Aliiglaciecola sp. LCG003: QR722_11225
Help
Entry
QR722_11225 CDS
T09143
Name
(GenBank) two-component regulator propeller domain-containing protein
Organism
alii
Aliiglaciecola sp. LCG003
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HisKA
Y_Y_Y
SGL
Hpt
Methyltransf_1N
HATPase_c_2
PPC
Ig_J
HATPase_c_3
HATPase_c_5
Longin
PDE8A_N
TcfC
Phage_SPbeta_YorH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WJG07934
LinkDB
All DBs
Position
complement(2623588..2628186)
Genome browser
AA seq
1532 aa
AA seq
DB search
MSSWLHFALPKRCGLACIIVLACWGWLTQTWAKHGVPSKTNFYQTDLHQLYFNNISPQTM
GLQPFINAIEQDSRGFIWFGTQNGLHRYDGKSMRHYNFIPGDSSSLSNNWIRDLHVDGEG
RLWVATDSGINLYLAEQDAFKSFSPNAVKYPNLLAEEFLVIAEAHDGSMWFGSRDAGLTL
YNPQRDTFTAFQLDPANPESLSSNKITGILVDKTNNLWVATEDAGIAIKLAGSQDFIHLN
EQSAQPFPSNNIADLFQDKQGTIWIATKDKGLYAIDFGFEVTKAYRHDENNGFSLCSDEV
GYIQDDNVGRLWLATAKGLCEFNLETQRFYLYQHESGRPTSLISNAVKTLYQDDGGVMWV
GTFGGVSSWNADVKNFTHISQDFGVGSQLSVNLITSFAQDAHGNLYVGTWDGGVNQIDTN
TSQFTHLKDTGEPGSIKDNRVMSLLVDDKDTLWVGTYQSGLFKRKSGEQHFENYRHDPED
PNTISSNAISKIIQLASGEIAVATYGGGLNILPADGQIKHFKHIASDPSSLSSDRLLDLV
QSADGNIWLATNGGGLNRVDLQRNEITRFVNDPDDPNSIPSNNIYTLLDTENYLWIGTQQ
VGLLRFTKHQSDTHKSNFEYFSINNRVPIQVVFGLLDDENGNIWFTHPNGISQIASDGTF
TRTFNSGHGLQSSDFTAGANFKAKNGRMFFGGSNGFYTFFPNNPPVNRFNAPMALLSFSI
FNHDVPLYKAFRDDGVIELKHSDSVIGFKFAVLDFTKPSDNQYQYKVDGLHDEWVDAGSN
NEITFSNLADGTYTLRVRGANSDGYWSEQELEVQLEVMPPPWKTIYAYVVYLIILISILY
RVYQRQQQKEQAQLRYQQKLESEVEQRTNELKVSNQQLAETIIEKDVARARAEDAAKAKS
DFLATMSHEIRTPMNSILGMGELLLNTHLNPLQRRYASTAHRSGEMLLELINDILDFSKM
EVSKIALEHIAFDVHSLIEESVFYIAGRAHEKDVQIGFNVATDCPTFIMGDPLRLRQILT
NLIGNAIKFTEYGCIVIDVSCEDNRLQIAVSDSGIGMSEQQQQKIFQPFEQADSTTTRKF
GGSGLGLTITKTLVELMKGEISVTSEQHKGSKFIVSLPLEAAQQPTGEYPLAEFGSITVA
VLAFDEPTKSMLLNCLERMQMNYFEITSVSQLTSVEQQKNIIYLVDEAILQDLSWLHGII
EVQSSVIVMTQLNHDQDDLPIASLQILNKPIQRHSLVESIKEKMGLRHTSENVISPLEFG
QNYIFEAKILVVDDSKTNQQVASDMLTLLGCKVEIADHGMMAIEKVKTSHFDLILMDCQM
PVMDGFECTRELRILQNVQHIARLIIVALTAGMGSHYRQECLDAGMDDCMLKPFTAKQLL
ATLQHYLGDKIVAKKVVQNYVLDSQEPAATVDEDSPLAQYINTETVNTIVAVEKQTGRKI
FSRVIETFKTEMQHKIPELLNHYQQGDAENLALLAHSIKSITGNVGAKKLEVYCQIIEKA
GIDNNLAACSDTIDKFSACYEKTLSYLDTFTA
NT seq
4599 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgagttggttacatttcgcccttccaaagcgctgcgggctggcgtgtattattgtg
ctagcctgttggggttggcttacacagacttgggcaaaacatggggtgcccagtaaaaca
