Anastrepha ludens (Mexican fruit fly): 128859811
Help
Entry
128859811 CDS
T10909
Name
(RefSeq) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
KO
K15162
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
Organism
alud Anastrepha ludens (Mexican fruit fly)
Brite
Transcription machinery [BR:
alud03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
CDK-module
128859811
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
128859811
NCBI-ProteinID:
XP_053952876
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(73768854..73812271)
Genome browser
AA seq
2341 aa
AA seq
DB search
MLPLLQEKRPLKRSRLGPPDVYPQEARQREDELTPTNVKHGFATTPPLADEFGTAHNSNM
NANKVGSFFNSILSKKEELLTLQDTVRKKQQINCKDNFWPVSPRTKGALDAWFKDLAGNK
PLLSLAKKAPSFNKKEEIFIILCDNQVNMQRAAWFIKLSAAYTLSFTESKNKKRSIYDPA
VEWTGNIIKFMKELLPKLHEYYQLGSERNAHICNTSGSGVSGQIISSPVVNSPVTVHSPL
TINSMSTAPCASYVGSACAANTSGNACSGSSSPISGNGSNFEDCRNALKYWKYCTRLSKY
MHEESLLDRQEFLNWILELMEKLRSQTSFDTSLKKLILVFALQYMPDFVQSERLSRKLAI
LVAKNLTVLLDSNVEFHSLNKTNEATGANMEVDITEETKLVADSTYASLNDCVSCPHHRD
IILYLSTILQTITLECPTALIWNGINESRASSALCGSPLDYINTVPSELPMPLKCEKSNS
NIRRQLQIAEAEISLRSKHAQNSWFAEKWRSSKVNSFTHVLKILDYLDTHCFDRRDNDNN
IDSLYSKIFPLRETKSDDSEQISKHIPYIPKRDAPTVKILCEWAVSNQRWGEHRAMVVAI
LLDKRQIEVTSGVDNDQPHNSNCQDEKDSINSGVGLIGGLPVFQSVLMDFLDRDAPVLDE
NGSQQNRTQFINLVHLFSTLIRFDVFSHNAYMHTLISRGDLLRENSIAELDNVTRNEASS
VCGTESVDNKPSPTHNFDDEFTSTLDFKHSEFDDSNVDDDLGKLLQNIKEKGQQSALETP
DSPKLPDNSQTDLNESLISRHYIYTKHFPIPQDETCVSYSNECNQRYILLFGVGKERDEK
KHAVKKMSKEVCKLFSKKFSIDIAEGGKVKKHSRNEFNFEATTSKCKSMAYFEQHVVTSQ
CAIVVLEQLNGFAAGNNNYLPVQEHVAFLFDLMEMALNIHSLLEFCDHILKELPEIENQL
QAKKSNLVRLYTTSLALYIVGILRRYHSCLLLSTEETISVFEGLCKTIKHVNNPKECSSA
ERCILAYLSDLYEICILLKSKETEPEYFSIIAVMKAFKELYNSPEQLSAVPQTYNPHFLQ
ELFISPRRAGRIDFHCIRQLQDSSSNVYSFVSNAILAVCQETDNDRLNEIAILCAELTAS
CNSLSEEWIAALQSICNASKKLRYPHLFEQVDIHDNKIHNSLAVFICILVARHSFSLADF
VLKFALPTLAYAYPVGGEFTTDAEAGARLTCHLVLKLFKTIEIPQPRMYSVSTSPNPINI
VGGSFSIKLSCDRHLLVGAHKNIPIQAVLAVIKAILIVVDLKTPTVPNNNSSALSSGKRS
GVNTPVHPGSTPKTNDRPADLSQILGTSDLSNIASCIDQDMNQPNSVSSNAKSLEQVSLL
EFANHVLKQICSQEHVLERCLKHADNLCEMIIDDMLTTKQVQRVLYMICYPEAEYNIISE
MDQRSMIVRILENLEQWTLRISWLDLELMYRQSMNNPNELNNWLDTVAKAAIDVFQTDNG
SPTHGGKEMCREKQSTWLIAPLVSKLTPAVKGRVLRVAGRALESMNFFAKLPKSDGNCIN
NGEERDRNTSAAINQSYGVLNANNSAKKISLNYQPFLGLILSCLNGQDEYKESLLVSLYS
QLSHCLQSFSEYDSLNEFNDPQEREEILDALQLRFSLVGGMFDTIQKNGTSTTDWAILLT
QLVCQGVIDTSSNRELFTTVVDMLATLVHSTLVTESQSERDENKKLYLNLIKKLKKEIGE
KNNASIRVIRQLLPLYKRTAEVISCEPAGVDMKGNKICDMDKKQLRISDKQRISVWDILE
GHKNPAPLSWVWFGAVKSERKSLTYEETHRSLKYHGHSLVKPYNYFYEPLALPPEDIEPA
PEKISIKDEMKPDTPSSVDQSPSAVTSGKTRGKGTTRKRKPKNSKTSPSNVSTPSQMAPQ
