Alteromonas macleodii Balearic Sea AD45: AMBAS45_07570
Help
Entry
AMBAS45_07570 CDS
T02253
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K06877
DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
Organism
amb
Alteromonas macleodii Balearic Sea AD45
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amb00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99996 General function prediction only
AMBAS45_07570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
MZB
ResIII
DUF6909
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFT94989
LinkDB
All DBs
Position
1769258..1775560
Genome browser
AA seq
2100 aa
AA seq
DB search
MKYFSELVNQSIARAKESSLSVLGITNPALRQHLAIQMSQDCGESESMMATPLFEHTFGW
TEADRTMGQLAEDRLLSSAVLDALDKEKITDSQGKQVENRYQFKKEFKPYTHQLKSWNTL
LADKPKSVVVTSGTGSGKTECFMVPVLEDLYRESQQTQEPLAGVRAIFLYPLNALINSQR
ERLHAWTQDFGKDIRFCLYNGNTEEKANKVKARQAQVPNEILSRELMRDQPAPILVTNGT
MLEYMLVRNVDSPIINKSKEQKSLRWIVLDEAHTYVGSQAAELSMQLRRVLHAFGVEAKD
VRFVATSATIGDKDAEKQLQSYLADLAGVPNDHVVVIGGKRNIPQLTFSPKDGKTLEELS
LIPADKKPGEKDYDPDVSKTRFEALTESTVAKKIRDKFVNSNKPLKLAELKKYLEEEFPS
QTFTQNSVLQWLDLLTGTKLSPKHEAFLKVRAHFFQRMMNGVWSCIDPHCASKKSSVLKD
SWPFGMVYSKQTGKCNCGAPVLEVGFCNDCNEPHLLAADKSGFITQRDTDVGDEFSLLID
QDDDDDTEDDESGNKNKPTSIFVTLRAEPDDELIYSPVDINVSTGKLGDITDTVRLYYAY
DRDENCTYQTGCCGYKGTSFKKPIRRAILGSPFYVANAVPTILEFCPDPKVDKETGLGPN
TLPGRGRKLITFTDSRQGTARMAVRMQQEAERSKLRGLVFSILRTFQESQPEKEDIAKDA
DLAGLKENIKSLQSAGLYDMAAQLQEKINAAEGGKPVSFKPEVVSWGTMVKELQLKNDIK
DNILTYNKYANPEVFGDSTGAEKLSEMLLIREFARRPKFQNNMETQGIIKIGYQGLEKVN
AIPDNWSEHGLKLEDWLDFLKVCLDFYVRENTYIKLEDDWRVWIGFKFAPKTFLKPDSFE
EDENRVKKWPQVKGAYNRLAKLLILGAKLNKESKVTKDLVNEWLRSAWTALTQNKVLDNE
GNQFFLSRQKITFEFAEKCFICPVTNKLLDTTFRNLTPYLPNSFDSRNFECKSIDLPPIW
TLDISQYDYSEGLEKIRQSVLADEKVSQLRSRNLWTDINDRVVEGGFYYRTAEHSAQQSS
ERLNNYESMFKSGKVNVLNCSTTMEMGVDIGGISAVVMNNVPPHPANYLQRAGRAGRSKE
SRAISYTLCKSNPHDTEVFNEPSWPFVTAIPAPKISLDSKRLVQRHVNSLLLSIFLRDVI
GSTNKEKTSLNLEWFFLPSEGGQSVCDKFIAWASGNANTLEKTLKDVLKGTVLSTVPACN
VIDDTNQAIEKLSKRWITHYRQLKTAEQDATPESAYEFKVRVELTRHTNEYLLKELAAKA
FLPGYGFPTDIVTLNNKNIVDFKREKEGKQKREKFREDNISQLRELPTRNLAVAIREYAP
GAEIVLDGRVFKSAGVALNWQKLASDAREGQKFDVAWRCGSCGHSGVETNTTIMEDWSCG
SCGTKIRNSWKKTVLEPTGFVTDFFTAPSNDISSQSYIAVQPSWLSIDALPINLPDPNLG
YMKYGTESTIFQHSSGANEHGYAICMQCGKAESMLGDGEFPKSLNPASFHKPITSTPKSK
DKDGFEPELCDGSATVHGNVHLGCSGLTDAFELVLRHPLSGEYIDPSHPDSDSIALTLAV
AMRNALAAKLGIATSEIGYSTRKTRVQESNKQAIAVQLYDVVSGGAGFSTSAALHIEDVL
