHDATSTLSG
RVQTTESELRLDGDADWRRLDAWKTRVHAQAHRFRVNVPNMAKVEFSPNIEVTAMPNELV
LGGNIDIPWARIAVESLPESAVSVSGDEVIMDGSVKQKIPLAQRQIPEKTAGGMAIKANI
NIHIGDDVSINAYGLKSHLNGTIAVRQGKQGLGLYGQVNLKNGRYASFGQDLLIRKGVIS
FAGLPSQPSLNIEAIRNPEAMEDPSITAGVKVIGLADSPEVKVFSEPAMSQNEALAHVLT
GRSLDNSGDAGSSNSMAAALISMSLSKSSKTVGAVGSTFGLKDLNVTTAGIGDNTKVEVS
ASLTPKFKVRYGVGIFAALTELTLRYNLAPRLYLQWVSSVNQAVDLMYRFEFDEMFE
NT seq
3234 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaccaaacaagcgccgattaaattaccgttagatgcatcgattccgcaattggaagcc
aaaaatattcatattgaacggaaagtaaaagacaaagaaggaaagctaacgacagctcaa
tcgattgtgaaagtagcgtcgttgttgttgcaagccaaggcggatcaacaagcggtcgaa
ttatcgcaattatcgcttaaaagtgatcgcggtgatattcacggcaacggtttactgact
ctcgcggaaaattatccgctcaattgggcgttaaatgcggattcgccattattaacggag
ctaaaaattccggcaagccaagcaaaaattgcgttaaacggcgaattattcggtaaaacg
tcgctcgatattcaaacaagcggcgcagtgaaagcaaatttaaaggggaatgttcaactt
gccgagccgaaaactccgcttaatctgcatttaaccgctgatgcggtttcttatccgttt
atgccggaaaagggctctgatccgctgaaattagaaaaaatcgatttgttactcaccgga
gatttactcaattatcaattagatacgcaagtgagtgcgacggggatgcgcattccggcg
agccgtgcgcatttaaaaggacagggcgaaattacccaatttaatattgatcagcttgcg
ctgaatgccttagagggtaaagcaaatctaagcggaaatattaattgggaaaacggagtg
gcatgggatgcgcaaacggatctaaatgcgatcaataccaaatcgcttgcaccgcaatgg
gcagcggtactttccggcggtttgcaatctaaaggttatgctggacgaggagaaaacggt
tcggattggaatgttgaggtttctcatttagatttgaacggttcgcttttgcaaaaaaat
ttacagctcaaaggtgagattaaatcgaataatgacactttattagacgtaccttccgcc
acgttgatttacggcgaaaataatattgccctgaaaggcgtcttaagtgatgagtcggat
ttttccgcgcaaattaatgcgccgaatttaacgggtttattacctaagttggcggcaaat
attcaaggaaatatcaagttgaacggtaaagtggccgagccgaatttagatgtggattta
accgctaaaagcttaagttatgatcagttgagtctaaaaaacttagtcgcaaaaggaaaa
gtaaataccgagaaaacgattcaaggtaatttggatgtgagcttggcacagttggcatac
ggcgatgtaacggtagaaaacgccgacttagctgtaagcggtagcgaagcgaatcacaac
ttaaaattgagtgcgaaaggaaatcctattggcgcaaatttacaactttccggaaaattt
gaccgcttgcaacaagtttggcgaggtcaattaagccaagttgcgattgagagcaaagat
ttcgggtcgtttaaaaccaaccaagcggtaaatgttagctacgataacaagcaagtcaat
gcgaatgtttctgcccattgttggaataatccaaaaattaatttgtgtttcccgcaagcg
tttaatgccggtcaagaaggtaaagtaccgtttgaaatcaagcaatttaacttggcgaca
attcaagaatttttggatcaaaatacgcaattagccggtattatcaatgcaaaaggcgat
gcggcttggtttaaaaacaaacagccgcaagtgaatgttgagcttgattcaaaaaaattg
aaattggtacaaaaacttgatggcggcaacagcttcccgttgacgttaagtccggttaaa
gtgaatgcgaatttagcggataataatttgaaattaaaaaccgatattaaagtggaaaat
aacggtcgtctgactaccgatcttgtgatgaatgatgtggcgaatacacgcaaattatcc
ggcagtattcatattgatcaactgacgcttaaactgattaaaccgttattaaccggaggt
gaatcggttgatggtaatatcaatgcgcgtttgtcggtcggaggaactgtcaccgcaccg
ttattaaacggcacgttaaatcttagcgagttacgggcgaaagcgagtgcaatgccgttt
gatgtcaccggcggtcatttagtgttaaatttccacgatgcgacttcaacgctttccggt
cgagtacaaaccacggaaagcgaattgcgtttggacggcgatgcggattggcgacgttta
gatgcgtggaaaaccagagtacacgcccaagcgcatcgcttccgcgtaaacgtgccgaat
atggcaaaagtcgaatttagcccgaatattgaggtaaccgcaatgccgaacgagcttgtt
ttaggcggcaatatcgatattccttgggcgagaattgcggtggagtccttgccggaaagt
gcggtaagcgtgagcggcgatgaagtgattatggacggttcggtaaaacaaaaaattccg
ttggctcagcgtcagatcccggagaaaaccgcaggcggtatggcgataaaggcaaatatc
aatattcatatcggcgatgacgtcagtattaatgcttacggtttgaaaagccacctaaac
ggtacgattgcggtacgccaaggcaaacaagggcttggtttatacgggcaagtcaatttg
aaaaacggtcgttatgcctcattcggtcaagatttactgattcgtaaaggggtaatcagt
tttgccggacttccgtcacaaccttccttaaacattgaagcgattcgtaatccggaagca
atggaagatccgagtattaccgcaggggtaaaagtgatcggtttggcggatagtccggag
gtaaaagtattttccgaaccggcgatgtcgcaaaatgaagcgcttgcgcatgtgctgacc
ggtcgttcgttagataatagcggcgatgccggatcgagcaattctatggcggcggcatta
atcagtatgagcttatcgaaaagcagtaaaaccgtcggagcggtaggcagtacgttcggt
ttgaaagatttaaatgtaacgaccgccggtatcggtgataatacgaaagtggaagtgagt
gcgagtttaacgcctaagtttaaagtaagatacggtgtcgggatctttgccgcacttacc
gaattaacgttacgttataatcttgcgccgagactgtatttacaatgggtttccagcgta
aatcaagcggtggatttaatgtatcgttttgaatttgatgaaatgtttgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
