Alteromonas mediterranea DE1: amad1_07650
Help
Entry
amad1_07650 CDS
T02340
Name
(GenBank) putative TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
amaa
Alteromonas mediterranea DE1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amaa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
amaa02000
]
amad1_07650
Transporters [BR:
amaa02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
amad1_07650
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
KdgM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV85041
LinkDB
All DBs
Position
1720837..1723398
Genome browser
AA seq
853 aa
AA seq
DB search
MQQAKINASVFKLSLIASAIAGISFSSASFAQEQTAIDEQDVEQIQIVGSRRVGRTVNDS
PVPIDIIDASSIEATGLTETNMILNQLLPSFNFPQPSVTDGTDHVRPAQLRGLAPDHTLV
LVNGKRRHTSALLNLNGSVGRGSSAVDLNAIPANAIKRIEVLRDGAAAQYGSDAIAGVIN
IVLKDAAEGGEVSATYGANVTTMDGVPNLENVAIDANGDLAFTEGSDREVTDGQTFTLRG
NVGFEWGDDGFVNVSGEYRDRGQANRADYDQRENYARDAEGNLDPRELTVNRYNHVYGNG
EVEDYALFINAGKALTDSVEFYTTAGYSTRDSLGSGFYRRAQDSRNIVEIYPDGFLPAIQ
TDITDMSLIAGIKGYGDVWNYDLSVTHGGNELEYGVVNTLNTSLGPTSQTEFDAGTLEYD
TTIINADASRLVDTGLFYSEMNFAMGAEYRHEGYDITAGEENSYIQGTFGPGGAVTDPVD
GPFGAAGSQVFPGFTPESAGDNSRHNYSFYVDLEADVVENWNVAVAGRYEDYSDFGSTFN
WKMSHRVTLSDAFALRASVSTGFRAPSLQQQFFTSIATVFVDGEPTETGTFAPSSDVAQA
LGSPGLDAEESDNYSAGFTYSPTADFNLTVDFYRIDIDDRIVLSNNLSGEAIEALLEGTG
ANQARFFLNAIDSRTEGVDIVSTYTLNTADYGAFNFNAGANFNDNEVTSVIDAPEVLQNA
GFDQDNLFSDVELRRFETSSPDSKLNLGVTWNYDRYTTTLRTTRYGEVEDPSSIEARNEI
LPSEWITDLDVRIALTEGLTVSVGANNVFDVYPEPTRDLVDDVTTFSRLFSYSGFSPYGF
TGRFVYGKVAYRF
NT seq
2562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacaggctaaaattaacgcttctgtttttaagctttccttaattgcttctgcaatc
gccggaatatctttttctagcgcgtcttttgctcaagagcaaaccgctatcgatgagcag
gatgttgaacaaatccaaattgtaggttcacgtcgagtagggcgtaccgtcaatgattcc
ccggtacctatcgatattatcgacgcttcatctattgaggcgacaggcttaactgaaacc
aacatgatccttaaccagttactgccaagctttaactttccgcagccttcagttaccgat
ggtacggaccacgtgcgcccagctcagcttcgcggtttagcccccgatcacacccttgta
ctggtcaatggtaagcgtcgtcacacatctgcgctacttaacctaaacggctcggtgggt
cgcggatcatcagcggtagatttaaacgctattccagctaatgccatcaaacgaattgaa
gtattgcgtgacggtgcagcagctcagtacgggtctgacgctattgcgggcgttatcaat
attgtgcttaaagatgctgcagaaggcggtgaagtatcggcaacctacggtgctaacgtt
actacaatggacggcgtgccaaaccttgaaaatgttgctattgacgctaacggcgaccta
gcgttcaccgaaggaagtgaccgagaggtaaccgacggccaaacctttacccttcgtgga
aacgtgggttttgagtggggcgacgatggctttgtaaatgtttcaggtgaatatcgcgac
cgcggccaagcaaatcgtgccgactacgatcagcgagaaaactatgctcgtgatgcagaa
ggcaacctcgacccacgtgaactcacagtaaatcgctataatcacgtatacggtaatggt
gaggtagaagactacgcgctgtttattaatgcgggtaaagcacttaccgatagcgtcgag
ttttacactacagcaggctacagcacccgtgactcgctaggcagtggtttctatcgccgt
gcacaagactcgcgcaacattgttgaaatttaccctgacggcttcttacctgctattcag
accgacatcacagatatgtcgcttatcgccggaattaaaggctacggtgatgtatggaat
tatgacctatcagttacgcacggcggtaacgagctagagtacggtgttgttaacacgcta
aatacatcccttggcccaacaagtcagactgagtttgacgcgggtacccttgagtacgat
acgactatcattaatgcagacgcatctcgtctggtcgatacagggctgttttacagcgaa
atgaactttgcaatgggcgcagaatatcgccacgaaggttatgatattacagcgggtgaa
gagaactcgtacatccaaggtaccttcggtccaggcggagctgtgaccgaccccgttgac
gggccgtttggtgcagctggctctcaagtgttccccggttttacaccagagtcggccggt
gacaacagccgtcacaactatagcttctatgtagacttggaagctgatgtggtagagaac
tggaacgttgctgttgccggtcgttatgaagattattctgattttggcagcacgttcaac
tggaagatgtcgcaccgtgtaaccttaagcgatgcgtttgcacttcgcgcgtcggtatca
acaggctttagagctccgtcgcttcaacagcagtttttcacctcaattgctaccgtcttt
gttgacggcgagccaactgaaaccgggacctttgcaccttcaagcgatgtggcacaggcg
ctgggtagcccaggtttagatgcagaagagtcggataactacagcgcgggcttcacatat
tctccaacggctgattttaacttaacggtagatttctatcgcatcgatattgatgaccgt
attgtactgtctaacaacctatcgggtgaagcaattgaagcactactagaaggcacgggt
gctaatcaggcgcgtttcttcttaaacgccatagattcccgtaccgaaggtgttgatatt
gtgtctacctatacattgaacacggcagattacggtgcgtttaactttaacgcaggtgct
aattttaacgacaatgaagtaaccagcgtaatcgatgcgcctgaagtgcttcaaaatgca
ggctttgaccaagataacttgttcagcgacgtcgaacttcgccgtttcgaaacgagctcg
ccagacagtaagttaaacttgggcgttacatggaactacgaccgttacaccactacgctt
cgcaccacacgctatggtgaagtggaagatccttcttcaattgaagcccgcaacgaaatt
cttccttcggaatggatcactgacttggatgttcgtatagcgttgacagaagggttaacc
gtatcggtaggtgccaacaatgtattcgatgtatacccagagccaacccgagatttggta
gacgatgtaactacgttctctcgtttattctcatactcaggcttctcgccttacggcttc
acaggccgttttgtatacggcaaagttgcgtatcgcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system