MQTYQNLSCEASCDSACSTCLLDSNTRHDANQLNRNLAKAWLGDEFSNFVSLSEQYHFIK
GAKFCYEPILEAISRQINKGASEIRVWMGSNVNEWDLNSRHVQMFAFQMLNIHKVKLTIV
LPNTTLSNADYISLSRLRDIGVEFVTSDAELDSGALVAQAIYEKDKAFTLACSSFDVLNP
NQSWLLSRTENMVVYSEALSSVEVSPVDTSSWIKFDGNSMAKVELRRELDGAIDGFGKRF
WELLGSNFKPLEDDLNSSQLAGVKYTDRYLQSPWYVILLGEVIRALPKAPGVGFELETLF
NSRDKGARLHDDWSNSNAMTEVISTWFEKGAATPCYLDLHQRRDDIAHRREMKLTFSNGN
RYTVSLDQGMGYWNHHLAKNKHWFDFAQPHEQLLQMAEVWQYGNLQTKYDWETVIFIAKL
NT seq
6303 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtatttttctgagttagttaatcaatctattgcgagagcgaaagagtcgtcttta
agtgtattgggtataactaaccctgcgttacgtcaacatctcgctattcaaatgtcacaa
gattgcggagagtctgaatcaatgatggcgacaccgctttttgaacatacattcggatgg
acagaggccgatagaaccatggggcaattagctgaagatagattgttatcgtcagcagtt
ttggatgcattggataaagagaaaataacggatagccaaggaaaacaggtagaaaatcgc
tatcagtttaaaaaagagttcaaaccttatactcatcaattaaaaagctggaacacacta
ctagccgataaacctaaatctgttgtagtaaccagtggaactggctctggtaaaaccgag
tgttttatggttccagtgctcgaagatctttatagagaatcacagcaaacacaagagcct
ttggcgggtgtcagagctatcttcttgtatcctctcaacgcactgattaattcacaacga
gaaaggctacacgcttggacacaggactttggtaaagatattcgattttgcttgtataac
gggaatacagaagaaaaagccaacaaggtaaaagcacgccaggctcaagtgccaaatgag
attctatcaagagagttgatgcgagatcagcccgcgcccattttggttacaaacggcact
atgctggaatatatgcttgtaagaaacgttgactcgccaattatcaacaaatcgaaagaa
cagaagtccttgagatggatagtattggacgaggctcacacgtatgttggctcacaggca
gctgaactatcaatgcagttgagacgagttttacacgcttttggtgtggaagctaaagat
gttcgttttgttgctacctccgcaacaattggcgacaaggatgctgaaaaacagcttcaa
agctatctggcggacctcgccggtgttcctaatgatcatgtagtcgtcatcggagggaag
cgaaatatacctcagttaacattttctcccaaagacggtaaaacactggaggaattgtct
ttaataccagctgataaaaaacctggagaaaaagattacgatccagatgtttcgaaaaca
cgctttgaagcactgacagagtctacggttgcaaagaaaattagagataagttcgtcaat
agcaataagccattaaagcttgctgaattaaaaaaatacctagaggaggaattcccttct
caaacgtttacgcagaactctgtacttcagtggctagacttactaactggaacgaagcta
tcgcctaaacatgaagcgttcctaaaggttagagcgcacttttttcaaagaatgatgaat
ggagtttggagctgtattgaccctcattgtgcaagtaagaaaagttctgtcttgaaagat
agttggcccttcggcatggtgtattcgaagcaaactggcaaatgtaattgtggtgcaccg
gtattggaagttggcttttgtaacgactgcaatgagccccatttattggctgcagataaa
agtggttttattacacaaagagatacagatgttggtgatgagttttcgttgcttatcgat
caggacgatgatgacgatactgaggatgatgaaagcggtaataaaaacaaacctacatca
atttttgtaacgcttagagctgagccggatgacgagcttatttacagcccagtcgatatt
aatgtgtctacaggaaaattgggtgacatcactgacactgtgcgcttgtactatgcatat
