Alteromonas macleodii ATCC 27126: MASE_13310
Help
Entry
MASE_13310 CDS
T02246
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
amac
Alteromonas macleodii ATCC 27126
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS38172
LinkDB
All DBs
Position
complement(3095516..3098026)
Genome browser
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MNKNHTLNALTLAICAAFSGSVIAQESSTADADAKSKEKFEQIVVTAAPGGATMQEASVS
VSAFDEDDILKLAPRSTAEVFRALPGIRAESSGGGGNANITIRGIPLATGGSKFLQIHED
GLPVLEYGDINFGNADNFLRYDWSVANVEAVRGGSASTFASNSPGGVINLISNTGEVGGG
AIGTSFGVDYEEFRLDFRYGGEISDDLYYHIAGFARGGEGPRETGYNGDQGGQVKFNITK
MLDNGHIRFFYKNLDDKVSTYLPSPVLVKGDGEYGPVPGYDASSQALNSAYNTNISTFDS
YGNPENRDVRDGIESKVNSFGVEVDLEVAENLFLLNKFRISDISGGFIAPFTDGFPAGPG
DVSNFASALCAGATDGDGNALNCDSTSVVLANGPGAGEVYTGQAFTNLQFDTRINDLGNM
INDFSLRKEFDNGIDLTVGYYYSNQDIATSWSSWQTFIQTLDGDNSQLLTITDGDGVELV
SNGLLSPSFLSWEWDLNYVTKAPYMNVGFELSDNILIDASVRHDTTEASGELISSCCGGN
ADFDLNGNGTIEQIEDASAINSGFISGGVINLNRAGASSQIVDYSANNTSYSIGGSYLLS
ASQTFFARYSKGGRAIADRLLQIGGTLNTDGSLTSTTSGYDTTKQFEVGYKYGTKDLMVN
ATLFDTVTEDTQAEVTSGLTFMREYEATGLELEGRWTATDNFVLSGNLTWTDAEISKDVN
NPALEGNTPRRQADWIWTITPEYVTDTWSVGASLQGSTEYYVQDNNDLKQEGYNLVNLFA
TYWVNDQFSVSLNVNNATDEFIITESEEGSAEVGSYIRARPLNGRTTVLSLKYMFD
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaatcacacactcaacgctttgaccctagcgatttgcgccgctttttcgggc
tcggttatcgcgcaggaatcatcaacagctgatgctgacgcaaagtcgaaagaaaaattc
gaacagattgtggttaccgctgcaccgggtggtgcaacgatgcaagaagctagtgtttct
gtaagtgcattcgatgaagacgatattcttaaactagctcctcgttctaccgctgaggta
tttcgcgcgttacccggtattcgtgccgagtcttcaggcggtggcggtaacgcaaatatt
actattcgcggtattccacttgcgacgggtggttctaaattcttgcaaatccatgaagac
ggtttacctgttttagaatatggtgatattaactttggcaatgccgataactttttacgc
tacgactggtcagtagcgaatgtggaagcagtacgcggtggttcagcgtcaacattcgca
agtaactcgccaggcggtgttattaacttgatcagtaacacgggcgaagtaggtggcggt
gccattggaacgtcatttggcgtcgattacgaagagtttcgtttagattttcgctatggc
ggtgaaattagcgacgacctttactaccacattgctggctttgcccgtggtggagagggc
ccgcgagaaacgggatacaatggcgaccaaggcggtcaggttaagttcaatatcactaag
atgctagataacggtcacatccgtttcttctataaaaaccttgatgacaaagtatcaaca
taccttccttctccggtattggtgaaaggcgatggtgaatatggcccggtacctggttac
gatgccagctcacaggcattaaactcagcttacaacacaaacatttctacttttgacagc
tatggtaacccagagaatcgcgacgtccgcgatggtatcgaatcaaaagtaaactcattt
ggcgttgaagttgacctcgaagtggctgaaaacttgttcttattaaacaagttccgtatt
tcagatatctcaggtggttttattgctccatttactgatggatttccagcgggccctggc
gatgtatcgaatttcgcttctgcactttgtgccggcgctactgacggtgacggaaatgcg
ctgaattgcgacagcacaagtgttgtactcgcgaacggacctggcgctggtgaagtgtac
acaggacaagcatttacaaaccttcagttcgacactcgaatcaacgatctgggtaacatg
atcaacgatttcagcttgcgtaaagaatttgataacggtatcgacctcacagtaggttat
tactactcaaaccaggacatcgccacaagctggtcaagctggcagacatttatacaaact
ctagacggtgacaattcacagcttctaacaattacagatggcgatggcgtggaacttgtt
tcaaacggtttattgtcaccaagcttcctttcgtgggagtgggacttaaactatgtaaca
aaagcgccgtacatgaacgttggttttgaattgtcagataacattcttattgatgcatcg
gtacgtcatgacacgaccgaagcttcaggtgaactcatcagctcatgttgcggcggaaat
gctgacttcgacctaaacggtaacggaactattgagcaaattgaagatgcttcagcaatc
aacagcggcttcattagcggtggtgttatcaacttaaatcgcgccggtgcgtcttctcaa
attgttgattacagtgcgaataatacgtcttattcaatcggtggttcgtacctgctaagc
gccagtcagacattttttgcccgttactcaaaaggtggccgtgctattgccgatcgttta
ctgcagattggcggtacattgaatacagacggcagcttaacaagcacaacatcgggttac
gatacaacgaagcaattcgaggtaggttacaaatacggtacgaaagacctcatggttaac
gcaaccttgtttgatactgttactgaagatacgcaagcagaggtaaccagtggtttaacc
tttatgcgcgaatatgaagcaacaggtttagagcttgaaggccgctggacagcaactgat
aatttcgtgctatccggtaacttaacgtggacagacgctgaaatcagtaaagatgtaaac
aaccctgcacttgaaggaaatactccacgccgccaagcagattggatttggactattaca
cctgagtacgttactgatacatggtctgttggtgcctcactacaaggctcgacagagtac
tatgttcaggacaataacgaccttaaacaagagggttataaccttgtaaacttgtttgcc
acttattgggtgaacgaccaattttctgtgtcgcttaatgtgaataacgccactgatgaa
tttatcatcactgagtcagaagaaggttcagcagaagttggtagctacatcagagcacgt
ccattgaacggccgtactacagtgctgtcgcttaaatatatgttcgactaa
DBGET
integrated database retrieval system