Anoxybacillus sp. PDR2: GRQ40_13855
Help
Entry
GRQ40_13855 CDS
T06397
Name
(GenBank) DNRLRE domain-containing protein
Organism
and
Anoxybacillus sp. PDR2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
DUF6531
CBM96
RHS
DUF4595
TGFb_propeptide
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHC04923
LinkDB
All DBs
Position
complement(2870203..2875839)
Genome browser
AA seq
1878 aa
AA seq
DB search
MARKRGFRYKCYMAVILSFCLIFSSIAPSFTQAALGKSDRVMTKKQKIEAQLGDLPDKRP
KTKLELESKRTKYSTRYLNPDGSFTEEIYLQPQFYQDPLDKKWKKINNNLKANKTNQFET
TANVFKAAFAEHSNQAELVSIAENDKKLSLIPINDKNVQGIVKNNEITYKGLFEQTDVRY
RIQGNAVKEDIILNNKPSNNAFTFEIKLKGLTAVAKKDGTIVFEDAKGNPQWYFEKPYMF
DANNKYSDQVAFHLRQENGKTYVDVIADENFLQDPDTTYPVTIDPTINDWDVLRDNFIAS
NYPDSIYSSNTYMNTGYSSYFGMTRALVRFYLPSLPSDSVISNATFNAYQTNADGQQVSI
DLYRITSNWSSSVTWNNQPSVRSTKESTTTNNTANAYWSWDITQLVKDWYNGIQPNYGLM
LKQQNESSSPYRAFNTVNSSVNTPRITINYWVEPIGQESFWTTTKDGVNPANGNFVLQTT
DLAISGLGEDVEVTRTYNSRKSGTNGMFGYGWMSNVEMNIWDASNGPITFVDGDNTRHIF
GEKVGGGYEAAGGVYLDLIKNGDGTYTVTKTDGTKLYFNANGKLSRIVDTNGNTTTLNYN
ANGKLALITDASARTTTISYGTNGYVSSITDPANRTISYEYDTFGNLTKVRDAQGNATIF
TYDSDHNLTSIKNARNIMTTIGYDTSDRVKSIERPITINGTPATSITNYSYDKTNSVTSV
TDGEGRRIDYTYNANGNIIQITENPLDAQNKAVTTFDYDNNNNLTRVIEPNENKANGTAA
FIYQYDEKGNIVSVQLPENQSAQYTYDLQNNLIKEQDFNSNVSTFDYDQNNNQTEAIDPY
TQSVSQRYDNVGNLQYSTYPMSSADNLVSNSSFELDNNADNWPDNWTKAVESGKTATFSW
TATSKFGNKGISISNSTGWAIVSSDKQPYDGGIYVASGYVKTSSMSAQALIKVEYFDAQG
NWLNQKISYGLAGTNDWTRFHVVADNAPSGTRTIRVSVGINAGSGTAYFDGIQLEKGTVV
SAYNLVDNSSFERDVNSDGIPDSWTTSGNLSANDGLDTTVANIYVGSKSFKITGESGKNK
YIKQRINISGDSNTKLTLSGWSKQEGANPNGGYYSLQVAIHYTNGTTDWDYANDFDKMKT
DWQHVAAEVKPKQAFDYIDVYYYYYNQTGTAWFDAMRLEVGASLTSYTYDAKKNYVTKVT
DPAGNTVSYTYDAIGNQTSVTDGKGKTTSYEYNNNNQLTKVTDPNGNVTTYGYDGVGNRT
SVTNAKNYTTNYTYNEWNQISSFKNPLNQTTSFAYDKNGNLTGVTYATGDRVSYSYNALN
RLVAVAYNGTTKWTFHYDANGNVTSVTDANGNATTYTYDKNNRLTRISKGSSNAIAYGYD
DNGNVTSTSITAGTTTDTIGYSYNPLDQLVVLSRNSANLARFTYDERGNISSIIHANGTY
TAYEYNDANQLKSLKNFGANGNVLNYFLYNYDANGNITTVETKDGTITYQYDALNQLTKE
TLADGTAITYEYDAVGNRTKKIVNNGTTTTTTTYTYDAADQLTAVNGQAYTYDVNGNLTN
NGNKTFVYDNENRLIQVKNASGATIATYTYDHQGRRINKTTSSGTTYYHYDGDSIRLLYE
TDANNNIAAEYTWDALGRPVTMTKGGVTYYYHVNGHGDVVALTDASGNVVAQYQYDAWGN
ILSKTGALATANPYRYAGYYYDEETGLYYLMARYYDANMGRFITRDTFHGFENEPQSLNQ
YAYTKNNPVMYVDPNGNYAWIVLSFLSGGANATWQMVWDFYKKYKFNRSAWINKFDWKKF
GKLFVTGGLIGIYGRGITSYMTKSQIAKAGQFAWDVTYAAKEYILLQVAGGDPITWSGLV
DAIWNKAKGYLDFLKKLK
NT seq
5637 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaggaaacggggatttcgctataagtgctatatggctgtgattctttccttttgc
ttaatttttagttctattgctccatcgtttactcaggctgctcttggaaagtcagatcga
gtgatgacgaaaaaacaaaagattgaagctcaacttggtgatcttcctgacaaacggcca
aaaacaaaattggaattagaaagcaagcgaaccaagtactcaactcgatacttgaatcca
gatggaagttttacagaagagatatatctacaacctcaattttatcaagatcctcttgat
aaaaaatggaaaaaaattaataacaatctaaaagcaaataaaacaaaccaatttgaaact
