Anabaena sp. 90: ANA_C13278
Help
Entry
ANA_C13278 CDS
T02341
Symbol
pfaA
Name
(GenBank) polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA
Organism
anb
Anabaena sp. 90
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Ketoacyl-synt_C
Acyl_transf_1
PP-binding
KAsynt_C_assoc
Tape_meas_lam_C
PFam54_60
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFW95954
UniProt:
K7W814
LinkDB
All DBs
Position
chANA01:3709335..3714743
Genome browser
AA seq
1802 aa
AA seq
DB search
MSSPLQKIDTINSSLTELEAQINSFEQAVLKFIEEGKMNSGNLKNSINSMSTKEINRKLH
TTPIAIIGMASLMPQSRTLRDYWQNIVNKIDCITDVPSTHWSVEDYYDPNPRTAEDKTYC
KRGGFIPEVDFNPMEFGIPPSILEVTDVSQLLSLVVAKETMEDAGYSESREFSRENIGVI
LGVAMGKQLGMPLTARLEYPVWEKVLKSSGVSDEDTKKIVDKIKSAYVKWDENAFPGMLA
NVVAGRIANRLNFGGTNCVVDAACASSFGALKMAISELVEHRSNMMLTGGVDTDNTIMAY
ISFSKTPAVTPSENVKPFDAKSDGMMLGEGIGMILLKRLEDAQKDGDKIYAVIKGIGTSS
DGRYKSIYAPRKEGQVKALERAYDDAGFSPATVGLMEAHGTGTMAGDPIEFSSLRDFFGK
HDTQKQHIALGSVKSQIGHTKAAAGAASLIKTALALHHKVLPATINITEPNPKLDIENSS
FYLNTQTRPWIKAEGETPRRAGVSAFGFGGTNYHVVLEEYEPEQQSSYRLHGAAGEVLLF
GATHAELISKLEATLNNLQANDGERFYSQLLLYCQSLAIPTTALRIGFVSENLQEACKLL
QVSLGLLKSKPDAISWEHPQGIYYRSSGMDLGGKVVALFSGQGSQYLEMGREAVMNFPSL
RQLYGKMDHLFKQSNLQPVSEVVFPHSTFDEVEKKAQVATLQRTEYAQPAIGVFSAGLYG
ILQQAGFKADFTAGHSFGELTALWAAGVLSEADYLFLVKARGQAMAAPKDPDHDAGSMLA
VKEDISKIEPVLKQFPKVSIANFNSPTQIVLAGPKLEIQKVQDACEKLGYSAVLLPVSAA
FHTPLIAFAQKSFAIATKSVTFHNPQIPVFSNVTGKHYPQNAAAIQKNLESHLASSVLFK
QEIENIYGAGGYCFVEFGPKRVLSNLVKDTLGDRPHLTISLNPSASKNSDRSLREAAVQL
RVIGMNLGNLDPYKLPAVLHPISSKKTLSVKLTGINYISDKTKNAFTEALADGHKISGIQ
EFRSASSGGASLTEVQDSSRGLAMLNPSINLEIETPVIAKIPPTNGHNGNGNGHKKQPLI
ETQLQPQMTTTATIIKEPQKEPRAELFTQQLEGKMQTPDKLINCQQILTSLGTLLSQFQH
NQSENLEVHGTYLNNQIEYAKTFFQLMQQQNTLFANAKSSAEAAQIKQVIMESLERSMMQ
FHSQQGETLRIHEQYLREQIEYTKHFFQLIQEEYSQLISDTQAAAPANIYAAPEEAPVAP
TVTIIPPQALPVIEPKVQLAAPIPPVIEVAKPVIAAPVIEPEPIIIPQSPVAFIPEHATS
SLNLDDLANNLLSITSEKTGYPIEMLELDMDMEADLGIDSIKRVEILGGLQELYPNLPKP
NLEELAEKRTIGQVVEYLQGQQQVTAEITPEQIIIPQVQTQVIEEVIPESISIPQSPVPN
PQYQDLGQTLLNITSEKTGYPVEMLELDMDMEADLGIDSIKRVEILGAMQEAYPDLPKPN
IEELGDLRTIGQIVNYLQSLVGGEKKKSQFDVNSINSLNPPLSRGETTEVVDLTPPPIVD
INLPRRPVKLRTLPRPDFLEAQLPQGHIGLITDDGSLTTTKLAHALIEQGWKVVVLSFPQ
SLVPEQLPLPAGVTRVTLANMSEQHLQLLLQSVTTKHGAIGAFIHLHPQFTPEKPGHISY
PEAEKAIIKQVFLMAKHLKTTLNNAASLAGRTSFCTVAHLDGEFGLGHQGNFSAISAGLF
GLTKSLRWEWPQVFFRAIDLNPTLDPHESAEYIVAELHDSNRYIGEVGYGNQGRVTLVAK
SE
NT seq
5409 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttccccccttcaaaagatagacacgataaatagttctttgacggaattagaagcc
caaattaatagttttgaacaggctgtgctgaagtttatagaggaaggaaaaatgaattca
ggaaacctaaaaaattcgataaattccatgtcaactaaggaaattaatagaaaactacac
acaactcccatagctattattggtatggcttccttaatgcctcaatcgagaacattaagg
