Arcticibacterium luteifluviistationis: DJ013_10190
Help
Entry
DJ013_10190 CDS
T05496
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
als
Arcticibacterium luteifluviistationis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
als00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
als02000
]
DJ013_10190
Transporters [BR:
als02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DJ013_10190
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
STN
CILP
CooC_C
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWV98520
UniProt:
A0A2Z4GBS5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2483840..2487163)
Genome browser
AA seq
1107 aa
AA seq
DB search
MKITFINQRLIFRIVKSTLLQLFLTLLFTSSTWATNVKGQDMLDRKVTITLNQTSLIDAL
QEIEEKTGVKFSYNSRMTELNEKVNLTAEDEALSSVLTKTLKPLGVSYILISNRIVLRKI
AKGQATLKESFGGINYVLPEKILQTVSGTVKDDTGETLPGVSIVVKGTTNGTTTDIDGSF
TLNVPTKSSVLVFSFVGYLAQEVTVGNQSQINVNLKLDTQALDEVVVVGYGTAKKKDLTG
AVSSVNIEDTRLQPNTNASQILRGTTAGVQVIDNGRPGQAGSIRIRGINSISASTDPLIV
LDGIIYAGGSLADINPNDIESMDVLKDASSTAVYGSLAANGVIEITTKKGKSGKPKFSLN
SYIGASDYAYLPNYLNPEQYLAARKDAEIAEGGSVPFSVLELANIAAGRSINPFDEIKQA
APMSNYQLSVSGKTDKVNYFFSGAYTASKSPVKGDNFSRLSSRLNLGVQATDWLKIGINS
GFSSIDNSGVRASLESASYLGPYGSLFLEDGVSPNPLPQNVGLVQNPILGTLLDDNKSIK
NILFTNAYADVSIWKGLSYKMNAGYTRTDSKNFGYSPSYIPLNRLGAGSKQHGESQNFTL
ENIVKYKQKIAKNHNLDLTLLYGVYELSNQSSFLSSRNIFNDALGYNALEIGEGFVIDAG
ASQNRQISNMARLGYNIASKYFFTLSMRRDGYSAFGEGEKYGIFPAAAFSWNISDEPFFQ
NISQVDFLKLRASWGRNGNRGVSEYSSLSQVGQNNYVFGDGSATSIGLSTTTLANPNLGW
ETTESFNVGVDMEAFSERVNASLNFYSSNTFDLLLNQTIPNTNGFENFLRNIGETKNTGF
ELDVKTLNVQKGNFTWNTNLAFSMNRNKIQKLTGRDIDLDGIEDDDIASGWFIGYPLGSN
FDYVFDGIFQEGDDLGLIRGAQVGDIKFKDISGPNGEPDGSITPLDRMVISDNQAKFNMG
ITNIFSYKNFSLSVALNIREGGESSNSLINPGSNFFDLANFLNTPYWTTSNPIDTNPRIN
YRNPLGYGFYQDRSFVRLQDVSLSYNVPERWADMLHVSGLQVYASGKNLHTWTSWEGWDP
EFGGGGRNPGDNGPLLKTFVGGINVSF
NT seq
3324 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaattacctttattaatcaacgattaatctttcggatcgtgaaatcaaccttacta
caattatttctaacattactctttacaagctctacatgggcgacaaatgtaaaagggcaa
gatatgttagacagaaaagtaacaattaccttgaatcagacgtcgctcattgacgcctta
caggaaattgaggaaaaaactggtgttaagttttcatataattcgagaatgaccgagttg
aatgaaaaagtcaatctcaccgctgaagatgaggcactatcttcagtactaaccaaaacc
ctaaagccactgggtgtgtcgtatatactaataagtaaccgaattgtattgcggaaaata
gcaaaaggccaggccactttaaaagaaagctttggtgggattaactatgtacttcctgag
aaaattttacaaactgtttctggaacagtaaaagacgacacaggagaaactttaccagga
gtaagtatagtggtgaaaggtaccacaaacggaaccaccactgatattgatggaagcttt
actctaaacgtacctaccaaaagttccgtacttgtttttagctttgtggggtatttagcc
caagaagttactgtggggaaccaatcacaaataaatgtaaatctaaagcttgatacacaa
gctctggatgaagtggtggtggtaggatatggtactgctaaaaagaaagatttaacgggt
gctgtttcaagtgtaaatattgaagacacaaggctgcaacccaatactaatgcttcccag
