Antarcticibacterium arcticum: FK178_00130
Help
Entry
FK178_00130 CDS
T06142
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
anp
Antarcticibacterium arcticum
Pathway
anp02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
anp00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
FK178_00130
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_6
Ig_7
Ig_3
Por_Secre_tail
I-set
PKD
InhA-like_MAM
PKD_3
Ig_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QED36231
UniProt:
A0A5B8YF96
LinkDB
All DBs
Position
complement(39410..49141)
Genome browser
AA seq
3243 aa
AA seq
DB search
MEKKLLSGFFIISLFLLVSFSGYGQCPTSVSISSDKGNTICAGTEVTFTASANGGTNLAY
QWQIGQVNQNNETNSTFKTSSLTNGQKVRVVVTSTAEGFETCSISSSEITMTVNVVRTPT
VSISSNKTSICPGESVTYTASNTFGGTSPQYSFYLNGETSTLQTGSSNTFTTTTLDNGDR
IRVVLTSNLECVTSSTAEVTSSAITVRAGTPVKPGTISAAETAICPGASQTYSISPVTGA
SSYQWTLPSGWAGNSTSTSITATAGTNSGTISVKAINDCGTGEAENIEITVKAGTPAVPN
NISGETAVCPGVSQTYSITDVANASVYIWTLPSGWSGTSTTNSITVTTGPSGSGNISVQA
KNDCGTSTARNLAVSVKAGTPAQPGTITGTAEVCPGVSQTYSITAVTGATSYIWTLPNSG
WTGTSTTNSITVTSGTTGGNISVKATNDCGTSVEQTLALTVKAGTPATPGTINGATTICP
GDVETYSFDAVSGATEYIWSLPSGFSAPSTTTASPSIDITAGNSGSGTITVKAVNSCGTS
ATSSISISINNPVPVMSGTITGPAEMCSTATGLQYSIPAITNATEYVWTVPSGWTITGGT
GTRTITVSASSNSGNIFVIAKNTCGDSASSANFAVTSVTGVPATPGALTAPNLPTGAICP
PATGIQFTVPTVTGANSYLWTLPTGWEITSGAGSNSITVRVNSTAATTANASVSVQAVNI
CGNSEKSTLSGIAIDNHVVTNAGADQTVCKVISPISIEGTYSFSGTNANLKPTWSAPTGM
GSFDNASKLAAKFTPTQAALDAGSVIITLTTDAPSGACGPGKDEMKITFKPLITATIAAT
SPACNGNTSTLTFTGTPNSRITYKKDNGANQTVDIGASGTAIVTTAVLTANATYSLVSGL
YLDTPACSNALTGSATITITAKPTAVIAYSAAPFCTALSTGQTPSLTGTGAYTGGTYSST
TGLTIDSSTGAVTPSTSTPGTYTVTYKTPASGGCEEIIATTEITITKQPTASITYSGIPF
CTSDSDSKPVTLSGTDGFSGGTFSAPAGLTIDATTGAITASSSTAGTYLITYETPSAGGC
SPVPATTEIVITKAPTVTISYPDAPFCLADTSEKEVTIEGTDAYTGGTYSAMAGLSINSS
SGAIDPAASSVGTYTVSYKTPATAGCGEVTATTEVSITQTPFVEIAYDGPFCTADETAQS
VNFTNGIGIYEGGTFSSNPGGLDLDPSTGAINPKTSNPDTYKVTYTIPASLGCDAVVVET
EVTITLMPQVSISYETPLCNTDDAIAVSYSSTMGDYTGGIFSATSGLVIEADGSINPQAS
TPGIHTITYSKETEGDGCAIIEATTQVEIFEKVQITTQPVNFGTCSTNPASFEVVATGDN
LAYQWYKKDTGGTFVQINGETNPTLSFSNATSTNAGEYYVVVSSSNAVCASETSDPVTLN
IDEDIVIIKPAEDITICEDDYESLSFDYEAHANGAELTFQWIKDGNPINEVADKYVMTKS
GPTGTDGVYTGTLTILNIDSNDDGIYAVIIDGPDYFTCPEATSKSFTFRVNKRPDKPVTA
TVEYCLNATPTALTATKANEDNELLWYSYDASSTEYTYLGTSVTPTTETAGTTSYWVTQK
QPNSCESDPAELVVTVYDKPQPIATETIQFSFCFNETVTDPISLTPAEGTTLNWYDAENA