acagctaatgtctttaaagctgcatttgcagaacattctaatcaagctgaacttgtttct
attgcagaaaacgataaaaaactttcacttattccgattaatgataaaaatgtacaagga
attgtcaaaaataatgaaattacttataagggattatttgaacaaacagatgtgcgatac
cgtattcaaggaaatgctgtcaaagaagatattattctgaacaataagccttccaataat
gcatttacttttgagattaaattaaaaggattgactgctgttgctaaaaaagatggcacc
atcgtttttgaggatgccaaagggaaccctcaatggtattttgaaaagccatatatgttt
gatgcaaataataagtattcggaccaagttgcttttcatttgcgccaggaaaatggtaaa
acttatgtagatgttatagcggatgaaaattttttgcaggatccggatacaacataccca
gtaacaattgatcctacgattaatgattgggatgttttacgtgataattttattgcaagc
aattatcctgactcaatttactcgagtaacacatacatgaatacaggatacagcagttat
ttcggcatgactcgtgctttagtgagattttaccttccaagtcttccaagtgatagcgtg
atttccaatgcgacatttaatgcatatcaaacaaatgctgatggtcaacaagtgtccatt
gatttatatcggatcacaagtaactggtcttcttctgttacttggaataatcaaccttct
gttcgaagtacaaaagaatcaacaacaacaaacaatacagccaatgcgtactggagttgg
gacatcactcagttagttaaggactggtacaatggcattcagccaaactacggattgatg
ttaaaacaacaaaacgaatcgtcttctccctatcgcgcattcaatacggtaaatagcagt
gttaatactccacgcatcacgattaactattgggtagagccaatcggccaagaatctttc
tggacgaccactaaagatggggtgaatccagcaaacggaaactttgttttacaaacaacg
gatcttgctatttctggtctgggtgaagatgttgaagttacaagaacatacaatagtcga
aagtccggaacaaatggaatgtttggttatggttggatgtctaatgtcgaaatgaacatt
tgggatgcaagcaatggccccattacgtttgttgatggagataatactcgtcatattttt
ggtgaaaaagtgggtgggggatacgaagctgctggtggtgtctatcttgatctaatcaag
aatggagacggcacttatacagtaacaaaaacggacggtacaaaactttatttcaatgca
aatggaaaactttctcgcattgttgatacaaacgggaacacaactacattgaattataat
gcaaacggaaaattagctttaattacagatgcatcagcaagaacgaccaccatttcctat
ggaacaaatggatatgtatcaagtatcaccgacccggcaaatagaaccatctcttatgag
tatgatactttcggtaacctaaccaaagtcagggatgctcaaggaaatgcgaccattttt
acgtatgattcagatcataatctaacaagtattaaaaatgctcgaaatattatgacgaca
attggctatgatacatcggaccgcgtaaaaagtattgaacgccctattacgattaacggc
acgcctgcaacgagtattaccaattattcctatgacaaaaccaatagtgttacgtcggtt
acagatggagaagggagacggatagattatacgtacaacgctaacggcaatattattcaa
atcacagaaaatcctttagatgctcaaaacaaagctgtaaccacatttgattatgataat
aacaataatttaacccgagtgatagaaccaaatgaaaataaggcaaacggaaccgcagcg
ttcatttatcaatatgacgaaaaaggaaatatcgttagcgttcaattgccggaaaatcag
tccgcacaatatacgtatgatttacaaaacaatcttatcaaagagcaggattttaacagc
aacgtcagcacctttgattatgaccaaaataataatcaaaccgaagcgattgatccttat
acgcaatcagtttcgcaacgatacgataatgtgggaaatttgcagtattcgacgtatcca
atgtcatcagccgataacttggtaagtaactctagcttcgaattggataataatgcggat
aattggccagataactggacaaaggcggtagaatcagggaaaaccgctacattcagttgg
accgcaacaagcaaatttgggaataaagggattagtatttccaattcaactggatgggca
attgttagttctgataagcagccgtatgatggtggaatttatgtggcaagcggttatgta
aaaacatcgtccatgtctgcacaggcccttataaaagttgaatattttgatgcacaagga
aactggttaaatcaaaaaatttcttatgggttggcaggaacgaacgactggacccgattt
catgttgtagcggataatgctccatcgggaactcggacgattcgagtatctgtcggtata