gattactggcaaaatattgttaataaaattgactgtatcactgatgttccttctactcat
tggagcgtagaagattactatgatcctaatccgagaacagcagaagataaaacctattgt
aaacgtggtggttttattcctgaagttgattttaaccctatggaatttggtattcctccc
agcattttagaagttacagatgtttctcaactattaagtttagtagttgctaaagaaaca
atggaagatgctggttatagcgaatcccgtgaatttagccgcgaaaatatcggcgtgatt
ttgggtgtagctatgggcaaacaattgggaatgccattaactgccagattggaatatccg
gtttgggaaaaagttctcaaaagcagtggtgtatctgacgaagatactaaaaagattgtt
gataaaatcaaatctgcttatgtgaaatgggatgaaaatgctttccctggaatgttagca
aatgtggtggctggcagaattgctaaccgtctcaactttggcggtacaaactgtgtagtt
gatgcggcttgtgctagttcctttggggcattaaaaatggccattagtgaattagttgaa
catcgtagcaatatgatgttaaccggtggagtagacaccgataacacgatcatggcttac
atctcatttagcaaaactccagcagttactcctagcgagaatgtgaaaccatttgatgct
aaatctgatgggatgatgttaggtgaagggattgggatgattctcctcaaacgcttagaa
gatgcccaaaaagatggggataaaatctatgcggtaatcaagggaattggtacttctagt
gatgggcgttataagagtatttatgcccctagaaaagaaggacaagttaaagccttagaa
cgggcttatgatgatgctggattttctccggcaactgtgggtttaatggaagcacacggt
acaggaacaatggcaggagatcccatagaattcagttctttaagagatttctttggtaaa
catgacacccaaaaacaacatattgctttgggaagtgtaaaatcacaaattggacataca
aaagccgccgcaggtgcagccagccttattaaaactgccctagcattgcatcataaagta
ttgccagcaaccatcaatattaccgaaccaaatcccaaattagatattgaaaattcctcc
ttttatctcaatactcaaactagaccttggatcaaggcagaaggtgaaactccccgacgt
gcgggggtgagtgcctttggttttggtggcacaaattatcacgttgttttggaagaatac
gaaccagaacaacaaagttcttatcgtttacatggtgcagccggtgaagtgctattattt
ggtgctactcacgcggaattaattagcaagttagaagcaactttaaataatttgcaagct
aacgacggcgaaagattctattctcaattattgttatattgtcaatctttagctattcct
acaactgccctaagaattggttttgtatctgagaatttacaagaagcttgtaagttactg
caagttagtcttggtttactcaaaagtaagcctgatgcaatttcttgggaacatcctcaa
ggtatttattaccgttcttcgggaatggatttaggtggaaaagttgtcgctttattctct
ggacaaggttctcaatacttggaaatgggcagagaagcggtgatgaatttccccagcttg
cgacagttatatggcaagatggatcatctgttcaagcaaagcaatttacaaccagtttct
gaagttgttttccctcattctacctttgatgaagttgagaaaaaagcccaagttgcaact
ttgcaaagaacggaatatgcacagccggcaattggggtttttagtgctgggttgtatgga
attttgcaacaagctgggtttaaggcagatttcaccgcaggacatagttttggtgaatta
accgctttgtgggctgcgggagtattgagtgaggctgattatttgttcctagtgaaagct
agaggacaggcaatggccgcacccaaagacccagatcatgacgctggtagtatgttagcg
gtgaaggaagatatcagcaaaattgaaccggtgctgaagcagtttccaaaagtaagtatt
gctaactttaattctcctacccaaattgttttagccggtccaaagttagaaattcaaaaa
gttcaagatgcttgcgaaaagttaggatatagtgcagttttattgcctgtgtctgcggct
ttccatactccattaatagcattcgcgcaaaaatcctttgccattgctactaaatcggta
actttccacaatccccaaattccggtttttagtaatgtcactggtaaacattatccccaa
aatgcagcggcaattcaaaagaacttagaaagccatttggctagttctgtattgttcaaa
caagagattgaaaatatctatggggctggtggttattgcttcgtagaatttggaccaaaa
cgggttttgagtaacttggtaaaagatacattaggcgatcgcccccatcttaccatatct
ctaaatcccagcgcctccaaaaacagcgatcgctctttgcgagaagccgcagttcagttg
