Malaciobacter marinus: AMRN_0172
Help
Entry
AMRN_0172 CDS
T06187
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase (protein kinase domain)
Organism
amar
Malaciobacter marinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
AAA_16
GAF
GAF_2
TPR_12
GAF_3
nSTAND1
AAA_14
RsgA_GTPase
TPR_8
TPR_1
TsaE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXX85966
UniProt:
A0A347TH88
LinkDB
All DBs
Position
complement(174020..179005)
Genome browser
AA seq
1661 aa
AA seq
DB search
MITKNYKLIKKLEFSQESDFFLAQQLNSKEEVFIKTNKEILSNQKNLEDEYLILQNLKHE
NIIKAKKVEKQGNKYFLILENFSLSTLKHQIKNKKFDLNTFLIIAIELCETCYYLHENQM
IYQNFSSDSILFDEKTNRVKLFDFCETKEISKRKNNKEKTNNTDIYKAPEQTNRVNFSIT
EQTDIYSLGIVFYEMLSGIIPYDSKDLLSLSHTIITKEFLSLYELELKIPKVISNIIDKM
IQKNPIDRYSNILSVLIDLKKIEDQLLNNRNIDEFEIDQFQKNFLINSNKKLFGREKELQ
ELKEEIDNISNELIIIKGVSGVGKTSFVKTALKHSNIDISNSLEIKLDNYKQNIAYKILY
EKIRELSKQLLTKDSHTLKLWRINISNALGNEANILYELIPELKIILDDKSNKTINNEEV
SKIKFDNYLFKYLQLFATKKSPLLIFIDDMQWSDEITRTWLETSLYQLKNTITIISYRDN
EVKENSRLYKLLNKLTKEDIKLKTFHLQALKLEDIKNILKTNIKLENSSEVAKLIFSKTL
GNCFFIIQLLKQLLDENIIYFNYKEFKWKCDLTQLNTVSASNNIIELLENKINKLEINET
KLLKIASCIGNKFDEVLLKKVYNDEKSFKQTLNKTILNEWIIKSKNINNSKHEKYKFSHD
RIQQVIYNSIILSERSLYHKQIADSILSLNFHKKNNDFLTYINHYNNAKSLFKTKEQKDY
LATLNHKASINARENADFIMAQKYMEEALSLFNDIKSKDNYSEILKDYAICEHMILNKKT
ALKYYNKAISVANTNLEKAYIYEQIIKLYSDFSEFKKAYETGKEALELFDLNIPKEFSKI
VYTKDSMYLNYKLKNKNPNNLISLQETKDEKIIIMIKLLSALLKAAYQIDPKLCVLVSMK
LVKLCLKYGDTKDAVIGFMVFGVIFQGAIKQNHKLGYKYANLSLEMIKKYNNSVLYPEVN
FVSGYFAFSWLLPTAITEQKWFESYNKGLLIGDLFHSGCAAAGIIQSMFLRGVCLDNINN
QIEIFEKKLRRIKAHEQLGAILSVKQAICKLKANTINKNSFCNKFFDEDEYVKDLENYNS
LHFAHYYYINKMITLYIYEDYKQAYEYYLQSKRFLENSKGTIHGIEHYFYESLIFSNLYE
KVNDGLKKKYLKTIKENLIEFEKYSLECPENFIVRKNLIKAELYRIENKINEAFKYFEKA
IEAAEIYSQIHLKAIANRLLSNIYKKINQERVSKLLKNEEEEALIQWGVSIKNHSNSTIN
FSKAINLDTLTKAAEAIVKEQKLPNLLKSLLYIILENSGAQYANVLLEDNEKYYIQATAS
YKSTTIEVMQNIEFEKSNNVVHNVINYVLRTKKPIVINDLNSDSIFIREDDAINRGVKSV
LCLPLIFHNKIRGLIYLENNAMSGVFSKEQIELLKHLSGQIAISIENTIMYKNLEEKVAE
RTQALDKKNDELENQNIKLQVQNKKILELNSDIIKENKKRKKVEEELQEAIKKLDMLATT
DSLTNINNRRVFDLTLEQESARAQRTNESLCLIMCDIDYFKLYNDYYGHLQGDECLKYVA
KTLNSSLKRTNDLVARYGGEEFAMILPNTSIENALKIATEIKNNIRKIEITHEKSKVSSY
ITLSMGIACTKELKTITPKNLIKIADEKLYIAKKKGRNQII
NT seq
4986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgattactaaaaactataaactaattaaaaaactagaattttcacaagaatctgatttt
tttttagcacaacaattaaatagtaaagaagaggtttttataaaaaccaataaagagatt
ttatctaatcaaaaaaatttagaagatgagtatttaattttacagaacttaaaacatgag
