Arabidopsis lyrata (lyrate rockcress): 110229487
Help
Entry
110229487 CDS
T01578
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
aly
Arabidopsis lyrata (lyrate rockcress)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
DUF445
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110229487
NCBI-ProteinID:
XP_020885467
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
974 aa
AA seq
DB search
MIPELGRRPMHRGNEDSSFGDDYEKEIGVLLGEQQRRQVEADELERELNLYRSGSAPPTV
DGSVSAAGGLFSGGGAPFLEFGGVNKGNGFGGDDEEFRKDPAYLSYYYANMKLNPRLPPP
LMSREDLRVAQRLKGSSNVLGGVGDRRKVNDSRSLFSMPPGFDQMKQHEFEAEKTTASSS
EWDANGLIGLSGLGLGGKQKSFADIFQADMGQGHPVAQQPSRPASRNAFDENVDSKNNLS
PSASQGIGAPSPYSYAAVLGSSLSRNGTPDPQAIARVPSPCLTPIGSGRLSSNDKRNTSN
QRPFNGVTSGLNESSDLVNALSGMNLSGSGGLDERGQAEQDVEKVRNYMFGLQGGYNEVN
LPNKSDQAHKATGSFRNSQLRGSQGSVYNDGGGLATQYQHLDSPNYCLNNYGLNPAVASM
MACQLGNSNFSPMYENVSAMGLSGMDSRLHGGGYVSSGQNLSESRNFGRLSNRMLGGGAG
LQSHMADPMYHQYARFSENADSLDLLNDPSMDMNFMGNSYMNMLELQRAYLGAQKSQYGV
PYKSGSPNSHSDYGSPTFGSYPGSPLAHHLLPNSLVSPCSPMRRGEVNMRYPSAARNYSG
GVMGSWHMDASLDEGFGSSMLEEFKSNKTRGFELSEIAGHVVEFSSDQYGSRFIQQKLET
ATTDEKNMVYEEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFEHGLPPQRRELAEKLFDNVLPLSLQM
YGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVKELDGHVMRCVRDQNGNHVVQKCIECVPEENIEFIIST
FFGNVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDPDTQSKVMDEIMSTISMLAQDQYGNYVIQHVLE
HGKPDERTVIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPEEREFLVNEMLGTTDENEPL
QAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILGRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGE
RRMALQSLTQPQMA
NT seq
2925 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataccggaactagggagaaggccgatgcatagaggtaacgaagattcatcttttggg
gatgattatgagaaagagattggagtattgcttggtgagcagcagagaaggcaagtagaa
gctgatgagcttgagagagagcttaacttgtatagaagtggctctgctccaccgactgtt
gatggttctgttagtgctgccggagggctttttagcggcggtggggctccttttttggag
tttggtggagttaataagggtaatggctttggtggtgatgatgaggagtttaggaaagat
ccagcttacttgtcttattactatgctaatatgaagttgaatccgaggctgccaccgcct
ttgatgtctagagaggatttgagagttgctcagaggcttaaagggagtagtaatgtttta
ggtggtgttggggatagaagaaaagttaatgatagtcgatctttgttctctatgccacct
ggttttgatcaaatgaagcagcatgagtttgaggccgagaaaactacagcttcttcttct
gaatgggatgctaatggattgatcgggttgtcgggtttggggcttggaggcaagcagaag
agttttgctgatatctttcaggccgatatggggcaaggacatcctgtcgcacagcagccc
tcacgtcctgcaagtcgtaatgcctttgatgaaaatgttgactctaagaataatctgtct
ccatctgcatcacaaggcattggcgcaccatctccatacagctatgcagctgttctggga
tcttctttgtcaagaaatggaactccagatccacaggccattgctagggtgcctagtccc
tgccttactcccattggcagcggtagattaagttcaaatgataagaggaacacaagtaac
caacgcccattcaacggtgttacatctggtctcaacgagtcttctgatctcgtcaatgct
ttatctggcatgaacctgtcaggcagtggcgggttagatgaacgtggtcaggctgagcaa
gatgtggaaaaggtcaggaactatatgtttggactgcaaggtgggtataacgaagtcaat
ctcccaaacaaatctgatcaagcccataaggcaactggctcgtttaggaattcacaattg
agagggtcacaaggatctgtctataatgatggaggtggattagctactcagtaccagcat
cttgatagcccaaactattgcctgaacaactatggattaaatccagctgtagcttcaatg
atggcttgccaacttgggaatagtaacttttctccaatgtatgaaaatgtttctgctatg
ggattatctggaatggattccagacttcatgggggaggttatgtatcttctggtcaaaac
ctctctgaatcacgtaattttggcagactcagtaatcgaatgttgggaggaggtgctggt
cttcagtcacatatggcagacccaatgtatcatcagtatgcgaggttctctgaaaatgct
gattcgcttgatcttctcaatgatccttcaatggacatgaactttatgggtaattcatac
atgaatatgcttgaactccagagagcttatcttggagctcagaaatcacagtatggtgtc
ccttacaaatccgggagccctaacagccatagtgattatgggagtccaacatttgggtca
tatcctggcagcccattggctcatcatcttctgccaaattctcttgtgtcaccctgtagc
cctatgagacgaggtgaagttaatatgcgatatccctctgcagcaagaaattattcggga
ggagtaatggggtcttggcacatggatgctagtttggatgaaggctttggatcttcaatg
cttgaagagttcaaaagtaacaaaacaagaggattcgaactttctgaaatagctggccat
gttgtagagttcagttcggatcaatatggaagccggtttattcagcagaaactcgagaca
gcaacaactgatgagaaaaacatggtttatgaggagatcatgccacaagctcttgctctg
atgactgacgtttttggaaactatgtgattcagaagttctttgagcatggactcccgcca
caaaggagagaactggcagagaaactttttgacaatgttttgcctcttagcttacagatg
tatggttgtcgtgttatccagaaggcaattgaggttgttgatctagaccagaaaattaaa
atggtgaaagaacttgatggacatgtgatgcgatgcgtacgcgatcagaatgggaaccat
gtggttcaaaagtgcattgaatgtgtgcctgaagaaaacatcgaatttattatatccact
ttctttggcaatgttgtaaccctctccactcatccatatgggtgccgagttattcagagg
gtattggagcactgccatgaccctgatacacagagtaaggtgatggatgaaatcatgtcc
actattagtatgctggcccaagatcagtatggaaactatgttattcagcatgtattggaa
cacggaaagcctgatgagcgtactgtgataatcaaggaattagcggggaagattgttcag
atgagccaacagaagtttgcgtcgaacgttgttgagaaatgtttgacttttggagggcca
gaggaacgagaatttctggtgaatgagatgctgggcacaactgatgaaaacgagcctctt
caggcaatgatgaaggatcagtttgccaactatgtagtgcaaaaagttttagagacatgt
gatgaccaacagcgtgagctgatacttggtcgtattaaagtgcatctcaatgctttaaag
aaatacacttatggaaagcatatcgttgctcgtgttgaaaaactcgttgctgctggagag
aggagaatggctttgcagtccctaacccagcctcagatggcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system