KEGG   Acinetobacter lanii: G8D99_06260
Entry
G8D99_06260       CDS       T06989                                 
Name
(GenBank) CRISPR-associated endonuclease Cas3''
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
alj  Acinetobacter lanii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:alj00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:alj02048]
    G8D99_06260
Enzymes [BR:alj01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     G8D99_06260
Prokaryotic defense system [BR:alj02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    G8D99_06260
SSDB
Motif
Pfam: Cas3_I-F_Cas2 Cas3-like_C_2 DEAD Cas3_HD ResIII HDOD PhoH Helicase_C DEXQc_Suv3 AAA_25 AAA_30 DpnI_C ATPase_2 RsgA_GTPase HD AAA_16 OmpH
Other DBs
NCBI-ProteinID: QIO08665
UniProt: A0A6G8S3F4
LinkDB
Position
1343441..1346389
AA seq 982 aa
MIVTFISQCEKKAIARTRRVLDAFADRIGDNTWQTVITEDGLIAVKKLLRKTVTKSTAVS
CHWIRGRRRSELLWIVGNRNKFNNIGIVPVNSTQKDVFMDVVTMKAKQDEFYANTHRQPL
AEHSFAIGYLAQKLFKKVVDNDEYDNLSKVAFLAGCLHDLGKLDPLFQEWVKKGKQKDPE
DDGQHIDVKFTFDKHPRHNEVSLLLFNFFEQQCKGLNNRQKECLQHILYWHHAKPYRQND
DFTGVYKAYEYLIKNVQADKFEILIKNTSDLVKRINTLSKNYHANESIEKHIDWNVDQAP
ELKENFEYQFKSKHFPEFKHYTNTDSIEVLRDKVRINSEHNLLRACVISADRLISKLSAQ
DLLEYIAEQRLDELLETQETLSNLYEHLSNVSTKFPNSERTQKQNEIAQQLADLRDIAVL
AGPAGCGKTKIALEWAKLKKAKKIFWICPRVQVCQGIFQELTESYLPDAKVEIFTGEFKF
TNAWDKATPETEYLSGDVVVTTIDQILGSIVTHSKVDSLVPFMDAHVVFDEYHEYIGMEI
FNLLFAELIANKNMRKKYEKNTLLVSATPHYSYLKQVLGLHEDDVIAMPSFNDRDYKIEF
IDYDESVIVGNPFYQSYDGQTFVISNTALTAQLGFIYQKNQEKSVLFHSKFKRSDKKYWF
NEVYEAFKKEGTHKFEVLRSGPIVQASLNITAKNMLTEMTSPENMLQRLGRLDRFGESES
VNILKVAITENVKNGSCKGSLAYFLNQLNCLQNTKAWYDFLQNQLAEQSFKLSKLYQLYK
DFHKQQDQDNSAVFQDMQKALKKSIDRINNKVTEPTKVSKPKTTERKSKISKNSLRGDSR
FVQLAKLNLNDYAKPIFENEYAYQPPLDDTTEYDNLTESLNIIQELGLIHFIAQKHGNID
PSHPVKGIPEKKQKSRCMVLENYARDADFPLYLSYIEDDLNKVGGTGVRHPEAIYYAVCD
QQPIGSITLDKLNILTTTPEGN
NT seq 2949 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgtgacctttattagtcaatgcgagaagaaagccattgctagaacacgacgagtc
ttagatgcctttgctgatcggattggtgataacacgtggcaaacggtgattaccgaagat
ggtctcattgctgttaaaaagttattgcgtaaaacggtgaccaaaagtactgcggtgagt
tgtcattggattcggggacggcgtagaagtgagttgctgtggattgtggggaatcggaat
aaatttaataacattgggattgtgccagtcaatagcacacaaaaagacgtatttatggat
gtggtgacaatgaaagcaaaacaagatgaattttatgctaatactcatcgacaaccactt
gctgaacatagctttgcaattggttatttagcacaaaaattatttaaaaaagtagtcgat
aacgatgaatatgacaacttatctaaagttgcatttttagcgggttgtttacatgattta
ggaaagcttgatcctctatttcaggaatgggttaaaaaaggtaaacagaaagatcctgag