TTALSSAPTPNTGEVKLTSYWVSQTLTSTGCESERTKVDIIINELPNVQINIADGFASEI
CLNSSTKLVASGATNYMWYFNNAEIGTDPEVTVTGNTVGTFEYKVIGTDANGCINENVFS
INVEEPSQGGTVSGPSSVCVSNNAGTLTVADFKGEILRWESTTDGTNWAAISMTTENLDF
QNISGTTTFRAIVKNGVCDEVPSTEIAVSIDPLPIGGELAFENFGRVLETCSNPGSDYNV
PINLTGETGTVVRWRYAQSTATSWSTVMVNGEPFTGKTLTAELIKSLGLNQTTIFEVEMT
SGACTPNVFSQNATLSIISSDIAPNPVTVTPGVVCIGELVTLSASSGYGNASDVMSGGDF
NNANSLTNEGWRVRRDGSTTNLDFPASGNNTRPNIWSNTNDQPFYTANINNPTTGSNQTW
DSGDKKFAIVTGKNASTLETPVFNTYAMESATLTFDQGYNLTEGAIIRVEISTDGGANYQ
SILYEVVGPATSESYNRFGSTSDPRNKISIDLASYLGQGNLRIRWHFIGARDGDVWAIDG
LSVPEGPSGVEMIWTDYTDPDNPVEIGRNNSEQWEPSLIGLNEFEIKTRLTFDSTGAQCP
VVENSSTINVFVFDQYTSKATALGGSCGFENVQLKGSIENSGLNKMKTFPTADGYSAKWE
VVTKPAGYTFSEAHFSPSIKDTAAIFSPGIEGEYTLQYSLSRPEDQYKNESCPPVYEKIT
FTVKACTTLDFDGIDDFVDLGEGYTGDYSIEAWIRPEAATGTIISTPQLEINMSDLSGLV
STNGRWYHIAVDSDGKLYVDGIAKGTTISGTGDVKRSFIGARWNAPNTENHFSGWIEEVR
IWNTKISEKNIRFTMNQRLKDTGNIGVQVDMVHPDAPEFGSLAGYYQLLTTSILNGGYTP
DLSGSPVNGKLRNMTTTQENTAPLPYFTKQDGSWDADATWAYPDVWQIPNSGGLDWNIVR
TKHNVNSTRDISVLGLISEVNTLDMVGDIPANESHELVGTGKALTISHYLKLDGIIDLNG
ESQLLQPELSIVDPASTGHLDRDQQGKRNSFIYNYWSSPVSATSINGGYSVGGVLLNGTN
PASPISISFPASHAAADGARSPNSLIISAYWLWKFSPATANAYSEWKHIGSTGTVNSGEG
FTMKGTDGYARMADGQNYTFRGKPHNGDLTLPDLSVDQNYLIGNPYPSAIDAHEFIRDNL
KDVSGGKNDRNVFDGSLYFWDHFQEVSHILKEYIGGYAVLNIGGAVPAASVDERIDNTGE
PNNKIPGPYIPVAQGFMINSTTLESAFPILGGKVKFKNSQRKFEIEGGFGSNSLFLKPET
GEKNVKAKDTEFKKIRLSFSSPVGYWRQILVGAIPGTTDAFDLGYDAHLFDNNIEDMYFL
QGENKLVIQSIADFNKDRIIPLGIKVKENKEFRIRLDTLENGNNELNIYLNDKLKDSIHD
LRKSAYFSTSEPGTIHDRFEIIFSKDEEVLPPVEPGPDGKDYGIVLRVRHSYANRQIQIL
NPEQIEISNLYLFDLNGNLLEDYDQITNEKEIILPVRGYSSGVYILKMYVSDKVITKKII
ISN
NT seq
9732 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaaaaaattactatccgggttttttataatttccttgtttttacttgtgtcattt
agtgggtatgggcagtgtccaacctctgtaagtatttcttctgataagggtaacactatt
tgtgcgggaactgaggtaacttttacggcttcggctaacggaggtacaaaccttgcttat
caatggcaaattggtcaggtaaatcagaacaatgaaaccaactctacctttaagacaagt
agtcttaccaatgggcagaaggttcgggttgtggtcacctccacagccgaaggttttgaa
acctgtagtatttcgagtagtgagataacaatgacggttaatgtagttcgcacccctaca
gtttcaatttcttcaaataaaactagtatctgccctggggaaagcgttacatatactgcc
tccaatacatttggggggacctctcctcaatattcgttttaccttaacggtgaaacctca
actttacaaacaggatcatcaaacacatttaccactacaactttagataatggagacaga
attcgagtagtacttaccagcaatttagaatgtgttacttcttctaccgctgaagtgact
tccagtgctattacagtaagagcgggaacccctgttaaacccggaactataagtgcagct
