Poseidonibacter lekithochrous: ALEK_3197
Help
Entry
ALEK_3197 CDS
T06860
Name
(GenBank) cadherin repeat domain-containing protein
Organism
alk
Poseidonibacter lekithochrous
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Ig_BT4661_3rd
Fib_succ_major
K319L-like_PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKJ24407
LinkDB
All DBs
Position
complement(3299283..3302654)
Genome browser
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
MLKFINIYKLFFSTLLLTFTLIGCGGGGVSGGGSSSTPSDPYTFSVLENQTSAVTATVNH
TNTLTYSLASGITDNNDFNINASTAVVTFKVAPNYEIKTQYKVTVHATDGLAFNSDIVYT
INITDLNDPNTFNVAENQSGAITASINSTSTLTYSLAATNDNDDFNIDSSTAVVTFKVAP
DYETKTQYTITVHATDGLSYTSDTVYTINISNVDDDAPVFVGSFTPSALENQTSAFTASA
TDSNTITYSLSAGVTDNNDFSINSTSGVVIFNTAPDYETKTSYSITVTATDSLSNVSTQV
YTLGITNIDDDAPVFTGSFTATVAENQTSATTANTTDLNTVTYSLGSGVTDNDDFNVNSS
SGVITFKVAPNFEIKASYSITVTATDSLAYSSTQVYTITISDVDENAPVFNAPYVISGDE
NQTSVSAISVTDASTITYSLTSGVTENNSFSINSSSGAITFNSAPNYEALPTKTSYTITV
TATDSLSNTSSQAYTVNVNDVDENPPVFTGSFTPSAAENQKTAFTASATDASTIAYSLGA
GVTDNDTFSINSSSGVVTFKLYPDFEATPTKTSFSITVTATDTQSNSDTQIYTLGLTDVN
ENLTFNSLPYKFIISQITGRFWLDRNIGATQVCTSSGDTACYGNLYQWGRLRDGHQLSSS
TNSATRATNIISSGSNFITNSSSPMDWLTNSTQDTDDIDDNGNIRNILWSQTNGDSATNN
IVCPSGYRMPSVAEIKAETLDDSIADTDTNSNGTIEVINSATAFQNFLKLPTSGYRNNSG
TPVSDGFGYLWSSSVSGGNASSINYDGTTASENTSTNLVNAYPIRCIQHTSTNTSTTIDA
GTDQIVYQGATVTLTATAGFTSYEWRDGNTPLGSAQSLVKSDFAVGIHYLSLIGTDSNGE
KSVDTITVTVKSTSISHNSINYIIVTSPYTTKKWLDRNIGASQVCSASNDLNCYGDYFQW
GRLADGHEKQTSTTTATTIAYNDDTSNEYITPAEWGTGDTSGALRVARWNQITGNVNGVS
GATYTDVCPVGFRVPTQAEVISETTSQGVSNNATAFSNFLKLPVAGFRKDDGTMQNVGSI
VYLWYNTPNGTTEAKYLRVSSGTAAPDSSLTRAFGGSVRCIED
NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaattcataaatatatataaattatttttctctactttgttattaacatttact
ctaattggatgtggaggtggaggagtttcaggtggaggatcttctagtactccttctgac
ccatacacttttagtgtacttgagaatcaaactagtgctgtaacggcaactgtaaatcat
accaatactttaacttattctcttgcttcaggaattacagataataatgattttaatata
aatgcatcaacagcagtagttacttttaaagtagcgccaaattatgaaattaaaacacaa
tataaggttactgtgcatgcaacagatggtttagcttttaattctgatattgtatataca
attaatattacagacttaaatgatcctaatacatttaatgtagctgaaaaccagagtggt
gcaataactgctagtattaatagtacaagtactttaacttattcattagctgctactaat
gataatgatgattttaatattgattcttcaacagctgtggttacttttaaagttgctcct
gattatgaaacaaaaacacaatatacgattacagtacatgcaactgatggcttaagttat
acttctgatacagtttatactattaatattagtaatgtagatgatgatgcaccggttttc
gtgggttcttttactcctagtgctttggaaaatcaaacgtcagcatttacagctagtgca
acagattctaatactattacatactctttatctgctggagttacagataataatgatttt
tctataaattctacttctggtgttgttatttttaatacagctcccgattatgagacaaaa
acatcatattctattacagttacagcaacggacagtttatcaaatgtatcaacacaagtt