cgagttatcggcatgaatttgggcaatcttgacccctacaaactccctgccgtattgcat
cccatttccagcaaaaagaccctcagcgtcaaattaaccgggattaactacatttctgat
aaaaccaaaaatgcctttacagaagcattagcggacggacataaaatttccggaattcag
gagttcagaagtgcctcctctggaggagcctcgctaacagaagttcaggattccagtagg
ggtttagcaatgctaaacccgtctataaatttagaaatagaaacccctgtaattgccaaa
attcccccaactaatggacataacggcaacggtaacggacataaaaaacaacccctcatt
gaaacccagttacagccacagatgactactactgcaaccatcataaaagaacctcaaaaa
gaacccagagcagaattgttcacgcagcaactcgaagggaagatgcaaacaccagataaa
ctgataaattgccaacaaattctcaccagcttaggaacacttttgagccagttccagcac
aaccaaagcgagaatttagaagttcacggcacatatcttaataatcagatagaatacgcg
aaaaccttcttccaattaatgcagcagcaaaacaccttatttgctaatgctaaatcttcc
gctgaagctgctcaaattaagcaagtgatcatggaaagcttagagcggagtatgatgcag
tttcattcccaacaaggtgaaaccctccgcattcatgaacaatatctgcgggaacagata
gaatataccaaacactttttccaactcattcaagaagaatattctcaactcatttctgat
acccaagcagcagcaccagcaaatatatatgctgctccagaagaagcacctgtagctcct
actgtcaccataattccccctcaagcattaccagtaattgagccaaaagttcaattagca
gcacctattcccccagtaattgaagttgcaaaacctgtaattgctgcaccagtaattgaa
cctgaaccaattattattccccagtccccagttgcattcataccagaacacgcaactagc
agcctaaatcttgatgatctagctaacaatctattaagtatcaccagcgaaaaaactggt
tatcctatcgaaatgctagaactcgatatggacatggaagccgacttaggtattgactcc
attaaacgggtagaaattctgggaggattgcaagaattataccccaacttacctaaacca
aacctggaagaactggcagaaaaacgcaccattggtcaagttgtcgaatatctgcaagga
caacaacaggtaacagcagaaatcacaccagaacaaattatcattcctcaagtgcaaacc
caggtaatagaggaagtaataccagaatcaatttccattccccagtccccagtccccaat
ccccagtaccaagatttaggacaaaccctgttaaacatcaccagtgaaaaaactggttat
ccagtggaaatgctggaactggacatggacatggaagccgatttaggcatagattccatc
aaacgggtagaaatactgggagcaatgcaggaagcgtatcctgacttacccaaacccaat
atagaagaattaggcgacttacggacaatcgggcaaatcgttaactacctccaatcactg
gtgggaggtgaaaaaaaaaagtcgcagtttgatgttaactcgataaactcccttaatccc
cccttgtcaaggggggaaaccacagaggtggttgatttaaccccacctcctatcgtagac
atcaatcttccccgtcgtccagttaagctaagaaccttacccagaccggattttttggaa
gcgcagttaccccaaggacacattggtttaatcactgatgatggttctttaactaccacc
aaactagcccacgcactgatagaacaaggttggaaagttgtagttttgagtttcccccaa
tcattagttcccgaacaattgccattacccgcaggtgttacccgcgtcacattggcaaac
atgagtgaacaacatctgcaattattattgcaaagtgtgactactaaacatggagcgatt
ggggcattcattcacttacatcctcaatttactcctgaaaaacctggacatatttcctat
ccagaagcagaaaaggcaattattaaacaagtgtttttaatggcaaaacatctgaaaaca
actttgaataatgcggcatctttagcaggaagaacaagcttttgcacagttgcccatctg
gacggtgaatttggcttaggacatcaaggtaattttagtgcaattagtgctggtttgttt
ggtttaacgaagagtttgcgctgggaatggccacaggtattcttccgagcaattgacctg
aatcccactttagatcctcacgaatctgctgaatatatcgttgctgaattgcacgattct
aatcgctatattggcgaagttggttatggtaatcaaggacgggtaacgctggtggcaaaa
agtgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
