Arabidopsis lyrata (lyrate rockcress): 9317350
Help
Entry
9317350 CDS
T01578
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
aly
Arabidopsis lyrata (lyrate rockcress)
Pathway
aly03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aly00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
9317350
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
aly03019
]
9317350
Messenger RNA biogenesis [BR:
aly03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
9317350
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9317350
NCBI-ProteinID:
XP_002879449
UniProt:
D7LGA1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
403 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWDTDENLLREYFSNFGEVLQVTVMREKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQDKHHIDNRDVDVKRAMSREEQSPAGRSGNFNASRNFDSGANVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQTTQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGVASGGGRGSGGAGGFPVYGGSGGSGYEGRVDSNRYMQPQNTGSGYPP
YGASGYGTGYGYGSNGVGYGGFGGYGNPAGAPYGNPGVPGAGFGSGPRSSWGAQAPSGYG
NVGYGNAAPWGGSAPGSAVMGQAGASGGYGSQGYGYGGNDSSYGTPSAYGAVGGRSGNMP
NSHGGGGYADASDVSGGYGNHQGNNGQAGYGGGYGSGRQAQQQ
NT seq
1212 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcagggaaagctatttatcggcgggatttcatgggataccgacgagaat
cttctgagagagtacttcagcaatttcggcgaggttttgcaggtcactgttatgcgagag
aaagctacaggtcgtcctagaggattcggattcgtcgcattctcggatcccgctgttatt
gatagggttcttcaggacaagcaccatattgataatagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagaagagcagagtcctgctgggagatcagggaattttaatgcttctaggaat
tttgatagtggagctaacgtgaggactaagaagatattcgtgggaggtttgcctcctgca
ttaacatcagatgaatttcgggcttactttgagacttacggtcctgtgagtgatgcagtc
attatgattgatcagactacacagcgtcctcgaggatttgggtttgtttcttttgactcc
gaagattcggttgaccttgttttacataagactttccacgatttgaatggtaaacaagta
gaagttaaacgggctcttcctaaagatgctaaccctggagtagccagcggtggtggtcgt
ggcagtggtggagctggagggtttccggtctatggtggttctggtggtagtggctatgag
ggtcgtgtggattccaatagatacatgcagccgcaaaacactggaagtggttatcctcct
tatggtgcttctgggtatggtactggttatggttatggaagcaacggtgtaggttatggg
ggttttggtgggtatggcaatccagctggtgcgccttatgggaatcctggtgtccctgga
gctgggtttggaagtggtccaagaagttcatggggcgctcaagcaccatcgggttatggg
aatgtgggatatggaaatgcagctccgtggggtggttctgctcccggttcggcagtgatg
ggtcaagctggtgcatctggaggttatggcagtcaaggttatggctacggtggaaatgat
tcctcttacgggactccatctgcctatggtgcagtaggtgggcgatctggcaatatgcct
aacagccatggcggcggtggctatgcggatgcttcagatgtctctggaggttatgggaat
caccaagggaacaacgggcaagctggttatggcggaggttatggaagtggtaggcaagct
caacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
