Arcticibacterium luteifluviistationis: DJ013_21100
Help
Entry
DJ013_21100 CDS
T05496
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
als
Arcticibacterium luteifluviistationis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
als00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
als02000
]
DJ013_21100
Transporters [BR:
als02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DJ013_21100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Laminin_G_2
Sialidase
GEVED
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWW00545
UniProt:
A0A2Z4GHR5
LinkDB
All DBs
Position
complement(5154454..5159055)
Genome browser
AA seq
1533 aa
AA seq
DB search
MIRFIQLVGIFLLSSFSIYGQNKAPIQPIPPGVSSINFRVGCSLFTDPVNYTTGSTFSYN
APVNNSSNLTGGSGVRYGCLYSVPNQAWFIITVNTGGNLHFNFTNSNNRDVDAAVWGPIS
GNDEANACASTQNYPLTCDYDAYKPDLYINGAVAGQKYVMLVTNYSNVNTVINISQPTGG
SVTYSMVNLPNCALVPTAEIDGTSTTIVEGQSTTLDLAFTGDSPWNYTLSDGTMGTSITS
PLSLDVYPTASQTYTVNSVSNLCGTTGGSGSVGVSVTRDVELKSCFPLNGYALDSKSLNI
GTLHNGVSSVANRLSEANGALSFDGIDDYVSLSASQFNNNTFAFAAWVKLDELPNVTNSE
RIAFSVGGTGDEHYISAAISNGVPYWKFSSNGNYVNSSSIVDLNWHLLTAVRTGGSIKIF
VDGALTGTQEVTGVASYGSPLVARIGSSISNNKHFKGKIDELKVFDGSLIEPEILLLQNY
TSCNNVYNDTYISTQSVSTAVICTGSAFVLEAFSNNITIDNGLQFLAELSDASGSFNNPT
VVGVNTFLPISVTVPNNIVGGDYKLRIRYGGLVSVNSIDIYVNNPASYNITGTVAISDGQ
SSNLNLEFTGTGPWNYIMSNGLSGVATTSPWQITVDPDQSTTYSVSSAQNVCGNASINGS
SSATVTVNYTKEFITCLPFSGNAIDSKSNNTTVLNGPILTTQRYGYQNQAYTFNGSNNYI
EYTTNDLRKREFTMSAWVLVNALSGSNQYIISQGEVGTKTFQGLGVNNSGWFFQSYGNYG
GYTASSNSGLATNQWVQLTAVRTYQSLKLYVNGELVRTTSSNAVIPFKSSDIGRIGANSS
TLGNYFNGKIDDVRLFKGALNDEEVYALYTNNSDCPVVENTSLIVVRDVNPSTVCAGNTV
SLYYSLSNVSASNMLRAELSDRYGSFTSPTVLGTGFTSSPISVAIPANTAESGEYDNYRI
RLVSSGPIPVTSINAKSIIVYGILPTATVSGGGNIQYQGSSTVNIDFTGNAPWTYALNNG
VSQNTTQSPISVSVSPYGTTTYTVTSVSNTCGPGTRSGSAVVNVEDHIGLNESTVNICKG
QSFAVAFVTNIAYPTNDFNVEISNKEGIFAGASTIIGSGLNSVINCSIPDDIDLGLYKLR
IVYNSSISDTAFANYSTVPSASMDGTYEVEDGTDLIVPIYFQGEGPYSFNLSNGYNGISY
NDTLNYFYSKPKNDIFLTVNGLSNRCGSGSSIGGTNIIVKYVNRLVSCFNLDNNAVDQVG
NNNGSLNGGVLSTSDRFGNLNSAMQFDGNNDYIDFSTTDMENQKYSYSVWVMPFSLPYAN
SSIEAEWRSALSVGSNYRQHAIYSYYYYYQGYPVWRANSTRTYYKSPEGVAQVTNQWYHL
VMVSGEEDLKLYINGVLIGSTNNSWNDPENIYSSPIGVIGAQNANGIKRFFHGKIDDVQI
YKGELNARQILALYENSGSCFDATSYTCLSDNTLNTILNGQKVYQVSNQLIGSSSIQSGS
DIHFDSKNSVLLQPGFKTESNAVFSATVGGGCE
NT seq
4602 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcagattcatacaactagtaggtatatttttattgtcctcattttcaatttacgga
caaaataaagcccccatccaacccataccaccaggtgtctcaagtattaactttagagta
ggttgctctttatttactgacccagtaaactatactacgggaagtacctttagttataac
gcacccgtaaataatagttctaatctaacaggtggtagtggagtaagatatggttgtctt
tattccgttcctaatcaggcatggtttattataactgtgaatacgggaggtaatcttcat
tttaattttacaaactcaaataatagggacgtagatgccgccgtttgggggcctatttct
ggaaatgatgaagctaatgcatgtgcatctacacaaaattatcctctgacgtgtgattat
gatgcctacaagcctgatttgtatataaatggtgccgtggcaggtcagaagtatgtcatg
cttgttactaactattctaatgtgaataccgttattaatatctctcagcccacaggtgga
agtgtgacttattctatggtgaatttaccaaactgtgctttagtgccaactgccgaaatt
gatggtacaagtactacaatagtagaaggtcaatcgacgactttggatttagcttttacg
ggagattctccctggaactataccttgtcagatgggacaatgggtacgagtattacatca
cctttaagtttggatgtttacccaacggctagtcaaacatacacagtgaactctgtaagt
aatttgtgcggaactactggaggttcaggaagtgtaggtgtctcggtaactagggatgta
gaattaaaatcttgttttcctttaaatggatatgctttagattctaaaagtttaaacatt
ggcaccttgcacaatggtgtctcatcagtagctaacagattgagcgaagctaatggtgca
ttgtcgtttgatggtattgatgactatgtaagtttatctgcaagtcagtttaataataat
acttttgcttttgctgcttgggttaaattagatgaattgccaaatgtcactaattcagaa
aggattgctttttccgtgggtggtacaggggatgaacactatatctcagcagccataagt
aatggggtgccttattggaaattttcatcaaatgggaattatgtaaactccagttccata