aatattattaaagcaaaaaaagttgaaaaacaaggtaataaatattttctaatattagaa
aactttagtctaagtactttaaaacatcaaataaaaaataaaaaatttgatttaaatact
tttttaattattgcaattgaactttgtgaaacttgctactacttacatgaaaatcaaatg
atatatcaaaatttttcaagcgattcaattctttttgatgaaaaaacaaatagagtcaaa
ctttttgatttttgtgaaactaaagaaatatctaaaagaaaaaacaataaagaaaaaact
aacaacactgatatatataaagctccagaacaaactaatagagttaatttttcaattact
gaacaaacagatatatactcattgggaatagttttctatgaaatgttatctggaataatt
ccttatgattcgaaagatttattatcattatctcatacgattattaccaaagagttttta
tctttatatgaacttgaacttaaaataccaaaggttatatcaaatataattgataaaatg
attcaaaaaaaccctattgatagatatagtaatatcttatctgttttaattgatttaaaa
aaaatagaagatcaacttttaaataatagaaatattgatgaatttgaaatagatcaattt
caaaaaaactttttaattaatagtaacaaaaaactatttggaagagaaaaagaactacag
gaattaaaagaagaaatagataatattagtaatgaacttataattataaaaggtgtctca
ggagtaggtaaaacatcatttgtaaaaacagctttaaaacattcaaatatagatatttct
aactccttagaaataaaattagataactataaacaaaatattgcttacaaaatattatat
gaaaaaataagagaactttcaaaacaactattaacaaaagactctcatacattaaaatta
tggagaataaacatatcaaatgcacttggaaatgaagcaaatatactttatgaactaatt
cctgaattaaagattatcttagatgataaaagtaataaaacaataaataatgaagaagta
tctaaaataaaatttgataattatttatttaaatatttgcaactatttgcaacaaaaaaa
tctcctttacttattttcatagatgatatgcaatggagtgatgaaattacaagaacttgg
ctagaaacttcactttaccaattaaaaaacactattacaatcatttcatatagagataat
gaagtaaaagagaactcaagattatacaaacttttaaataagttaacaaaagaagatata
aaattaaaaacgtttcatttacaagctttaaaacttgaagatataaaaaatatactaaaa
acaaatataaagctagaaaatagtagcgaagtagcaaaactaatttttagcaaaacctta
ggaaattgtttttttatcattcaacttttaaaacaactattagatgaaaacattatatat
ttcaattataaagaatttaaatggaaatgtgacttgacacaattaaatacagtttcagca
agtaataatatcattgaacttttagaaaataaaataaataaacttgaaataaatgaaact
aaattattaaaaatagcctcatgtattggaaataagtttgatgaagtgcttttaaaaaag
gtttataacgatgaaaaaagttttaaacaaacactaaataaaactatattaaatgaatgg
ataattaaaagtaaaaacatcaacaatagtaaacatgaaaaatacaaattttcacatgat
agaatacaacaagttatatataactctataatattaagtgaacgaagtctatatcataaa
caaattgcagattcaatattaagtttaaattttcataaaaaaaataatgactttttaact
tatataaatcattataataatgcaaaatcactatttaaaacaaaagaacagaaagattat
ttagcaactcttaatcacaaagcttcaattaatgcaagagaaaatgcagattttattatg
gcacaaaaatatatggaagaggctttatctctcttcaatgatataaaatcaaaagataat
tatagtgaaatattaaaagattatgcaatttgtgaacatatgattctaaataaaaaaact
gcattaaaatattataataaagcaattagcgtggctaatacaaatcttgagaaagcttat
atttatgaacagataataaaactttattctgatttttcagagtttaaaaaagcttatgaa
acaggaaaagaggctttagaattatttgacttaaatataccaaaagagtttagcaaaatt
gtatacacaaaagattctatgtatttaaattacaaacttaaaaacaaaaacccaaataac
ctaatttcattacaagaaacaaaagatgaaaaaatcataattatgataaaactattatct
