Apis mellifera (honey bee): 100577763
Help
Entry
100577763 CDS
T01057
Name
(RefSeq) small subunit processome component 20 homolog
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ame
Apis mellifera (honey bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ame00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ame03009
]
100577763
Ribosome biogenesis [BR:
ame03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
100577763
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
HEAT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100577763
NCBI-ProteinID:
XP_026297432
BEEBASE:
GB48105
UniProt:
A0A7M7MKQ3
LinkDB
All DBs
Position
LG7:13405543..13415053
Genome browser
AA seq
2780 aa
AA seq
DB search
MKNKPIRHKELNTFQFKTFSERINEIDVDIFHYVSHRNEENDEETETYFYQTLQKWNFLN
LTEGYCSFKKKVRNIVTLPQLINQKQFVIDTLIEYLEKRDILFLQPILELVVAVSKDLQK
DFYEYFPRCLIVIIDLLRTKDTEQIEYTFTSLAYLFKFLWRYLIQNIKTVFDLLLPLLAD
TQPTYVNNFAAESFAFVVRKIKDKDSFLKTILHILKNNPNAISGCGKLLFEVISGIPGQF
HSCAEQMLSLYFNALNNESFNQNLVFKLLKEIIDCLLQNIHPQKCHIFWSVFLNVMDKSI
EKTRNFQLTTGKKSLILLMQLLNTIINYKNGKIVIDPVSLIKKLVQILNIFENENDVLQE
TINVSVTILLATNVKLMQETSSQILFKIMSVKDIKLLYGTVESLMHYSSFETLILPHIIR
HSISIGFNDDILELFTKIIKVKAPLCLNGINLNKWTKYILDIRGAKFDSINFCQKNLKAL
LSNDIPVNTLKTLIILPHLKPLPEEFKDILKNGILSLYQRILNNINIEIEINKLCLTLLI
TLESAIHILELEILQNFMEMNDIKILDLITKYPDNKFILNAVDLYITYFSTSQYRDIYIN
RIIFDKLNNNIAQKLSSPFSEIRLIVTHLYFLFSNINEVESTLNEKIKRNPMEHMYLAEC
ESISIQTYRSKLLHLQTLSYESDVMTNFDLKYYEIPLQYLLGNLYINFSLLWEPVSKIIA
TYAHKDCDQFWPLFLAELKCDEKLIEDYKPLFECNVISEIQNRIQRTNDKPDYKNHKILL
WKCMTNFSHFCEIKNRDITGLFIDFVNDNFFKSNSEDARYCNILKIQDLTISNSNMKIDK
ENESDSEFEEYKENEIEEKEQKEVTICKNTELKQINAETKEIVSKNYKVKLLIAQLEVFE
KITNPRTLYRESEMQKLYLDLLSSKNSDIQRAALKCLLTYKYKYLLPYKDNLFSLINEKN
MKNELTRFKIDNESNMILDEHRDEFIPILMRIIYAKMITKTGMRTGSKAGGILKRKMILR
FLAGIQENEMIIFINMAFKPFKKYTLLELHKVDNQQINLRQITQNIINTIDLNNVTPPKR
LQSATNLLAILIEQSGSKMGQKLLPYLLGLVICILAEVTGILQNSDKVHVGYLRLIRNVR
STCISILARFFSHFENYEWNKYEIDALYNVAVFPWLEKLPIDGIHSPTPLLRLFMIWSQN
SRYYPLFIKHHEDNKSISPLPYIMQLLLNAKTNASVTNAILEMIEKMVTLQDYGKTNENN
MEVDTPFLPLIPIINNLLEINKEALSNDVNYGSVILLPHVFDILQYIKNKLEKSTKRISK
SELVILSRISEFVKDADACNILLTLTLPILTKKAGAGEEEEIIIELITTIINLVKQVKKP
TTHIRAMLPLLSIISTISTRKLLLELYKTIVENSTENDREILIRNYNLINALNAWDRRWI
DQPDYQKRLDAFSEINNTMERNEITLEFGVAIIHNCYYFLKNESDLALRDNAGQCLKLLG
CKLAKKYKENTVDRRYLIDDTILVLIRKGITSKIEIVKFQSISFLGYLAMECSDVHPILR
DLSPLTNKIDLEVDFFENMQHLQLHRRARALLKFCSFAKTLKKSINTRTLTQFILPLASS
YLCNETYIHKNNIIDAAIETVGTVCKLLPWHQYEIILKHYLEKIRNSIEFQKQLVRIIII