aacttctatcaaaccgatcttcatcaactttactttaataatatctctccgcaaacaatg
ggtttacaaccatttatcaacgcaattgaacaagattctcgcggattcatttggtttgga
acccaaaacgggcttcaccgctatgatggcaaatcaatgcgtcattataactttattcca
ggcgacagtagcagtcttagcaataactggataagggatttgcatgtagatggagaggga
cgtctttgggttgcgaccgactcagggatcaatctttaccttgccgaacaagatgcattc
aaatctttttcgccgaatgcggtcaagtacccaaatttacttgctgaagagttcttagtc
attgccgaagctcacgatgggagtatgtggtttggtagtagggatgctggtctgaccctc
tacaatccacaacgagataccttcactgcttttcagcttgaccctgccaatcccgagtct
ttaagtagcaacaagataacgggtattctggtggataaaaccaacaacctttgggtagcg
acggaagatgctggtattgcaatcaaattagccggttcacaagactttattcacttaaat
gaacaaagtgcacaacccttcccaagtaataatatcgcggatttgtttcaagataagcag
ggcaccatttggattgctactaaagataaaggcctgtacgcaattgattttggttttgaa
gtgactaaagcctatcgacatgatgaaaacaatggttttagtctttgttccgacgaagtc
ggatatatccaagatgacaatgtagggcggttgtggctcgctacagcaaaaggcttatgt
gaatttaatcttgaaacccaaagattttatctttatcaacacgagtcgggtcgacccact
agtttgattagcaatgctgtcaagacgctatatcaagatgatggtggggtaatgtgggtg
ggcacctttggaggtgtaagttcctggaatgcggatgtcaaaaactttactcatataagc
caagattttggagttgggtctcagttatcggtgaatctgatcacctcttttgcccaagat
gctcatggtaatctctatgtaggaacctgggatggtggcgtaaatcagattgatacaaat
accagtcagtttacgcacttgaaagatactggcgagccaggctctatcaaggataaccga
gtcatgagcctgttagtggatgacaaggacacattatgggtgggtacatatcaaagtggt
ttgtttaaacgtaaaagtggagagcaacattttgaaaactatcgacacgatcccgaggat
ccaaatacaatcagttcaaatgcaatcagtaaaattattcaattggcaagtggcgaaata
gccgttgcaacatacggaggggggcttaatattttgcccgccgatggtcagattaaacat
tttaaacatatcgcgagtgatcctagctcactgtcaagtgatcgattattagacctggtg
caaagtgcagatggaaacatctggttggcaactaacggtggcggcttgaatcgggttgat
ctgcagcgtaatgagatcacccgatttgttaatgatccagatgatcccaactctatccca
agcaataatatttatactctacttgataccgaaaactatttatggataggtactcaacag
gtaggtctgttgcgatttactaaacaccaatccgatactcacaaaagtaacttcgaatat
ttttcaattaataatagggtgcccatccaagttgtattcggcttgttagacgatgaaaat
ggtaatatttggttcactcatcccaacggtatttctcaaattgcctcagatgggaccttc
actcgtactttcaattcgggccatggtttacaaagcagtgacttcactgccggtgctaat
ttcaaagctaaaaacggtaggatgttttttggtggctcaaatggtttctatacctttttt
cccaacaatcctccggttaaccgcttcaatgcgccaatggcattattgtcatttagtatt
tttaatcatgacgttcctctgtacaaagcgtttcgtgatgatggggtgatagagcttaaa
cattcggattcggtgatagggtttaaatttgccgtgttggatttcaccaagccttctgac
aaccaatatcaatacaaagttgatggattgcatgatgaatgggtagatgccggaagtaac
aatgaaattactttctcaaacctagccgatggaacctacacattaagagtgcgtggcgcc
