Apis mellifera (honey bee): 412454
Help
Entry
412454 CDS
T01057
Name
(RefSeq) tetratricopeptide repeat protein 37 isoform X1
KO
K12600
superkiller protein 3
Organism
ame
Apis mellifera (honey bee)
Pathway
ame03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ame00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
412454
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ame03019
]
412454
Messenger RNA biogenesis [BR:
ame03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ski complex
412454
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_2
TPR_14
TPR_19
TPR_17
TPR_16
TPR_8
TPR_12
TPR_11
CFAP70_TPR_C
TPR_CcmH_CycH
TPR_6
CFAP70_mid_TPR
ARM_TT21_C
ANAPC3
CABIN1_N
BTAD
DUF7017
CC_STIL
TPR_21
PknG_TPR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
412454
NCBI-ProteinID:
XP_026297790
BEEBASE:
GB47950
UniProt:
A0A7M7MLP6
LinkDB
All DBs
Position
LG7:complement(8736065..8744542)
Genome browser
AA seq
1298 aa
AA seq
DB search
MSDEIKITLKEARAAFKENKYLDVIKKCKKILKKDQCNYGALMLLAAAMKEIDEYKSQVP
LILQKGIQIQADNPLAWHGLITYYEKNLDDNDCYNKLILAYCKLLQIESDSKFTFILNKI
SELSLQLKDVATLNQCIEYLSELQKELDDNKIKMIDKVLGRILLDNINKLDKYQDLLKNV
FKSSITDLDAIEQQHFYKKYLKILYDKDELTILMKEAINMHQQFPQDIISLEYICLIYCE
QNILGENFSDIDMTQFYECLLKLNKESEIATVTKAIYLKKSNDLITAREILKDMLVLKPH
SIHGWMALSEISMKLYCWEDAEIAAKRILEIKEYKLKDELKYKMELILVEAMSRCNDKHK
WETALQIYEQHLKTHTSMQLDLIHARLSILLNQPNAYILLNNLESKHETKSQANILRALY
LKQNKQLDEAVNVLDSVLETSETWLFLGIIYWEMAEYNYSLMAFLNGIKADRYNWKCLVY
LGHYYREYGNDMERSRKCYQSALQINPNSEEAGIGLSTAYRLLKNQDANIKLLQVLTVQG
SGPRWAWLQLGLQYLDQGNAEQAIKAFQHVIRVDPNDSHCWESLADAYFIRGAYTSALKS
YQRVLELCPKSLYPMIQLANIKLIIGQYNEAKNDFEHILIYESRYIPALKGLAETCLALA
KEYTAKQFLGRANDCLQQAMNSLIVAIKERKDTSCIWKLLGDICYRVAILPEKYSYLKVS
SILIKYEDIENIILLKKQDMFSLSIRCYCCALSLSPQSALLWHDLALCYLMQLQYDPSIN
HKNLASKSLAAAKHAIKLNPSIWIHWNLLGVICMSPYIKNFALAQHAYIMAIDTEINNAI
VWCNLGTLYLYTENLYKANEAYSRAQRADPAYINSWIGQALIAEMMHRKEAMDLFRHATQ
LGYHSQAAIGYTHWVLDMILNSDTKKNSLNICVTENAVFAATDVMTWYIENHPNDCYARN
AYGLLLQRQKLYKSAAEQFAVAVCNSINNKKDLVCVNLAHVLIKLKKYNEAIKLCQTVQN
INYNSQCHLALALFKAAKYEEAYTTYETTLQFLANTEIEKSYALCAMGAIAYTFQKVNDA
KTLLFQCIQIQPPVITGLLAAASLGILHGDINLTTLVLNELQLYENHLEYGYHVVNLSAY
FYLIGNDVKKAITILSKAIFTHPSNVKNWIRLLRILLETNVHMFSKCAQKVLFLNKYITS
ENHANVACALSYSYFMQNLVPANIIAMQKLVFTYPGNIESWAMFIAVFLSRSAIKSHKVD
IKWLTMLITSIQKNYESTNLMAKWLNDSKKKLKEISIK
NT seq
3897 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagatgaaataaaaataactttaaaagaagctcgtgcagcatttaaagaaaataaa
tatttagatgtgattaaaaaatgtaaaaagatattaaaaaaagatcaatgtaattatggt
gcacttatgttattggcggctgcaatgaaagaaatagatgaatataaatcacaagtacca
ttaattcttcaaaaaggtatacaaattcaagcagataatccattagcttggcatggttta
ataacttattatgaaaaaaatttggatgataatgattgttataacaaattaatattggct
tattgcaaacttttacagattgaaagtgattctaagtttacatttattttgaataaaatc
tcagaactttcattacaactcaaagatgttgcaactctaaatcaatgcattgaatattta
agtgaattacaaaaagaattggatgataataaaattaaaatgattgataaagtacttgga
agaattttattagataatattaataagttagataaatatcaagatttattaaaaaatgtt
tttaaatcttcaattactgatcttgatgcaattgaacaacaacatttttataaaaaatat
ttgaaaatattatatgacaaagatgaattaactattttaatgaaagaagctataaatatg
catcaacaatttccacaagatataatatcattagaatatatatgtcttatttattgtgaa
caaaatatattaggtgaaaatttttctgatattgatatgacacaattttatgaatgtctt
ctgaaattaaataaagagtctgaaattgctacagttactaaagcaatatatttaaaaaaa