ILDSFHFDLSKYKPSEEFSISKYIKNVSENEIVFDKKKDEDENIEEKSKEKNDDKNNEQK
IEEKLNEALNSENINKIEEKIQETQEISIIEKQIILSEYGAQQVIFSISKELLPQLHRSI
IARTSRENSHKINKKKITIDNEEEELMRVPIALAFVKLLQKLPEYFLDTNLSGIFMKLCT
FLKSRLESVRRVTREILQKIMITLGPKYLHHLLREMNTLLTKGFQVHVLAYTVQSVLVAL
KPYFQKFDINKNLQSILSVCKIDLFGLTAEEKEVIGIVKNVVEAKSTKSFDIFHILAQYI
TESCLVDLILPLKEVLMKTHSHKTVQKIIECFRNIVLGLADNIFIPLEQMLIFLYGVISE
SIPELRPEKNDKLLTEKEIETFNRQKPDCFIIPPEPKNKMGIKAISKTSKNTNAHVIIEF
GLKLFHILLKREKVSNADFKPLLDPFVPLISECIRSQHVKLTTLSLQCLNWLLKMDLSLI
QESISNICTSIFDLLHKYAAAGLSKGDNFDLVMAGFKCMSVIVRDVKHYVIKTDQLKALI
MYAEQDMHNTDKQATAFGLLKAIIARKMILPEMHLVMEKVAILSITSELEHVRLQSRSVF
YSYLMEYPLGKHLNKHIAFYLTQVSYEMQPGRLSALEMIHNIVTGFPFKTLILKSSLIFI
MVGARLVNDDDPTCRKLCAKCIKELIERLSYNRRSKLFDIIITWLKDIKIMHRTLAAQLC
GIFVTVEKDSFDSRLKEILPLILKQFHANFNDDNDDNEPGRFVKIHSEEKTQLKMHNIKD
PERMKDHHMFQVLQLVLKISANCTTFLKNEEYKEAIHLFAEYSQSLLAHPHIWIRLAASQ
MIGFILAILDVDKIIDIINNPEKYENEIGFMYSDPITVIKSLTLDLIAQLEPDMTLEELA
DQTVKNLIFIARILKSIKKINTIAIDQNDEIKSDKNQLSLPWLVRKLRKAVNKEITQTPK
SITVRIAFFKWVAGVVVTIPMEFLNVVLFNIMSPIVREISAVEEKNTTLRRLAKEAAMMI
KKRLDNEQYTKLLNRIQQNLDIKKAERRKIRTQQFVTDPELAAKRKIVRQQKKKEAKKRK
LDIVRGKKNIKKTFEKKIDI
NT seq
8343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaaccaattcgtcataaagaattaaatacatttcagtttaaaacattttcc
gaaagaataaatgaaatcgatgttgatatatttcattatgtttcacatcgaaacgaggaa
aatgatgaagaaaccgaaacttatttttatcaaacacttcaaaaatggaattttcttaac
cttacagaaggttattgcagttttaaaaagaaagttcgtaatatcgtaactcttccacaa
ttaattaatcaaaaacagttcgtaatagatacgttaatagaatatttagagaagagagat
attttgtttttacaaccaattttagaattagtagtggctgtatcaaaagatttgcaaaaa
gatttttatgaatattttcctagatgtttaattgttattattgatttgttacgaacaaaa
gatacagaacaaatagaatatacatttacatcattagcttatttatttaaatttttatgg
agatatctgattcaaaatataaaaactgtatttgatcttttgttgccattattagcagat
acgcaaccaacttacgtaaataattttgcagctgaaagttttgcatttgtggtacgtaaa
attaaagataaagattctttcttaaaaacaatattacatattttgaaaaataatcctaat
gcaatatcaggatgtggtaaattattatttgaagtaatatctggtataccaggacaattt
cattcatgtgcagaacaaatgctttcattatatttcaatgcattaaataatgaatctttt
aatcaaaatctagtgttcaaattattaaaagaaattattgactgtttgctacaaaatata
catccacagaaatgtcatatattttggtctgtatttttaaatgttatggacaaatctatt
gaaaaaactagaaattttcaattaacaactggaaagaaaagtttaattcttttaatgcaa
ttgttaaatacaattataaattataaaaatggaaaaattgttatagatcctgtatcattg
attaagaagttggttcaaattttaaatatttttgaaaatgaaaatgatgtattgcaagaa
actataaatgtatcagttactattcttttggcaactaatgttaaattgatgcaagaaaca
tccagtcaaatattatttaaaattatgtccgtgaaagatatcaaattattatatggtact
gttgaaagtttaatgcattattcatcatttgaaactttaatattgccacatataatacga