aatagcgacggctattggagtgagcaagaattagaagtgcagttggaggtgatgcctcca
ccgtggaaaacgatttatgcttatgtagtttatctcatcatattaatcagcatcttatat
agggtttatcagaggcaacagcaaaaagaacaagcacaattgcgctatcaacaaaaattg
gaaagcgaagtcgagcaacgtaccaatgagctaaaagtatctaaccaacaattagctgaa
accatcattgaaaaagacgttgcacgcgcccgtgctgaggatgcggcgaaagctaaatca
gacttcttagccactatgagtcatgaaataagaacgccgatgaacagtatacttggtatg
ggggagttgttgctcaatactcacctgaatccattgcaacgtcgatatgcctcgacagcc
catcgttctggcgaaatgttattagagcttatcaacgatattttggacttttccaagatg
gaagtgagtaaaattgcgctagagcatatcgctttcgatgtgcattccttgattgaagaa
agcgttttttacattgctggtcgagctcacgaaaaagatgtgcaaataggctttaatgtg
gccactgactgcccaacatttatcatgggcgatccattacgcctacgccaaatattgacc
aacctgattggtaacgctattaagttcactgaatacggctgtatcgttattgacgttagt
tgtgaagacaacagattgcagatagcagtgtccgatagcggtatcggtatgtcagaacag
cagcaacagaaaattttccagccatttgaacaggccgatagcaccacaacacggaaattt
ggaggctctggtttaggtctgaccatcaccaagaccttagtggaattaatgaaaggtgaa
attagcgtaacctctgaacaacacaagggctccaagtttatagtgtcattgccccttgag
gctgcacagcagccaaccggtgaatatccgttggcagagttcggcagcataacagtcgca
gttttggcgtttgatgagccaaccaaatctatgcttttgaactgcctcgaacgtatgcaa
atgaattattttgagatcaccagtgttagtcaattaacctcagttgaacaacagaaaaat
attatatacttggtggatgaggccattttacaggatttgtcatggttgcatggcatcata
gaagtacagtcatcggttatcgtcatgacccaactcaaccatgatcaggacgacttacct
attgcatctttgcagatccttaacaaacccatacagcgacacagtttagttgaaagcatt
aaagagaaaatggggcttcggcatacctctgaaaatgtcatatcaccgttagagttcggc
caaaattatatcttcgaagcaaaaatcttagtggtagatgattctaaaaccaaccagcaa
gtcgcatcagatatgttaactctgctgggctgtaaagttgaaattgcagaccatggaatg
atggcaattgagaaagtgaaaaccagccattttgatcttatattgatggactgtcagatg
ccggtaatggatgggtttgaatgtactagagagttacgcatactgcaaaacgtacaacac
atagccaggttgattatcgttgctttgaccgctggaatgggtagtcattataggcaggaa
tgtctagacgcgggcatggatgattgcatgcttaaaccctttaccgccaaacaattattg
gccactttacaacactatttaggcgataaaattgttgccaaaaaggtagttcaaaactat
gttttagatagccaagaaccggccgccactgtggatgaggatagtccccttgcgcaatat
attaataccgaaaccgttaacactattgttgccgtagaaaagcaaacgggtagaaagatt
tttagtcgtgttattgaaacttttaaaactgagatgcaacataaaatacccgaactgttg
aatcattatcaacagggcgatgcggaaaatctagcattgctagcccatagcatcaagtct
attactggcaatgttggagctaaaaaacttgaagtctactgccaaattatcgaaaaggct
ggaattgataacaatttggcggcatgctcagacaccatagataaattttcagcttgttat
gagaaaaccctaagttacttggatacatttaccgcatga
DBGET
integrated database retrieval system