PQQSQVQSQNPQQMNSQSQINQMQINTQVNVQQFNSNQLLQPNSGVMMQQQLQGNLHQLN
NAPNAQIGFMGNVPQGVSQLSGQNQQHWIGQNQYHPIQQQQQFYPHQANRFERPQLNQSK
QALCNMLRQRQPTFNQNNSAQFNAIQQHQQIRQTQGQQTQGPIGSVPQQFVRGGMRGIAS
SQSQLTSGINGVNIPQGVNQNNMPGQQITPQNMNAQVNSQTMTSSNPQNNLMNVQPASGL
IGSGNVLQQNVNLGSGNGNQNIISQATNPFHNFNQYQQQGLINNSGSGQVQSSNMVGAYN
QIGQRNNSSDYLQQRGSNSRGQFVNPNPNVTMGNIIGQNTISPYSRQPTATGKPGVVSSQ
QQFQQQRLHHQMMQIQGGMVQSQNQNINQQQTPNLVAQLQRQLPNQHNLSVQQYQHHQPP
Y
NT seq
7026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgcctttactacaagagaaaaggcctttgaaaagatctcgtttaggccctccagat
gtgtatccccaagaagcgaggcagagagaagatgaattgactccgacaaatgtaaaacat
gggttcgctaccaccccaccgttggctgatgaatttgggaccgctcacaattcaaatatg
aatgccaataaagttggttcgtttttcaactcaattttatcaaagaaagaggaattgttg
acgttgcaagatacagttcgaaaaaaacaacaaataaattgtaaagataatttctggcct
gtttcaccacgaacaaaaggagctttggatgcttggtttaaagatcttgctggaaacaag
ccacttctaagtttagcaaaaaaagcaccttcttttaacaaaaaagaagaaatttttatt
attctttgcgataaccaagttaatatgcaacgtgccgcttggtttattaaattaagcgcg
gcttacacattaagttttactgagtcaaaaaataagaaacgaagtatatacgacccggca
gtagaatggaccggtaatattattaagtttatgaaagagcttcttcctaagcttcatgaa
tactatcaacttggttcagagaggaatgcgcatatttgcaacacgtcgggttctggggtc
tcgggccaaataatttcatctcctgtagtcaacagtccagtaaccgttcacagtccattg
acgattaattcaatgtctaccgctccttgtgcatcatacgttggcagtgcatgtgctgcc
aatactagtggtaatgcgtgttccggctcaagttctcccatatctggtaatggaagtaat
ttcgaggattgtcgaaatgccctgaaatattggaaatactgtacgcgactttccaagtat
atgcacgaagagtctttacttgatcgtcaagagtttctcaactggatattggaactaatg
gaaaaactgcgttcacaaacatcatttgatacgtctttgaaaaaactaatacttgttttt
gcgttgcaatacatgccggatttcgttcaatccgaacgtttgagcagaaaattagcaata
ttggttgcaaaaaatttaacagtgcttttagattcaaatgttgaattccattcattaaac
aaaacaaatgaggctaccggagccaatatggaagttgatattaccgaggaaaccaagtta
gtggcggattcaacgtatgcatcgttaaatgactgtgttagttgtcctcatcatcgcgac
attatattgtatttaagcacaattcttcaaacaattacattagagtgtcctacagcattg
atatggaatggaattaatgaaagtcgcgcctcatcggcattgtgcggtagcccacttgat
tacattaatacagttccatctgaattgccgatgccactcaagtgtgaaaaatcaaattct
aatatacggcgacagctccaaattgcagaggcagaaatatctttgcgttccaagcacgcc
caaaatagttggtttgcggaaaaatggcgtagctcaaaagtgaattcattcacccatgtg
cttaaaattcttgactatctagatactcactgttttgatcggagagataatgataacaat
atagactcactttactctaaaatttttccacttcgtgagacgaaaagtgatgattctgag
caaataagtaaacatataccgtacattcctaaaagggacgctcctacagtaaaaatactt
tgtgaatgggctgtctctaatcaaagatggggagaacatcgagccatggttgttgctatt
ttgctggataagcgacaaattgaagttacctctggcgtggacaatgatcaacctcataat
tcaaattgccaggacgaaaaggattcaatcaattccggagttggtttaattggtggctta
ccagtttttcaatcagtgttaatggattttttggatcgagatgctccggttttagatgaa
aatggctcacaacaaaatcgtacccaatttattaatcttgtgcatctttttagcacatta
