Antarcticibacterium arcticum: FK178_11965
Help
Entry
FK178_11965 CDS
T06142
Name
(GenBank) OmpA family protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
anp
Antarcticibacterium arcticum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
anp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
anp02000
]
FK178_11965
Transporters [BR:
anp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FK178_11965
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QED38388
UniProt:
A0A5B8YMA6
LinkDB
All DBs
Position
2641172..2642584
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MKHLSRFLLASFFVLGFTAVQAQDENNPWAIEIGVNAVDLYPTGEDAPAGGMFEDYFNVS
DHWNILPAMSRISVARYIGGGFVLEGAGSVNQISKFGDTQVDDLSYYSLDGTAKYSLRAL
LNNGWLDPHLGVGGGYTWLDNEGSATLNGAFGLSFWFSDNIALNVQSTYKHAFADDAFPH
FQHAAGIKFMFGGKDTDGDGVYDRDDECPETPGLKEFNGCPDSDGDGIPDHLDACPDTAG
LAEFDGCPDSDGDGIPDPQDECPTVAGTAAMNGCPDTDGDGVPDQKDECPEEAGPVENNG
CPFEDRDGDGVLDKDDECPDTAGTVANNGCPEPTAEAISTLNEYSKTVLFDTNKSTIKPE
SEEALKAIHDIMHEYSNTVFHIEGHTDSVGSDAYNLNLSKERAASVRQWLVSNGIPANRL
TSEGYGESRPISTNNTAAGRQDNRRVEISLDKDKEMRSTETDTTKTGNKQ
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatcttagcagatttttattagcttcattttttgttctgggctttacggctgta
caggcacaagatgaaaacaacccctgggccattgaaattggcgtgaacgcagttgactta
taccctacgggagaggacgctccggcaggaggtatgtttgaggactattttaatgtatct
gatcactggaatatccttccggctatgtcaagaatttctgtagccagatatattggtggc
ggttttgtattggaaggtgctggttctgtaaaccaaatttcaaaatttggtgatactcaa
gtggatgatctttcttattattcattagacggtactgcaaaatatagccttagagcttta
ttgaacaatggctggttagatccgcaccttggagttggtgggggttatacctggttagac
aatgaaggttctgcaactttgaacggagcttttggattaagcttctggttctcagacaat
attgcacttaatgtgcagtcaacctacaagcacgcttttgctgatgatgcttttcctcat
tttcaacacgctgccggtattaaattcatgtttggtggaaaagatactgatggagatggt
gtttatgacagagatgatgagtgtcctgagactccaggtttaaaagaatttaacggatgt
ccagactcagatggtgacggtattccagatcatttagatgcttgtcctgatactgcaggt
ttagctgaatttgacggatgtcctgattctgatggtgatggtattccagatcctcaggat
gaatgtcctactgtagccggaactgccgctatgaatggatgtcctgataccgatggtgat
ggtgtgccagatcaaaaagatgagtgtcctgaagaagctggtcctgttgaaaacaacgga
tgtccttttgaagaccgtgatggtgatggtgtattagataaagacgatgagtgtcctgat
actgccggaactgttgctaacaatggttgtccagagccaactgctgaagctatttctact
ttgaatgaatattctaaaactgtattgtttgatactaataagtcaaccattaagcctgag
tctgaagaagctttaaaagctattcacgatattatgcacgaatattctaatacagtattc
catattgaaggacatactgatagtgtaggtagcgatgcttataacctgaacctttctaaa
gaacgtgctgcatctgtaagacagtggttagtttctaacggtattcctgcaaacagatta
acttctgaaggatatggtgaatcaagaccaatctctacaaacaacactgctgctggaaga
caagataacagacgtgttgagatatctttggataaagacaaagaaatgagaagtacagaa
actgatactaccaaaacaggtaacaaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system