Aliiglaciecola sp. LCG003: QR722_11070
Help
Entry
QR722_11070 CDS
T09143
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
alii
Aliiglaciecola sp. LCG003
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alii00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
alii02000
]
QR722_11070
Transporters [BR:
alii02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
QR722_11070
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WJG07903
LinkDB
All DBs
Position
complement(2581677..2584583)
Genome browser
AA seq
968 aa
AA seq
DB search
MKHTHLFKPALLSLAVSTAMFSHHSSAQETAAQDNSVEVISVKGIRGSLIRAQAVKMENS
SIVEAISAEDIGKLPDSSIAESLARLPGMAGERVGGRTSGISVRGFKEDFTGTSLNGREL
IGIGDNRGVEYDLYPSEIMTGATIYKTADAGLMVQGIGGTVDLQTVRPLQAQETLTVNGN
YELSGRDSDNPEFDNKGHRLSLSFVEKFADDTVGLAVALATTESPNNQRKYGVWGYNTND
EGQVTPSGLDSQAISTVLERDTISVVLQFQPTDNLDIIVDALDISYSDSGVIRGFIEPFS
AGAMTGTGTNTTGTQIEANPVLRTDPSQKDGDLQVFGLNVEYHVNDNWSVELDVANSEST
KRDLRGESYAGLARSGALTSDQLGTRDFVMSSDGIYFTGSTGLDAFSDPNALQLTGPQEW
GGGLANLADQFTSTELTANGSPYTYLNAQDGFLNYADFSEELTTYKFEVVGLLDGDVFTK
VTAGVNYSDRYKDKENKGFFATASSYPSSSAIPQQYLYNGLADLTWAGMGYVVAYDGFAP
YEDGEYTLNDAGLLEPDRLGDTYIVEEEITTVYAKVDFNTELGGLPVMGNIGLQYVQTDQ
SSSGYTGVVGANFAVCDANGDQQIDADCIKFVSTDYSHVLPSLNVSMEVADNKFVRFAAN
KTISRARIDQMKASGFVKFDQNIDLIAIPNSQAAVDQYGSPWSKFAGNPLLKPLEANNFD
VSFENYFDDEGYVSAAVFYKDLVNWTRDGNLPINFRSDETNDGADYFIAGFHDRVATEDG
EYGPAKVFYAAGDLITPPDYGTFSYFEDGLTGTVKGLELTANVPFSMFADELEGFGVAAS
ATLIDAELEDGTSIPGQSDRTYSLTAYYAKGGFEVRVAGTDRSEFSTYQRGGSNKIETAT
RNGVTLLDAQISYDFENHDNDYLQGLRVSLQGTNLTDVDEETVNDDGIVTTRRQFGPSYM
LNFNYSFY
NT seq
2907 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacacacacacttatttaaaccagcgctgttgtcgcttgccgtatcgacagcaatg
ttttcccatcacagctcagcgcaagaaaccgctgcgcaagataatagcgttgaagttatt
tccgttaagggcatcagaggctcattaataagagcccaagccgttaaaatggaaaactcc
tccatcgttgaagcaatttctgcagaagatataggtaaattacccgattcatccattgcc
gagtcattagcccgtttgcctggtatggcgggcgagcgagtgggtggacgtacttcgggt
atatcggttcgtggttttaaagaggattttacaggtacctcattaaatggtcgcgagtta
attggtattggcgacaaccgtggtgtggaatatgacttgtatccttctgagattatgacg
ggcgcgaccatatataaaacggctgatgctggactgatggttcagggcattggtggtact
gttgatttgcagactgtacgtccgctacaagctcaagaaaccttaactgtaaatggcaat
tatgagctatcaggtcgtgactctgacaacccggagtttgacaataaagggcatcgtttg
tctctgtcatttgtagaaaaatttgctgacgatacggttggtttagcggtggcacttgct
accactgagtcgcctaataaccaacgtaagtatggggtgtggggctataataccaatgat
gaaggccaagtgaccccttcaggactagacagccaggccatcagtacggtattggaacgc
gataccatatctgtagttttacagtttcaacctactgacaatctagatattatcgtagat
gcgttagacatcagttattctgactccggtgtgattcgcggctttattgaacccttctct
gcaggagcaatgacaggtaccggcactaacaccacgggaacccaaattgaggccaaccca
gtactaagaactgacccgtcacaaaaagacggtgatctacaggtattcggcttgaatgtg
gaatatcatgtaaatgacaactggtcggtagagttggatgtagccaacagtgagtctacc
aagcgcgatttacgcggtgaatcttatgcaggattggcccgttctggcgctttgaccagt
gatcaattgggaactcgtgatttcgttatgagctcagacggtatttatttcaccggctca
actggtttggatgcgttttctgatccaaatgctttgcaacttactggtccacaagaatgg
ggcggtggtttagccaatttggcagatcaatttaccagtactgaattaaccgctaacggc
tcgccatacacctaccttaatgcacaggatggtttcttaaactatgccgattttagcgaa
gagttaacgacctataagtttgaggttgtgggcttgctagacggtgatgtatttaccaaa
gtcaccgcgggtgtgaattacagtgacagatacaaagataaagaaaataaaggcttcttt
gccacagcatcttcttatccttcatctagcgctataccgcaacaatacctttataacggc
ttggcagatttaacctgggctggaatgggttatgtggttgcctatgatggttttgcccct
tatgaagacggcgaatataccttgaatgatgctggcttactcgaacctgaccgtttaggc
gacacctatatcgttgaggaagaaataaccacagtctacgctaaagtagattttaacact
gagctgggcggtcttccggttatgggtaatatcggcttacagtatgtgcaaactgaccaa
tcttcatctggatatacgggggtggtaggtgctaactttgcggtttgtgatgcaaatggt
gaccaacaaatagatgcagactgtataaaatttgtcagcaccgattatagccatgtatta
ccaagcttaaacgtcagcatggaagtagctgataataaatttgtacgctttgcggcaaat
aaaactatcagccgagcccgtattgaccaaatgaaggcatctggttttgtgaaatttgac
cagaacattgatttaattgctattcctaatagccaagctgcggttgatcagtatggctcg
ccttggtctaagtttgcgggtaacccattacttaaacctcttgaagctaataattttgac
gtatcatttgagaactattttgatgatgaaggctatgtatcggccgcggtcttttataaa
gacttagtcaactggactcgagacggcaacttacctattaactttcgcagcgatgaaact
aatgacggtgcggactacttcattgctggattccatgaccgtgtagcaactgaagatggc
gaatacggccccgcaaaagtgttttatgcggcgggcgatttgattacgccaccagattac
ggcactttctcgtatttcgaagatggtttaacgggaacagtgaaaggattagagctaacg
gcgaatgtaccctttagtatgtttgctgatgagctggaaggttttggtgttgccgcttct
gcgaccttaattgatgcagagctagaagatggtaccagcattccaggacaatcagaccga
acctattcactaacggcctattacgctaaaggtggttttgaggttcgagttgccggaaca
gatcgttcagagttcagtacctatcaacgtggcggctctaacaaaatagagacggcgaca
cgaaatggtgtaactttattagatgcccaaatcagttatgactttgaaaaccatgacaat
gattatttgcagggtttgcgtgtatcgctacaaggcaccaatctgaccgacgtagatgag
gaaaccgtcaatgacgatggcatcgtgaccacccgtcgtcaatttggtccttcttatatg
ctgaactttaattactcgttttactaa
DBGET
integrated database retrieval system