gaaacagctatatgtccgggtgcttctcaaacttattcaatttccccggttaccggtgca
agctcctaccagtggactcttccttcaggatgggcaggaaacagcacttctacttcaatt
acagctaccgccggcactaacagtggtacaatttcggtaaaagcaattaatgattgcggc
accggtgaagccgaaaacatagaaattacggtaaaagccgggacacctgctgtacctaac
aatataagtggagaaacagccgtatgtccgggggtttctcaaacatattctatcacagat
gttgcaaatgcctccgtatatatctggacccttccttctggttggtcaggaacaagcacc
acaaattctattacagtaactaccggcccatcgggatcaggaaatatatctgttcaggca
aaaaatgattgtggaacaagtacagcaagaaacttagccgtttcagttaaagctggaact
ccggctcaacccggaacaatcaccggaacagcagaggtatgtccgggagtttctcaaaca
tattctattacagccgttacaggtgcgacttcttatatctggaccttaccaaatagtgga
tggactggaacaagtacaaccaattcaataacggttacttcaggtactaccggaggaaat
atttccgttaaagcaactaacgattgtggtaccagtgtagagcaaactttggccctaact
gtaaaagctggaacacctgcaactcccggaactataaatggtgccacaaccatttgtccc
ggcgatgtagaaacctatagttttgatgctgtgtctggtgcaactgaatatatttggtct
ctgccaagtggtttttcagctccttccacaactaccgcatctccatccattgatattact
gccggaaattctggttcagggactataaccgttaaggcggtaaacagctgtggaacaagt
gccacatcaagtatatccataagcattaataatcctgttccagtaatgagtggaacaata
acaggtccggctgaaatgtgctctaccgcgaccggacttcaatactccataccagccatt
actaatgccacggaatatgtatggactgttccaagtggctggacaattaccggcggtaca
ggaacaaggactattaccgtcagcgcgtcttctaacagtggaaatatttttgtaattgcc
aaaaatacttgcggggatagtgcttcttctgccaattttgccgtaacctcagttacaggc
gtacctgcaactccaggtgcattaacggctcctaacttgccaacaggcgctatttgtcct
cctgccacaggcatacaattcacagttcccaccgttaccggggccaacagttatttatgg
actcttcccaccggatgggaaataacctccggagctggttccaattccattactgtcaga
gtaaattctactgctgcaacaactgcaaatgcatcggttagtgttcaggccgttaatatt
tgtggaaatagtgaaaaatcaactttaagtggaattgcaattgacaaccatgttgttacc
aatgcaggggcagaccaaacggtttgtaaagttatctctcctataagtattgaaggaact
tacagtttctcggggacaaatgctaatttaaaacccacctggtctgctcccacagggatg
ggttctttcgataatgcttcaaaactagccgcaaaatttactcctactcaggcagcgctg
gacgccggttcggtaatcattactcttacaacagatgctccaagtggtgcctgcggacct
ggtaaggatgaaatgaaaattaccttcaagccgctgattacagctacgatagcagctacc
tcacccgcgtgtaatggaaatacatctacattaacttttacaggaacaccaaacagtaga
ataacctacaaaaaagataatggagcaaatcaaacggttgatataggagcttcaggaaca
gctattgttactacagcagttctaactgctaacgctacatattctttagtgagcggatta
tatctggacacgccggcctgttcaaatgctttaaccggctcggccactattacaattact
gctaaaccaactgctgtaattgcttattcggcagcaccgttttgtactgctttaagtaca
ggtcaaaccccttctcttacaggtaccggtgcctacacaggtggtacatactcctctaca
actggtttaactatagacagttccacaggagccgtgactccttcaacaagtactcccgga