gttgatttaaactggcacttactgactgctgtgagaacaggtgggagtataaagatattt
gtagatggagctcttactggtacacaggaagtaacaggagtggcttcatacggtagccct
ttagtggctagaataggaagcagtatttcaaacaataaacattttaaagggaaaattgat
gaactgaaggtttttgatggttccttgattgagcctgaaattttattgcttcaaaattac
acgtcgtgtaataatgtatataacgatacttatatctctactcaaagtgtaagtactgct
gtgatatgtacgggtagtgcatttgtgttggaagcattctcaaataatataactattgat
aatggattacaatttttagcagagctttcagatgcgtctgggagctttaacaatcctaca
gttgttggggtcaatacttttttgccaataagtgtaactgtgcctaataatattgttgga
ggtgattataaacttcgaataagatatggtggcttggtcagtgtaaactcaatagatatt
tatgttaacaatccagcgagttataacattactgggacagtggctataagtgatggtcaa
tcttctaatttgaatttagaatttacgggaacaggtccttggaactacattatgtctaat
ggccttagcggggtggctaccacctctccatggcaaattaccgttgacccagaccaaagc
actacttattcagtttcatcagcccaaaatgtctgtggtaatgcaagtataaatggaagc
agttccgctacagtgactgtaaattatacaaaggagtttataacctgtttaccgtttagt
ggaaatgccattgattcaaaatctaataatacaacggtactcaatggtcctattttgaca
acacaaagatatggataccaaaatcaggcttacacatttaatggttcaaataactatata
gagtacacaactaacgatttaaggaagcgagagtttacaatgtcggcttgggtgctagtg
aatgccctctccggaagtaatcaatatataatttctcaaggggaagtaggcactaaaact
tttcagggacttggtgtgaataattctggttggttttttcaatcttatggtaattatggt
gggtatacggcttcttcaaattcaggactagccacaaatcaatgggttcagttaacagca
gttagaacttaccaaagtttaaagctatatgttaatggggaattagtacgtactacatct
agtaatgccgtaattccttttaaaagctctgatataggtcggataggggctaatagctct
actttaggtaactattttaatggtaaaattgatgatgttcgactatttaaaggagctttg
aatgatgaagaagtttatgctctttatactaataattcagactgcccagtggtcgaaaac
acctctttaatagttgttagagatgtaaatccttctactgtttgtgctggaaataccgta
agtctttattattcattgagcaatgtgtctgcatctaatatgcttagagccgaactctct
gatagatatggttcttttacaagccctacagttttgggtactggatttaccagtagtcca
attagtgttgctattccagctaatacagcggaaagtggtgagtatgacaattatagaata
agactagtttcttcggggccaattcctgttacaagtatcaatgccaaaagtattatcgtt
tatgggattttgcctactgccacagtttcaggaggaggaaatattcagtatcaaggttca
tctacagtaaatattgattttacagggaatgctccatggacttatgcattgaataatggc
gtgagtcaaaacacaactcagagccctatttcggtttcagtttctccctatggaactacg
acttatacagtaacttctgtaagtaacacttgtgggcctggaacaagatcgggaagtgca
gtggttaatgtggaagaccatataggtcttaatgagtccactgttaatatttgtaaaggg
cagagttttgcagtagcttttgtgacgaatatagcttatccaacaaatgattttaatgtt
gaaatttccaataaagaaggaatatttgccggtgcttcaaccattataggaagtggattg
aattctgtaattaattgttctatacccgatgacattgatttgggtttgtataagctaaga
attgtttataattcgagcattagtgataccgcatttgctaattatagtacggtaccatct
gcttcaatggatgggacatacgaagtagaagatggtacagatttaatagttccgatttac
tttcagggtgaaggcccatacagttttaacctttcaaatggctacaatggaatctcttat
aatgacactttgaactatttttattctaaacctaagaatgatattttcttgactgtaaat
ggtttaagtaatagatgtggaagtggttctagtataggaggtacaaacattatagtaaaa
tatgtcaataggttagtttcatgctttaatcttgacaataatgctgtggaccaagttgga
aataataatggttctttgaatggcggagtattatcaacgagtgatagatttggcaattta
aatagtgcaatgcaatttgatggtaataatgattatatagatttttcaaccacggatatg
gaaaatcaaaaatatagttactcggtctgggttatgccctttagtttaccctatgcaaat
tcgtcaattgaggcagaatggcgttctgcgttgtcagttgggtctaattatcgccaacat
gcgatatattcatattattattattatcaaggatatccagtttggagagcaaattcaaca
cgcacttattataagtcacctgaaggagtggcccaagtaacaaatcaatggtaccatttg
gttatggtaagcggagaggaggatcttaaattgtatattaatggtgttttaattggctct
acgaataattcttggaatgatcctgagaatatttattcgtcaccaataggagttattggt
gctcagaatgcgaatgggataaaaaggttttttcatggaaaaatagatgatgtgcagatt
tacaaaggggaactaaacgcacgacagattttagccttatatgaaaattcagggagttgc
tttgacgcaacaagctatacctgtctttctgataatactttaaatactatcttaaatggt
caaaaagtataccaggtaagtaaccaattgataggaagcagttcaatacagtctggctct
gatattcattttgattctaagaattctgtactgttacaaccaggttttaaaaccgagtca
aatgctgtttttagtgccaccgtgggtggggggtgcgaataa
DBGET
integrated database retrieval system