Algibacter luteus: O5O44_04495
Help
Entry
O5O44_04495 CDS
T09147
Symbol
secDF
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
alut
Algibacter luteus
Pathway
alut02024
Quorum sensing
alut03060
Protein export
alut03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
alut00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
O5O44_04495 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
O5O44_04495 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
O5O44_04495 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
alut02044
]
O5O44_04495 (secDF)
Secretion system [BR:
alut02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
O5O44_04495 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
MMPL
ACR_tran
LemA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WJJ97646
LinkDB
All DBs
Position
1032836..1035823
Genome browser
AA seq
995 aa
AA seq
DB search
MQNKGLVKLFAILFGLVSLYQLSFTFKANQVEKEAEEYAISKISESEENYRALRSQEEAS
FLQEKATDTVYNIGVAKFTYNEVKQKAMNLGLDLKGGINVILQVSVKDILKGLANNTTDP
VFNQALEDASELQKNSQNTYLQDFFTAFDAIKGDTKLASPDIFYTKALDGEIDGSMSDDE
VKAIIETKIDESIVSAFEVLRKRIDEFGVTSPNIQRLGNSGRILVELPGVKDVERATSLL
QSTAQLEFWDAYKGEQFFQFIDQANVVLKDLVNPESDTEVEPQDEEDAQGDQIDDLLGDA
VTDSTAVEENNPLGKLIRGIGYQGGPIIAKFEIKDKETVLDYLNRPEVRALLPAEQRYAK
FVFGKPEKNSELVDLYALVGNRENVPQLSGAVVTDARNQFGPTGKSEVSMQMNAKGAKIW
EEMTGKAYTQGSQIAIVLDDVVYSAPGVTTGPIAGGSSSISGDFSLNEAIDLANVLRAGK
LPASADIIQSEVVGPSLGKEAIESGTMSFLIALALVLLWMIFYYGKAGAFADAAMLLNIL
LIFGILSGLGAVLTLPGIAGIVLTIGMSVDANVLIFERIREELAKGKGQLESIKDGFSNA
LSSILDANITTGLTALILFVFGTGPIKGFATTLLIGIATSLFTAIFITRLLIDWYANRGG
KLEFSTGITKNLFRNINIDFLKKRKVAYIVSGILIAISLGSLLTNGLNQGVDFVGGRTYQ
VRFAQDISASEITDLLSQPEVFGSADAKTFGDANQLKITTKYRVNESGAEVDEDIRKSLY
EALVPHLEGITYEQFIDLNDENKQIGLLESYKVTPTIADDIKQASFWAILGSLIVVFLYI
LIRFKKWQYSLGAVAAVFHDVLIVLGVFSLTYKFMPFNMEINQAFIAAILTVIGYSLNDT
VVVFDRIREFFNEHTSWKFDKVVNSSLSSTLSRTLNTSLTTLVVLLSIFIFGGDSIRGFM
FALIVGVIVGTYSSLFIATPVMYDTVSKSEDKKKK
NT seq
2988 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaacaaaggattagtaaagctatttgctattttgtttggtttggtaagtctttac
caattatcattcacattcaaagcaaatcaggttgaaaaagaagcagaagaatatgcgatt
agtaaaatctctgaatctgaagagaattatcgtgcactgcgcagtcaagaagaggctagt
tttcttcaagaaaaagctacagataccgtatataacattggtgtagcaaaattcacttat
aacgaagtgaagcagaaagccatgaatcttggtttagatttaaaaggaggtattaacgtt
attctacaagtatcggtaaaagatatcttaaaaggattagcaaacaatactaccgatcct
gtttttaatcaagctttagaagatgcttcagaacttcaaaaaaacagtcagaatacctat
ttacaagattttttcactgcttttgatgcaattaagggcgacactaaattagcttcacca
gatatattttacacgaaagcactagatggagaaattgatggaagtatgtctgatgatgag
