Anaerocolumna sedimenticola: Ana3638_20195
Help
Entry
Ana3638_20195 CDS
T06399
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02035
peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
anr
Anaerocolumna sedimenticola
Pathway
anr02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
anr00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Ana3638_20195
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
anr02000
]
Ana3638_20195
Transporters [BR:
anr02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
Ana3638_20195
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
DUF2812
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHQ62815
UniProt:
A0A6P1TTQ4
LinkDB
All DBs
Position
complement(4534622..4536682)
Genome browser
AA seq
686 aa
AA seq
DB search
MKKKVLSILLVLCMVFSLNACGKNKDTADTANEAETTGNAGKAADSAEVPDKVVATGTYD
TLVIGTDPLNGVFNEMFSFSAFDKEVTDLIFSPVSWLDPQGALIDNAGHVEAKEITAADG
HTQIEYTVSIKPDMKFSDGEPVTIDDVLFWYYVTSDPTYDGSSTFSTLDIVGLKDYYYDT
PNYSAQLDKITKEVEAKYSLDKISEEDYKAYLRDTKLDGWWEGIDSYDWVTYLKGEGYDP
TGIEKDEEKLFEMLVDCEYTKYKDGYDPQSYYQHKLEGQYIKGNLEDGIDVQEISGIKKV
DDYTCTVLFDSPNISGDKQVAWIPIIPKHYYGADFTKGNLDGIKAFNGTPLGCGPYKFVS
YQDNIVTLEANTLFWGETPKIPTIKFQVVSEDDKVDSVINGDIDIAVPSASKEVVDQVES
AGMAYSLVDNPGYGYIAINAEKIPDINVRKGIMYLMNRKPAVESYYGELAQVIERPMTPT
VAEYPRDAKEVYGYDPDKALEYLTKAGYAKDASGKFVKNGEPLKITIGIAGDGTMNHPSA
PILTQMANDLKSMGAELIIQDIDSSTLFDLIDAGELDMWVAAWGNAADCDLTQMFGSKGN
DNDVHLYSDEIDKLQAEILKTVDFDARCKLVAQELDLIMDAAVYMPVYQRKNMEIYNTTT
IKADTLPKETTTYWNYAKEINKLELN
NT seq
2061 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagaaagttctatcaattcttcttgttctgtgtatggtgttttctttaaatgcc
tgcggcaaaaataaagatactgctgacacggcaaacgaagctgaaactactggcaatgca
ggtaaagctgctgattctgcggaggtacctgataaggttgttgctaccggtacatatgat
acattagttataggtacagatccattaaatggagtatttaatgaaatgttttcatttagt
gcatttgataaagaagtaacagatcttatattttcaccagtttcctggctggatccacag
ggggcattaattgataatgcaggacatgtggaagcaaaagaaattacggctgcagacgga
cacactcagattgaatataccgtttccataaaacccgacatgaaattttccgatggggaa
cccgttacaatagatgatgttcttttttggtattatgtaacatcagaccctacttatgat
ggttcatctactttttcaacgcttgatattgtaggtttgaaagattactactatgataca
ccgaattattctgctcagcttgacaaaattacaaaagaagtagaagcaaaatattcactt
gataaaatttcagaagaagattacaaagcatatttaagagatacgaaacttgatggctgg
tgggaaggcatagacagctacgactgggttacctatcttaagggcgaaggttatgaccct
accggtattgagaaagacgaagaaaaactctttgaaatgcttgttgattgcgaatataca
aaatataaagacggctatgatcctcaatcctattatcagcataaattagagggacaatac
ataaaaggaaatttggaagatggtattgatgttcaggaaatctccggtataaaaaaagtt
gatgattatacctgtaccgttttatttgattcaccaaatatctccggagacaaacaggtt
gcctggattccgattattccgaaacattattatggagcagatttcaccaaaggtaatctg
gatggaataaaagcatttaatggtactcctttaggctgcggcccatataagtttgtaagt
tatcaggataatattgttaccttagaagcaaataccctgttctggggtgaaacacctaag
attcctaccattaagttccaggtggtatctgaagatgataaggttgattcggttattaac
ggtgatatcgatattgccgttccatctgcttcaaaggaagttgttgatcaggttgaatca
gccggaatggcgtattctttagtggataatcctggttatggttacatagctattaatgca
gagaaaattcctgatattaatgtacgtaaaggtattatgtatttaatgaatagaaaaccc
gcagttgagtcctattacggagaattagcacaggttatcgaaagacctatgacacctact
gttgcagaataccctcgtgatgcaaaggaagtttatggttatgatccggataaagcatta
gagtatttaacaaaggcaggttatgcaaaagatgcaagcggcaaatttgttaaaaatggt
gaaccgttaaaaattactattggtatcgccggtgacggtacaatgaatcatccttctgct
ccgatcttaacccagatggcgaatgatttgaaatccatgggtgcagaattaataattcag
gatattgattcttcaactttatttgatttaatcgatgccggagaattagatatgtgggtt
gcagcatggggaaatgctgccgactgtgacttaacccagatgttcggaagtaaaggtaat
gataatgatgttcatctttacagtgatgaaatcgataagctgcaagcagagattcttaaa
acggtagattttgatgcaagatgtaaacttgttgcacaggaacttgatcttataatggat
gctgcagtatatatgccggtataccagagaaaaaatatggaaatatacaatacaactacc
attaaggcagatactcttccaaaagaaacaacaacatattggaattatgcaaaagaaatt
aacaagcttgagttgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system