Poseidonibacter lekithochrous: ALEK_0627
Help
Entry
ALEK_0627 CDS
T06860
Name
(GenBank) multi-sensor domain-containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
alk
Poseidonibacter lekithochrous
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
CBS
PAS_3
PAS_8
PAS_4
PAS_11
PAS_12
PAS_13
Gp34_trimer
GCH_III
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKJ21930
LinkDB
All DBs
Position
complement(641988..645137)
Genome browser
AA seq
1049 aa
AA seq
DB search
MITKLIQSENDYVEHDVTLQNVLDIMTTNRIKYLVLLKDKKPFGIITERDILFLYAQNID
FKQKALEFAKKDLIISKENRRVDYILSLMINHNIRRVIITDSQNNYLGCILQETIIYELD
KDIYKSHIRIREIVKTSNLVLHVEKDATIQEAIEIMASHNIGSILIYNNDIPVGIITESD
IIDLAQKHVNTNECVEKHMHAPVITFDSETYVYEIVNAMKKNNIRRVVIYNQGLDNHYIV
TSKDLLNNIKGNYGLFLESKLTDAKKTFNSLNEALIEVFINDETEHTISWFNSKATKLFD
LKVDDDVTKIIPKQRWQNIYEKIQNDESFEDQTIELNGSIYQLTILHVKILQTPIIKLLF
TNISELVNKTNEINNKYNETFEQNSVGIVHISLDNKVLDANKKICELLAYEKDNLLDRNI
SDLTHKEDLELTHEKFNTLLKNKDVKDVNLKKRCVKKDGSIIWVSTTASLSYNKQNEAQY
FICFITDITLKEKIKKELILSDIVFENTTEGIIITNEKNKVVSVNKSFTEITGYSLSEIY
GKSPKILKSGKNSQEFYLKMWDDINKNGFYKGEIWNRKKNGEIYAEWLNISTVTNKEGQI
TNYVAIFSDITKMKDSDEQIEYLAHHDPLTNLPNKLLLNARLEQSIQRANTEHQSLAVLF
IDIDNFKLVNDSYGHTIGDRIINLVSQRLQKNVRKADTISRIGGDEFVIVIENVNKENIK
RIAQKIIQDFTEPIKLEEYIFDTTITIGISLYPNNGISYEDLIKHADTAMHSAKAAGKNQ
FHFYKNQMTSEIFEKVLMKQEIKNAIKNKEFEVYFQPQIDTKTKKLIGAEALVRWNHKDL
GVLSPINFIPHAEDNKLIIPLGEYILDESCAFIKKLHSLNIFKNGKIAVNISGEQIKHSE
ITKTIVNTLNKYNVEPKYLEVEVTETFIMEDVEKSIAMFKELKKIGVSLSIDDFGTGYSS
LNYIKQFPIDKLKIDKSFVDELPNNYKDIAIAKTVIALAKGLELRVIAEGVENKEQEEFL
ASQNCDEIQGWLYSKALKKDDFIEFCKNF
NT seq
3150 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattacaaaattgattcaatcagaaaatgattatgtagaacatgatgttacattgcaa
aatgttttagacataatgacaacaaatagaataaaatatcttgttttactaaaagataaa
aaaccttttggaatcattacagaaagggatatccttttcctttatgctcaaaatattgac
ttcaaacaaaaagcattagagtttgcaaaaaaagacttaattattagcaaagaaaataga
agagttgactatattttatcattgatgattaatcataatatcagaagagtaatcattaca
gattcacaaaataattatttagggtgtattttacaagagacaattatttatgaattagac
aaagatatttataaatctcatattagaattagagaaattgtaaaaacttcaaatcttgtt
ttacacgtagaaaaagatgcaacaattcaagaagcaattgagataatggcttcacataat
attggctcaattttaatttataataatgacattccagttggaataatcacagaaagtgat
attattgatctagcccaaaaacatgttaatacaaatgaatgtgttgaaaaacacatgcat
gcacctgtaattacttttgatagtgaaacttatgtatatgaaattgtaaatgcaatgaaa
aaaaataatatcagaagagttgtaatttataatcaaggtttagataatcactatattgta
acttcaaaagatttactaaataacatcaaaggaaactacggattattcctagaatcaaaa