catagcatttccattggttttaatgatgatattttagaattgtttactaagataattaaa
gtaaaagctcccttatgtcttaatggtattaacttaaataaatggacaaaatacatttta
gatatacgaggtgcaaagtttgatagtattaatttctgtcagaaaaatttaaaagctcta
ttaagtaatgatataccagtaaatacattaaaaacattaattattttaccacatttaaaa
cctttgccagaagaatttaaagatattttaaaaaatggaatattgtctttatatcaacga
atattaaataatatcaatatagaaattgaaataaataaattatgtttgacattattaata
actttggaatcagcaattcacatattggaattagaaattttacaaaattttatggaaatg
aatgatataaaaatattagacttaattacaaaatatcctgataataagtttatcttaaat
gcagtagatttatatataacatattttagtacatcacaataccgagatatttatataaat
agaattatatttgataagttaaataacaatattgcacaaaaattaagttcaccttttagt
gaaatccgcttaatagtaacacatttatattttttattttctaatatcaatgaagttgaa
tctactttgaatgaaaagattaaaagaaatcctatggaacatatgtatttagcagaatgt
gaatctatatctatacagacatatagaagtaaattgctacatttacaaacattgtcatat
gaaagtgatgtaatgacaaattttgatttgaaatattatgaaattcctcttcaatattta
ttgggaaatttatatataaatttttctttattatgggaacctgtgagcaaaattatagct
acttatgcacataaagactgtgatcaattttggcctttattcttagcagaactaaaatgt
gatgagaaattaattgaagattataaaccattatttgaatgtaatgttatttctgaaata
caaaatagaatacaaagaactaacgataaaccagattataaaaatcataaaattctttta
tggaaatgtatgacaaatttttcacatttttgtgagataaagaacagagacataacagga
ttatttattgattttgtaaatgataatttttttaagtctaattctgaagatgcaagatat
tgtaatattttgaaaatacaagatttaactatttctaatagtaatatgaaaattgacaaa
gaaaatgaaagtgatagtgaatttgaagaatataaagaaaatgaaatagaagagaaagaa
caaaaagaagttacaatttgtaaaaatacagaattaaaacaaataaatgcagaaactaaa
gaaatagtaagtaaaaattataaagtgaagcttttaattgctcaacttgaagtatttgaa
aaaataacaaatccaagaacattatacagggaatcagaaatgcagaaactttatttagat
ttactatcttcaaaaaattctgatatccaaagagctgctttaaaatgtcttcttacttac
aaatataaatatttattaccttataaagataatttgttcagtttaattaatgaaaaaaat
atgaaaaatgaattaacacgttttaagattgataatgaaagtaatatgatattggatgaa
catcgtgatgaatttatacctatattaatgaggataatttatgcaaaaatgattacaaaa
acaggaatgagaactggtagtaaagctggaggtattctaaaacgaaaaatgattttacgt
tttctagctggaattcaagaaaatgaaatgatcatatttataaacatggcatttaaacct
tttaaaaaatatacattattagaattacataaagtggataatcaacaaattaatttaaga
caaattacacagaatattattaatactattgatttgaataatgttacaccacctaaacga
ttacaaagtgctacaaatttgcttgcaatattaatagaacaatctggtagtaaaatggga
caaaaattattaccttatttacttggtttagtaatatgtattctggcagaagtaactgga
attttacaaaattcagataaagttcatgttggttacttaagattaattagaaatgtcaga
tcaacttgcatttcaatattagcaaggttttttagtcattttgaaaattatgaatggaat
aaatatgaaatagatgccttatataatgtagctgtatttccatggttggaaaagttacct
atagatggtattcatagtcctactccattattacgattatttatgatatggagtcaaaac