tacactttaggtatcacaaatattgatgatgatgcaccagtatttacaggttcatttact
gctactgtagcagaaaatcaaacatcagcaactactgcaaataccacggatctaaatact
gttacatattctttaggttcaggagtaacagataatgatgattttaatgttaactcaagt
tcaggtgttattacatttaaagtggcaccaaattttgagataaaagcatcatattctatt
acagtaacagcaacagatagtttagcttattcatctactcaggtttatacaattacaatt
tctgatgtagatgaaaatgctcctgtatttaatgctccctatgtaataagtggagatgaa
aatcaaacaagtgtttcagcaattagtgttacagatgcaagtacaattacttattcatta
acaagtggagttactgaaaataatagtttctctattaattcaagttctggtgctataact
tttaattctgctccaaattatgaagcattaccaactaagacttcatatactattactgta
acagctacggatagtttaagtaatacttcaagtcaagcatatacggtaaatgtaaatgat
gtagatgaaaatcctcctgtatttacaggttcttttactccaagtgctgcagagaatcaa
aaaactgcatttacagcaagtgcaactgatgcaagtactattgcatattctttaggtgca
ggagtaacagataatgatactttctcaataaactcaagttctggagttgtaacttttaag
ttatatccagattttgaagcaactcctactaaaacttctttttctattactgtaacagca
acagatactcaaagtaatagtgatacacaaatttatactttaggtttaacagatgtaaat
gaaaatcttacatttaactctttaccatataaatttataatctctcaaattacaggaaga
ttttggttagatagaaatattggagctacacaagtttgtacttcttcaggtgatacagct
tgttatggtaatctttatcaatggggaagattaagagatggacatcaattatcttcaagt
acaaatagtgctacaagagctacaaatataataagttcaggttctaattttattacaaat
agttcttctcctatggattggttaactaatagtacacaagatacagatgatattgatgat
aatggaaatataagaaatattttatggtcacaaacaaatggagattctgcaacaaataat
atagtttgtccaagtgggtatagaatgccaagtgttgccgaaataaaagcagaaacttta
gatgattcaatcgctgatacagatacaaatagcaatggtacaatagaagtaataaatagt
gcaacagcttttcaaaactttttaaaattaccaacttctggttatagaaataatagtgga
actcctgtaagtgatggctttggatatttatggtcatcaagtgttagtggtggtaatgca
agtagtattaattacgatggaacaacagctagtgaaaatacatcaacaaatttagttaat
gcctatcctattagatgtatccaacatacaagtacaaatacaagtactacaattgatgca
ggaactgatcaaattgtatatcaaggggcaacagttactttaacagctactgctggtttt
acttcttatgagtggagggacggtaatactcctcttggatcagctcaatctttagtaaaa
agtgattttgctgtaggtattcactacttatcacttataggaacagattcgaatggtgaa
aaatcagtagatacaattacagttacagttaaatctacatcaatttctcataatagtatt
aattatataatagtcacatcaccatatactacaaaaaaatggctggatagaaatattgga
gcatctcaagtatgttctgcttctaatgatcttaattgttatggggattatttccaatgg
ggtagattagctgatggacatgaaaaacaaactagtacaacaactgctacaacaatagct
tataacgatgatacaagtaatgaatatattaccccagcagaatggggtactggtgatact
tcaggagcattaagagttgctagatggaatcaaattactggaaatgtaaatggagtttca
ggagcaacatatacagatgtttgtccagttggatttagagttccaactcaagctgaagtt
atttctgaaactactagtcaaggtgtaagtaataatgcaacagccttttctaatttctta
aaattaccagtagcaggatttagaaaagatgatggaacaatgcaaaatgtaggttcaatt
gtttacttatggtataacacacctaatggtacaactgaagctaagtatcttagagtttct
tctggaactgctgcacctgatagtagtttaactagagcttttggtggttctgttagatgt
atagaagactaa
DBGET
integrated database retrieval system