ctaacagatgcaaaaaagacttttaattcattaaatgaagctcttattgaagtattcatc
aatgatgagacagagcatacaataagctggtttaactcaaaagccactaaactttttgat
ttaaaagttgatgatgatgtaacaaaaataattccaaaacaaagatggcaaaatatttat
gaaaagattcaaaatgatgaaagttttgaagatcaaacaattgaattaaatggaagtatt
tatcaacttacaatattacatgtaaaaatacttcaaaccccaataatcaaacttttattt
actaatatctctgaactagtaaataaaacaaatgaaattaacaataaatataatgaaaca
tttgaacaaaatagtgttggaattgtacatatatcactagataataaagtattagatgct
aataaaaaaatctgtgaattgttagcttatgagaaagataatttattagatagaaatatt
tctgatttaacacataaagaagacttagagttaacacatgaaaaattcaatactttacta
aaaaataaagatgtaaaagatgtaaatctaaaaaaaagatgtgtaaaaaaagatggttca
attatttgggttagtacaactgcatcactatcttataacaaacaaaatgaagctcaatat
ttcatctgttttatcacagatattactctaaaagaaaaaatcaaaaaagaattaattctt
tcagatattgtatttgaaaatacaacagaaggtattattattaccaatgaaaaaaataaa
gttgtatctgtaaataaatcttttactgaaatcacaggttacagtctaagtgaaatttat
gggaaaagtccaaaaattttaaaatcaggtaaaaactcacaagaattctatttaaaaatg
tgggatgatattaataaaaatggtttttacaaaggtgaaatctggaatagaaagaagaat
ggtgaaatctatgctgaatggttaaatattagtaccgttacaaataaagaaggacaaatt
actaattatgtagctatattctcagatattacaaaaatgaaagattcagatgaacaaatt
gagtatttagcacaccatgaccctcttacaaatcttcctaataaacttctattaaatgca
aggttagaacaatcaattcaaagagcaaatactgaacatcaaagtttagctgtactattt
attgatattgataacttcaaattagtaaatgactcttatggtcatacaattggagataga
atcattaatcttgtatctcaaagattacaaaaaaatgtaagaaaagcagatactatttct
agaattggtggggatgaatttgtaatagtaattgaaaatgtaaataaagaaaatataaaa
agaattgctcaaaaaattattcaagattttacagaacctataaaattagaagagtatatt
ttcgatactactattactattggtatctctttatatcctaataatggtatttcgtatgaa
gatttaattaaacatgcagatactgcaatgcacagtgctaaagcagcaggtaaaaatcaa
tttcatttttataaaaatcaaatgacttctgaaatatttgaaaaagtattaatgaaacaa
gagataaaaaatgcaataaaaaataaagaatttgaagtatatttccaaccacaaattgat
acaaaaacaaaaaaactaataggtgcagaagctcttgttagatggaatcacaaagactta
ggcgtgttatcaccaattaattttattccacatgcagaggataataaactaattattcct
ttaggagaatacattttagatgagtcttgtgcttttattaaaaaactacactctttaaat
atttttaaaaatggtaaaattgctgtaaatatttcaggggaacaaattaaacatagtgag
attacaaaaactatagttaatactttaaataaatacaatgttgaacctaaataccttgaa
gttgaagttacagaaacatttattatggaagatgttgaaaaatcaatagcaatgttcaaa
gaacttaagaaaattggagttagtttatctattgacgattttggaacaggttattcatca
ctgaattatattaaacaatttcctattgataaactaaaaattgataaatcttttgtagat
gaattaccaaataactataaagatattgccattgcaaaaacagtaattgccctagcaaaa
ggacttgaacttagagtaattgcagaaggtgttgaaaataaagaacaagaagagttctta
gcttcacaaaattgtgatgaaatacaaggttggttatactcaaaagccttaaaaaaagat
gactttatagagttttgtaaaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system