atacgtttcgacgtattttcacataatgcttatatgcatactttgatttcgaggggtgat
cttttaagggaaaattcgatagccgaattggataacgtaacccgtaatgaagcgtcatca
gtatgtggcacagagtcagttgataataaaccctctcctactcataattttgatgacgag
tttacatccactttagattttaaacatagtgaatttgacgattcaaatgttgatgatgat
ttggggaaactacttcaaaatattaaagaaaaaggtcaacagagcgccctggaaacacct
gatagtccgaaattacccgataattcgcagacagatttgaatgagtctcttatttcacgt
cattatatatatacaaaacatttccccatacctcaagatgaaacttgcgtgtcttatagc
aatgagtgtaatcaacgatatattttgctgtttggtgtcggaaaagaaagagatgaaaag
aaacatgctgtaaaaaaaatgtctaaagaagtttgtaagcttttttctaaaaagtttagc
attgacattgcagaaggtggaaaagtaaagaaacattctcgaaatgagtttaatttcgaa
gctactacgagtaaatgcaaaagtatggcatattttgaacaacatgtagttacatctcaa
tgtgctattgtcgtattagaacaactcaatgggtttgcggcgggtaataacaattactta
cccgttcaagaacatgtagcctttttgtttgatctgatggaaatggctcttaatatacat
agcttgctagagttttgtgatcatattctgaaagagttacccgaaattgaaaaccagtta
caagcaaagaaatctaatttggttcgattatacacaacctctttggctctttatatcgtt
gggatactacgaagataccattcatgtcttctgctcagtacggaagagactatatcagtg
tttgaaggattatgcaaaacgataaaacatgtcaacaatcctaaggaatgtagctcagcg
gaacgatgtattctcgcttacttgtctgatttatatgaaatatgcattctgcttaagtca
aaggaaactgaaccagaatatttttcgataattgctgttatgaaagcttttaaagagcta
tacaactctccagaacaattaagtgctgttccgcagacgtataatcctcattttttacaa
gaactattcatatcacctagaagggctggtagaatagattttcattgtattcggcaacta
caagactcatcatccaacgtctatagttttgtatcaaatgctattttagccgtttgtcaa
gagactgataatgaccggttaaacgaaattgcaatattgtgtgctgagttgaccgcttca
tgtaattcactttcagaggaatggatagcggcacttcaaagcatttgtaatgcttcaaag
aaacttcgatatcctcatcttttcgagcaagtcgatatacatgataacaaaatccataat
tcattagcagttttcatttgtattttggtggcaaggcactcattctctttagctgatttt
gtgcttaagttcgcacttccaacgttagcatatgcgtaccctgttggcggtgaattcaca
accgatgctgaagctggagctcgtctcacttgtcatttagtgctaaaattgttcaagact
attgaaataccacagccaagaatgtattcagtaagtacttcaccgaatccaataaatata
gttggaggatcgttcagtataaagttgagttgtgatcgtcacttattagtgggtgcacac
aaaaacattcccatacaagcagttttagctgttataaaagcgatattaattgttgttgat
ctaaaaacaccaacggtaccaaataataactcttcagcattaagtagtgggaagcgcagt
ggtgttaatacaccggtgcatccaggaagtactccaaaaactaacgatcgtccggctgac
ttgagccaaatacttggtacgagtgatttatcaaatattgcttcgtgcatagaccaagat
atgaatcaaccgaattccgtgagtagtaatgcaaaatctttggagcaagtgtctttgctg
gaattcgcgaaccatgttttgaaacaaatttgttcacaagaacatgtattagaacgctgt
ttaaaacatgcagataatttatgtgaaatgattattgatgatatgcttacaacaaaacaa
gttcagcgagtactatatatgatttgctatcctgaagctgagtataatataatttcggaa
atggaccaaagatcgatgattgttcgaattttggaaaatcttgaacagtggactcttcga
atatcgtggttagatttggaattaatgtatcgacagtcaatgaataatccgaatgaactg
aacaattggttagatactgttgccaaagctgcaattgatgttttccaaacagataacgga
tcacctacgcatggaggaaaagaaatgtgtcgtgaaaaacagtcaacttggctaattgct