tctcgttattatccattatttataaaacatcacgaagataataaatctattagtcctctt
ccatatataatgcaacttttattaaatgcaaaaacaaatgcatctgtaactaatgctatt
ctcgaaatgattgaaaaaatggtaacattacaagattatggaaaaacgaatgaaaataat
atggaagttgatacaccttttcttcctttaattcctataattaataatttacttgaaata
aataaagaagcattatctaatgatgtcaattatggatctgttatacttcttcctcatgta
tttgatattttacaatatattaaaaataaacttgaaaaatcgactaagagaataagcaaa
tcagaacttgtaattttatcacgtatttcagaatttgtgaaagatgcagatgcatgtaac
atacttcttactcttactttaccaatattaactaaaaaagctggagctggtgaagaagaa
gaaattattattgaattaattacaactataataaatctcgtaaaacaagtaaaaaaacca
acaacacatatacgagcaatgttacctttattaagtataatatcgacaatttctactcgt
aaacttctattagaactttataaaacaattgttgaaaattctaccgaaaatgatcgtgag
atattaataagaaattacaatttaataaatgcgcttaatgcatgggatcgtagatggatt
gatcaaccagattatcaaaaaagattagatgcattttctgaaattaataatacaatggaa
agaaatgaaattacattagaatttggtgtagctattattcataattgttactattttctt
aaaaatgaatcagatttagcattgagagataatgcaggacaatgtcttaaacttcttggt
tgtaaattagcaaagaaatacaaagaaaataccgtagatagacgttatttgatcgatgat
acaattttagtacttataagaaaaggaataactagtaaaattgaaattgtaaaatttcaa
tcaatatcttttttgggatatttagctatggaatgttcagatgttcatcccattttacga
gatttatcgccattaactaataaaatagatctcgaagtagatttttttgaaaacatgcaa
catttgcaattacatagaagagctcgagcattacttaaattttgcagttttgcaaaaaca
ttaaaaaaatcaataaatacacggacattaacacaatttattcttcctcttgcttcttca
tatttgtgcaatgaaacttatatacataaaaacaatattattgatgctgcaattgaaaca
gttggaactgtatgtaaacttttaccatggcatcaatacgaaattattctaaaacattat
ttagaaaaaataagaaactccattgaatttcagaaacaacttgttagaattattattatt
attttagattcctttcattttgatttatcaaaatataaacctagtgaggaattttcaata
tcaaaatatattaaaaatgtttctgaaaatgaaatagtttttgataaaaagaaagatgaa
gatgaaaatattgaagaaaaaagcaaagaaaaaaatgatgataaaaataatgaacaaaaa
atagaagaaaaattaaacgaagctttaaattccgaaaatataaataaaattgaagaaaaa
attcaagagacacaggaaatatctatcatagaaaaacagataattctttcagagtatgga
gcacaacaagttatatttagtatatcaaaagaattgttgcctcagttacatcgttccatt
atagcaagaacaagtcgtgaaaacagtcacaaaattaataaaaagaaaattacaatagac
aatgaagaagaagaattaatgcgagttcctattgctcttgcttttgtaaaattattacag
aaattaccagaatattttttagatactaatttatcaggaatttttatgaagttatgtaca
tttttgaaatctcgtttagaatccgtacggcgtgtcactcgtgaaatattacaaaaaatt
atgataactttaggtccaaaatatcttcatcatcttctaagagaaatgaataccttatta
acaaaaggttttcaagttcatgttcttgcatatacagtacaatctgtattagttgctttg
aaaccatattttcaaaaatttgatatcaataaaaatcttcaaagtattttatctgtatgt
aaaatagatttatttggtctaactgcagaagagaaagaagtaataggaatcgtgaaaaat
gttgtagaagcaaagtctacaaaaagttttgatatatttcatatattagcacaatatatt
actgaatcatgtttagtagatttaattttaccattaaaagaagtacttatgaaaactcat