attttgagaggtactacagcgggtgttcaggtaatagacaatggaagaccagggcaagct
ggaagcataagaattagaggtatcaactctatttctgctagtacggatcctttaatagtt
ttagatgggataatttatgcaggcggaagtttagcagatataaacccgaacgacatagag
tccatggatgttttaaaagatgcaagctctacagctgtttatggctcattggctgccaat
ggtgttattgaaattacgactaaaaagggtaaatcagggaagccaaagttttctttgaat
tcctatataggagcttcagattacgcttatttgccaaattacttgaatcctgagcagtat
ttggcagcacgtaaagatgccgaaattgcagaaggtggttccgtaccgttttcagtactt
gaattagcaaatattgctgctggaagaagtatcaatccttttgatgaaatcaaacaggct
gcaccaatgtcaaattatcaattgagcgtgtctggaaaaacagataaagtcaattatttt
ttctcaggagcttatacagcttcaaaatcacctgtcaaaggggacaacttttctaggttg
tcaagtagattaaatttgggagtacaagctacggattggctgaaaattggcattaattca
ggcttttcttccatagataattcaggggtaagagcatctttagaaagtgcttcatacctc
gggccttatggaagtttatttttagaagatggtgtatctcctaacccgcttcctcaaaat
gttggcctagtgcagaatccgattttgggaacccttttggatgataataaatctatcaaa
aatattttgtttactaatgcgtacgctgatgtaagtatctggaaaggtttatcgtataag
atgaatgcaggttatacaagaacggattcaaaaaactttggatatagcccttcatatatc
cctttaaataggctaggtgcgggttcaaaacaacatggagaaagtcaaaatttcacgtta
gagaacattgtaaagtacaagcaaaaaatagctaaaaatcataatcttgatttgacctta
ttgtatggagtttacgaattaagtaaccagtcttcctttttgtcaagtagaaacatcttt
aatgacgctttagggtataatgccttagaaataggagaaggttttgttattgatgcaggt
gcttcgcaaaacagacaaatatccaatatggctagacttggatataatatagccagcaag
tatttcttcacattaagtatgcgtagagatggttattcagcctttggtgagggtgagaaa
tatggtatattccctgctgctgctttcagttggaatattagtgatgaaccgttttttcaa
aacatcagtcaagttgacttcctgaaacttcgggcttcctggggtagaaatgggaatagg
ggtgtgagtgaatactcttctttaagtcaagtaggacaaaacaactatgtttttggcgat
ggttcagcaacatctattggtttaagtacaactaccttagctaatccaaatctgggatgg
gaaactacggaaagttttaacgttggagttgatatggaagctttttctgaaagagtaaac
gcttctcttaacttctactcatctaatacgtttgatttacttcttaaccaaactatacct
aatactaatggttttgaaaacttcttgagaaatattggagaaacaaaaaacactggtttt
gagcttgatgtaaagacccttaacgttcaaaaaggcaacttcacttggaatactaattta
gctttttcaatgaatcgaaataagatccagaaattgacaggaagagacatcgatttagat
ggaattgaagatgatgatattgccagtggatggttcattggctatcctttaggttctaac
tttgattatgtatttgatggaattttccaagaaggggacgaccttggtttaattcgaggt
gctcaagttggtgatattaaatttaaagatatcagtggccctaatggtgaacctgatggt
agtatcacgccgctagatagaatggtaattagtgacaatcaagctaaatttaatatgggt
attaccaatatatttagttacaaaaactttagtctttctgtcgcattaaatatcagagaa
ggtggagagagttctaattcacttatcaatccagggtctaattttttcgacctagctaac
ttcttgaacacgccttactggactacttcaaatccaattgatacaaatccaagaataaac
taccgtaatccattaggatatggcttttatcaagatagaagctttgtgagattacaggac
gtttccttatcatacaatgtacctgaaaggtgggccgatatgcttcatgtttctggtttg
caagtgtatgcgagtggaaaaaacctacacacttggacaagctgggaaggttgggatcct
gagtttggaggtggcggaaggaatccgggagacaatggtcccttgttgaaaaccttcgta
ggaggtattaatgtctcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system