Malaciobacter mytili: AMYT_0334
Help
Entry
AMYT_0334 CDS
T05895
Symbol
addB
Name
(GenBank) AddAB recombination complex, helicase AddB
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
amyt
Malaciobacter mytili
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amyt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
amyt03400
]
AMYT_0334 (addB)
Enzymes [BR:
amyt01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
AMYT_0334 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
amyt03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
AMYT_0334 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDDEXK_1
Dna2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXH13942
UniProt:
A0AAX2AFT3
LinkDB
All DBs
Position
312436..314784
Genome browser
AA seq
782 aa
AA seq
DB search
MQIKQKLIVFPTSRAIREHLLLNKSSNSLLPFFLTIDDFFKKSFFFNNKKLIDEEHKFLL
LKESIKFDDFKKLGISSNFTQFLKQSDYIFRFFTEISSEKVDINEIKNVDTYEFYKEHLE
ILNKIKINYIELLEKNNFIDRVNEANHYKLNKDFLNKFEEIELNFEGYFTKVEFDKILQI
SENTKLIINLFTNEYNKKSIEAFKSIGFELEENKAYKLDISNKKILEETQVKSILQNFEI
KGFASRINQIAYIKATIVSCIQSGVEPSKIVLIVPDEGFINKLKLFDNEGYFNFAMGLDI
TNSKSYKLLYTLFNLFSDEEFKIDFSIEFFKINKDFLEFIKQNWNKQLTLNIFEFLEKEV
LQYEDNEEIIVKLNELFYKFKVLFFTNNSYILVKEALKILLQKLQKTTIDDVNSGKITVM
GLLESRAVNFEVVIICDFNEEFIPKISLKDKFLSTKVKEYANLPTIKDRENLQKYYYKRL
INNCKSLYVCYTNNELSFISRFASELFNRKIDNRVFDNEYKHIIYNKTNFSHFDKQIIET
IDLSKMTWSATSLKAYLQCKRKFYLQYILKLKEHEISLKPKGYELGDIIHKILYEYFEKS
LDSFERLEELFVKYTQKNPFLTLELEVWKKKIYKVFENEKQRFENIQILHKELPFNMTYQ
GINIKGAIDRIDKQNDKYLVIDYKTSSSLKVDSLKNYEKSCDFQLEFYYLAVQELYKTLN
IESFYYDLNSAKLLKEEALDAKLELLNTIFNSFKQTKEINFEKCEDKALCGFCSYKIICN
RE
NT seq
2349 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaattaaacaaaaacttatagtatttcctacatcaagggcaataagggagcatcta
cttttaaataaaagtagtaattctttattgcctttttttttaacaattgatgattttttt
aaaaaatctttcttttttaataataaaaaacttatagatgaagaacataaatttctacta
ttaaaagaatcaattaaatttgatgattttaaaaaattgggaatttcatcaaattttaca
caatttttaaaacaaagtgattatatatttagattttttactgaaatatctagtgaaaaa
gtagatataaatgagataaaaaatgtggatacatatgagttttataaagagcatcttgaa
atattaaataaaattaaaataaattatattgaattattagaaaaaaataattttattgat
agggtaaatgaagcaaatcattataaattaaataaagattttttaaataaatttgaagaa
attgagcttaattttgaaggatactttactaaagttgagtttgataaaatcttacaaata
tcagaaaatacaaagcttattattaatctttttacaaatgaatataataaaaaatcaata
gaagcttttaaaagtataggatttgaattagaagaaaataaagcttataaactagatatt
agtaataaaaagattttagaagaaactcaagttaaatcaattttacaaaattttgaaata
aaaggttttgcttctagaattaatcaaattgcttatataaaagctactattgtttcttgc
atacaaagtggtgttgagccttcaaaaattgttttaattgtacctgatgagggttttatc
aataaattaaaactttttgataatgaaggatattttaactttgctatgggcttagatata
actaatagtaaatcatataagcttttatatactctatttaatctatttagtgatgaagag
tttaaaatagactttagcattgaattttttaaaataaataaagattttttagagtttata
aaacaaaattggaataagcaattaactcttaatatttttgagtttttagaaaaagaggtt
ttacagtatgaagataatgaagaaattattgtaaaacttaatgaacttttttataagttt
aaagtcttattttttacaaataactcatatattttagtaaaagaggctttaaaaatactt
ttacaaaaacttcaaaaaacaacaattgatgatgtaaactctggaaagattactgtaatg
ggtctattggaaagtagggcagttaattttgaggttgtaattatttgtgattttaatgaa
gagtttattccaaaaatttctttaaaagataagtttttatctacaaaagttaaagagtat
gcaaatttacctacaattaaagatagggagaatttacaaaaatactactataaaagattg
attaataattgtaaaagtttatatgtttgttatacaaataatgaattaagttttattagt
agatttgcaagtgaactttttaatagaaaaatagataatcgtgtatttgacaatgaatat
aagcatattatttataataaaacaaatttttctcattttgataagcaaattattgaaact
attgatttatcaaagatgacttggtctgcaacttctttaaaagcatatttgcagtgtaaa
agaaagttttatttacaatatattttaaagctaaaagaacatgaaatttcactaaaacct
aaagggtatgagttaggagatataattcataaaattttatatgagtattttgaaaaatct
cttgatagctttgaaagattggaagagttatttgtaaaatatactcaaaaaaatcctttt
ttaactttagagttagaagtttggaaaaagaagatttataaagtttttgaaaatgaaaaa
caaagatttgaaaatatacaaattttgcataaagaactaccttttaatatgacttatcaa
ggtattaatatcaaaggggcaattgatagaattgataaacaaaatgataaatatttagta
attgattataaaacatcaagtagtttaaaagtagatagtttaaaaaactatgaaaaaagt
tgtgattttcaattggagttttattatttggcagtacaagaattatataaaactttaaat
attgaaagtttttattatgatttaaatagtgctaaacttttaaaagaagaagcactagat
gctaaattagaactattaaatactatttttaactcttttaaacaaactaaagagataaat
tttgaaaaatgtgaagataaagctttatgtggtttttgctcttataagataatttgtaat
agggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