aacgctggttctggaactgcttatttcgatgggatccaactagagaaaggaacggttgtc
agcgcctataatcttgtagataattcaagctttgagcgagatgttaatagtgatggaatt
cctgacagttggacaacaagcggcaacttatcagcaaatgatggactagatacaacagtt
gcgaatatatatgtcggaagcaagtcatttaaaatcacgggagagtctgggaaaaataaa
tatattaaacaacgaatcaatatttccggcgacagcaacaccaaacttacgttgtctgga
tggtccaaacaggaaggagccaatccaaacggcggttactatagcttgcaagtagcgatc
cactatacgaatggtacaacagactgggactacgccaacgatttcgataagatgaagacc
gattggcagcatgttgccgcggaagtgaagccgaaacaggcattcgattacattgacgtg
tattattactattataatcaaacgggcacagcatggtttgatgcaatgcgtctagaagta
ggagcttctctgacgtcgtacacgtatgatgcaaagaaaaactacgtcaccaaagtcacc
gatccggcaggaaatacggtttcttacacatacgatgctatcggaaaccaaacgagcgtc
acagatggaaaaggaaaaacgacttcttacgaatataacaacaataaccaattaaccaaa
gtcaccgacccaaacggaaatgtgactacctatggttacgacggtgtgggaaatcgaaca
tcggtcactaatgcaaagaattatacaaccaactatacgtataatgaatggaaccaaatc
tctagtttcaagaacccgttaaatcaaacgacatcctttgcttatgataaaaacggcaat
cttacaggggttacgtatgcaaccggggatcgcgtatcctatagctacaacgcgctgaac
cgactcgttgccgttgcttacaacgggacaacaaaatggacgttccattacgatgccaat
ggcaacgtgacgtcggtgacggatgccaatggaaatgcgaccacgtacacatacgataaa
aacaaccgtctgactcgcatcagcaaaggatcatcgaacgccattgcctacggttatgac
gataatggaaatgttacatcgacatccattacggctggtacaacgactgatacgatcgga
tacagctataatccattggaccagttagtcgtcttgtcaagaaacagcgcgaatttagcg
agatttacgtacgatgagcgcggaaatatttcgtccatcatccatgccaatggaacttat
accgcttatgagtataacgatgccaatcagctaaaatcactgaaaaacttcggtgcaaac
ggaaatgttttaaactacttcctctacaattacgatgccaacggcaatattacgactgta
gaaacaaaagatggcacgattacgtatcagtatgatgcattgaatcagctgacaaaggaa
acactagcggatggaacagcgattacgtatgaatatgatgcggttggcaaccggacgaag
aaaatcgtcaacaatggaacgactacgacaacgaccacgtatacgtatgatgctgcggac
caattaacagccgttaacggacaggcatacacatatgacgtgaacgggaatttaacgaac
aacggcaacaagacgtttgtgtatgataacgaaaaccgtctcattcaagtaaaaaacgca
tccggcgctacgatcgcaacctatacgtatgaccatcaaggaagacgcatcaacaaaaca
acatcaagcggtacgacttactatcactacgatggcgactcgattcgcttgttgtatgaa
acagatgccaacaacaacatcgcagcggaatatacgtgggacgcattgggccgcccggtc
acgatgacgaaaggcggagtgacttactactatcatgtaaacggccatggagatgtcgtc
gcattgacggatgcaagcggaaatgtcgtcgcgcaataccaatatgacgcatggggcaac
attctgtctaaaaccggcgcgctggcaacagcgaacccataccgttatgccggttattat
tacgatgaggaaaccgggctatactacctaatggcgcggtattatgatgcgaatatggga
cggtttattacaagagatacgttccatgggtttgaaaatgagccgcaaagtttgaatcag
tatgcgtatacgaaaaataatccggtaatgtatgtggatccaaatggaaactatgcatgg
attgtattgtcgtttctaagtggaggcgcaaatgcaacttggcaaatggtttgggacttt
tataaaaaatataaatttaatcggagtgcgtggataaataaatttgattggaaaaaattc
ggtaagttatttgttacggggggtttaataggtatatatggtagaggaataactagttat
atgaccaagtctcaaatagctaaagcaggtcagtttgcctgggatgtcacatatgcggca
aaagaatatatattattgcaagtagcaggtggagaccctatcacatggtctgggctagtt
gacgctatttggaataaggctaaaggatatctagattttttaaagaaattaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system