Acaryochloris marina: AM1_5667
Help
Entry
AM1_5667 CDS
T00617
Name
(GenBank) nitrogen regulatory protein, putative
Organism
amr
Acaryochloris marina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
cNMP_binding
Sigma54_activ_2
Fer4_5
Fer4
Fer4_10
Fer4_7
Fer4_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW30614
UniProt:
B0CG61
LinkDB
All DBs
Position
5730109..5732637
Genome browser
AA seq
842 aa
AA seq
DB search
MASSEDKKAWLQEHTDLNIFPEKILDRLARKVKVQTLEANRRLILEDTLPDAVYILRQGH
LESYHTSLVDTAQVCSLLPGAVLHLFDILLEQPTLQTIITLTDCEFWVISKKDLLKIAGE
YQDVTRIVSQKLSKDLAHVSRELEAEQERQAILRPYLVPRVNRGIVGSSRYAKRLREQLK
EAACTRHSVIIFGEPGLEKDNAAALIHFGSNQRREPMVKINCNTLQISGADLFGRVGGKP
GLLEAVGEGTVLLNNIQDLPPVLCPKLRQLLETQTYLPVQRDGTAAKPRTSNARLIFTAE
KIQPELDGEIFHRIKMPPLRVSKADVEAQVEYYISLLSKEQGFAKRQLTPEALRRLQSYN
YPGNIVELHSLVERAIAQSSPNEDLTAEIFWAAQDRQQRFRLNLLNANPWLRRFLRSPWW
PTRINYGIVLPLFIFVVIILFVGPQQRSQNFALNLFWAWWWPLILIGFPFVGRLWCSVCP
FMICGELLQKLSLWLVPRQLQRWPRQQAEQWGGWFLFGLFALIFLWEELWNLEDTAYLSS
CLLLLITAGAVICSQIFERRFWCRYLCPIGGMNGLFAKLSMTELRAQQGTCSAECSTYQC
YKGGPEKGEGQETDGCPLYSHPAQLEDNRDCVLCMTCLQACPHRSVEFNLRPPGIELWTT
HTPRIYEVALLLLLLGGIFLHRLPELQAWLGLDFHLQQFSAHLLVSVLVLGIAALIPLLT
HTILCRISTKLKPRPFIELVYGYLPLVLGGTLAHYLRLGLTEAGQILPVTWVTFGFSGVG
LPIWVAHPAVVSFLQGSTILTAIFLTWVLTQKIARQPITVLLPQHMTSLGLGFCLWSVIV
GV
NT seq
2529 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcatcctcagaggacaaaaaggcttggttacaggagcatactgatttaaatatcttt
cccgaaaagatcttggatcggctggcgagaaaggtaaaagtacagaccttggaagccaat
cggcggttgattctagaggatacgttgccggatgctgtatatattttgcgtcaaggccat
cttgaaagttatcacaccagtttggtggatacggcccaggtctgtagcttgttacccggg
gcagtgctgcatctattcgatatcttgctcgaacagccgacgcttcaaaccatcattact
ttaacggattgcgaattttgggtcatttctaaaaaagacctgctcaagatcgccggtgaa
tatcaagacgtgacccgcatcgtgtcgcaaaagctatcaaaagatttggctcatgtttca
cgagaactggaggctgaacaggagcgacaagccatcctcagaccctatttggtccctaga
gtaaatcggggaatcgtcggttctagccgctatgccaagcggttgcgagaacaactcaaa
gaggcagcctgcacccgccattcagtgattatctttggtgaacccggtctagagaaagat
aatgctgctgctttgattcacttcggctcgaaccagcggcgcgagccgatggtgaaaatt
aactgcaatacgcttcaaattagcggggccgatttgtttggtcgagtggggggtaagcct
gggctgctagaagcggtgggtgaggggactgttcttctcaataatattcaagatctgccg
cccgtactatgtccaaagctacgacagctgctagaaacccaaacttatttaccggttcaa
agagacgggactgctgctaagccccgaaccagcaacgctcgtttaatctttacggctgag
aaaattcagccggaactggatggggagattttccatcggattaagatgccgccgttgcgg
gtcagtaaggcggatgtggaggctcaggttgagtactatatcagtctgctttctaaagaa
cagggatttgctaagcgccagttgacccctgaagccttacgacgactgcaaagctacaat
tatccgggcaatattgtcgagcttcatagcttggtggagcgtgcgatcgcacaatcgtct
cccaacgaagatctcaccgcagaaatcttttgggcagcccaagatcgccaacagcgcttc
cgtcttaacctgctgaatgccaacccttggttgcgccgttttctccgcagtccctggtgg
cccacccgcattaactatggaatagtcctacccctgtttatttttgtggtgattattcta
tttgtgggtcctcagcagcggagtcagaactttgccttgaacttgttttgggcttggtgg
tggccgttgatattaattggctttccctttgtgggccgtctctggtgctccgtctgtccc
tttatgatttgtggtgaactgctgcaaaaactgtctttatggctggtgcctagacaactg
cagcgctggccccggcagcaggcggagcagtggggaggctggttcttgtttggtctgttt
gctctgatttttctctgggaggagctgtggaatctagaggatacggcttatctgtctagt
tgtctgctgttgttgattacggcgggggcagtgatttgttcgcagatttttgagcgacga
ttttggtgtcgatatctttgtcccatcgggggaatgaacgggttatttgccaagctgtcc
atgacagagctaagggcgcaacagggcacctgttctgctgagtgcagtacctaccaatgt
tataaaggtggacctgaaaaaggggaaggacaagaaacagatggttgccctctctactcc
caccctgcccagttggaagataaccgagactgtgtgctctgtatgacctgcttgcaggcc
tgccctcaccgctctgttgagttcaatttgcgtccgcccggcattgaattatggacgacc
catacccctcggatctatgaggttgcactgctcctactgttgctaggagggatattcctg
catcgattacccgagctgcaagcctggttggggttagattttcacttacagcagttttca
gctcatttactggtgtcggtgttggtgttgggaatcgctgccttgattcccttgcttacc
catacgatcctatgtcgcatcagtactaaattaaaacctcgaccctttatcgaattggtc
tatggctatttgcctttagttctgggtggtaccttagcccactatttaaggttaggactc
acagaagcaggccaaattcttccggtcacctgggtaacgtttggtttctctggcgtaggt
ttacccatctgggtggcccatcctgcggtagttagtttccttcagggttctacgatattg
acggcaatttttttgacatgggtgttgactcaaaaaattgcccgacaacccattactgtt
ctgctgccccagcatatgaccagcctgggactaggattctgtttatggtcagtgattgtt
ggggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system