Alkalimarinus alittae: NKI27_02495
Help
Entry
NKI27_02495 CDS
T08567
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein
Organism
alkm
Alkalimarinus alittae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Fil_haemagg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZE96641
LinkDB
All DBs
Position
574691..578860
Genome browser
AA seq
1389 aa
AA seq
DB search
MQHAYRNSRTRQTVSLLLIFQLVFSPLYSSLALAGGLTVDANASSAHQPTIDAAGNGVPI
VQITAPSASGVSLNKYNQFNINNNGLILNNSQQIIKTQLSGYIEGNSNLATSNGARIIVN
QINGGLPSALNGYAEVAGQQADVIIANPGGITCNGCGFINTNRGVLTTGTVELDSAGAVN
NIRINQGVLQVNGRGLNASNINQLDLLARAIEVNADIHGQQINAITGTNRVDYSDLSTTT
IEGVGDTPSLSLDVSALGGMYANRIFMVGTEKGVGVNSEGVIGAAKGGLILTAEGDIKLK
NTHSESASLLTSTSGSIELVGDHFSEQKISLAAGNDIKIDGAVGAQDTVTVSSNRLIIEN
SGSLSAGYDDAGLQRGEGKLDIKTSAMLNNGSVVAQDISVIAQQLENEGSVAQVGNGDVS
IIADSLVRNSGTLSATKQLSINTADYDNSDGTVVSRGDLQVDAVDITNQNGRLISESIVK
LNGDQLDNTQGTLLGEKGISIDVATIVNDAGKIHSLKNLSVDANTLNNTSGEIVGVGAVD
ISALDTTNLDGTIQSNELLSVTGNLIDNRRGSMRSAKGVFLNADSISNESGKIQSEAILG
VVSNHLKNSDGELLVLAGEDLRLNLKTLDNRGGLIETNASNLTLNVERIDNSEGGKISHY
GDQTLQFLGDTLNNQLGDIQSNGQIDINERHLIDNSKGDISAIKSIALSVASGDVNNSDG
KVEAELSLNVIAQNVINQYGEMTSNQSISLSSDHLMNDNGLLVGQKALTLKTATLTNDAG
ELQAGTVLSYIGNVLDNSQGVLVGGNGVNLVANTIINAFGQLQTGSTLQLTADKLENQNG
SVLVLSDADQEVTLTTLDNRNGEFETNAKHLTLDVSYLDNSAGGKITHFGDQSTVIRGSE
LNNQNGIISSNGLLDITEDRRVNNNDGQITAVKNLQLLVTTGDVQNNSGLFESGGLLDIT
ASIINNNRGKISSQQAQRLSAAGIQNQLGKIESATTLDVNATSLDNRKGSLLSLSSSDQK
LDINQIDNREGSLASNANNWVIESTQLNNTVGGSISHHGIGMASINAGTNNNSGAIKSNG
MLTLNQKGVLDNRSGLVSSVSDLTINASEINNQKGEVAAGGSISLIFSLGNRLLDNTLSG
MVQAVSSLSISNLATLKNQNGQILANNQLSILADHFNYQGQIDAGYIDVSSHNEINIAAG
QLWNTAGQLTLRAAGHLVLNGEINTGRNYELIARDMTVGNSGILAGASQGNIAISNNFSN
YNRVSSNQALPVVANKFDNYGDFGGLTTELNVGSLYNTGLLFGQSSLNIYSNSLYNDRGD
IFTFGDMTLAKDSALNKSHEITNNHGLIQSEGNLRFNTKSFLMWVVTRRVLQISSLRRQF
THMGRMRSM
NT seq
4170 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacacgcttatcgtaatagccgcacccgtcaaacggttagccttttactcatattc
caattggttttctcccccctttacagctcacttgcattggccggtgggttgacggtcgat
gccaacgcatcatcggctcatcagcctaccatcgatgcggcaggtaatggcgtgcccatt
gttcagattacggcgccctcagcatcaggcgtttctttgaataaatacaaccaattcaat
attaataataacgggttgattctcaacaatagccaacaaattataaaaactcagttgagt
ggctacatagaaggtaattcgaacttggcgaccagcaatggggccagaataatcgtcaac
cagattaatggtggtttgccgtcagcgcttaatggctatgccgaagtggcaggtcagcaa
gcagatgtcattatcgcaaacccagggggcatcacctgtaatggttgtggctttatcaat
accaaccgaggcgtactaaccacaggcaccgttgaattagatagtgcaggtgcggttaat
aatattcgcataaaccaaggcgtacttcaggttaatgggcggggtcttaatgcttcaaat
attaatcagctagatcttttagctcgcgccattgaagttaatgcagacattcatgggcaa
caaatcaatgcaatcacaggcactaatcgtgttgattatagcgacctttctacaacaacc
attgaaggggtaggagacacgccttcactttcactggatgtttctgctctaggtggaatg
tacgccaaccgtatctttatggttggaacggagaaaggggtcggcgttaatagtgagggc
gttataggggcagctaagggaggcttaatactcacagccgaaggcgatataaaactcaaa
aacactcactctgagagcgcctcattgcttacctcaacgtcaggcagtattgagttagta
ggtgatcattttagcgagcaaaaaatatcgttagccgcagggaatgacatcaaaatcgac
ggcgcagttggcgctcaagataccgtgactgtgtcgagcaatcggttaatcattgaaaat
agtggatcgctttcggcaggctatgatgatgctgggttgcagagaggtgagggcaagtta
gatattaaaaccagtgcaatgctgaataatggctccgttgttgcgcaagatattagcgtg