tcacataaaactgtgcagaaaataatagaatgttttagaaatatagtattaggattagcg
gataatatctttataccattggaacaaatgttgatatttctttatggtgtaatttctgaa
agcattcctgaacttagacccgaaaaaaatgataaactattaacagaaaaagaaatagaa
acattcaatagacagaaacccgattgctttattattcctccagaaccaaaaaataaaatg
ggcataaaggctatttcaaaaacatcgaaaaatactaatgctcatgtcattatagaattt
ggtttaaaactttttcatattctattaaaaagagaaaaagtatcgaatgcagatttcaaa
cctttactagatccatttgtaccactcataagtgaatgtataagatcacaacatgttaag
ttaactactttaagtttacaatgtttaaactggttgctcaaaatggatttatctttaata
caagaatcaatttcaaatatttgtacatctatttttgatttattgcataaatatgcagca
gcaggcttaagtaaaggagataattttgatttagtaatggcaggttttaaatgtatgtct
gtaattgttcgtgatgtgaaacactatgtaattaaaacagatcaattgaaagctttgatc
atgtatgctgaacaagacatgcataatactgataaacaagccacagcgtttggtttactc
aaagcaataattgctcgaaaaatgattcttccggaaatgcatctagttatggaaaaggtg
gctattttaagcattacatctgaattagaacatgttagattacaatctcgttctgtcttt
tattcctatttaatggaatatcctcttggtaaacatttaaataaacatatagcattttat
ttgacgcaagttagctatgaaatgcaacctggtcgacttagtgctttagaaatgattcac
aatattgtcacaggatttccatttaaaactttaattttgaaatcaagtcttatatttata
atggtgggtgcaagattagtaaatgacgatgatccaacatgtcgcaaattgtgtgctaaa
tgtattaaagaactaatcgaacgtttatcttataatcgaagaagtaaattatttgatata
attataacatggttaaaagatataaagataatgcatcgaacattagctgcgcaattatgt
ggtatatttgtaactgtagaaaaagattcttttgattctcgtttaaaagaaatattacct
cttattttaaaacaatttcatgcaaattttaatgatgataatgatgataatgaaccgggt
cgttttgtgaaaattcattcggaagaaaaaactcaattaaaaatgcacaacatcaaagat
ccagaaagaatgaaagatcatcatatgtttcaagtattacagttggtattaaaaatatca
gcaaattgtacaacatttcttaaaaatgaagaatataaagaagctattcatttattcgct
gaatatagtcaatctttactggcacatcctcatatatggattcgtttagcagcttctcaa
atgattggtttcattttagctattctggatgttgataagattatagacattataaacaat
ccagaaaaatatgaaaacgaaatcggtttcatgtattccgatcctattaccgttataaaa
agtttaactttagatttaattgcacaattagagcctgatatgacattagaagaattagct
gaccagactgttaaaaacttaatttttattgcaagaattttgaaatctataaaaaaaatt
aatacaattgctattgatcaaaatgatgaaataaaatcagataaaaaccagttatctctt
ccttggcttgttagaaaattgagaaaagctgtaaataaagagataactcaaactcctaag
tcaataacagtgcgaattgctttttttaaatgggtggccggtgttgtcgttacaatacct
atggaatttttaaatgtagtactttttaacatcatgtcaccaattgtgcgagaaatatcg
gcagtagaagaaaaaaacactactttaagacgattagctaaagaagcggctatgatgatt
aaaaaacgtttagataatgaacaatatactaaattattaaatcgaatacaacagaattta
gatattaagaaagcagaaagaagaaaaattcgtacgcaacagtttgtaacggatccggaa
ttagctgctaaacgtaaaattgtaagacaacaaaagaaaaaggaagctaaaaaaagaaaa
ttggatatagtaagagggaaaaaaaatatcaaaaaaacatttgaaaaaaaaattgatatt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
