Alligator mississippiensis (American alligator): 102570345
Help
Entry
102570345 CDS
T03087
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin 2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
amj
Alligator mississippiensis (American alligator)
Pathway
amj04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amj00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
102570345 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
amj00536
]
102570345 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
amj00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
102570345 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102570345
NCBI-ProteinID:
XP_019333611
UniProt:
A0A151M7W6
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
2787 aa
AA seq
DB search
MCTCSSGQISPICGSKSIQQCNIRCMNGGTCADDQCQCQKGYVGTYCGQPVCENGCQNGG
RCIGPNRCACVYGFTGPQCERGKKNYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGR
AWGHPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINTVGSYECKCPA
GHKQNEATQKCDDIDECSIIPGICEGGECSNTVGSYFCICPRGYVSSTDGSRCIDQRAGT
CFSSLVNGRCAQELPGRFTKMQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEYSRLCIDGIPVGG
GSRAGGIGGNGFLPGGNGNGYGAGGTGFIPIPGGNGFSPGIGGAGVGTGGQSPTGNGPII
TGLTILNQTIDVCKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCT
NGDCVNTPGSYYCKCHAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAG
FELTTDGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCTDIDECQTS
GICMNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVCVRPFPGAVTK
SECCCANPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGVGITVDGRDINECALDPDICSNGICE
NLRGSYRCNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFST
ETDTCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFNCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDG
RCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACPRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGV
CPNGRCVNSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRMDAC
CCAVGAAWGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPGMCM
NGKCRNTIGSFKCRCNNGFALDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFEG
YESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSSSRDECVDINECS
LSDNLCRNGKCVNMIGTYQCSCNSGYQATPDRQGCIDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYE
CSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCID
VNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDAHASCV
NVPGSFKCSCREGWVGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGF
TCSDVDECAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSKSCQDIDECSFQNICVFGT
CNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLN
PTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVN
STEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSE
ETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYN
GTTCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKTICGNIPGFTFDIHTGK
AVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNA
DCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCICHNGFKA
SQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVC
RNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTPDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPP
GYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNNPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCF
TNFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGI
DDTREDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCVDTDECSIGNPCGN
GTCTNVIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPIGYEL
REDQKMCKDLDECAEELHDCRSRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCMDENECRTK
PGICENGRCVNTIGSYRCDCNEGFQSSPSGTECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLV
TKSECCCNGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRNGQC
INTMGSFRCICKVGYTTDISGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYVLQE
DGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQTSLCGSK
GICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQ
HYQWNQCVDENECSNPNACGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKNP
CNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCISGMGFNKGQYLPLDGDVDEENALSPEACYEC
KLNGYSKKNSRRKRSVNDTQPAEIEQISLESLDIDTPLKMRFNNSGLGNKHHILELMPAI
EPLTNHVRYVISQGNDDGIFRIHQRDGLSFLHMTKKRSVPGTYTLEIVSVALYKKKELKK
LEDKNEDNYLLGELGEALKMRLWIELY
NT seq
8364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcacttgttccagtggacaaatatcacctatctgtggatcaaagtcaatacaacag
tgcaatatcaggtgcatgaatggtggtacttgtgcagatgatcagtgccagtgccagaag
ggctatgttggaacgtactgtgggcaacctgtctgtgaaaatggttgccagaatggagga
cgatgtattggacccaaccgttgtgcatgtgtgtatggatttactggccctcagtgcgaa
agaggtaagaaaaattatagaaccggtccttgtttcactcaggtcaacaaccagatgtgc
cagggccagttgacaggcattgtttgcacaaagactctctgttgtgcaacaattggtcgt
gcttggggccacccttgtgagatgtgtcctgctcagcctcagccatgtcgtcgtggtttc
atccctaacatccgcactggagcttgtcaagatgttgatgagtgtcaagctataccagga
gtctgccagggaggaaactgcattaatacagttgggtcatatgaatgcaaatgtcctgct
ggccacaagcagaatgaggcaactcagaaatgtgatgatattgatgaatgcagcatcatt
ccaggaatttgcgaaggtggcgagtgttctaacactgttggaagttatttctgtatctgt
ccacgtggctatgtctcatctacagatggctcccgctgcattgatcagagagcaggcaca
tgtttctccagcttggtgaatggtcgctgtgcacaagagcttcctggtaggtttaccaaa
atgcagtgctgctgtgaatctggtcgatgctgggccattggatctgttccagagatgtgt
cctgttagaggatctgatgaatacagcagactttgcatagatggaattccagttggaggt
ggttccagagctggtggaataggaggaaatggattccttcctggtggaaatgggaatggc
tatggtgcaggaggaactggattcattcctattcctggtggcaatggcttctcacctggc
ataggaggagcaggagtagggactggtggccagagtcccacagggaatggcccaatcatt
actggactaacaatactcaatcagacaatagatgtctgtaagcatcaccccaacctttgc
ttaaatgggcgatgcataccaaccatttctagttatcggtgtgaatgcaacatgggatat
aagcaggatgcaaatggagattgtatagatgttgatgagtgcacatcaaacccatgtact
aatggtgattgtgtcaacacacctggatcctattattgcaaatgtcatgcaggtttccaa
agaactcctaccaagcaagcttgcattgatattgatgaatgcatccaaaatggtgttctt
tgtaaaaatggccggtgtgtcaatactgatggcagcttccagtgtatttgcaatgctggc
tttgaactaactacagatggaaaaaactgtgtcgaccatgatgaatgcactactacaaac
atgtgtttaaatgggatgtgtataaatgaggatggtagcttcaaatgcatctgcaaacca
gggtttgttttagctccaaatgggcgttattgtactgatattgatgaatgccagacatca
gggatttgcatgaatggtcattgtatcaatactgaaggatcatttcgatgtgaatgtcca
cctggcctggctgttggagttgatggtcgtgtttgtgtagacactcatatgcgtagcaca
tgctatggaggaattaaaaagggggtatgtgtccgtcctttccctggggctgtgacaaaa
tctgaatgttgctgtgccaatccagactatggctttggagaaccttgtcacccgtgtcct
gccaagaactcagctgaattccatggtctgtgtagcagtggagtaggcattactgtggat
gggcgagatattaatgaatgtgcattggaccctgatatttgctccaatggaatttgtgaa
aacctacgtggtagctaccgttgtaattgtaacagtggctatgaacctgatccttctgga
aggaactgtgttgacattgatgaatgttcagtgaacagactgttgtgtgacaatgggctg
tgtcgaaacacacctggaagctacagctgcacttgtccaaagggttatgtattcagcact
gagactgacacatgtgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccgtgtgtcaatggcgcc
tgcagaaacaatcttggttctttcaactgtgagtgttcacctggcagcaagctggattct
actggactgatctgcattgatagtcttaagggaacatgctggctgaacatccaagacggt
cgttgtgaagtgaacatcaatggtgctacgctgaaatctgaatgctgtgcaacgttagga
gctgcgtggggtagcccttgtgaacgatgtgaattagacactgcttgcccaagaggattt
gccagagttaagggtgttacctgtgaagatgtaaatgaatgcgatgttttcccgggggtt
tgtcctaatggacggtgtgttaacagcagagggtcatttcactgtgagtgtcctgaaggc
ctgacactggatggaacaggtcgagtgtgtttagatatccgcatggaacaatgttacttg
aagtgggatgaagatgagtgtattcagtctgtacctggcaaatttcgtatggatgcctgc
tgctgtgctgttggtgctgcttggggctcagactgtgaggaatgccctaagcctggcacc
aaagaatatgaggccttgtgccccagaggacctggattttctaatagaggtgacattcta
actggcaggccattttataaagatattaatgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatg
aatggtaaatgcaggaatacaattggaagtttcaaatgcagatgtaacaatggttttgct
ttagatatggaagaaagaaactgtacagacattgatgaatgccgtatctccccggatctc
tgtggaagtggtacttgtgtcaacactccaggaagctttgagtgcgagtgctttgaaggc
tatgaaagtgggtttatgatgatgaagaactgcatggacatagatgaatgtgaacgtaac
cctctcttgtgccgtggtggaacttgtgtgaacacagaaggtagctttcagtgcgactgc
cctttgggacatgaactgtcgtcatcacgtgacgaatgtgtggatataaatgaatgctcg
ttgagtgataatctgtgcagaaatggcaaatgtgtgaacatgattggaacttatcagtgt
tcttgtaactccggatatcaggctactccagacagacaaggctgtattgatattgatgaa
tgcatgatcatgaatggaggctgtgatacccactgtactaactcagaaggcagctatgaa
tgtagttgcagtgatggttatgctctcatgccagatgtcagaacatgtgcagatattgat
gaatgtgaaaataacccagatatctgtgatggtgggcaatgtactaatattccaggagag
tatcgctgtctttgttatgatggattcatggcttctatggacatgaaaacctgtattgat
gtaaacgaatgtgacttgaattccaacatctgtatgtttggagagtgtgaaaacaccaag
ggctccttcatttgtcactgtcaacttggatactcagtcaagaaaggaacgactgggtgt
acagatgtggacgagtgtgagattggggcccacaactgtgatgcacatgcctcatgcgtc
aatgtcccaggaagcttcaaatgcagctgcagagagggttgggttggaaatggcattaaa
tgtattgatcttgatgaatgttcgaatggaacccaccagtgtagtgtgaatgctcagtgt
gtgaacacacctggatcatatcgctgtgcctgtgctgaagggttcacaggagatggattc
acttgttctgatgttgatgagtgtgcagaaaatgttaatctgtgtgagaatggacagtgc
ctcaatgtccctggtgcctaccgttgtgagtgtgagatgggattcactccagcttcagac
agcaaatcatgccaagatattgacgaatgctcttttcaaaatatatgtgtatttggcacc
tgtaataacttaccaggaatgtttcattgcatctgtgatgatggctatgaactggataga
actggaggaaactgtacagatattgatgagtgtgctgatcccattaactgtgttaatgga
ctctgtgtgaatactcctgggagatacgaatgtaactgtccaccagatttccagctgaac
ccaactggagtgggttgtgtggacaatcgtgtaggcaattgttacctgaaatatggaccc
cgaggggatggaagcctatcctgcaacactgaaattggagttggagtcagtcgttcttca
tgctgctgctctttgggaaaggcctgggggaacccctgtgagacttgtccccctgtaaac
agcaccgaatacaatactctgtgtccagggggtgaaggatttagaccaaatcccatcact
attattttagaagacattgatgaatgtcaggagttgcctggtctttgccaaggtggaaac
tgtatcaatacttttggcagtttccagtgtgaatgtccacaaggctactacctcagtgaa
gagacacgcatctgtgaagatattgatgaatgtgttgcacatcccggtgtctgtggtcct
ggcacctgctacaacaccttggggaactacacctgcatttgtcctcctgagtatatgcag
gtcaatggaggacataactgcatggacatgcggaagagtttttgctatagaagttataat
ggaaccacctgtgagaatgaactgcccttcaatgtgaccaagaggatgtgctgctgcaca
tacaatgttggcaaagcctggaacaaaccttgtgagccatgtccaacaccaggaacagct
gaatttaagaccatatgtgggaacattcctggcttcacctttgacatccacactggcaaa
gctgttgatattgatgaatgtaaggagattccagggatttgtgcaaatggtgtctgtatt
aatcagattggtagtttccgctgtgaatgtcccacaggattcagctacaatgacctgctc
ctggtttgcgaagatattgatgagtgcagcaatggagacaacctgtgtcaaagaaatgca
gactgtatcaatagtcctggcagttaccgatgtgaatgtgctgcgggtttcaaactttca
