Alkalihalobacillus sp. LMS39: MM271_03070
Help
Entry
MM271_03070 CDS
T09200
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
alkl
Alkalihalobacillus sp. LMS39
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alkl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
alkl02000
]
MM271_03070
Transporters [BR:
alkl02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
MM271_03070
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt_3
Polysacc_synt
HepII_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOE94643
LinkDB
All DBs
Position
618316..619668
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MGHSSNQMDFTEGQISKKMLLFSWPIFFANLLQTSYQFIDSIWVGNLIGSHALAAISISA
TVVFTILSFIIGVNGASLTVLSQYKGAKDEEGLKKALNTFVFVLGTMTIVLGIIGLMFAE
TILIWLGTPDTILPMAVSYLQLNFIGIVFLFGYNFIGTVLRAMGDSKTPIRFVIIAVILN
TILDPLFISGFNMGIEGAALATIVSQGIAFLYGLIYSITKAGVPFTMPTIPEKSQFIALF
RMGLPSGLSMMVISAGVMAIMSVVTTFGEEVVAGFGAAQRIDSLIMLPAMTLGSAVNSMA
GQNIGAQKWDRVSLITKSGLFLIGTVTVIISSIAFIFAPTFIALFVNDESTIEYGARYLR
LVAFFYPFLGINFVLNGIVRAAGAFVPILILNIISFWVLRYPLTYWFAVWLGEDGIALGM
GVSFIISSLFASGYYMFGNWHKYAVVEKKE
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggacattcaagtaatcaaatggattttaccgaaggacagatttcaaaaaagatgtta
ttgttttcatggccgatcttttttgcaaacctgcttcaaacttcgtatcaatttatcgat
agcatttgggttggaaatttaattgggtcccatgcgttagctgcgatatcgatttctgcg
acagttgtctttactattctttcgtttattatcggtgtgaacggagccagtttgacggtt
ttgtcacaatataagggagcaaaggatgaagaaggcttaaaaaaagcattaaatacattt
gtatttgtccttggaacaatgaccattgtgttaggaatcattggactgatgtttgctgaa
acaatattaatatggctaggaacaccagatacgatattaccaatggcggtttcttattta
caacttaattttatcggaattgtgtttttgttcggttataattttattggaacggtgtta
agagcaatgggtgatagcaaaacaccgatacgttttgtgattatcgcagttattttaaac
acgattttagacccgttgtttatttctggctttaatatgggaattgaaggagcagcatta
gctacgattgtttcgcaaggtattgcatttttatatggattgatttattcgattacaaaa
gcaggtgttcctttcaccatgccgacaattccagaaaaaagtcaatttatagcattgttt
cgaatgggattgccatcgggattgtcgatgatggtgatatcggctggggtgatggcaatt
atgtcggtcgtaaccacttttggagaagaagttgtcgctggttttggtgcggctcaacga
atcgacagtttaattatgctaccagcgatgacgctaggttcggccgtaaatagtatggct
ggtcaaaatattggcgcacaaaagtgggatcgagtttcattaataacgaaaagtggatta
tttttaattggaactgtgactgttatcataagttctattgcctttatttttgcaccaaca
tttatcgcgttatttgtaaatgatgagtcaacaattgaatacggtgctcgctatttgcgg
ttagtcgcctttttttatccttttctcggtattaattttgttttaaatgggattgtccgt
gcagctggagcgtttgttcctatcttaattctcaatatcatatctttttgggtgttacga
tatcctcttacgtattggtttgctgtatggttgggggaagatggtattgcgcttggcatg
ggtgttagttttatcattagcagtttgtttgctagtgggtactatatgtttggaaattgg
cataagtatgcagttgttgagaaaaaggaatga
DBGET
integrated database retrieval system