Alteromonas mediterranea DE1: amad1_14750
Help
Entry
amad1_14750 CDS
T02340
Name
(GenBank) Heavy metal efflux pump CzcA
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
amaa
Alteromonas mediterranea DE1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amaa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
amaa02000
]
amad1_14750
Transporters [BR:
amaa02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
amad1_14750
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFV86446
LinkDB
All DBs
Position
complement(3320353..3323562)
Genome browser
AA seq
1069 aa
AA seq
DB search
MFNKLIDWAVTSRLLVVIALTTLIVSAVFVIPKLNLDAFPDVTNVQVSVNTEAPGLAAEE
VEQLITYPIEAVMYALPDVMEVRSISKTGLSGVTVVFSEGTDIYFARQLVFERLQAAKEL
IPEGVGTPEMGPNTSGLGQVYQYLLLAEPDSGLDAMALRSLNDWVVKLLLLPADGVTDVL
SFGGEVRQYQVNLNPSQLLGYGLTQDIVMEALERNNTNVGGWYMNRGQEQLVIRGTGWLD
HGEEGLEQLRQVPLKTVDGTTITVSDVANVELGSEIRQGAATMTRKDADGNIQNLGEVVS
GIVLKRMGANTKATIDGVNARIQRINQALPDGVSFEVFYDQADLITQAVDTVVNALMLAF
VFIIVILALFLMNLRATFLVLISIPISIGIALMVMSWFGLSANLMSLGGIAVAIGMLVDG
SVVMVENMFKHLTHTDAEHDHKRQLGEHVEDDDPLDSSHDTHGIALRLQEAGKEVARPIF
FATAIILVVFMPLFSFEGVEAKLFQPMAISIMLAMLSAVLVALIIVPALATYLFKKGVKP
RESVVLKPLDAGYRKGLSWAILHKKVVIGIAAIMVVAAGVVLPRLGTEFVPELEEGTINL
RVTLAPSSSLDTALEVSPKLENILMGFPEVTYTLSRIGRAEIGGDPEPVNNIEIYIGLKP
VPEWTSANNRYELQALMEEKMEQHPGLLFNFSQPIATRVDELLSGVRAQLAIKLFGPDLK
VLAEKGQAIEALVKEVQGARDVAMEQIAGESQLIVTPNRRALSRYGLAVGDAMELVREGL
GGASAGQIINGNERYDIYVRLAEQFRNDSQMIADLRLQAPSGAWVRLGDVAEVTIASGPP
QVRRDDVQRRVVIQANVQGRDMGSVVADIRKSIDEKLALPTGYSVDIGGQFENQQRAQKR
LSLVVPLSLGLIALLLYFAFASFGQAMLILVNVPLAVIGGVFSLWLSGQYLSVPSSVGFI
TLFGVAVLNGVVMVESINQRVADGLSVSDAVFDGATSRLRPVLMTAITSALGLIPMLLSN
GVGAEIQKPLASVIVGGLVTATFLTLFVLPVLFAWFSKGKLKDMARAPS
NT seq
3210 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaataaattaattgattgggctgttactagtcgtttattagtggtgattgctctg
acaacgttaatagtcagcgcggtttttgttattccgaaactgaatttggatgcatttcca
gatgtcaccaatgtgcaagtatctgtcaatacagaagcaccgggattagctgccgaagaa
gtagagcagttaattacttatccaatagaagcggtgatgtatgccttacctgatgtgatg
gaagtgcgctctatttctaaaacaggtctttcaggtgtgaccgttgtgtttagcgagggc
acagatatttattttgcacgtcaattggtattcgagcgtctgcaagcggctaaagagtta
attcccgagggcgtcggtacgccagaaatgggacccaacacatcaggattggggcaagtg
tatcagtatctattgttggctgagcccgattcaggcctagacgctatggcgttgcgtagt
ttaaatgattgggtggtgaaattgctgctgcttcctgccgatggcgtaacggatgtgctc
tcttttggtggggaagtacgccaataccaagttaacctcaatccatctcaattacttgga
tatggcttgactcaagatatagtgatggaagcacttgagcggaataataccaatgtgggg
gggtggtatatgaaccgagggcaggagcaacttgtgataagaggcactggctggttagat
catggcgaggaagggttagagcaattacgtcaggtacctttaaaaaccgtagacggaaca
