Malaciobacter marinus: AMRN_1275
Help
Entry
AMRN_1275 CDS
T06187
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
amar
Malaciobacter marinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
ubiquitin
Rad60-SLD
OMP_b-brl
Rad60-SLD_2
Ubiquitin_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXX87016
UniProt:
A0A347TK88
LinkDB
All DBs
Position
complement(1272587..1274044)
Genome browser
AA seq
485 aa
AA seq
DB search
MKNRTYLKVFAILLICSSNLMAMQIFVKTLTGKTITLDVEASDSIENIKAKIQDKEGIPP
YSQRVIFAGKQLEEGRTLSDYNIQKESTLHLVLNKPKPNEDNSKTIKKSIDNADNKNSKN
NKNSRNAARVLDKIKDKGNDLGGFISSLNTKTDKEVAQAVKETTPVVATALANSSNQVQQ
TIGSVVSGRQLGIRGISTLRGANSGDDMLSNDNAWYKAFVSKASQDDKDGYDGYDFDSYG
FAIGADKEFGNNSRFGLAFVYASGDIDTNNVSQSSDLDIYNLVAYGSTPIFDKDTFLFYQ
LSLGIQDTKTSRKEHTTNTTATSDFNGKIASASLRLIKNMQLNDNLLFVPTIRGMYTYMK
NPSYKESGANALNLKVDKFSTSSFKLGIGADFEYKLNNSFTLLSNAMINYDLKQSDNTST
SSYAGSSDLAFTTKGMDLSKFSYEVGIGFKTNISEDVDFRFEYNYEGRDSSFSNQTLSGK
ISWKF
NT seq
1458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatagaacatatttaaaagtttttgcaattttgcttatttgctcttcaaacctt
atggcaatgcaaatttttgttaaaacattaactggaaaaacaattactcttgatgtagaa
gcaagtgacagtatagaaaatattaaagcaaaaattcaagataaagagggaatacctcca
tattcacaaagagtaatttttgctggtaaacaattagaagaaggaagaaccttatctgat
tataatattcaaaaagagagtacattgcatttagttttaaataagcctaaacctaatgaa
gataattcaaaaacaataaaaaaatcaatagataatgctgataataaaaatagtaagaat
aataagaatagtagaaatgccgcaagggttttagataagataaaagataagggaaatgat
ttaggtggatttatctcttcacttaatactaagactgataaagaagttgcacaagctgtt
aaggaaacaactcctgttgttgctactgctttagctaatagttctaatcaagttcaacaa
actattggtagtgttgtttctggaagacaacttggtattagaggtatttctactttaaga
ggtgctaactctggtgatgatatgctttctaatgataatgcttggtataaagcttttgtt
tctaaggcttctcaagatgataaagatggctatgatggttatgattttgactcttatggt
tttgctattggtgctgataaagagtttggaaataatagtagatttggattggcttttgtt
tatgcttctggggacattgatacaaataatgtatctcaatctagtgatttagatatttat
aatcttgttgcttatggtagtactcctatttttgacaaagatacttttttgttttatcaa
ttaagtttaggtattcaagatactaaaacttctagaaaagaacatactactaatactact
gccacttctgattttaatggtaaaattgcttctgcttctttaaggcttattaagaatatg
caacttaatgataatcttctttttgttccaactattagaggaatgtatacttatatgaaa
aatccttcttataaagaaagtggtgcaaatgctcttaatttaaaagttgataaattttct
actagttcttttaagcttggtattggggctgattttgaatataaattaaataactctttt
actcttttatcaaatgctatgattaactatgatttaaaacaaagtgataatacttctacc
tcttcttatgctggtagttctgatttagcttttactactaagggtatggatttatctaag
ttttcttatgaagttggtattggctttaaaactaatatctctgaagatgttgattttaga
tttgagtataattatgaaggaagagacagctctttttctaatcaaactttatctggtaaa
atctcttggaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system