atagcacagcagcttgaaaatgagggttctgtcgctcaagtgggtaacggagacgtaagc
atcattgctgattcccttgtgcgaaatagcggaaccttgtcggccacaaagcaactttcg
atcaataccgctgattatgataatagcgatggcacggtagtgagtcgtggtgacttacag
gtcgatgcagtagacattaccaatcaaaatgggcgattaattagcgagtcaattgttaag
ctaaatggagatcaattagataatactcaaggcactcttttaggtgaaaaaggtatctct
attgatgtggcgactattgtaaatgacgctggaaaaatccacagtctaaaaaatctatcg
gttgacgcaaataccctcaacaatacatcaggggaaatagtcggtgtaggcgctgttgat
ataagcgctttagacacgactaacttagatggaacgattcaaagcaatgaactgctttca
gtgaccggtaacttaattgataaccgtcgcggttcgatgaggtctgcaaagggggttttt
ctgaatgccgatagcattagcaatgagtcaggaaaaatacaaagcgaagcaatactcggc
gtagtgagtaaccatctaaaaaacagcgatggtgaactgctagtgttggcaggggaagac
ctgcgacttaaccttaaaacgttagataatcgtggcggtcttattgagactaatgcaagt
aacctaacgctcaatgttgagcgtatcgacaactctgaaggcgggaaaatcagccactat
ggggatcagactctccagttcttaggcgatacccttaacaatcagttgggagatattcaa
agcaacggccagatagatatcaatgagcgtcatctgattgataatagcaaaggcgatata
tcagctatcaagagcatagcgttatcggttgcatcaggcgacgtgaacaacagcgatggc
aaggttgaggcggagctatcgctgaatgttattgctcaaaatgtgattaaccaatacggt
gaaatgacatccaaccaatctatatcgctaagctcagatcatctgatgaatgacaatggg
ttgttggtgggccaaaaagcgctaacccttaagacggcaacactcaccaatgatgcaggt
gagcttcaagcaggcacggtgttgtcatatatcggtaatgttttagataacagccaaggt
gtactcgtcggcggcaacggggtcaaccttgttgcaaatacgattatcaatgcatttggt
caactacaaacaggcagcacccttcagctgacggctgacaagttagaaaatcaaaatggc
tctgtattggttctatcagatgccgatcaggaggtgacattaacaacattagataaccga
aatggtgagtttgaaacgaatgctaaacacttaaccttagacgtctcttacttagacaac
tctgcaggcggaaaaataacccactttggtgatcagagtacggttattagaggttctgaa
ttaaataaccagaacggtattattagtagcaacggcctgcttgatatcactgaagacagg
cgtgtaaacaataatgatggccagataacagcagttaaaaatctgcagctattggttaca
acgggtgatgttcagaataactcagggttatttgaatcaggcggtttgcttgatataacc
gcgtcaattatcaataacaaccgcggtaaaatatcctcacaacaagcgcagaggttaagt
gctgcaggtatccaaaatcaactcggaaaaatcgagtctgccacgacgttagacgttaat
gctacttcactggataaccgcaaagggtcgttgttatcactctcttcgtctgatcagaag
ctagatattaaccaaattgataatagagaaggttctcttgctagtaatgcaaacaactgg
gtaattgaatcgactcagcttaataatacggtgggaggaagtatttcacaccatggcata
ggcatggcgagcatcaatgcgggtactaacaataacagcggcgcaataaaaagtaatggt
atgttaacgctgaaccagaagggcgtgcttgataatcggtcaggcctagtatcgtctgtt
tctgaccttacgataaacgcctcagaaataaataaccagaagggtgaggtagccgctgga
ggctctataagccttattttctcactgggcaatcgcctgctagacaacacattatcaggc
atggttcaggcggtttctagcttatctatctcgaacctcgcgacgttaaaaaaccaaaat
ggccagatattggcaaataaccagttgagtattttagctgatcatttcaactatcaaggc
caaatagatgctgggtatatcgatgtatctagtcataacgaaattaacattgccgcaggg
cagttatggaatactgcaggtcaactgacgttgcgtgctgcagggcatttagtcttgaat
ggtgagataaacacaggtagaaattatgagctaattgcacgtgatatgacggtaggtaat
tctggcattttggctggtgcgtctcagggtaatatcgcgataagtaataatttttctaac
tataaccgagtgagttcaaatcaagcattgcctgttgtagccaataaattcgataactat
ggtgactttggtgggctaactaccgagcttaatgtgggctcactctacaatacagggtta
ctattcgggcaaagcagtctgaatatatatagcaatagtttatataatgaccggggtgat
atttttactttcggtgatatgactctggcaaaagattcagcattaaataagtcgcatgaa
atcactaacaatcatggtttgattcaatctgaaggcaatctaagatttaatacaaagtct
tttttaatgtgggtagttacgaggcgggtccttcaaatatcgtcattgaggcgccagttt
actcacatgggaagaatgcgttcaatgtga
DBGET
integrated database retrieval system