gatgatggtcagcatatcgatgttaaatttactttcgataaacatccacgtcataacgaa
gtttcactgttgctatttaacttttttgaacagcaatgtaaggggttaaacaatcgtcaa
aaagaatgtttacagcatatcttatattggcatcatgcaaagccatatcgtcaaaatgat
gattttacaggcgtgtataaagcttatgaatatttaatcaaaaatgtccaagcagataag
tttgaaatattgataaaaaatacatctgacttggtcaaacgaattaacacgctatcgaaa
aactatcatgccaatgaaagtatcgaaaagcatattgattggaatgtagatcaagcgcca
gaattaaaagagaactttgagtatcagtttaaaagcaaacattttcctgaatttaaacat
tataccaatactgattctattgaggtattgcgtgataaggttcgtatcaattcagaacat
aacttattgcgtgcctgtgtaattagtgcagatcgtttgatttcgaaattgtctgcacaa
gatttactggaatacatagctgagcaacgcttggatgaattattagagacacaggaaaca
ctttctaatttatatgaacatttaagcaatgtatccacaaaattcccaaatagtgaacgc
actcagaaacagaatgaaatcgcacaacaacttgccgatttaagagatattgctgtactt
gcaggtccagcaggctgtggtaaaacaaaaattgcgctagagtgggcaaaactaaaaaag
gcaaaaaaaatattttggatttgtcctcgtgtgcaagtgtgtcagggcatattccaagaa
ctgacagaaagctatttgccagatgcaaaggtagaaatctttacgggtgaatttaagttc
accaatgcttgggacaaggcgacacctgagacagaatatctatcgggggatgttgtggtt
accacaattgatcaaatcttaggatcaattgtgacgcatagtaaagtcgatagtttagtt
ccatttatggatgcgcatgtggtgtttgatgaataccatgaatatattggcatggaaatt
ttcaacttattgtttgctgagttgattgctaataaaaacatgcgtaaaaaatatgaaaaa
aatacgttattggtttctgcaacaccgcactattcgtatttaaaacaagttttaggttta
catgaagatgatgtcattgccatgccatcatttaatgatcgtgattataaaattgaattt
attgattatgatgaatcagtcattgtagggaatccattttatcaaagctatgatggacaa
acctttgtaatttccaatacagctttaacagcacaattaggctttatttatcaaaagaac
caagaaaaaagcgtactttttcattctaagtttaagcgtagtgataaaaaatattggttt
aatgaagtgtacgaggcatttaaaaaagagggtacacacaagtttgaggtcttacgcagt
ggtccaattgttcaagcgtcattaaacatcacagccaaaaacatgctgacagaaatgacc
tcgcctgaaaatatgcttcagcgtttagggcgcttagatcgttttggcgaaagtgaaagt
gttaatattttaaaagttgcgattactgaaaatgtaaaaaacggtagttgtaaaggttca
ttggcatacttcttaaatcaactcaattgtttgcagaatacaaaagcttggtatgatttt
ttacagaatcagcttgcagagcaaagctttaagttatccaagctgtatcaactttataaa
gatttccataaacagcaagatcaagataattcagctgtttttcaagatatgcaaaaagcg
ttaaagaaaagtattgatcgaatcaataataaggtgacagagccaacaaaagtatcaaaa
ccgaaaacgacagaacgcaaatctaaaatcagtaaaaactcattacgtggcgatagccgt
tttgttcagttggcgaaattgaacctaaatgattatgccaagcctatttttgaaaatgaa
tatgcgtatcagccaccattagatgatacgactgaatatgataatttgacggagtcttta
aatattattcaagaacttggattgattcattttattgctcaaaagcatggcaatattgat
ccgtcacatccagtgaaaggcattcctgagaaaaaacaaaaatcacgatgtatggtcttg
gaaaattatgcaagagatgcagatttccctttgtacttaagttacatcgaagatgacttg
aataaagtagggggtacaggagtaagacatcctgaagcaatttattatgcggtatgcgat
cagcaaccgattggttcaattacattagacaagctaaatattttaacaacaacgccagag
ggaaattaa

DBGET integrated database retrieval system