gatagagatgagaattgtacctatcaaacaggatgttgtggttataaaggaacatcattc
aaaaaaccgattagaagggcaatactcggctctcctttttacgtggctaatgctgttcca
accatacttgaattttgccctgacccaaaagtagacaaagaaacaggacttggtccgaat
acgctgccagggcgaggacgcaagctaatcacatttacagacagtaggcagggcactgct
cgtatggctgttagaatgcagcaggaagctgaacgcagtaagttacgaggtttagtattt
agcattttaagaacttttcaggaatcgcaaccagaaaaagaagatattgctaaagatgct
gatttagctggattaaaagagaatataaaaagcctccaaagtgcaggcttatatgatatg
gctgcccagctacaagaaaaaattaatgcagcagaaggtggtaaacccgtctcatttaaa
cccgaagtggtttcttgggggacaatggtaaaagagcttcagctaaagaacgacattaaa
gataacatattaacttataataaatacgcaaaccctgaagtattcggtgattcgactgga
gcggagaagctttctgaaatgttgttgattcgcgagtttgctcgtcgtccaaagttccag
aacaatatggaaactcaagggattataaaaattggatatcagggtttagaaaaagtaaac
gctattcctgacaattggagtgaacatggccttaagcttgaagattggctggattttctc
aaagtctgtttagatttttatgttcgagaaaatacctatattaagcttgaagatgactgg
agagtttggattggttttaagtttgcacctaaaacgttcctaaaaccagattcttttgaa
gaagacgaaaatagagttaaaaaatggccacaggtcaaaggagcctataacaggctagct
aagttacttatactcggtgctaaattaaacaaagagtcgaaggttacgaaagatctcgtt
aatgaatggctaagatctgcttggactgcacttactcaaaataaagtacttgataatgaa
ggtaatcagtttttcttaagtcgtcaaaaaataacttttgagtttgctgaaaaatgcttt
atttgccctgttactaacaaactgctcgatacaacattcagaaatcttacgccctatttg
ccgaattcttttgattcaagaaactttgagtgcaaatcaatagatttaccacctatatgg
actttggatatatcccagtacgactacagtgaagggcttgaaaaaattcgacagtctgtt
ttagcagacgaaaaagtttcccaacttcgttctcgcaacctgtggacagatataaatgat
agagtagtggagggtggtttttattatcgaactgccgagcattctgctcaacaatcatca
gagcgacttaacaattatgaaagcatgttcaaaagcggaaaagttaatgtgctcaattgt
tctacaaccatggaaatgggtgtagatataggtggtatatcagcggttgtaatgaataac
gttcctccacatcccgcaaattacttgcaacgggcaggacgagctggccgaagtaaagag
tccagggctatatcttatacgttgtgtaaaagtaacccccatgatacagaagtttttaac
gagccatcatggccttttgtcacagctatacccgcacctaaaatatctttagattctaaa
cggcttgttcaaagacatgtaaattcgcttttactttcaatttttctaagagatgttatc
ggctcaacgaataaggaaaaaacaagtttaaacttagaatggttcttcttaccgtcggaa
ggcggacaatctgtctgcgacaaattcatcgcatgggcatcaggtaacgcaaatacctta
gaaaaaacgcttaaagatgtattgaaaggaactgtactttcgactgttccggcttgcaat
gttatcgacgatacaaatcaggctattgaaaaattatctaagcgctggataactcactac
cgccagcttaaaactgcagaacaagatgcaacacctgagagtgcatacgagtttaaggta
agagttgagttaacaaggcacactaatgaatatttgttgaaagagctcgctgccaaagct
tttcttccaggttacggctttccaacagatatcgttacactaaacaataaaaacattgtt
gattttaaacgtgaaaaagaaggaaaacaaaagcgcgaaaaatttagagaggacaatatt
