Acinetobacter nosocomialis: RR32_07020
Help
Entry
RR32_07020 CDS
T04196
Name
(GenBank) biofilm synthesis protein
KO
K11935
biofilm PGA synthesis protein PgaA
Organism
ano
Acinetobacter nosocomialis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PgaA_barrel
TPR_19
TPR_14
TPR_9
TPR_6
TPR_2
YfdX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJB47870
LinkDB
All DBs
Position
1471018..1473456
Genome browser
AA seq
812 aa
AA seq
DB search
MLKKCVFSLVYLLPIHLYAAQVDVLREQAVQNYRAGQTQQAVSQLDQLLKHYPYDQKLLA
DYLIVMSSEKKDLTNFSNFLENINYVNFPEYAKLPLIRNFRDFKHFQTAIDWSNKLNIQK
SVDGRILLSVLYAEAQDSTNAKTQLSNINIKGLNTDQLVQVAYAYRLINLPVEALATIEQ
AYQQNSKSSAVLQEYVYDLAAIGAFKKAQQLLQVNEKNQQTEQLQQTLQVSEFSQHVNNA
IARYKYLNRQGLSDAESYAELDAVLEQGQKIQQQMSPNNPNYLRFHYDYLYALDFRGRSK
AVIENFTQLNIPLEKLPAYVRHAIADSYLAEQKPKQAELAYKTLLNEKNYPDMIVYTGLY
YSYIEQEKYKEAEQLLAKVDHLIPTYKYSQAKGVDKTSHPDRDDYIALKGMHLAYANHLD
QAEQHFQKTVEQAPANESLINNLARVERWREKPLEAKKTISRLNGIDPIAKDTRINEMQN
AQALGDIPTWRKTTQNLEQYYPDDSGVIKSRKELDDRNRATISHSTTWGQSKADNSDTVS
GQNGLKDREMETRLNSPWIKDNYRLFAWHQDRYGEYRFGDVHNQRYGVGAEWQANRKALS
AILSQSTDGGQAGVRLDWSQWLNDHWQYQLQYNSQADIPLQAIDAGEDGQSYRAALTWQK
DESRQIGASYGLTDISDGNKQQEFSTFWRERLFAAPHHITYGTVRGFYGSNSQDQTTYFS
PSSHYSAELNLSHDWVTWREYERSFKQHFEAGVGLYKQADYSTKPTYSLQYQHQWQLSRT
WQLNYGIGWQYHPYDGHDEQHTYGIFGFEGRF
NT seq
2439 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaaaaatgtgttttttcattggtatatctcttaccaattcatttatacgcagct
caagttgatgtactgcgtgagcaagctgttcaaaattatagagcaggccaaactcaacag
gctgtttctcaactcgatcaattgttaaaacattatccgtatgatcaaaaattgcttgct
gattatttaattgttatgtcaagtgaaaaaaaggatctgacgaatttttccaatttttta
gaaaatattaattatgtgaattttcctgaatatgcaaaattacctttaattcgaaatttt
cgtgattttaaacattttcaaacagcaattgattggtcaaataaacttaatattcaaaaa
tcagtcgatgggcgtatcttactatcggttttatatgctgaagctcaggactcaacgaat
gctaaaactcagttatcaaatatcaacattaaaggcttaaatactgatcagttggtacag
gttgcatatgcttaccgtttaataaatttgcccgtagaggccttagctacaattgaacaa
gcttatcagcaaaattctaagtcttcagctgttttgcaagagtatgtttatgacttggct
gctattggggcatttaaaaaagcccagcaattacttcaagttaacgaaaaaaatcagcaa
actgagcagttacagcaaactttacaagtcagtgagttttctcagcatgtcaataatgca
attgcccgctataaatacttaaatcgccaaggcttatcagatgcagaaagctatgctgaa
ttagatgctgtgttagaacaagggcaaaaaatacaacagcaaatgtcaccaaacaaccct
aactatttaaggtttcactacgattatttgtatgcgctagattttagagggcgttcaaaa
gcggttatagagaatttcacccagttgaatattccactcgaaaaattaccggcatatgta
cgtcatgcaattgctgatagttatttggcggagcagaagccgaagcaagctgaacttgct
tataagactcttctaaacgaaaaaaattatccggatatgatcgtctataccggattgtat
tattcctatattgaacaggaaaagtataaggaagctgaacagcttttggcaaaagttgat
caccttataccgacttataaatatagtcaggcgaaaggtgtagataaaacaagccatcct
gatcgtgatgattatattgctttaaaagggatgcatttagcctacgctaatcatctggat
caagctgaacagcactttcaaaaaacagtcgagcaagcacctgcgaatgagagcctgatt
aataatcttgcgcgtgtagaacggtggagagaaaaaccgctagaggcaaaaaaaacaatt
tcccggttaaatggtatagatccgattgctaaagacactcgcattaatgaaatgcagaat
gctcaagctttaggtgatattccgacatggcggaaaaccactcaaaacttagagcaatat
tatcctgatgatagtggtgtcataaaaagccgcaaagagttggatgatcgtaatagagcc
acaatttcacactcaactacttggggccaaagtaaggccgacaatagtgatactgtaagt
gggcagaatggtttaaaagaccgtgaaatggaaacacgtcttaatagcccttggattaag
gataattatcgtttatttgcttggcatcaagatcgttacggcgagtaccgttttggcgac
gtgcataaccagcgctatggtgtcggggccgaatggcaagctaatcgtaaggcattgtct
gcgatcttgtcgcaaagtacagatggcggacaagcaggtgttcgtcttgattggtctcag
tggttaaacgatcactggcagtatcaattgcaatataacagccaggctgacatccctctg
caggcaattgatgcgggagaagatggccaatcttaccgagctgctttgacatggcaaaaa
gatgaatcacgtcaaattggcgcaagttacggtctgactgatatcagtgatggtaataaa
caacaagaattttcaactttttggcgtgaaagactatttgcggcgccgcatcacattact
tatggcactgttcgtggtttttatggcagtaatagccaagatcaaactacttattttagc
ccaagttcgcattacagcgcggagttgaacttaagccatgactgggtgacttggcgtgaa
tatgagcgttcatttaaacagcatttcgaggctggagtggggctttataaacaagccgat
tattccactaagccaacctattctttgcaatatcaacatcaatggcagctatcacgtaca
tggcaactcaattatggaattggttggcaataccatccttacgatggacatgatgaacag
catacctatggtattttcggatttgaagggcgtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system