cccttagtatctaaactaactcctgcagttaaaggccgtgttcttcgtgttgctgggcga
gcacttgaaagcatgaattttttcgctaaacttcctaagtcagatggcaattgcattaac
aatggggaagaacgcgatagaaataccagtgccgcgataaaccaatcgtatggcgtatta
aacgctaataatagtgccaaaaagatctcgttgaactatcaacccttcttaggacttatc
ctgtcttgtttgaatggtcaagacgaatataaagaaagcctcctggtatcgttatactca
cagctctctcactgcttgcagtcattctctgagtatgattctttaaatgaattcaatgat
ccacaagaacgggaagaaatattagatgcactgcaattacgtttttccttggtcggtgga
atgtttgatacaatacagaaaaatggcacatcaacaacagactgggctattcttctgaca
cagctggtttgccaaggagtcattgacacaagctctaatcgagaactttttacaacagtt
gtggatatgctagctacacttgtgcactcgactttagtgacagagagccaatctgaacgt
gacgaaaataaaaaactttatctcaatcttataaaaaagttaaaaaaagaaattggagaa
aaaaacaatgcttcaataagagttattcgtcagttattaccactttacaagcgaacagcc
gaggttatatcatgtgaaccggccggtgtcgacatgaaaggaaacaaaatttgtgatatg
gacaaaaaacagcttaggatttctgataagcagcgcataagtgtttgggatatattggaa
ggtcataaaaacccagcacccttatcatgggtttggtttggtgcagtcaaatccgaaagg
aaatctcttacatatgaagaaacacatcgaagtcttaaataccatggtcacagtttggtt
aagccttacaattatttttatgaacccttggcactacctcccgaagacatagagcctgcg
ccggaaaaaatcagtattaaagatgaaatgaagccagatactccatcatcagtggatcag
tcacctagtgctgtcacttctggaaaaactcgagggaagggaacaacgcgaaagcgtaaa
ccgaaaaattcaaaaacttctccatcgaatgtctcaacaccctcacaaatggctccacaa
ccgcaacaatctcaagttcagtcgcaaaacccgcaacagatgaactcccaaagtcaaatc
aatcaaatgcaaattaatacgcaggtaaacgttcaacaatttaactcaaatcaattgtta
caacccaattcgggcgtcatgatgcagcaacagctgcaaggaaatttacatcagcttaat
aatgctccaaatgcccaaattggttttatgggaaacgtgccacagggagtatctcaacta
agtggtcaaaatcaacaacattggataggacaaaatcaataccatccgattcagcagcaa
cagcaattctatcctcatcaagcaaatcggtttgaacggccacaacttaatcaatctaag
caagctttgtgtaatatgctacgacaacgtcagcctacatttaatcaaaataactccgca
caatttaatgccattcagcaacatcaacaaatacgtcagacacaagggcaacaaacgcaa
ggtcctattggttctgtgccacaacagttcgttagaggaggtatgaggggaattgcatcg
tctcagagtcagctaacaagtggtattaatggggttaatatacctcagggcgttaatcag
aataatatgcctggacagcagattacaccacagaatatgaatgctcaagtcaatagccaa
acaatgacttcatctaatccccaaaacaacttaatgaatgttcagcctgcatctgggcta
ataggatcaggaaatgttttacaacagaatgttaacttaggaagtggcaatgggaatcag
aacatcattagtcaagcaacgaatccatttcacaattttaatcaatatcaacaacaagga
ttgataaataacagtggaagtggtcaagttcaatcatctaacatggtaggcgcctataat
caaatagggcaaagaaacaattcatcagattatctccaacaacggggaagtaatagtcga
ggacagttcgtaaatccgaatcccaacgttaccatgggaaatattatagggcagaataca
atatcaccctattcaaggcaaccaacagcaactgggaaaccaggtgtggtatcgtcccag
caacaatttcagcaacaaagattacatcaccaaatgatgcaaatccaaggtggaatggtg
caatcccaaaatcagaatataaatcagcagcagactccaaacttggttgctcaacttcaa
aggcagctgccgaatcaacataatttatctgttcagcagtatcaacatcatcagccacca
tattga
DBGET
integrated database retrieval system