tctcagcttagagaattacctactagaaaccttgctgttgcaatccgagaatatgctcca
ggtgcagaaattgttttggatggacgtgtattcaaatctgcaggggtcgctcttaattgg
cagaaactggccagtgacgctagagaggggcaaaaattcgatgttgcgtggcgctgtggc
tcatgtggtcattcaggtgtagaaacaaataccacaattatggaagattggagttgtggc
tcatgtggaaccaaaataagaaatagttggaaaaaaacggttcttgagccgactggtttt
gtaactgacttttttaccgctccatcaaacgacatttcatctcaaagttacattgctgtt
caaccgtcttggctgtccattgatgcattaccgattaatcttcctgaccctaatttgggg
tacatgaagtatgggacagagtctactattttccaacattcatctggtgcaaatgaacat
ggctacgcgatttgcatgcagtgtggtaaagctgaatctatgctaggtgatggtgagttt
ccaaagtcgcttaatcctgcctctttccataagcctattacttcaacaccgaaatcaaaa
gacaaggatggtttcgagcctgagctttgtgatggaagtgcaactgtccacggtaatgta
catcttggctgttctggtctaacagatgcgtttgagctggtgttgcgacatcctctttct
ggtgagtacatagatcccagtcatcctgattccgattctatagcgctaacattggctgtc
gccatgcgtaacgcccttgcagcaaagttaggcatcgcgacgtcggagatagggtactct
acgagaaaaaccagagttcaagaatcaaacaagcaagcaatcgctgtgcagctatatgac
gtagtaagcggaggtgcaggtttttcaacaagtgcagcacttcatattgaagatgtactt
atgcagacttatcaaaatttgtcttgtgaagcttcgtgtgactctgcgtgttcgacatgt
ttgttggattcaaatactcgacacgatgcaaaccaactaaatcgtaacttggctaaagca
tggttaggagatgagttttccaattttgtatctttgagtgaacagtatcactttattaaa
ggtgcaaaattttgttacgagcctattctggaagctatttctcgacagataaacaaaggt
gccagtgaaatacgagtgtggatgggaagcaatgtaaatgaatgggacttaaattctcgt
catgtacagatgttcgcttttcaaatgctaaatattcacaaggtgaagcttactattgtt
cttccaaacacaactttgtctaatgctgattatatttcgttatctcgattaagagacatt
ggcgttgaatttgtaaccagtgatgccgagttagatagtggggctcttgttgcgcaggca
atatacgaaaaggataaggcttttacactagcttgctcttcatttgatgtactcaatcca
aatcaaagttggttgctttcacgcactgaaaatatggttgtttattccgaagctctttca
agcgttgaggtgtctccagttgatacatcatcttggataaaattcgacggtaactctatg
gcaaaagtagagctaagaagagagctcgatggtgccattgatggtttcggcaagagattc
tgggagctgttgggaagtaattttaaaccgcttgaggatgacctaaactcatcccagtta
gctggtgttaagtacaccgataggtatttacagtcgccttggtacgtcattttacttggc
gaagtaattagggctttacctaaagctccaggcgttggctttgaattagaaactttgttt
aattccagggacaaaggtgcccggcttcatgatgactggagcaacagcaacgcaatgaca
gaagttatctctacgtggtttgagaagggagcagctacgccttgctaccttgatttgcat
cagagacgcgatgacattgctcatagacgtgaaatgaagcttacattcagtaatggcaat
aggtacacagtaagcctagatcaaggcatgggatattggaaccatcatctagctaagaac
aagcattggtttgatttcgctcagccacatgagcagttacttcaaatggctgaagtttgg
caatatgggaatcttcaaaccaagtatgactgggaaacagtgatttttatcgcaaagctt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