gtaaaagccattatcgaaactaaaatagacgaatctattgtttcagcattcgaagtactt
cgtaagcgtattgatgagtttggtgtaacatcaccaaacattcagcgtttaggaaattct
ggtcgtatacttgtcgaattaccgggtgtaaaagacgtagaacgtgcaacaagtttgtta
cagagtacagcacaattagagttttgggatgcgtacaagggtgagcaattctttcagttt
atagatcaagctaatgttgttttaaaagatttggttaatcctgaatctgatactgaagta
gaacctcaagacgaagaagacgctcagggtgatcaaattgatgatttattaggtgatgcc
gtaactgactctacagcagttgaagaaaataacccattagggaagttaattagaggtatt
ggttaccaaggtggaccaatcattgctaagtttgaaataaaagataaagaaacagtttta
gattacctaaacagacctgaagtaagagctttacttcctgcagagcaacgttacgcaaag
tttgtttttggtaagccagaaaaaaacagtgaattagtagatttatatgctttagttggt
aaccgtgaaaatgtacctcaattaagtggagcagtggtaaccgatgcgcgtaatcaattt
ggtcctacaggaaaatctgaagtatcaatgcaaatgaatgctaaaggtgctaagatttgg
gaggaaatgactggtaaagcatacactcaaggtagtcagatagctattgttttagatgat
gttgtgtattctgctccgggtgtaactactggaccaattgcaggtggtagttcttctatc
tcaggtgatttttcattaaatgaggccatagatttagcaaacgttttacgtgcaggtaaa
ttaccagcatcggcagatattattcaaagtgaggttgtaggaccatctttaggtaaagaa
gctatagagagtggtacaatgtcgttcttaattgcgttagcattagtgttactttggatg
attttctactacggaaaagcaggtgcttttgcagatgccgcaatgttattaaacatctta
ttaatcttcggtattttatcaggattaggtgctgtacttacattgcctggtattgcgggt
atcgtattaaccattggtatgtcggtggatgctaacgtacttattttcgagcgtattcgt
gaagaattagccaaaggtaaaggacaattagaatctataaaggacggatttagtaacgct
ttatcttctattttagatgccaacattaccacaggtttaacagctttaatcttatttgtt
tttggtactggtccaattaaaggtttcgcaacaaccttattaataggtattgcaacgtct
ttatttactgcaatctttattactcgattattaatcgattggtatgctaacagaggcggt
aaattagagttctctacaggtattacgaaaaacttattcagaaatataaatattgatttc
ttgaaaaaacgtaaagtggcttacatcgtttcaggaattttaattgctataagtttaggt
tcgttattaacaaacggattaaaccaaggtgtcgattttgttggtggtagaacgtatcaa
gttcgtttcgcgcaagatattagcgcgtcagagattacagatttgctttcacaaccagaa
gtatttggtagtgccgatgcaaaaacatttggtgatgctaaccagttaaaaattacaaca
aaatacagagtaaatgagtctggggcagaagtagacgaagatatcagaaagtcgctttac
gaagcattagtaccacatttagaagggattacttatgagcagtttatcgatttaaatgat
gaaaacaagcaaataggtttattagaatcttataaagtaacaccaaccattgccgatgat
atcaaacaagcatcattctgggcaattctagggtcgttaatcgtagtattcctttatatc
ttaattcgttttaagaaatggcaatactctttaggtgcggttgcagccgtatttcacgat
gtattaattgtgttaggtgtattctcgttaacttataaattcatgccattcaacatggaa
atcaatcaagcgtttatcgcagcaattctaaccgtaattggttattcgcttaacgatacg
gtggttgtattcgatagaattcgtgagttcttcaacgagcacacctcttggaaattcgat
aaggttgtaaactcatcattaagtagtacattaagtagaacattaaatacctcgttaaca
acgttggttgtgttattatccatcttcatttttggtggagattctattcgtgggtttatg
tttgcacttattgtaggtgtaattgtaggtacgtactcatcgctatttattgcaactccg
gtaatgtacgatacggtaagtaaatcagaagacaagaaaaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
