Alkaliphilus metalliredigens: Amet_3437
Help
Entry
Amet_3437 CDS
T00551
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat
Organism
amt
Alkaliphilus metalliredigens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR49565
UniProt:
A6TTP7
LinkDB
All DBs
Position
complement(3507533..3510124)
Genome browser
AA seq
863 aa
AA seq
DB search
MSINDLIINGGFETGTFSPWVPFNATITSQFSHSGFFAARLAGGAVNSFVYQIVPINEGE
SFQLLVSLSKVGTAPSPPVSLSIPYYDVNFNFIGYGLITNIPANGITSVDEQDWLVVYDV
TAPVPAGATQALVLVNKLTHAGSADIIVDDVSLLEVENGTGTTGPTGPTGPTGATGPTGE
DGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPMGATGPTGDDGEDGATGATGPTGATGPTGE
DGEDGVTGVTGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGEDGE
DGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGA
TGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGE
DGATGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGA
TGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGP
TGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGADGATGATGPTGATGPTGADGATGATGP
TGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGDDGEDGATGATGP
TGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGA
TGPTGPTGPDNGVDLFFSNETESITVFPPIDTEVTVVSTLVDVEIGEILKIDYVLSVDSL
TTANSNQVLEARLYRDNNLLSTRIIQRNIQAAGVQRLLVADTFAYVVTIEGLANYNVRII
YTTATNVTSADAIHRNLNIIEFH
NT seq
2592 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaatcaacgatttaataattaatggtggttttgaaacaggaactttttcaccatgg
gttccatttaatgcaaccataacttctcaatttagtcattctggcttttttgctgcaaga
ttggcaggtggagcagtcaactcatttgtttatcaaatcgttcctataaatgaaggtgaa
agctttcagttgcttgtgtctttatcgaaggttggaacagcgcctagtccgccagtatca
ttatctataccctattatgatgtaaactttaactttattggctatgggctgattaccaat
ataccagctaacggaattactagtgttgatgagcaagattggcttgtcgtatatgacgtt
actgctcctgtgccagcaggtgcaacacaagcccttgtactagtaaataaattaacacat
gcaggcagtgcagatataattgtagatgatgtatctttattggaagtagaaaacggtaca
ggtacaacgggtccaacaggcccgaccggaccgacgggagctacggggccaactggagaa
gatggggaagacggagccacaggggctactggtccaacgggagctacggggccaactggc
gaagatggagcaactggtgccacaggtccaatgggagccacagggccaacaggagatgat
ggagaagatggagccacaggggccacaggtccaacgggagccacgggaccaactggcgaa
gatggggaagatggagtcacaggtgttactggtccgacgggagccacagggccaactgga
gaagatggagcaactggtgccacaggtccaacgggagccacagggccaacaggagatgat
ggagccacaggggccacaggtccaacgggagccacgggaccaactggcgaagatggggaa
gatggagccacaggtgccactggtccaacgggagccacagggccaactggagaagatgga
gcaactggtgccactggtccaacgggagccacaggaccaactggagaagatggggaagat
ggagccacaggtccaacgggagctacgggaccaactggagaagatggggaagacggagcc
acaggagccacaggggccacaggtccaacgggagccacgggaccaactggcgaagatgga
gaagacggagccacaggggctactggtccaacgggagctacggggccaactggggaagat
ggagaagatggagccacaggggccactggtccgactggagccacagggccaactggagaa
gatggagcaactggtgccactggtccaacgggagaagatggggaagatggagccacaggt
ccaacgggagctacgggaccaacgggagaagatggggaagatggagccacaggtccaacg
ggagctacgggaccaactggagaagatggggaagatggagccacaggtccaacgggagct
acggggccaactggagaagatggggaagacggagccacaggagccacaggggccacaggt
ccaacgggagccacgggaccaactggcgaagatggagaagacggagccacaggggctact
ggtccaacgggagccacggggccaacaggagaagatggagccacaggggccactggtccg
actggagctacgggaccaaccggagaagatggagaagatggagcaacaggggccactggt
ccgacgggagctacgggaccaaccggagaagatggagcagatggagccacaggggctact
ggtccaacgggagccacggggccaacaggagcagatggagccacaggggctactggtcca
acgggagccacggggccaacaggagaagatggagccacaggggccactggtccgacggga
gctacgggaccaaccggagaagatggagaagatggggccacaggtgccacaggtccaacg
ggagccacagggccaacaggagatgatggagaagatggagccacaggggccacaggtcca
acgggagctacgggaccaacaggagaagatggagaagatggggccacaggggccactggt
ccaacgggagccacgggaccaacaggagaagatggagaagatggagcaacaggggctact
ggtccaacgggagctacgggaccaactggagaagatggagaagatggagcaactggtgcc
actggacctactggaccaacaggaccagataatggagttgatttatttttctctaatgaa
acagaatcaataactgtgtttcctccaatagacacagaagtaactgtagttagcactttg
gttgacgtggaaatcggagagattcttaaaattgattatgtcctgtcggtagattcatta
accacagcaaactccaaccaagtattggaagcacgactttaccgtgataataacttacta
agcacaaggattatacagagaaatattcaggcagcaggagtacaacgtctccttgtagca
gatacttttgcctatgttgtaaccattgaaggtttagcaaactataatgtaagaataatt
tataccactgctactaatgttacctctgctgatgcaatccaccgcaatttaaatatcata
gaatttcattag
DBGET
integrated database retrieval system
