Alteromonas sp. BL110: D1814_19175
Help
Entry
D1814_19175 CDS
T11343
Name
(GenBank) cyclic diguanylate phosphodiesterase
KO
K26148
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
alta Alteromonas sp. BL110
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alta00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
D1814_19175
Enzymes [BR:
alta01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
D1814_19175
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
CSS-motif
CSS_CxxC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT40657
LinkDB
All DBs
Position
complement(4407925..4409478)
Genome browser
AA seq
517 aa
AA seq
DB search
MNKSDQKRYFLADNLKAIGVSLLSVAVVTLLLAIVMFVFIKEQEESRAKEILDNVRIVFR
DAEITLDYLNALPYQSCEIENLTEMRKTLFRSRFVKEIGFYENGGLLCSTYLGILEEPIK
EATPDFYTQLGDAFWINTPLQLFDKQATGTIVQRGRYNAVLDMDSVIGYSFTQDWQLFYN
GDHFYHMAGNPGLVDTTLSQDDMDARTGYFSLQFIMCDERYNNTCLKVKSDHGRVLDLHT
GKLVLFVFAMLMTAALTHMLVFNYLRRRRSLESRVSKGLKEHKFYSLYQPFVDLETGKVI
GCEVLSRFEDEFGPIYPDEFIPQVKEQNMTWEFTVDMITTAMKELNENPDIPNGFKVSFN
LFPFDFTREDCLDLDFAMEMNVKNFKLVLEITEDEQIATHSAVKHIKSLKSKGFLFAIDD
FGVGYSNLSQLKTLNCDYLKIDRSFVMDMEDNSIRSSLIPHIVSIAEGLNVDLIAEGVEN
IDQSNELKGLTIGFGQGWLFGKPQSADALAKSVQDTQ
NT seq
1554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaagcgatcaaaaacggtattttctggcagataacttaaaggcgattggtgtt
tctctgttaagcgtagccgtcgttacactacttcttgcgatagttatgtttgtgtttatc
aaagagcaagaggagagccgagctaaagagatccttgataatgttcgcattgtctttaga
gatgccgagattacccttgattatctcaatgcactgccttatcagtcttgtgaaatcgag
aacttgaccgaaatgcgcaaaactctctttcgctcccgttttgtaaaagaaattggcttc
tatgagaatggcggattgttgtgcagcacctatctgggtattcttgaagagcctataaaa
gaggcaacccccgatttttatacccaacttggtgatgcattctggattaacacgccgcta
cagctttttgataagcaggcgacaggcaccattgttcaacgtggacgctataatgcagtt
ttagatatggatagtgtcattggctacagtttcacccaagattggcagcttttttataat
ggcgatcatttttatcatatggcgggtaatccagggctggtagatactacgcttagtcaa
gatgatatggatgcgcgcactggctatttttcattacagttcataatgtgtgacgaacgt
tacaataatacctgtttaaaagttaagtctgatcacggaagggtattagatttacacacg
ggtaagcttgttttgtttgttttcgctatgctgatgacggccgcactgacccacatgctt
gtgtttaattatttacgtcgtcgtcgttctctagagtccagagtaagcaaaggtttaaaa
gagcataagttttatagtctttatcagccatttgtcgatttagaaacgggcaaagtcatc
ggctgtgaagtgctaagtcgctttgaagacgagtttgggccaatttatcccgatgagttc
attccacaagtcaaagagcaaaatatgacgtgggaatttactgtcgatatgattacgacc
gcgatgaaggagcttaacgaaaatcctgatatcccaaatgggtttaaagtgtcctttaac
ttgtttcctttcgactttacaagggaagactgtttagatttagattttgcaatggaaatg
aatgttaaaaactttaagttagtgctggaaattaccgaagatgaacagatagcaactcat
agtgcggttaagcatattaaatcgttaaaaagtaaagggttcttatttgctattgatgat
ttcggcgtggggtactctaacctaagccagctaaaaaccttgaactgtgactatctcaaa
attgaccgaagctttgttatggatatggaagacaacagtattcgttcgtcgcttattccg
catattgttagtattgccgaggggcttaatgtcgacttgatcgcggagggcgttgagaat
attgaccaatcaaatgaattaaaaggtttaactataggcttcggccaagggtggttgttt
ggcaagccacagtctgccgatgcacttgctaaaagcgtccaagacacacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