acctataccgttacttataaaactcccgcttccggcggatgcgaagaaataattgccaca
accgaaattacaattacaaaacaaccaacagcttcaataacgtattcaggaatacctttt
tgcacatcagactctgattctaaacctgtaactctttcaggaacagacggtttttccgga
ggaactttttctgcgccggcaggattgactattgatgccactaccggtgctattacagca
agcagtagtacagcgggtacttatttaataacttacgaaactccgtcagccggaggatgt
tcaccagtcccggccacaacagaaattgtcataactaaagcacctacagttactatttcc
tatccggacgcccccttctgtcttgcagatacttcagaaaaagaagttactatagaggga
acagatgcttatacaggaggaacatattctgcaatggctggcctatcgattaattcttct
tcgggtgcaattgatcctgctgcaagttctgtgggaacttatactgtaagttataaaact
cccgcaactgcaggctgtggtgaagttaccgcaacaacagaggtcagcattacacaaact
cctttcgttgaaatagcttatgacgggcctttctgtactgccgatgaaaccgcacaatct
gttaatttcaccaatggtattggaatttatgaaggcggaactttttcctccaacccaggc
ggacttgatctggacccgagcaccggggccataaatccgaagaccagtaatccggatact
tataaagttacttatacaattccggcttccttaggttgtgatgctgttgttgttgaaacg
gaagttactataacccttatgccacaagtttctattagctacgaaacacctttatgtaat
acagacgacgcaattgcagtgagctatagcagtacaatgggtgattacacaggaggtatt
ttttccgcaacttctggtttagttattgaggccgatggaagcattaatcctcaagccagt
actccaggcattcatacaataacttattcaaaggaaacagaaggtgatggttgtgctatt
atagaagcgactacccaggttgagatatttgaaaaggtacaaattacaacacagccggta
aattttggtacctgttcaactaatcctgcctcttttgaagtagttgcgacaggggataat
cttgcataccaatggtacaagaaagatacaggaggcacttttgttcagatcaatggagaa
accaatccaactttatcattttcgaatgcaacttcaaccaatgcaggagaatattatgtg
gtagttagtagtagcaatgctgtatgtgcatcagaaacttcagaccccgtaactctgaat
attgacgaagacatagttattataaaacctgcagaagatattaccatttgtgaagatgat
tatgaatctctgtcattcgattatgaagcgcatgcaaatggtgccgaattaacattccag
tggatcaaggacgggaatccaataaatgaagttgctgataaatatgtgatgaccaaatcc
gggcccacaggtacagatggagtttacacaggcactttaactatacttaatattgattca
aatgacgatggaatatatgccgtgataattgatggccccgattatttcacctgtcccgaa
gcaacctccaaatcttttacattcagggtaaataaaaggccggataaaccagttactgct
actgttgaatattgtttaaatgccactcctacggccttaacagctactaaggctaacgag
gacaatgaacttttatggtatagttatgatgcctccagcacggagtacacatatttagga
acgtctgttactcctaccacagaaacagcaggtacaacctcttactgggttacacaaaaa
caaccaaatagctgtgaaagcgatcctgcggaacttgtagttactgtatatgacaaacca
cagcctatagctacagagactattcaattcagcttttgttttaatgaaacagtcacagat
cctatttctttaacaccagccgagggcaccaccttaaattggtatgatgcagaaaacgct
actacagcccttagttctgctcccacccctaatactggtgaagtgaagttaacctcttat
tgggtgagccagactttaacaagtacggggtgtgaaagcgaacgtacaaaagttgatatc
atcataaatgaacttcccaatgttcaaataaatattgccgacggttttgcttctgaaatt