gcattattaaaagctgcctatcaaattgatccaaaattgtgtgtacttgtatcaatgaaa
ttagtaaaattgtgtttaaaatatggtgatacaaaagatgctgtcattggatttatggtt
tttggagttatttttcaaggagcaataaaacaaaatcataaattaggttataaatatgca
aatctctctttagagatgataaaaaaatacaataacagtgttttatatccagaagttaat
tttgtatctggttattttgcattttcatggctcttaccaacagcaataactgagcaaaag
tggtttgaatcgtataataaaggtttattaataggtgatctttttcatagtggctgtgca
gcagcgggaattatacaaagtatgtttttaagaggtgtttgcttagataatataaataat
caaattgaaatttttgaaaaaaaacttagaagaattaaggctcatgaacaattaggagct
attttaagtgtaaaacaagcaatttgcaaattaaaagcaaatacaataaataaaaactct
ttttgtaataaattttttgatgaagatgagtatgtaaaagatttagaaaactataactct
ttacattttgcacattactattatattaataaaatgattactctatatatttatgaagat
tataaacaagcttatgaatactatttacaaagtaaaagatttttggaaaattctaaaggt
actatacatggaatagaacattatttttatgaatcattaatattttcaaatttgtatgaa
aaagtaaatgatgggttaaagaaaaaatatctaaaaacaatcaaagaaaacctaatagag
tttgaaaaatatagccttgagtgtccagaaaatttcatagtaagaaaaaatctaataaaa
gcagaattatatagaattgaaaataaaattaatgaagcatttaaatattttgagaaagca
attgaagcagcagaaatctattctcaaatacacttaaaagctatagcaaatagactatta
tcaaatatctataaaaaaattaatcaagaaagagtatcaaaattattaaaaaatgaagag
gaagaagcacttatacaatggggagtttcaataaaaaaccattcaaatagtacaattaat
ttttcaaaagcaataaatcttgatactttaacaaaagctgctgaagctattgttaaagaa
caaaagttaccaaatttattaaaaagcttactatatattatattagaaaactctggtgct
caatatgcaaatgtattattagaagacaatgaaaagtattatatacaagctactgcatca
tataaatcaacgaccattgaggttatgcaaaatattgagtttgaaaaatctaataatgtt
gttcataatgtaattaattatgttttaagaactaaaaaaccaattgttattaatgattta
aatagtgactcaatttttataagagaggatgatgcaattaatagaggtgttaaatctgtt
ttatgtttacctttaatctttcataataaaataagaggtttaatctatttagaaaacaat
gcaatgtcaggagtattttcaaaagaacaaatagaattattaaaacatttaagtggtcaa
attgctatctctattgaaaatactataatgtataaaaatcttgaagaaaaagtagctgaa
agaacacaagcactagataaaaaaaatgatgaattagaaaatcaaaatattaaattacaa
gtacaaaataaaaaaattttagaattaaattcagatattataaaagagaataaaaaaaga
aaaaaagtcgaagaagaactccaagaagcaataaaaaagctagatatgctcgcaacaaca
gattcccttacaaatattaataatagaagagtttttgatcttactttagaacaagagtct
gcaagagcacaaagaacaaatgaaagcttatgtttaattatgtgtgatattgattacttt
aaactatataatgattattatggtcatttacaaggcgatgagtgtttgaaatatgttgca
aaaactttaaatagtagtctaaaaagaacaaatgatttagttgcaagatatggaggagaa
gagtttgcaatgattcttcctaatacttcaattgaaaatgcactaaaaattgccactgaa
ataaagaacaatattagaaaaattgaaattactcatgaaaagtctaaggtaagttcatat
attacattaagtatggggattgcttgcacaaaagaattaaaaactattactccaaagaac
ttaattaaaatagcagatgaaaaactatacatagcaaagaaaaaaggtagaaaccaaatc
atataa
DBGET
integrated database retrieval system