acgattactgtatccgatgtggcgaacgttgagttaggtagcgaaattcgtcagggtgct
gccaccatgaccagaaaagacgccgacggtaacattcaaaacttaggtgaagtcgtctca
ggcattgtacttaagcgcatgggagctaacacgaaagccacaattgatggcgtcaatgct
cgtattcagcgaattaaccaagcattgcctgatggcgtgagttttgaagtattctacgat
caagctgacttaattactcaagccgtggatacggttgtaaatgcgctaatgttagcgttc
gtatttattattgttattctagctttatttttgatgaatctacgagccacgtttttagtc
ctgatttcgatccctatttctattggtattgccttaatggtcatgtcgtggtttggactt
tctgccaaccttatgtcgcttgggggcattgcagtggcaatcggcatgctagtagatggc
tcagtggtaatggttgaaaacatgtttaaacacttgactcacactgatgctgagcatgat
cacaagagacaattgggtgaacatgttgaagatgatgatccattagactcgtcccatgat
acgcacggtatcgctttgcgattacaagaagcgggcaaggaggtagcccggcctatcttc
ttcgcaacagccataatccttgtggtattcatgcctttgtttagctttgaaggcgttgaa
gcaaaattatttcaaccaatggctattagtattatgttggccatgctttcggcggtatta
gttgcactgattattgtaccggcattggcgacgtatctatttaaaaaaggcgtgaaacca
cgagaaagcgttgtgttgaaacctttagacgcggggtatcgcaaagggctatcgtgggca
attttgcataaaaaagtagtgattggaattgctgcaattatggtagtcgctgctggtgta
gtgcttcctcggcttggcacagagtttgtaccagaactggaagagggcaccattaacttg
cgtgttactttagcgccttcatctagtttagatactgccctagaggtatccccgaaatta
gagaatatattaatggggtttccagaagtcacctatacgttgtcgcgtatcggtcgcgcc
gaaatagggggtgatccagagccggtgaacaatatcgaaatttatattggactaaagcct
gtgcctgaatggacaagtgcaaataaccgttatgaactgcaagcgttaatggaagaaaaa
atggagcaacatccgggtttgcttttcaatttttctcaacctatcgcgacaagggttgac
gagttattgtcgggagttagagcgcagctagccattaaattgtttgggcctgacctcaaa
gttctagctgaaaaaggccaggccattgaagcattagtaaaagaagttcaaggtgcacga
gatgttgcaatggaacaaattgccggagaatctcagctcattgtgacaccgaatcgtcga
gctctgtcgcgctatggattggccgtgggtgatgcaatggaacttgtacgcgaaggttta
ggtggagccagtgctggtcaaatcattaatggtaatgagcgatatgatatttatgtcagg
cttgctgaacaattccgaaatgacagtcaaatgatagctgacttgcgtttacaagctcca
tcgggtgcttgggttcgtttgggggacgtggctgaagtgactatcgcctctggtccaccg
caagtaagacgtgatgacgtgcagaggcgagttgtgatccaggcgaatgttcaaggtcga
gatatgggtagcgttgtggcagatattcgcaaatctattgatgagaaactagcactgcct
acagggtattcggtggatattggcggtcaatttgagaatcagcaacgagcgcagaagcga
ctatcattggttgtgccactttctttggggttaatagctttattattgtactttgctttt
gcttcatttggtcaggcaatgttgatacttgtaaatgtaccattggctgttatcgggggg
gtattttcactttggttatcaggtcaatatctttctgtgccgagctccgtaggttttatt
accctattcggcgtagcggtgttaaacggagtcgtgatggtagaaagcatcaatcagcgt
gttgcagacgggttatcggtatctgacgccgtatttgatggtgctacatcaagactgcgc
cctgtattgatgacagcgattacatctgcgctaggccttattccaatgttactgtctaat
ggcgttggtgctgaaatccaaaagcctttagcgagtgtaatcgttggtggcttggtaacc
gctacatttttaactctatttgtattacctgtgctattcgcctggttttcaaaagggaag
ttaaaagatatggcaagagcgccttcctaa
DBGET
integrated database retrieval system