tgccttaacagcagtaccaagttagtcgcttcgggtgcgaccaactacatgtggtatttc
aataatgccgaaatagggactgacccggaagtaacggtaaccgggaacactgtaggaact
tttgaatacaaggttattggaacagatgcgaatggttgtataaacgaaaacgtattcagc
ataaatgtggaggagccttctcaaggtggaacagtttcagggccttcttctgtttgtgtt
tccaataacgcgggaacactgaccgtggcagattttaaaggagaaattctgagatgggaa
agtactactgacggcacaaactgggctgcaatttcaatgactactgaaaatttagatttt
caaaatatttccggaaccacaacattcagagcaattgttaaaaacggggtttgtgacgaa
gtaccttctactgaaattgcagtttctatcgatccgcttcccattggaggtgaattggct
ttcgagaattttggcagggtgctggaaacctgttccaatccgggttcagattataatgtt
ccaataaatttaacgggtgagacaggaacggtggtgaggtggagatacgcgcagagtaca
gccacttcctggtcgaccgtgatggtaaatggagagccttttactggaaaaactttaaca
gccgaacttattaaaagtcttggcctgaatcagaccactatttttgaagttgagatgaca
agtggtgcctgtactccaaatgtattttcccaaaatgcaactttaagcatcatttcctct
gacattgcacctaatcctgtgaccgttactcccggagtggtatgtataggagagttagtt
acccttagcgcaagctccggatatggtaatgccagtgatgtgatgagcgggggagatttt
aataatgccaactctcttaccaatgaaggctggagagtgagaagggatggaagcaccacc
aatttggattttcccgcttctggaaataataccagaccaaatatttggtcaaacaccaat
gatcaaccgttttacactgcaaatataaataatcctaccacaggatctaaccagacgtgg
gattctggagataagaaatttgcaattgttacaggaaaaaacgcttccactttggagact
cctgtctttaacacttatgccatggaatctgcaactcttacctttgatcaggggtataac
ctaacggagggtgctataattagagttgaaatttcaaccgatggaggtgcaaattatcaa
tctatcttatatgaagtagttggtcctgcaacaagtgaaagttataatagatttggttca
acctctgacccccggaacaaaatttccattgatctcgcctcatatttggggcagggaaac
ctaagaataaggtggcattttattggcgctcgagatggtgatgtctgggccattgatggg
ttatcagttccagaaggtccaagtggggtagaaatgatttggacagattataccgatcct
gacaatcctgttgaaattgggagaaataattctgaacaatgggagccaagtcttatagga
ttgaacgaattcgaaattaaaacaagattgacttttgatagtacaggggcacaatgtcca
gttgtagaaaactcctcaactattaatgtatttgtttttgaccagtatacttccaaagct
actgctctgggaggcagttgtggttttgaaaatgtgcaattaaaaggaagtattgagaac
agtggtttgaacaagatgaaaacttttcctacagccgacggatactcggctaaatgggaa
gtagtgaccaaaccggcaggttatactttttcagaagctcatttctccccctcaataaaa
gacactgcagccattttttccccggggattgaaggggaatataccttacaatactccttg
agcaggccagaggatcaatataaaaatgaatcctgtcctcctgtatatgaaaaaataaca
tttaccgttaaagcctgtacaacccttgactttgacggcatagatgatttcgttgacctt
ggcgaaggatatactggtgactacagcatagaagcctggataaggccggaggctgcaacc
ggaactattataagtactcctcagttggaaattaatatgagtgacctttccgggttagtt
tcaactaacggacgatggtaccatattgcagttgattcagatggtaaattatatgtggat
ggaattgcaaaggggacaaccatttcaggcactggcgatgttaaaagatcttttataggc