cccaatggagcctgcgttgatcgcaatgaatgcctggaaattcctaatgtttgcagtcat
ggcttgtgtgtggacatgcaaggaagttaccagtgcatctgtcacaatggttttaaagca
tcccaggaccagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgagcgccatccatgtggaaat
ggaacttgtaaaaacacggttggatcatacaactgtctgtgttacccaggatttgagctc
actcataataatgattgtatggatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgc
agaaatggacgatgttttaatgaaattggttctttcaaatgtttatgtaatgaaggctat
gaacttactccagatggcaagaattgcattgatacaaatgagtgtgtggcacttcctggc
tcatgctctcctggtacgtgccagaacttggaaggttcattcagatgcatttgtccacca
ggatatgaagtgaaaagtgaaagctgtatagatattaatgaatgcaatgaggaccccaac
atctgtctctttggctcctgtaccaataatccaggaggattccagtgcatttgtcccaca
ggctttgtgctgtctgacaatggaaggaggtgctttgatacccgccagagcttctgtttt
actaactttgagaatgggaaatgttctgttccaaaagcatttaacaccaccaaggcaaag
tgttgctgcagtaagatgccaggagaaggatggggtgacccctgtgagctctgccccaaa
gaagaggaagttgctttccaggatttgtgcccttatggtcatggaactattcctggaatt
gatgatacacgtgaagatgtcaatgaatgtcttgagagcccaggcatttgttcaaatggc
cactgtatcaacactgatggctcattccgctgtgagtgccccatgggatacaacttagat
tatactggagtgcactgcgtcgatactgatgaatgttcaattgggaatccatgtggaaat
ggcacatgcactaatgtgattggtagttttgaatgcaactgtcatgaagggtttgagcca
ggcccaatgatgaattgtgaagatataaatgagtgtgcacagaaccctttgctctgtgct
tttcggtgcatcaacacatatggtttctatgaatgcacatgccccattggctatgaactg
cgagaagaccaaaagatgtgcaaagatctggatgaatgtgccgaagagctccacgattgc
agatcaagaggcatgatgtgcaaaaacctgattggtaccttcatgtgtatctgccctcct
ggaatgacacgtagacctgatggagaaggctgcatggatgaaaatgaatgccgaaccaag
ccaggtatctgtgaaaatggtcgctgtgtgaacaccattggaagctatcggtgtgactgc
aatgagggatttcaatcaagcccatccggcactgagtgccttgataaccgccaaggattc
tgctttgcagaagtgttacagaccatgtgtcagatggcttctagcagccgtaatcttgtc
accaagtcggagtgctgctgtaatggaggcagaggttggggtaaccagtgtgagctgtgc
ccacttccagggaccactcagtataagaaactctgtccacatggaccaggctacactaca
gatggaagagatattgatgaatgtaaggtcatgccaaatctatgtagaaatggccagtgc
atcaacaccatgggttccttcagatgcatttgcaaagttggctacaccactgacataagt
gggacatcctgtgtggatcttgatgaatgttctcagtctccaaaaccatgcaactttatc
tgcaagaacacagaaggaagctatcagtgctcatgtcctcgtggctatgtcctccaagaa
gatggaaagacgtgcaaagatcttgatgaatgtcaaaccaagcaacacaattgccagttc
ctctgtgttaacacacttgggggattcacgtgcaaatgtcctccaggtttcactcagcat
cacacagcttgtattgataacaatgaatgtggttcacagacatcactttgtggatcaaaa
ggaatctgtcagaatactcctggaagtttcacttgcgagtgtcagagaggattctctctg
gattctactggactcaactgtgaagatgtggatgaatgtgatggaaatcaccggtgtcag
catggctgccagaacatcctgggtggctacaggtgtggatgcccacaagggtatattcag
cattaccaatggaatcagtgtgttgatgaaaatgagtgttccaaccctaatgcttgcggc
tctgcatcttgctacaacacactcgggagctacaagtgtgcatgtccatctggattttcc
tatgaccagttctccagtgcatgccatgatgtgaatgagtgttcctctactaagaacccc
tgcaattatggttgttccaatacagaaggtggctatctctgtggctgtccacctggatat
tacagagttggacaaggccattgcatctcagggatgggatttaacaaaggccagtacctg
cctttggatggagatgtagatgaagaaaatgccttgtctccagaagcatgttatgagtgc
aaactgaatggctattcaaagaaaaatagcaggaggaaaagaagtgtgaatgacactcag
cctgctgagattgaacagattagcttggaaagtttagacattgacactcctttgaagatg
aggttcaacaactctgggcttggcaacaaacaccacatcctggaactcatgccagccata
gaaccccttaccaatcacgtccgctatgtcatctcccaaggcaatgatgatggcatcttc
cgaatccatcagcgggatggactcagtttcctgcatatgaccaagaaaagatctgtacct
ggcacttacacactggaaatcgttagtgttgctctatacaagaagaaggagctcaagaaa
ctggaagacaagaatgaggacaactacctcctaggagaacttggtgaagctctcaaaatg
aggctgtggattgaactctattag
DBGET
integrated database retrieval system
