Malaciobacter mytili: AMYT_0506
Help
Entry
AMYT_0506 CDS
T05895
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
amyt
Malaciobacter mytili
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
amyt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
amyt02000
]
AMYT_0506
Transporters [BR:
amyt02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AMYT_0506
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Porin_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXH14114
UniProt:
A0AAX2ALT3
LinkDB
All DBs
Position
complement(491521..493716)
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MKIKKSLLSITIIATINNLSANNPSNMGEVTVISASGYEQKLVKAPASISVITQEQLHKN
SYTNLLDAMRDIEGVDIGETRDKSGQGTISIRGMGGDYTLILIDGKKQNNNGDIYPNNFG
GFQYVNIPPLEAIERIEIIRGPMSTLYGADAMGGVINIITKKTFTKWRGSFTQGQTFQTD
NQFGNNKTSDFAIRGPIIKDKLGLSLRGSYYDKEASNPQTSSGTTFGGAGKTVDNQNWTL
GASLTFTPSDKHILRFDYDIMKQKYDNTSSNVGTVDSKENLWFKRRGNFSPRVGYAPIQR
MQREQYSILHEGFWEIGKSTIGIHHIKTSNNGRSLPLNPSERLFMNDLYANYSSLNDFET
NGSSTQLAQFNSLLPRPKRVLESKNITYNGKIEIPFEKHFLVLGTQYIDAQLEDGVFGIT
NKTKKAVTSSYKQWALFLEDSWDILKDLTFTTGIRYDDHETFGSHLSPRAYLVYNANSNL
IFKGGVATGYKTPKTTDLFSGITGFGGQGTLPWVGNPNLKPEESLNTEIAAYYQHNAGHD
FNITLFKNNFNNKIESVNVQQNQLPSQWNTIASSMRQKQNIGNAQIKGIELSGKYKILDN
LTIKANYTYTDSKRDDNKNPLSSTAKHLYSATLNWQTTSKWNNFLRIVGEKDRWRGDDKL
KYYDNYQVFDLGTSYKISKDVIFNARINNLLDKDFTKMTSYKNDNGDTVETYAYNLAQKR
RELWLSLNIKF
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaaaaaaagtctattatcaataactataatagccacaataaacaacttatca
gcaaataatccatctaatatgggggaagtaaccgtaataagtgcaagtggttatgaacaa
aagttagttaaagcaccagcaagtatttctgtgattacacaagagcaattacataaaaat
tcatatacaaacttacttgatgcaatgagagatattgaaggagttgatattggagaaact
agggataaatcaggacaaggaacaattagtattagaggaatgggaggagattatacttta
attttaattgatgggaaaaagcaaaacaataatggagatatttatccaaataattttgga
ggatttcagtatgtaaatattcctcctttagaagcaattgaaagaatagaaataattaga
ggtcctatgagtactttatatggtgctgatgcaatgggaggagtaataaatataattact
aaaaaaacttttactaaatggagaggctcatttacacaaggtcaaacttttcaaacagat
aatcaatttggaaataataaaacaagcgattttgccataagaggtcctataattaaagat
aaattaggattaagtttaagaggaagctattatgataaagaagcttcaaatccccaaaca
agttcaggtacaacttttggaggggcaggaaaaactgtggataatcaaaattggacttta
ggtgcaagtttgacttttacacctagtgataaacatattttaagatttgattatgatatt
atgaaacaaaaatatgataatacaagcagtaatgtaggaactgttgatagtaaagaaaat
ttatggtttaaaagaaggggtaatttttctccaagagttggatatgctcctattcaaaga
atgcaaagggaacaatactctattttacatgaaggcttttgggaaatagggaaaagtaca
ataggtattcatcatataaaaacttcaaataatggaagaagcttaccattaaacccttca
gaacgactttttatgaatgatttatatgctaactattcaagtttaaatgattttgaaacc
aatggttcaagtacacaattagcacaatttaattcattgttaccaagaccaaaaagagtc
ttagagtcaaaaaatataacctataatggaaaaattgaaattccttttgaaaaacatttt
ttagttttaggaacacaatatattgatgcacaattagaagatggtgtatttggaataaca
aataaaacaaaaaaagcagttacaagttcatataagcaatgggcactatttttagaagat
agttgggatatactaaaagatttaacatttaccacaggaattagatatgatgaccatgaa
acttttggaagtcaccttagtccaagagcttatttagtttacaatgcaaattctaactta
atttttaaaggtggtgttgcaacaggatataaaactcccaaaacaacagatcttttttca
ggaattacaggttttggaggacaagggactttaccctgggttggaaacccaaatttaaaa
cccgaagagagtctaaatacagaaatagctgcttattaccaacataatgctggacatgat
tttaatattactttatttaaaaataattttaataataaaattgaaagtgttaatgttcaa
caaaatcaacttccttctcaatggaatacaattgcaagttctatgagacaaaaacaaaat
attggaaatgcacaaattaaaggtattgaactatcaggtaaatataaaattctagataat
ttaacaattaaagccaattatacttatactgattcaaaaagagatgataataaaaatcct
ctttcttcaacagcaaaacatttatatagtgcaactttaaattggcaaacaacttctaaa
tggaataattttttaagaatagtaggagaaaaagatagatggagaggagatgataagcta
aaatattatgataactatcaagtatttgatttaggaacatcatataaaatatctaaagat
gtaatttttaatgcaagaattaataatttattagataaagattttacaaaaatgacaagt
tataaaaatgataatggagatactgtagaaacttatgcttataatcttgcacaaaaaaga
agagaactatggctaagtcttaatattaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system