gcgcgatggaatgctcccaatacagaaaatcatttctctggttggattgaagaagtacga
atttggaatacgaagatttcggaaaagaatattcgttttaccatgaaccagcgtttaaaa
gatactggtaatattggagtgcaggttgatatggttcatcccgatgctccagaatttgga
agtcttgcaggatattaccaattacttactacctccatcttaaatgggggttatactcct
gatctttctggttctccagtaaatggtaaattacgaaatatgaccaccactcaggagaat
acggcccctttgccatattttaccaaacaggatggatcttgggatgcggatgctacctgg
gcatatcctgatgtttggcaaataccgaattcaggtggattagactggaatattgtgcga
actaaacataatgtgaattcaacaagggatatttctgtcctgggtttaatatctgaagtt
aatacattagatatggttggggatattcctgccaatgagtctcatgaattggtgggaacc
ggaaaagctcttacaatttctcattatctaaaattagacggtataatagatcttaatggt
gaatcacagttgttacaacctgaattgagtattgtagatccggccagtaccggccatctg
gatcgtgatcaacaaggaaagcgaaatagttttatctataattattggtcttccccggtt
agtgcaacttcgattaatggaggatattcagtagggggagttcttctaaatggaacaaat
ccggcttccccaatttcaataagtttcccggcatctcatgccgctgccgatggtgccagg
tcaccaaattctttaataataagcgcctattggttatggaaattttctcctgcaacggca
aatgcttattccgaatggaaacatattgggtcaacgggtacggtaaattctggagaaggt
ttcacgatgaagggaactgatgggtatgctagaatggcagatggacaaaattatactttc
agaggcaaacctcacaatggggatcttacgcttcctgatttgagtgtcgaccaaaattat
ttgattggaaatccctatccatcggcgattgatgcacatgaatttattcgcgataatctt
aaagatgtgtctggaggtaaaaatgatagaaatgtatttgacggctccctttatttctgg
gatcattttcaggaagttagccatattctaaaagaatatataggtggatatgcggtattg
aatataggtggtgcggttccggctgcatctgtggatgagcgtattgataatacaggggag
cctaataataaaatcccaggaccgtatattccagtagctcaaggcttcatgattaattct
acaaccttggaatctgcgtttccaatcttaggcgggaaggtaaaatttaaaaattcacaa
agaaaatttgagattgagggaggatttggatctaactctcttttccttaaaccagaaaca
ggagaaaaaaatgtcaaagcaaaagacacagaatttaaaaagataaggctttcattctca
tcaccagttggatattggcgccagatcctcgtaggagcaattcctggcactactgatgct
tttgatcttggatatgatgctcacctgtttgataataatattgaagatatgtacttcctg
cagggagaaaacaagcttgttattcagtcaattgccgatttcaataaagacaggattata
cctctgggaataaaggtcaaagaaaacaaggaattcaggatacgactggatacactggaa
aacgggaataatgaattgaatatttatctaaatgataagttgaaagacagtattcatgat
ctccgaaaatcggcttacttctcaacatctgagcccggcactattcatgaccgttttgag
ataattttctctaaagatgaagaggtattgcctcctgttgaaccaggaccggatggtaaa
gattatggaatcgttttacgggtacgtcattcttatgccaaccgacagatccaaattttg
aatccggagcaaattgaaatttcaaacctttatctgtttgaccttaacggaaatttactg
gaagattacgaccagatcaccaatgagaaagagattattttaccggttcggggatacagt
tcaggcgtatatatcttgaaaatgtatgtcagcgataaggttataactaaaaagatcatc
ataagtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