tcaaatgacttgattacagcacgagaaatattaaaagatatgcttgtattaaaaccgcat
tcaatacatggttggatggcactaagtgaaataagtatgaaactttattgttgggaagat
gcagaaatagctgctaaacgaatattagaaatcaaggaatataaattaaaagatgaatta
aaatataaaatggaactaatattagttgaagcaatgagtaggtgtaatgataaacataaa
tgggaaactgctttgcaaatatatgaacaacatttaaaaacacatacttcaatgcagttg
gatcttattcatgcacgtctcagtatattattaaatcagccaaatgcatatattttgttg
aataatttggaatcaaaacatgaaactaaatcacaagctaatattcttcgagcgttatat
ttaaaacaaaacaaacaattagatgaagctgtgaatgttcttgattcagtcttagaaact
tctgaaacatggttatttttgggtataatctattgggaaatggcagaatataattacagc
ttgatggcttttttaaatggaataaaagctgatcgttataattggaaatgtctagtttat
ttaggtcattattatcgcgaatatggtaatgatatggaacgttctagaaaatgttaccaa
agtgcattacaaattaatccaaattctgaagaagctggtattggtctaagtacagcatat
agacttcttaaaaatcaagatgcaaatatcaaattgctacaagtattaactgtacaaggt
agtggtcctagatgggcatggttacaattaggcttgcaatatctagatcaaggaaatgca
gaacaagctattaaagcatttcaacatgttattagagttgatcctaatgacagtcattgt
tgggaatcactagcggacgcgtattttatacgaggtgcttatacatcggcattaaaatct
tatcaaagagtgttagaattgtgtccaaaatcattatatccaatgatacaattagcaaat
ataaaattgattattggtcaatataatgaagcaaagaatgattttgaacatatattaata
tatgaatcacgttatattcctgctttaaaaggattagctgaaacttgtttagcactagca
aaagaatatactgcaaaacaatttctgggtcgcgccaatgattgtttacaacaagcaatg
aatagtttgattgtagctattaaagaacgtaaggatacatcctgtatttggaagttactt
ggtgatatatgttatagagtagcaatattacccgagaaatacagttatttaaaagtatca
tccattttaataaaatatgaagatatagaaaatataatattgcttaaaaaacaagatatg
ttctccttatctataagatgttattgttgtgcactatctctttctccacaatcagcttta
ctatggcatgatttagctttgtgctacttaatgcaactacaatatgatccatcaattaat
cataaaaatcttgctagtaaaagtcttgctgctgcaaaacatgctattaaattaaatcct
tcaatatggatacattggaatctcttaggagttatttgtatgtcaccatatataaaaaac
tttgcattagcacaacatgcttatatcatggcaattgatacagaaataaataatgccata
gtatggtgtaatttgggaacattgtatctatatacagaaaatttatataaagcaaatgaa
gcttattctcgagctcagcgtgcagatccagcatacataaatagttggataggacaggct
ttaattgccgaaatgatgcatcgaaaagaagcaatggatttatttagacatgcaacacaa
ttaggatatcacagtcaagctgccataggatatactcattgggtacttgatatgatttta
aattctgataccaaaaagaacagtttaaatatatgtgttacagaaaatgctgtatttgct
gctactgatgttatgacatggtatatagaaaatcatccaaatgattgttatgctcgaaat
gcatatggattactattacaaagacaaaaactttataaatcagctgcagaacaatttgca
gtagctgtatgtaatagtattaataataaaaaagatctagtctgtgtaaatttagcacat
gtattaataaaacttaaaaaatataatgaagctataaaattatgtcaaacagttcaaaat
atcaattataattctcaatgtcatttagcattggctttattcaaagctgcaaaatatgaa
gaagcatataccacatatgaaacaacactgcaatttttggcgaatacagaaatagagaaa
tcatatgcactgtgcgcaatgggtgcaatagcatatacttttcaaaaagtaaatgatgca
aaaactttactttttcaatgcatacaaatacaaccgcctgttataactggccttttagca
gctgcatcattaggaatattacatggtgatatcaatttaactacattggtattaaatgaa
ttgcaattatatgaaaatcatcttgaatatggttatcatgttgtgaatttatctgcatat
ttttatttaattggaaatgatgttaaaaaagctattactattctttctaaagcaattttt
acacatcctagtaatgtaaaaaattggattcgattactcaggatattattggaaactaat
gtacatatgtttagcaaatgtgctcagaaagtattgttccttaataaatatattacttct
gaaaatcatgcaaatgttgcatgtgctctatcttatagttattttatgcaaaatttagta
ccagccaatattatagctatgcaaaaacttgttttcacttatcctggtaatattgaaagc
tgggctatgtttattgcagtatttttatcaaggtctgcaattaaaagccataaagttgat
atcaaatggctcacgatgctcataactagcatacaaaaaaattatgaatctacaaacttg
atggctaagtggttaaatgacagcaaaaaaaaattaaaagaaatctctattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system